Definition | Shewanella pealeana ATCC 700345 chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_009901 |
Length | 5,174,581 |
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The map label for this gene is 157962124
Identifier: 157962124
GI number: 157962124
Start: 2796192
End: 2798228
Strand: Direct
Name: 157962124
Synonym: Spea_2303
Alternate gene names: NA
Gene position: 2796192-2798228 (Clockwise)
Preceding gene: 157962123
Following gene: 157962125
Centisome position: 54.04
GC content: 41.53
Gene sequence:
>2037_bases GTGGACGCAACTAAATTTAATCAACTCGTTAGCTCTGTTCCTTTAGGAAAGAAATTACCTGAAGCTATCTATCTACATAA AGACTGTTTTCCTGAGTTAGATAACTCCCTAACTCAATTTATTCTTGCAGTTGGCAGCGCACTTAAAATAGATCCGAATG AGTGGCATATAGTTAAGTTATCACGCAATGAATTCAGACTATCGCTACTCTCCTACCCGACCTTTTTCACAGAAGCTTAT CCATCACTCACTCAAAGTGTAACGGTTGACCTGAATAAACTAAGTCACCGTATCGTTGACTACAAAGACAGTGACAATCC GCCAATCCTGCACCGCAAAGAAACCATGCTTCCTGCTCAACATGAATGCTTTGATGAATTTAAAGCAATCACTGAAGAGG GAGAAAATGCCGGGCTTTACCAAAATAGCCGTATGATCGGTTTCAAGCAAAGCTGGCTACGCACTATTGAAGCGCATGGC TATACGCTGGTAGACGGGCGATTATTTCGAAGCTCTGCAGTTATAGACCAAAGCAATACAACAGTAACAAGTATTGACCG CCATAAAACTGCGATTGTGAGGCATGAACTCTCTGCCCCAATGAAGCAACTCGCCAAGCAAGGCTACCTTAATGGCGAAC ATACTATCTTTGATTATGGCTGCGGTCGGGGCGATGATTTAACAGAACTAGAAGCTCACGGATTAGACGCCTTAGGCTGG GACCCGAACTTTCGACCAGAAGCTGAAAAGGTAAAGTCCGATCTCGTGAATATCGGTTTTGTTATTAATGTGATTGAAGA TAAAGTTGAGCGAGATGAAGCACTCCTCGGCGCTTGGGAGCTTACAGAAAAGTTACTGGTCGTTTCTGCAATGTTAGCCA ACGACAAATTCATCAGCCAGTTCACACCCTATAAAGACGGTGTCATTACATCAATAAATACCTTTCAAAAGTATTATGCT CAATCAGAGCTAAAAGGCTATATAGAGCGCACACTTGATGAAAACGCAATCGCCATTGCCCCCGGTATTTTCTACTTATT TAAAGATAAACTGGAAGAGCAACGTTTTCTTTCTGGCCGCTTTAAACGCCACCATTCATGGAAGCAATTAACCACTCCAA CGCCAACAAGTGAAGAACAAGCAAGGCTACTGTTTACAAAGCATCACAATCTACTTAACCGCTTTTGGGACAAGTGCTTG GAACTTGGTCGTTTACCCGCTTTAGAAGAGTTTACTGAAACGCCAGAGATAATTGCCGCGATTGGAAACGCCAAGAAAGC ACTAAAACTGCTGCTACAAGTTCAAGGTGAGCAAGCAACGAAGGTGTTCGAGGCCGCAATTGCAACAAGGCGAGAGGACT TATTGGTTTATTTTGCTCTATGTCAGTTTGAACAACACAAAGGCTATACACACTTACCCAATGAGCTGAAGCGAGATATA AAAGTATTCTTCGACACCTATAAAGTTGCCCAAGCAGAAGCTAAAACCCTACTCTACAGGATCGCTAATACCCAAGAAAT AGAGCAAGCATGTATTGAAGCACATCAAATACTACCTGCAAGTAAATTAAATGATGGCCACTCGCTTGAACTGCATAAAC AATTCTTGCCGCTTCTACCCGCCTTGCTGAGAGTTTATGTTGGCGCTGCCGTTCAGTTATATGGGGAGTTAGACGAAATA GACATCGTAAAAATCCATATAACATCAGGTAAAGTCAGCTTTATGGGCTACGATAATTTTGATACAAGCCCCTTGCCGAC ACTGCGAGAACGTATCAAGGTCAAGATGTGGCAATTGGATGTAGACTTTTTTGATTATGTTGATGAGCATTCTAGGCCAC CTCTAATCAACAAACATTTGCTACTTACATCTACTGACGAGACTTATAAAAAGCAGTTAAGTTTTGATAAGAGGTTAAGC AAGCTGCTAGGGCTTAATGAGCATGACAATGTGTTCATGTCAAAATGTGAGTTTGACTCAAAGCTATTAATGTTAAACAA AAAAATCATTGGATTTACCATTAAATCTGTAACATGA
Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases TGCAACTTTAATTGTTAATGAGTTTCTCATGTTACCGCTACCGTCCAGTAATAAACTCGATATTCCTGCATTAAGCCGAA TATTCGACAATACAACCAAC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 678; Mature: 678
Protein sequence:
>678_residues MDATKFNQLVSSVPLGKKLPEAIYLHKDCFPELDNSLTQFILAVGSALKIDPNEWHIVKLSRNEFRLSLLSYPTFFTEAY PSLTQSVTVDLNKLSHRIVDYKDSDNPPILHRKETMLPAQHECFDEFKAITEEGENAGLYQNSRMIGFKQSWLRTIEAHG YTLVDGRLFRSSAVIDQSNTTVTSIDRHKTAIVRHELSAPMKQLAKQGYLNGEHTIFDYGCGRGDDLTELEAHGLDALGW DPNFRPEAEKVKSDLVNIGFVINVIEDKVERDEALLGAWELTEKLLVVSAMLANDKFISQFTPYKDGVITSINTFQKYYA QSELKGYIERTLDENAIAIAPGIFYLFKDKLEEQRFLSGRFKRHHSWKQLTTPTPTSEEQARLLFTKHHNLLNRFWDKCL ELGRLPALEEFTETPEIIAAIGNAKKALKLLLQVQGEQATKVFEAAIATRREDLLVYFALCQFEQHKGYTHLPNELKRDI KVFFDTYKVAQAEAKTLLYRIANTQEIEQACIEAHQILPASKLNDGHSLELHKQFLPLLPALLRVYVGAAVQLYGELDEI DIVKIHITSGKVSFMGYDNFDTSPLPTLRERIKVKMWQLDVDFFDYVDEHSRPPLINKHLLLTSTDETYKKQLSFDKRLS KLLGLNEHDNVFMSKCEFDSKLLMLNKKIIGFTIKSVT
Sequences:
>Translated_678_residues MDATKFNQLVSSVPLGKKLPEAIYLHKDCFPELDNSLTQFILAVGSALKIDPNEWHIVKLSRNEFRLSLLSYPTFFTEAY PSLTQSVTVDLNKLSHRIVDYKDSDNPPILHRKETMLPAQHECFDEFKAITEEGENAGLYQNSRMIGFKQSWLRTIEAHG YTLVDGRLFRSSAVIDQSNTTVTSIDRHKTAIVRHELSAPMKQLAKQGYLNGEHTIFDYGCGRGDDLTELEAHGLDALGW DPNFRPEAEKVKSDLVNIGFVINVIEDKVERDEALLGAWELTEKLLVVSAMLANDKFISQFTPYKDGVITSINTFQKYYA QSELKGYIERTLDENAIAIAPGIFYLFKDKLEEQRFLSGRFKRHHSWKQLTTPTPTSEEQARLLFTKHHNLLNRFWDKCL ELGRLPALEEFTETPEIIAAIGNAKKALKLLLQVQGEQATKVFEAAIATRREDLLVYFALCQFEQHKGYTHLPNELKRDI KVFFDTYKVAQAEAKTLLYRIANTQEIEQACIEAHQILPASKLNDGHSLELHKQFLPLLPALLRVYVGAAVQLYGELDEI DIVKIHITSGKVSFMGYDNFDTSPLPTLRERIKVKMWQLDVDFFDYVDEHSRPPLINKHLLLTSTDETYKKQLSFDKRLS KLLGLNEHDNVFMSKCEFDSKLLMLNKKIIGFTIKSVT >Mature_678_residues MDATKFNQLVSSVPLGKKLPEAIYLHKDCFPELDNSLTQFILAVGSALKIDPNEWHIVKLSRNEFRLSLLSYPTFFTEAY PSLTQSVTVDLNKLSHRIVDYKDSDNPPILHRKETMLPAQHECFDEFKAITEEGENAGLYQNSRMIGFKQSWLRTIEAHG YTLVDGRLFRSSAVIDQSNTTVTSIDRHKTAIVRHELSAPMKQLAKQGYLNGEHTIFDYGCGRGDDLTELEAHGLDALGW DPNFRPEAEKVKSDLVNIGFVINVIEDKVERDEALLGAWELTEKLLVVSAMLANDKFISQFTPYKDGVITSINTFQKYYA QSELKGYIERTLDENAIAIAPGIFYLFKDKLEEQRFLSGRFKRHHSWKQLTTPTPTSEEQARLLFTKHHNLLNRFWDKCL ELGRLPALEEFTETPEIIAAIGNAKKALKLLLQVQGEQATKVFEAAIATRREDLLVYFALCQFEQHKGYTHLPNELKRDI KVFFDTYKVAQAEAKTLLYRIANTQEIEQACIEAHQILPASKLNDGHSLELHKQFLPLLPALLRVYVGAAVQLYGELDEI DIVKIHITSGKVSFMGYDNFDTSPLPTLRERIKVKMWQLDVDFFDYVDEHSRPPLINKHLLLTSTDETYKKQLSFDKRLS KLLGLNEHDNVFMSKCEFDSKLLMLNKKIIGFTIKSVT
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 77628; Mature: 77628
Theoretical pI: Translated: 6.55; Mature: 6.55
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.0 %Cys (Translated Protein) 1.3 %Met (Translated Protein) 2.4 %Cys+Met (Translated Protein) 1.0 %Cys (Mature Protein) 1.3 %Met (Mature Protein) 2.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MDATKFNQLVSSVPLGKKLPEAIYLHKDCFPELDNSLTQFILAVGSALKIDPNEWHIVKL CCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCEEEEEE SRNEFRLSLLSYPTFFTEAYPSLTQSVTVDLNKLSHRIVDYKDSDNPPILHRKETMLPAQ ECCCEEEEHHHCCHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEECHHHCCCCH HECFDEFKAITEEGENAGLYQNSRMIGFKQSWLRTIEAHGYTLVDGRLFRSSAVIDQSNT HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEECHHHHHHHHHHHCCEEEECCEEECCCEEEECCCC TVTSIDRHKTAIVRHELSAPMKQLAKQGYLNGEHTIFDYGCGRGDDLTELEAHGLDALGW EEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCC DPNFRPEAEKVKSDLVNIGFVINVIEDKVERDEALLGAWELTEKLLVVSAMLANDKFISQ CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH FTPYKDGVITSINTFQKYYAQSELKGYIERTLDENAIAIAPGIFYLFKDKLEEQRFLSGR CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FKRHHSWKQLTTPTPTSEEQARLLFTKHHNLLNRFWDKCLELGRLPALEEFTETPEIIAA HHHCCCCHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCHHHHHH IGNAKKALKLLLQVQGEQATKVFEAAIATRREDLLVYFALCQFEQHKGYTHLPNELKRDI HCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHH KVFFDTYKVAQAEAKTLLYRIANTQEIEQACIEAHQILPASKLNDGHSLELHKQFLPLLP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH ALLRVYVGAAVQLYGELDEIDIVKIHITSGKVSFMGYDNFDTSPLPTLRERIKVKMWQLD HHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEECCEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHEEEHEEEC VDFFDYVDEHSRPPLINKHLLLTSTDETYKKQLSFDKRLSKLLGLNEHDNVFMSKCEFDS CHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHCCCC KLLMLNKKIIGFTIKSVT EEEEECCCEEEEEEECCC >Mature Secondary Structure MDATKFNQLVSSVPLGKKLPEAIYLHKDCFPELDNSLTQFILAVGSALKIDPNEWHIVKL CCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCEEEEEE SRNEFRLSLLSYPTFFTEAYPSLTQSVTVDLNKLSHRIVDYKDSDNPPILHRKETMLPAQ ECCCEEEEHHHCCHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEECHHHCCCCH HECFDEFKAITEEGENAGLYQNSRMIGFKQSWLRTIEAHGYTLVDGRLFRSSAVIDQSNT HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEECHHHHHHHHHHHCCEEEECCEEECCCEEEECCCC TVTSIDRHKTAIVRHELSAPMKQLAKQGYLNGEHTIFDYGCGRGDDLTELEAHGLDALGW EEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCC DPNFRPEAEKVKSDLVNIGFVINVIEDKVERDEALLGAWELTEKLLVVSAMLANDKFISQ CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH FTPYKDGVITSINTFQKYYAQSELKGYIERTLDENAIAIAPGIFYLFKDKLEEQRFLSGR CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FKRHHSWKQLTTPTPTSEEQARLLFTKHHNLLNRFWDKCLELGRLPALEEFTETPEIIAA HHHCCCCHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCHHHHHH IGNAKKALKLLLQVQGEQATKVFEAAIATRREDLLVYFALCQFEQHKGYTHLPNELKRDI HCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHH KVFFDTYKVAQAEAKTLLYRIANTQEIEQACIEAHQILPASKLNDGHSLELHKQFLPLLP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH ALLRVYVGAAVQLYGELDEIDIVKIHITSGKVSFMGYDNFDTSPLPTLRERIKVKMWQLD HHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEECCEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHEEEHEEEC VDFFDYVDEHSRPPLINKHLLLTSTDETYKKQLSFDKRLSKLLGLNEHDNVFMSKCEFDS CHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHCCCC KLLMLNKKIIGFTIKSVT EEEEECCCEEEEEEECCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA