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The map label for this gene is 159897674

Identifier: 159897674

GI number: 159897674

Start: 1310335

End: 1312545

Strand: Reverse

Name: 159897674

Synonym: Haur_1145

Alternate gene names: NA

Gene position: 1312545-1310335 (Counterclockwise)

Preceding gene: 159897675

Following gene: 159897671

Centisome position: 20.68

GC content: 51.2

Gene sequence:

>2211_bases
ATGCAGACAGAACATTCCGATCTCCTTCCACGTTACACCACTGCTCTAATTGGGCGTGATGCTGAAACTGCTGAAATTGG
GGCTTTATTGGCCCAAGGTCAGCGGTTAATTAGTTTAGTTGGGGCAAGCGGCGCGGGCAAAACCCGTTTGGCGGTTGATT
GTGCCCGTTTATATGCCGACCAATTTGTTGGTGGCTGTTTTTTTGTGTCGTTGGTGCCGATTCGGGCGGCGGGTTTAGTG
CTAGCAACGATTGCCGAAAGCCTCGGTATCGCTCCCACCTCCGATCAACCATTGCTCACCACGATTGCCGCCCATTTTCC
ACATCAACCGAGCTTGTTAATTCTCGATAATATTGATCATGTAGTCGAGGCTGCCTCGGATGTGCAAGCCTTAGTCACAG
CCGTGCCGCAATTAACCATTTTGGTCACTAGCCAAGTGGCGCTGAACGTGGCTGCTGAAACGATCTATCGGGTGCCATTA
TTGAGCGTGCCTGCCGAAGATGCTCGCTTGAGCGCCAGCGAAATTTTGCAATATGGCGCTGTGCAATTGTTTAGCGAACG
ATTGCGACGGTTGCAGCCAATGCTCAAAGTCGATCAACCACAAGCTCAGGCGATCGCCGAAATATGTCGTTTGGTGCAGG
GCTTGCCGTTGGCCGTCGAGCTTGTCGCTAGCCATAGTCGCAGCTTACCGCCCTCTGATTTGGTGCGCATGGTGCGGCAT
CACTTGCGCTTGGGTGCGGCTATGATCGACAAAAACAGCACCATGCAACGCAAAGAAATTTTGTGGCCAGTGCTCGATTG
GTGCTATCGCCTGCTTTCGCCAACGCTGCAAGTGTTGTTTATTCGCTTGGGGATCTTTCGCGGCAGTTGGACGCTCGAAT
CGGCTGAAGCGATTTGCGCGGGCATTCCCGACGTACCGATCAATGTGGTTGAAGGCTTACAAACCTTGGTCGATAAATCG
TTGGTACAGCTTGAAACTCTGCCCAACGGCGATCATCGCTATCTGATGCTTGATGCGGTGCATGCTTATGCCGAGGGTCG
TTTACAACGTCGCCGCGAAGCTAACCACTTGCAACGATTGTATAGCTCATACTTTACCCATTTGGCTGAGAGTGCCGAAA
AACCCTTGCTCGGAGCCGATCAACCGCTATGGATGGCTCGCTTGCAGAGTGATATTTACAACTTGCGCTCGGTGCTGGAT
TGGGCGGTTGAGCAGCATCCCGCCACAGCCTTGCGGATTGCTGGCTCGTTGTGGTTGTTTTGGTTTACCAAAGGCTATGC
CCAAGAAGCGCGGGTCTGGATTCGCCAAGCATGGCGGCGCGAACACGAAATTGAGCCTGTGGTTCGCGCTAAAGCAGCGA
TTGCCGCAGGCATTTGTGCCCAATATTTTGCCGATCATGCTGATGCAACGTTATGGTATGAGCGTGGTCAAGCCTTATTC
AAGCAAGTTGGCGATACCTTTGGCGAAACCCGCGCCTTGCATAATTTATCGTCATTGGCCTATCAACAACGCTACTATCA
AAAAGCAGTGGAGCTTGGCGAAGATGTTGTGGCACGCTGGCAAGCCATGGATGATCGTTCAGGTGAAGCTGCGGCCTTGA
GCAATTTGGCCAGCTCCTACACTGGTTTGGGTCGTTTCGATGATGCTGAACGTTGCTACCAACAAAGCTTGCAGATCAAT
CGTAGCCTTGGCAATCAAGTTGGGATTATTCTCTGTCAGAGTGCTCGTGGCTGGCTCGCCTGTGCGATTGATGATTTGGA
ATTAGCCCAAGAGGCACTGGAGGAATCACTCAATCTAGCCCTGCAAAACGATGCTCGCAACTTAATTCCTGGTTCGCAGA
GTGCATTGGCTAGAGTTTGGTATAAAAAAGGCCAAATCCAACGTGCTTTCGAGCTTTTGCGCCCAGTTTTTGATATTCAA
GCTCAATTGCAAAATTTGGAGCAATCGGGCGAAGAGATGATCACTCTCGCGGCAATTTTGGCTGAGCATTATCCCAAATT
GGCCCAACAAGCCTTGGAGTTTGCTGAGCGCATGCAAGATCCTTATAACCAAGAGCTTCAGCCTGATCCAGCCACACTGC
TCTTTTTCAAGCAAACTGCCGAGCAGGTGAGCCATTTTGTGGGGCAAGCTGCGGCTACATCAACCCTGCCAACAATTAGC
GAATTTCTCGATTCGGTCGATCAAACGGTTGATCCACGAGTTTTAGGTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
GCAACGGCTCATCGATTGGGCTACGCACGACAACTAACATGCAACGGAGCATGGCAGCTATCAGTGCTGATGGCTTTAGC
AGAAACCAATTGGTGTGAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CTAACGAATCAAAACAACCCCTCTCTTCATGGTCACGAGAGGGGTTGGGGTAAGCAAAGCAAACCTTCGCTATTCCAAAT
TGCCGAGTCGGGCATCGAGG

Product: TPR repeat-containing protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 736; Mature: 736

Protein sequence:

>736_residues
MQTEHSDLLPRYTTALIGRDAETAEIGALLAQGQRLISLVGASGAGKTRLAVDCARLYADQFVGGCFFVSLVPIRAAGLV
LATIAESLGIAPTSDQPLLTTIAAHFPHQPSLLILDNIDHVVEAASDVQALVTAVPQLTILVTSQVALNVAAETIYRVPL
LSVPAEDARLSASEILQYGAVQLFSERLRRLQPMLKVDQPQAQAIAEICRLVQGLPLAVELVASHSRSLPPSDLVRMVRH
HLRLGAAMIDKNSTMQRKEILWPVLDWCYRLLSPTLQVLFIRLGIFRGSWTLESAEAICAGIPDVPINVVEGLQTLVDKS
LVQLETLPNGDHRYLMLDAVHAYAEGRLQRRREANHLQRLYSSYFTHLAESAEKPLLGADQPLWMARLQSDIYNLRSVLD
WAVEQHPATALRIAGSLWLFWFTKGYAQEARVWIRQAWRREHEIEPVVRAKAAIAAGICAQYFADHADATLWYERGQALF
KQVGDTFGETRALHNLSSLAYQQRYYQKAVELGEDVVARWQAMDDRSGEAAALSNLASSYTGLGRFDDAERCYQQSLQIN
RSLGNQVGIILCQSARGWLACAIDDLELAQEALEESLNLALQNDARNLIPGSQSALARVWYKKGQIQRAFELLRPVFDIQ
AQLQNLEQSGEEMITLAAILAEHYPKLAQQALEFAERMQDPYNQELQPDPATLLFFKQTAEQVSHFVGQAAATSTLPTIS
EFLDSVDQTVDPRVLG

Sequences:

>Translated_736_residues
MQTEHSDLLPRYTTALIGRDAETAEIGALLAQGQRLISLVGASGAGKTRLAVDCARLYADQFVGGCFFVSLVPIRAAGLV
LATIAESLGIAPTSDQPLLTTIAAHFPHQPSLLILDNIDHVVEAASDVQALVTAVPQLTILVTSQVALNVAAETIYRVPL
LSVPAEDARLSASEILQYGAVQLFSERLRRLQPMLKVDQPQAQAIAEICRLVQGLPLAVELVASHSRSLPPSDLVRMVRH
HLRLGAAMIDKNSTMQRKEILWPVLDWCYRLLSPTLQVLFIRLGIFRGSWTLESAEAICAGIPDVPINVVEGLQTLVDKS
LVQLETLPNGDHRYLMLDAVHAYAEGRLQRRREANHLQRLYSSYFTHLAESAEKPLLGADQPLWMARLQSDIYNLRSVLD
WAVEQHPATALRIAGSLWLFWFTKGYAQEARVWIRQAWRREHEIEPVVRAKAAIAAGICAQYFADHADATLWYERGQALF
KQVGDTFGETRALHNLSSLAYQQRYYQKAVELGEDVVARWQAMDDRSGEAAALSNLASSYTGLGRFDDAERCYQQSLQIN
RSLGNQVGIILCQSARGWLACAIDDLELAQEALEESLNLALQNDARNLIPGSQSALARVWYKKGQIQRAFELLRPVFDIQ
AQLQNLEQSGEEMITLAAILAEHYPKLAQQALEFAERMQDPYNQELQPDPATLLFFKQTAEQVSHFVGQAAATSTLPTIS
EFLDSVDQTVDPRVLG
>Mature_736_residues
MQTEHSDLLPRYTTALIGRDAETAEIGALLAQGQRLISLVGASGAGKTRLAVDCARLYADQFVGGCFFVSLVPIRAAGLV
LATIAESLGIAPTSDQPLLTTIAAHFPHQPSLLILDNIDHVVEAASDVQALVTAVPQLTILVTSQVALNVAAETIYRVPL
LSVPAEDARLSASEILQYGAVQLFSERLRRLQPMLKVDQPQAQAIAEICRLVQGLPLAVELVASHSRSLPPSDLVRMVRH
HLRLGAAMIDKNSTMQRKEILWPVLDWCYRLLSPTLQVLFIRLGIFRGSWTLESAEAICAGIPDVPINVVEGLQTLVDKS
LVQLETLPNGDHRYLMLDAVHAYAEGRLQRRREANHLQRLYSSYFTHLAESAEKPLLGADQPLWMARLQSDIYNLRSVLD
WAVEQHPATALRIAGSLWLFWFTKGYAQEARVWIRQAWRREHEIEPVVRAKAAIAAGICAQYFADHADATLWYERGQALF
KQVGDTFGETRALHNLSSLAYQQRYYQKAVELGEDVVARWQAMDDRSGEAAALSNLASSYTGLGRFDDAERCYQQSLQIN
RSLGNQVGIILCQSARGWLACAIDDLELAQEALEESLNLALQNDARNLIPGSQSALARVWYKKGQIQRAFELLRPVFDIQ
AQLQNLEQSGEEMITLAAILAEHYPKLAQQALEFAERMQDPYNQELQPDPATLLFFKQTAEQVSHFVGQAAATSTLPTIS
EFLDSVDQTVDPRVLG

Specific function: Unknown

COG id: COG3903

COG function: function code R; Predicted ATPase

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 1 HTH luxR-type DNA-binding domain [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR000767
- InterPro:   IPR016032
- InterPro:   IPR011990
- InterPro:   IPR000792
- InterPro:   IPR011991 [H]

Pfam domain/function: PF00196 GerE [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 81633; Mature: 81633

Theoretical pI: Translated: 5.40; Mature: 5.40

Prosite motif: PS50005 TPR ; PS50293 TPR_REGION

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
1.4 %Met     (Translated Protein)
2.6 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
1.4 %Met     (Mature Protein)
2.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MQTEHSDLLPRYTTALIGRDAETAEIGALLAQGQRLISLVGASGAGKTRLAVDCARLYAD
CCCCCHHCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
QFVGGCFFVSLVPIRAAGLVLATIAESLGIAPTSDQPLLTTIAAHFPHQPSLLILDNIDH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCHHH
VVEAASDVQALVTAVPQLTILVTSQVALNVAAETIYRVPLLSVPAEDARLSASEILQYGA
HHHHHHHHHHHHHHHCHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHCCHHHHHHHHH
VQLFSERLRRLQPMLKVDQPQAQAIAEICRLVQGLPLAVELVASHSRSLPPSDLVRMVRH
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH
HLRLGAAMIDKNSTMQRKEILWPVLDWCYRLLSPTLQVLFIRLGIFRGSWTLESAEAICA
HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHC
GIPDVPINVVEGLQTLVDKSLVQLETLPNGDHRYLMLDAVHAYAEGRLQRRREANHLQRL
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YSSYFTHLAESAEKPLLGADQPLWMARLQSDIYNLRSVLDWAVEQHPATALRIAGSLWLF
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH
WFTKGYAQEARVWIRQAWRREHEIEPVVRAKAAIAAGICAQYFADHADATLWYERGQALF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH
KQVGDTFGETRALHNLSSLAYQQRYYQKAVELGEDVVARWQAMDDRSGEAAALSNLASSY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH
TGLGRFDDAERCYQQSLQINRSLGNQVGIILCQSARGWLACAIDDLELAQEALEESLNLA
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LQNDARNLIPGSQSALARVWYKKGQIQRAFELLRPVFDIQAQLQNLEQSGEEMITLAAIL
HHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AEHYPKLAQQALEFAERMQDPYNQELQPDPATLLFFKQTAEQVSHFVGQAAATSTLPTIS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EFLDSVDQTVDPRVLG
HHHHHHHCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MQTEHSDLLPRYTTALIGRDAETAEIGALLAQGQRLISLVGASGAGKTRLAVDCARLYAD
CCCCCHHCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
QFVGGCFFVSLVPIRAAGLVLATIAESLGIAPTSDQPLLTTIAAHFPHQPSLLILDNIDH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCHHH
VVEAASDVQALVTAVPQLTILVTSQVALNVAAETIYRVPLLSVPAEDARLSASEILQYGA
HHHHHHHHHHHHHHHCHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHCCHHHHHHHHH
VQLFSERLRRLQPMLKVDQPQAQAIAEICRLVQGLPLAVELVASHSRSLPPSDLVRMVRH
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH
HLRLGAAMIDKNSTMQRKEILWPVLDWCYRLLSPTLQVLFIRLGIFRGSWTLESAEAICA
HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHC
GIPDVPINVVEGLQTLVDKSLVQLETLPNGDHRYLMLDAVHAYAEGRLQRRREANHLQRL
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YSSYFTHLAESAEKPLLGADQPLWMARLQSDIYNLRSVLDWAVEQHPATALRIAGSLWLF
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH
WFTKGYAQEARVWIRQAWRREHEIEPVVRAKAAIAAGICAQYFADHADATLWYERGQALF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH
KQVGDTFGETRALHNLSSLAYQQRYYQKAVELGEDVVARWQAMDDRSGEAAALSNLASSY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH
TGLGRFDDAERCYQQSLQINRSLGNQVGIILCQSARGWLACAIDDLELAQEALEESLNLA
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LQNDARNLIPGSQSALARVWYKKGQIQRAFELLRPVFDIQAQLQNLEQSGEEMITLAAIL
HHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AEHYPKLAQQALEFAERMQDPYNQELQPDPATLLFFKQTAEQVSHFVGQAAATSTLPTIS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EFLDSVDQTVDPRVLG
HHHHHHHCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9634230; 12218036 [H]