Definition Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome, complete genome.
Accession NC_003106
Length 2,694,756

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 15921687

Identifier: 15921687

GI number: 15921687

Start: 1403762

End: 1405243

Strand: Direct

Name: 15921687

Synonym: ST1398

Alternate gene names: NA

Gene position: 1403762-1405243 (Clockwise)

Preceding gene: 15921686

Following gene: 15921688

Centisome position: 52.09

GC content: 28.07

Gene sequence:

>1482_bases
GTGAGGCTAGTGCTAAGAATGTTGCTCAATAAGCTCAATAAAATTTCTCCATGTAATGTTTTTAATCAGAAAATTAAGGA
GTATATTGAATATTATGGCGATGATTATAACAAAATCTGTAGTAAGTATCATTATCTATTAAAAATATTTATTTTATTAC
TAATAGCAATAACTATACTAGGAATGTTTTTATTAAGATTCTTAATATTTCTTGATATACCAATTGGATTAATAGCATAT
ACTTATCCTTTGGTTTATACTTGGTCTAGAAGAGAAGAATATAAAAAAACTGTAAACTTAGAAGCCCCTTTTATCACTAT
AATAGTCTATATTAATTCAATTGTAGATAAAAGTTTATTATATACTTTTAAGGAGCTATCAGAAGTTAAAGAGTTAAAAA
TACCCAGAATTGAGTACACGTTTCTTAATAAAATGATAGAATATATGGGGTTTTCATACATTAAGGCGTTAGAAAAGAGG
GCTAATTTGCACCGCGGAGATTTGTTAGGGAAATTATATGACAATTATCTTGCTGCTTTAAATCTAGGTATAACTATTAA
GGATCGATTAAGGGATGTACTAAAAGATGTAATGTATGAGTTAAAAGAATCATATAAGACCTATATTGATAAATCCGCCG
AAATAGCAGAAATTCAGTTTGCTTTACTGTTATTGCTTCCTATTGTATTGCTCGGATTCGCATTTACTTTTAAAACATCG
ATTACCGAACTTCTTCTTCCTTTACTCTTTATTCCCCCACTAATTTTTGTAATTTCGACCATTCAACCGGGAGTTGATTA
TAATATTAAACATAATAAGTATATTTATTCGCTTATAATAATTCCGATAGCTATATTTATTCCTGTACAAATAGCATTTA
GATTGATAATAATTTTCTCAGTAATCTTATTTGTAAGTTTCTTCATATATCAACAAATACAATTAGCTAATGAATTAGAG
AAATCATTGCCATTATTACTTAAGGAAATAGCAGAGTATCTAAGACTGGGATATACTGTACAGAACGCAATACCTAGAAT
AAAAATTAACTCATCTAAAGTAAATAAAGTTTTAAGTGAGATCTTAAGACAATCCAATGAGATCTCAACACCATCAAAAC
TATTTAATATGAGTATGAAAGTTTTATTTATTATATCAAAATCTGGTTCCTCTTCGGTAGCTTTAGAGGAATTAGCTAAT
GCAATCAATGAAATAGTATATGCTAAACAATCTCTAATCAGACAACTTAGACTGTATGATGCTATGATAATATTAACTCC
AATAATGTTATGGTTAGCATTTGGTACTTTAAATAAGATAGTAAGTAGTACACTTCCAGCAATAGATATAATAGCAGCTT
ATAGTGTTGGTTCAGTAATTTTATTCTCTAAATTATCTAGATTCACATTATTATATTTCCCAGCAATTTTACTTCTTGTA
GTAGTCTTACTAATACTTTCGTTTTTGCCACCCGTCTTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GAAATAGAAAGAAGGATGAATTTCCTTACTACTTTAAAAAACGAGAAAGTTATTGATTTTGTTGATGTTTCTTATAAGAT
AAGAAAGTTTTATGAAGTAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAGCCTATAGTTATATGGGGAACAATATGAGAAGAACTAAAGGGATTTCATCAATATTAGGAACTGTAATAGTATTAGCA
ATAACTATAGCTTTAGGGGC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 493; Mature: 493

Protein sequence:

>493_residues
MRLVLRMLLNKLNKISPCNVFNQKIKEYIEYYGDDYNKICSKYHYLLKIFILLLIAITILGMFLLRFLIFLDIPIGLIAY
TYPLVYTWSRREEYKKTVNLEAPFITIIVYINSIVDKSLLYTFKELSEVKELKIPRIEYTFLNKMIEYMGFSYIKALEKR
ANLHRGDLLGKLYDNYLAALNLGITIKDRLRDVLKDVMYELKESYKTYIDKSAEIAEIQFALLLLLPIVLLGFAFTFKTS
ITELLLPLLFIPPLIFVISTIQPGVDYNIKHNKYIYSLIIIPIAIFIPVQIAFRLIIIFSVILFVSFFIYQQIQLANELE
KSLPLLLKEIAEYLRLGYTVQNAIPRIKINSSKVNKVLSEILRQSNEISTPSKLFNMSMKVLFIISKSGSSSVALEELAN
AINEIVYAKQSLIRQLRLYDAMIILTPIMLWLAFGTLNKIVSSTLPAIDIIAAYSVGSVILFSKLSRFTLLYFPAILLLV
VVLLILSFLPPVF

Sequences:

>Translated_493_residues
MRLVLRMLLNKLNKISPCNVFNQKIKEYIEYYGDDYNKICSKYHYLLKIFILLLIAITILGMFLLRFLIFLDIPIGLIAY
TYPLVYTWSRREEYKKTVNLEAPFITIIVYINSIVDKSLLYTFKELSEVKELKIPRIEYTFLNKMIEYMGFSYIKALEKR
ANLHRGDLLGKLYDNYLAALNLGITIKDRLRDVLKDVMYELKESYKTYIDKSAEIAEIQFALLLLLPIVLLGFAFTFKTS
ITELLLPLLFIPPLIFVISTIQPGVDYNIKHNKYIYSLIIIPIAIFIPVQIAFRLIIIFSVILFVSFFIYQQIQLANELE
KSLPLLLKEIAEYLRLGYTVQNAIPRIKINSSKVNKVLSEILRQSNEISTPSKLFNMSMKVLFIISKSGSSSVALEELAN
AINEIVYAKQSLIRQLRLYDAMIILTPIMLWLAFGTLNKIVSSTLPAIDIIAAYSVGSVILFSKLSRFTLLYFPAILLLV
VVLLILSFLPPVF
>Mature_493_residues
MRLVLRMLLNKLNKISPCNVFNQKIKEYIEYYGDDYNKICSKYHYLLKIFILLLIAITILGMFLLRFLIFLDIPIGLIAY
TYPLVYTWSRREEYKKTVNLEAPFITIIVYINSIVDKSLLYTFKELSEVKELKIPRIEYTFLNKMIEYMGFSYIKALEKR
ANLHRGDLLGKLYDNYLAALNLGITIKDRLRDVLKDVMYELKESYKTYIDKSAEIAEIQFALLLLLPIVLLGFAFTFKTS
ITELLLPLLFIPPLIFVISTIQPGVDYNIKHNKYIYSLIIIPIAIFIPVQIAFRLIIIFSVILFVSFFIYQQIQLANELE
KSLPLLLKEIAEYLRLGYTVQNAIPRIKINSSKVNKVLSEILRQSNEISTPSKLFNMSMKVLFIISKSGSSSVALEELAN
AINEIVYAKQSLIRQLRLYDAMIILTPIMLWLAFGTLNKIVSSTLPAIDIIAAYSVGSVILFSKLSRFTLLYFPAILLLV
VVLLILSFLPPVF

Specific function: Unknown

COG id: COG2064

COG function: function code NU; Flp pilus assembly protein TadC

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 56874; Mature: 56874

Theoretical pI: Translated: 9.75; Mature: 9.75

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
2.0 %Met     (Translated Protein)
2.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
2.0 %Met     (Mature Protein)
2.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA