Definition Shewanella pealeana ATCC 700345 chromosome, complete genome.
Accession NC_009901
Length 5,174,581

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The map label for this gene is 157962124

Identifier: 157962124

GI number: 157962124

Start: 2796192

End: 2798228

Strand: Direct

Name: 157962124

Synonym: Spea_2303

Alternate gene names: NA

Gene position: 2796192-2798228 (Clockwise)

Preceding gene: 157962123

Following gene: 157962125

Centisome position: 54.04

GC content: 41.53

Gene sequence:

>2037_bases
GTGGACGCAACTAAATTTAATCAACTCGTTAGCTCTGTTCCTTTAGGAAAGAAATTACCTGAAGCTATCTATCTACATAA
AGACTGTTTTCCTGAGTTAGATAACTCCCTAACTCAATTTATTCTTGCAGTTGGCAGCGCACTTAAAATAGATCCGAATG
AGTGGCATATAGTTAAGTTATCACGCAATGAATTCAGACTATCGCTACTCTCCTACCCGACCTTTTTCACAGAAGCTTAT
CCATCACTCACTCAAAGTGTAACGGTTGACCTGAATAAACTAAGTCACCGTATCGTTGACTACAAAGACAGTGACAATCC
GCCAATCCTGCACCGCAAAGAAACCATGCTTCCTGCTCAACATGAATGCTTTGATGAATTTAAAGCAATCACTGAAGAGG
GAGAAAATGCCGGGCTTTACCAAAATAGCCGTATGATCGGTTTCAAGCAAAGCTGGCTACGCACTATTGAAGCGCATGGC
TATACGCTGGTAGACGGGCGATTATTTCGAAGCTCTGCAGTTATAGACCAAAGCAATACAACAGTAACAAGTATTGACCG
CCATAAAACTGCGATTGTGAGGCATGAACTCTCTGCCCCAATGAAGCAACTCGCCAAGCAAGGCTACCTTAATGGCGAAC
ATACTATCTTTGATTATGGCTGCGGTCGGGGCGATGATTTAACAGAACTAGAAGCTCACGGATTAGACGCCTTAGGCTGG
GACCCGAACTTTCGACCAGAAGCTGAAAAGGTAAAGTCCGATCTCGTGAATATCGGTTTTGTTATTAATGTGATTGAAGA
TAAAGTTGAGCGAGATGAAGCACTCCTCGGCGCTTGGGAGCTTACAGAAAAGTTACTGGTCGTTTCTGCAATGTTAGCCA
ACGACAAATTCATCAGCCAGTTCACACCCTATAAAGACGGTGTCATTACATCAATAAATACCTTTCAAAAGTATTATGCT
CAATCAGAGCTAAAAGGCTATATAGAGCGCACACTTGATGAAAACGCAATCGCCATTGCCCCCGGTATTTTCTACTTATT
TAAAGATAAACTGGAAGAGCAACGTTTTCTTTCTGGCCGCTTTAAACGCCACCATTCATGGAAGCAATTAACCACTCCAA
CGCCAACAAGTGAAGAACAAGCAAGGCTACTGTTTACAAAGCATCACAATCTACTTAACCGCTTTTGGGACAAGTGCTTG
GAACTTGGTCGTTTACCCGCTTTAGAAGAGTTTACTGAAACGCCAGAGATAATTGCCGCGATTGGAAACGCCAAGAAAGC
ACTAAAACTGCTGCTACAAGTTCAAGGTGAGCAAGCAACGAAGGTGTTCGAGGCCGCAATTGCAACAAGGCGAGAGGACT
TATTGGTTTATTTTGCTCTATGTCAGTTTGAACAACACAAAGGCTATACACACTTACCCAATGAGCTGAAGCGAGATATA
AAAGTATTCTTCGACACCTATAAAGTTGCCCAAGCAGAAGCTAAAACCCTACTCTACAGGATCGCTAATACCCAAGAAAT
AGAGCAAGCATGTATTGAAGCACATCAAATACTACCTGCAAGTAAATTAAATGATGGCCACTCGCTTGAACTGCATAAAC
AATTCTTGCCGCTTCTACCCGCCTTGCTGAGAGTTTATGTTGGCGCTGCCGTTCAGTTATATGGGGAGTTAGACGAAATA
GACATCGTAAAAATCCATATAACATCAGGTAAAGTCAGCTTTATGGGCTACGATAATTTTGATACAAGCCCCTTGCCGAC
ACTGCGAGAACGTATCAAGGTCAAGATGTGGCAATTGGATGTAGACTTTTTTGATTATGTTGATGAGCATTCTAGGCCAC
CTCTAATCAACAAACATTTGCTACTTACATCTACTGACGAGACTTATAAAAAGCAGTTAAGTTTTGATAAGAGGTTAAGC
AAGCTGCTAGGGCTTAATGAGCATGACAATGTGTTCATGTCAAAATGTGAGTTTGACTCAAAGCTATTAATGTTAAACAA
AAAAATCATTGGATTTACCATTAAATCTGTAACATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CATTTAAAAAGCAAGGTAATGCCTACCTCTATTTAATAACGCCAAAGAGTAAGTAACTCAAACGTTAACTATGAAGCAGT
AAGCTAATTAAGGATATAGC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGCAACTTTAATTGTTAATGAGTTTCTCATGTTACCGCTACCGTCCAGTAATAAACTCGATATTCCTGCATTAAGCCGAA
TATTCGACAATACAACCAAC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 678; Mature: 678

Protein sequence:

>678_residues
MDATKFNQLVSSVPLGKKLPEAIYLHKDCFPELDNSLTQFILAVGSALKIDPNEWHIVKLSRNEFRLSLLSYPTFFTEAY
PSLTQSVTVDLNKLSHRIVDYKDSDNPPILHRKETMLPAQHECFDEFKAITEEGENAGLYQNSRMIGFKQSWLRTIEAHG
YTLVDGRLFRSSAVIDQSNTTVTSIDRHKTAIVRHELSAPMKQLAKQGYLNGEHTIFDYGCGRGDDLTELEAHGLDALGW
DPNFRPEAEKVKSDLVNIGFVINVIEDKVERDEALLGAWELTEKLLVVSAMLANDKFISQFTPYKDGVITSINTFQKYYA
QSELKGYIERTLDENAIAIAPGIFYLFKDKLEEQRFLSGRFKRHHSWKQLTTPTPTSEEQARLLFTKHHNLLNRFWDKCL
ELGRLPALEEFTETPEIIAAIGNAKKALKLLLQVQGEQATKVFEAAIATRREDLLVYFALCQFEQHKGYTHLPNELKRDI
KVFFDTYKVAQAEAKTLLYRIANTQEIEQACIEAHQILPASKLNDGHSLELHKQFLPLLPALLRVYVGAAVQLYGELDEI
DIVKIHITSGKVSFMGYDNFDTSPLPTLRERIKVKMWQLDVDFFDYVDEHSRPPLINKHLLLTSTDETYKKQLSFDKRLS
KLLGLNEHDNVFMSKCEFDSKLLMLNKKIIGFTIKSVT

Sequences:

>Translated_678_residues
MDATKFNQLVSSVPLGKKLPEAIYLHKDCFPELDNSLTQFILAVGSALKIDPNEWHIVKLSRNEFRLSLLSYPTFFTEAY
PSLTQSVTVDLNKLSHRIVDYKDSDNPPILHRKETMLPAQHECFDEFKAITEEGENAGLYQNSRMIGFKQSWLRTIEAHG
YTLVDGRLFRSSAVIDQSNTTVTSIDRHKTAIVRHELSAPMKQLAKQGYLNGEHTIFDYGCGRGDDLTELEAHGLDALGW
DPNFRPEAEKVKSDLVNIGFVINVIEDKVERDEALLGAWELTEKLLVVSAMLANDKFISQFTPYKDGVITSINTFQKYYA
QSELKGYIERTLDENAIAIAPGIFYLFKDKLEEQRFLSGRFKRHHSWKQLTTPTPTSEEQARLLFTKHHNLLNRFWDKCL
ELGRLPALEEFTETPEIIAAIGNAKKALKLLLQVQGEQATKVFEAAIATRREDLLVYFALCQFEQHKGYTHLPNELKRDI
KVFFDTYKVAQAEAKTLLYRIANTQEIEQACIEAHQILPASKLNDGHSLELHKQFLPLLPALLRVYVGAAVQLYGELDEI
DIVKIHITSGKVSFMGYDNFDTSPLPTLRERIKVKMWQLDVDFFDYVDEHSRPPLINKHLLLTSTDETYKKQLSFDKRLS
KLLGLNEHDNVFMSKCEFDSKLLMLNKKIIGFTIKSVT
>Mature_678_residues
MDATKFNQLVSSVPLGKKLPEAIYLHKDCFPELDNSLTQFILAVGSALKIDPNEWHIVKLSRNEFRLSLLSYPTFFTEAY
PSLTQSVTVDLNKLSHRIVDYKDSDNPPILHRKETMLPAQHECFDEFKAITEEGENAGLYQNSRMIGFKQSWLRTIEAHG
YTLVDGRLFRSSAVIDQSNTTVTSIDRHKTAIVRHELSAPMKQLAKQGYLNGEHTIFDYGCGRGDDLTELEAHGLDALGW
DPNFRPEAEKVKSDLVNIGFVINVIEDKVERDEALLGAWELTEKLLVVSAMLANDKFISQFTPYKDGVITSINTFQKYYA
QSELKGYIERTLDENAIAIAPGIFYLFKDKLEEQRFLSGRFKRHHSWKQLTTPTPTSEEQARLLFTKHHNLLNRFWDKCL
ELGRLPALEEFTETPEIIAAIGNAKKALKLLLQVQGEQATKVFEAAIATRREDLLVYFALCQFEQHKGYTHLPNELKRDI
KVFFDTYKVAQAEAKTLLYRIANTQEIEQACIEAHQILPASKLNDGHSLELHKQFLPLLPALLRVYVGAAVQLYGELDEI
DIVKIHITSGKVSFMGYDNFDTSPLPTLRERIKVKMWQLDVDFFDYVDEHSRPPLINKHLLLTSTDETYKKQLSFDKRLS
KLLGLNEHDNVFMSKCEFDSKLLMLNKKIIGFTIKSVT

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 77628; Mature: 77628

Theoretical pI: Translated: 6.55; Mature: 6.55

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
1.3 %Met     (Translated Protein)
2.4 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
1.3 %Met     (Mature Protein)
2.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MDATKFNQLVSSVPLGKKLPEAIYLHKDCFPELDNSLTQFILAVGSALKIDPNEWHIVKL
CCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCEEEEEE
SRNEFRLSLLSYPTFFTEAYPSLTQSVTVDLNKLSHRIVDYKDSDNPPILHRKETMLPAQ
ECCCEEEEHHHCCHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEECHHHCCCCH
HECFDEFKAITEEGENAGLYQNSRMIGFKQSWLRTIEAHGYTLVDGRLFRSSAVIDQSNT
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEECHHHHHHHHHHHCCEEEECCEEECCCEEEECCCC
TVTSIDRHKTAIVRHELSAPMKQLAKQGYLNGEHTIFDYGCGRGDDLTELEAHGLDALGW
EEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCC
DPNFRPEAEKVKSDLVNIGFVINVIEDKVERDEALLGAWELTEKLLVVSAMLANDKFISQ
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH
FTPYKDGVITSINTFQKYYAQSELKGYIERTLDENAIAIAPGIFYLFKDKLEEQRFLSGR
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FKRHHSWKQLTTPTPTSEEQARLLFTKHHNLLNRFWDKCLELGRLPALEEFTETPEIIAA
HHHCCCCHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCHHHHHH
IGNAKKALKLLLQVQGEQATKVFEAAIATRREDLLVYFALCQFEQHKGYTHLPNELKRDI
HCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHH
KVFFDTYKVAQAEAKTLLYRIANTQEIEQACIEAHQILPASKLNDGHSLELHKQFLPLLP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
ALLRVYVGAAVQLYGELDEIDIVKIHITSGKVSFMGYDNFDTSPLPTLRERIKVKMWQLD
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEECCEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHEEEHEEEC
VDFFDYVDEHSRPPLINKHLLLTSTDETYKKQLSFDKRLSKLLGLNEHDNVFMSKCEFDS
CHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHCCCC
KLLMLNKKIIGFTIKSVT
EEEEECCCEEEEEEECCC
>Mature Secondary Structure
MDATKFNQLVSSVPLGKKLPEAIYLHKDCFPELDNSLTQFILAVGSALKIDPNEWHIVKL
CCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCEEEEEE
SRNEFRLSLLSYPTFFTEAYPSLTQSVTVDLNKLSHRIVDYKDSDNPPILHRKETMLPAQ
ECCCEEEEHHHCCHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEECHHHCCCCH
HECFDEFKAITEEGENAGLYQNSRMIGFKQSWLRTIEAHGYTLVDGRLFRSSAVIDQSNT
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TVTSIDRHKTAIVRHELSAPMKQLAKQGYLNGEHTIFDYGCGRGDDLTELEAHGLDALGW
EEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCC
DPNFRPEAEKVKSDLVNIGFVINVIEDKVERDEALLGAWELTEKLLVVSAMLANDKFISQ
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH
FTPYKDGVITSINTFQKYYAQSELKGYIERTLDENAIAIAPGIFYLFKDKLEEQRFLSGR
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FKRHHSWKQLTTPTPTSEEQARLLFTKHHNLLNRFWDKCLELGRLPALEEFTETPEIIAA
HHHCCCCHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCHHHHHH
IGNAKKALKLLLQVQGEQATKVFEAAIATRREDLLVYFALCQFEQHKGYTHLPNELKRDI
HCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHH
KVFFDTYKVAQAEAKTLLYRIANTQEIEQACIEAHQILPASKLNDGHSLELHKQFLPLLP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEECCEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHEEEHEEEC
VDFFDYVDEHSRPPLINKHLLLTSTDETYKKQLSFDKRLSKLLGLNEHDNVFMSKCEFDS
CHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHCCCC
KLLMLNKKIIGFTIKSVT
EEEEECCCEEEEEEECCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA