Definition | Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_003106 |
Length | 2,694,756 |
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The map label for this gene is 15921687
Identifier: 15921687
GI number: 15921687
Start: 1403762
End: 1405243
Strand: Direct
Name: 15921687
Synonym: ST1398
Alternate gene names: NA
Gene position: 1403762-1405243 (Clockwise)
Preceding gene: 15921686
Following gene: 15921688
Centisome position: 52.09
GC content: 28.07
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases GAAATAGAAAGAAGGATGAATTTCCTTACTACTTTAAAAAACGAGAAAGTTATTGATTTTGTTGATGTTTCTTATAAGAT AAGAAAGTTTTATGAAGTAG
Downstream 100 bases:
>100_bases TAGCCTATAGTTATATGGGGAACAATATGAGAAGAACTAAAGGGATTTCATCAATATTAGGAACTGTAATAGTATTAGCA ATAACTATAGCTTTAGGGGC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 493; Mature: 493
Protein sequence:
>493_residues MRLVLRMLLNKLNKISPCNVFNQKIKEYIEYYGDDYNKICSKYHYLLKIFILLLIAITILGMFLLRFLIFLDIPIGLIAY TYPLVYTWSRREEYKKTVNLEAPFITIIVYINSIVDKSLLYTFKELSEVKELKIPRIEYTFLNKMIEYMGFSYIKALEKR ANLHRGDLLGKLYDNYLAALNLGITIKDRLRDVLKDVMYELKESYKTYIDKSAEIAEIQFALLLLLPIVLLGFAFTFKTS ITELLLPLLFIPPLIFVISTIQPGVDYNIKHNKYIYSLIIIPIAIFIPVQIAFRLIIIFSVILFVSFFIYQQIQLANELE KSLPLLLKEIAEYLRLGYTVQNAIPRIKINSSKVNKVLSEILRQSNEISTPSKLFNMSMKVLFIISKSGSSSVALEELAN AINEIVYAKQSLIRQLRLYDAMIILTPIMLWLAFGTLNKIVSSTLPAIDIIAAYSVGSVILFSKLSRFTLLYFPAILLLV VVLLILSFLPPVF
Sequences:
>Translated_493_residues MRLVLRMLLNKLNKISPCNVFNQKIKEYIEYYGDDYNKICSKYHYLLKIFILLLIAITILGMFLLRFLIFLDIPIGLIAY TYPLVYTWSRREEYKKTVNLEAPFITIIVYINSIVDKSLLYTFKELSEVKELKIPRIEYTFLNKMIEYMGFSYIKALEKR ANLHRGDLLGKLYDNYLAALNLGITIKDRLRDVLKDVMYELKESYKTYIDKSAEIAEIQFALLLLLPIVLLGFAFTFKTS ITELLLPLLFIPPLIFVISTIQPGVDYNIKHNKYIYSLIIIPIAIFIPVQIAFRLIIIFSVILFVSFFIYQQIQLANELE KSLPLLLKEIAEYLRLGYTVQNAIPRIKINSSKVNKVLSEILRQSNEISTPSKLFNMSMKVLFIISKSGSSSVALEELAN AINEIVYAKQSLIRQLRLYDAMIILTPIMLWLAFGTLNKIVSSTLPAIDIIAAYSVGSVILFSKLSRFTLLYFPAILLLV VVLLILSFLPPVF >Mature_493_residues MRLVLRMLLNKLNKISPCNVFNQKIKEYIEYYGDDYNKICSKYHYLLKIFILLLIAITILGMFLLRFLIFLDIPIGLIAY TYPLVYTWSRREEYKKTVNLEAPFITIIVYINSIVDKSLLYTFKELSEVKELKIPRIEYTFLNKMIEYMGFSYIKALEKR ANLHRGDLLGKLYDNYLAALNLGITIKDRLRDVLKDVMYELKESYKTYIDKSAEIAEIQFALLLLLPIVLLGFAFTFKTS ITELLLPLLFIPPLIFVISTIQPGVDYNIKHNKYIYSLIIIPIAIFIPVQIAFRLIIIFSVILFVSFFIYQQIQLANELE KSLPLLLKEIAEYLRLGYTVQNAIPRIKINSSKVNKVLSEILRQSNEISTPSKLFNMSMKVLFIISKSGSSSVALEELAN AINEIVYAKQSLIRQLRLYDAMIILTPIMLWLAFGTLNKIVSSTLPAIDIIAAYSVGSVILFSKLSRFTLLYFPAILLLV VVLLILSFLPPVF
Specific function: Unknown
COG id: COG2064
COG function: function code NU; Flp pilus assembly protein TadC
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 56874; Mature: 56874
Theoretical pI: Translated: 9.75; Mature: 9.75
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 2.0 %Met (Translated Protein) 2.4 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 2.0 %Met (Mature Protein) 2.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MRLVLRMLLNKLNKISPCNVFNQKIKEYIEYYGDDYNKICSKYHYLLKIFILLLIAITIL CHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GMFLLRFLIFLDIPIGLIAYTYPLVYTWSRREEYKKTVNLEAPFITIIVYINSIVDKSLL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH YTFKELSEVKELKIPRIEYTFLNKMIEYMGFSYIKALEKRANLHRGDLLGKLYDNYLAAL HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHH NLGITIKDRLRDVLKDVMYELKESYKTYIDKSAEIAEIQFALLLLLPIVLLGFAFTFKTS HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ITELLLPLLFIPPLIFVISTIQPGVDYNIKHNKYIYSLIIIPIAIFIPVQIAFRLIIIFS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VILFVSFFIYQQIQLANELEKSLPLLLKEIAEYLRLGYTVQNAIPRIKINSSKVNKVLSE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHCCCCEEECHHHHHHHHHH ILRQSNEISTPSKLFNMSMKVLFIISKSGSSSVALEELANAINEIVYAKQSLIRQLRLYD HHHCCCCCCCHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AMIILTPIMLWLAFGTLNKIVSSTLPAIDIIAAYSVGSVILFSKLSRFTLLYFPAILLLV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VVLLILSFLPPVF HHHHHHHHCCCCC >Mature Secondary Structure MRLVLRMLLNKLNKISPCNVFNQKIKEYIEYYGDDYNKICSKYHYLLKIFILLLIAITIL CHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GMFLLRFLIFLDIPIGLIAYTYPLVYTWSRREEYKKTVNLEAPFITIIVYINSIVDKSLL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH YTFKELSEVKELKIPRIEYTFLNKMIEYMGFSYIKALEKRANLHRGDLLGKLYDNYLAAL HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHH NLGITIKDRLRDVLKDVMYELKESYKTYIDKSAEIAEIQFALLLLLPIVLLGFAFTFKTS HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ITELLLPLLFIPPLIFVISTIQPGVDYNIKHNKYIYSLIIIPIAIFIPVQIAFRLIIIFS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VILFVSFFIYQQIQLANELEKSLPLLLKEIAEYLRLGYTVQNAIPRIKINSSKVNKVLSE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHCCCCEEECHHHHHHHHHH ILRQSNEISTPSKLFNMSMKVLFIISKSGSSSVALEELANAINEIVYAKQSLIRQLRLYD HHHCCCCCCCHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AMIILTPIMLWLAFGTLNKIVSSTLPAIDIIAAYSVGSVILFSKLSRFTLLYFPAILLLV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VVLLILSFLPPVF HHHHHHHHCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
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Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA