| Definition | Rickettsia akari str. Hartford, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009881 |
| Length | 1,231,060 |
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The map label for this gene is ampG1 [H]
Identifier: 157825833
GI number: 157825833
Start: 692154
End: 693473
Strand: Direct
Name: ampG1 [H]
Synonym: A1C_03850
Alternate gene names: 157825833
Gene position: 692154-693473 (Clockwise)
Preceding gene: 157825828
Following gene: 157825834
Centisome position: 56.22
GC content: 29.85
Gene sequence:
>1320_bases ATGTTAAATAACTCTCGTTTATGTATTATTTGGTTGTTTGGACTTATTAGCGGTTTTAATCTAATGATTACCGGTAATAC TTTAAATTATTGGCTTGCTAAAGAAGATATAACACTGCAAACAATCGGTATATTATCATTCATAACGCTTCCCTACTCTA TTAATTTTTTGTTAGCACCGATTTTTGATACAGTGCAAATTAAATATTTAAACAAAATATTTGGTCATAGATTATCTTGG ATTTGCTTCACTAGTACTGCGTTAATATTTCTTATATATAGTTTCAGCTTTCTAGATCCTCGTACTAATCTAGTATTATT TACCTTTACGGCTTTAATTATTTCTTTTTTTAGTGCTGCCCAAGATACGATATTAAGTGCTTTAAGAACAGAAATAGTAC CTAAAGAATCGCTTGGGTTTACTTCAGGAATATATATATTCGGTTATCGGGTCGGTATGCTTTTAGCTGGTTCCGGAGCT ATTTATTTATCTATTTATTTTACATTTAATGAGATATATAAAATCTTTGCCGGCTTAGTATGTATTTATTTAATTTTATT GATTGTAGCTACTAGATATACTAATTCTTTTTGTCTCGTTGAAGAAAAAATATGTTATCCCTGCGGAAGCGGGAATCCAG AAAACAAGCAAAATAAGAATGAATTTTTGATAAAACGTTATTATTCTAATTTCTTAAAGATCTTTCTGGATTCCCGCTTC CACGGGAATGACATAGAAAGCGGCAATGACATCAGCATCTCATACTTCATTATTCTTATATTAATTTTCCTAGTATTATA TAGATTACCGGATAACTTAATCAATGTTATGATTAATCCATTTTTGCTTCATCTTGAGTATGATGCTTTTGAAATAGCAA GTGTTGGAAAGTTTTGGGGGGTTGTCGGAGCTATAATCGGCGGATTACTCGGCGGCTTTATTATGAAACATAAAAATATA TTAAACAGTATATTGTTATTTGGGATTATTCATGCTTTAGGACATATTTTATTTATTTTTCTTGAAATAAAGGGGAAAAA TTCTTTATTATTATTTATCACGATAGGAATAGAAAGTATTACCGGTGGTATGACGATGACTGCTTATATAGCTTTTATTT CTTCGCTATGCCAAGGTAAATTTCGAGCTACTCAATATTCTTGTCTTTCATCGATGATGGGAATTTCACGCTCAATTTTT CCTATAATTTCAGGCTATATGGTGGTAAATTTCGGTTGGCAAAATTTCTTTTTATTTACTACAATTATTACTATCCCGTC TTTATTAATATTATTAAAGATAAAAACTAAATTACAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AGAAGAAATTGAGAAATTAAAATAACATAATTACATTACATGCTGCAAATAAACAGAATAATCACATTTTTGTATAGCTA CAGGCGCATATATAAACTTC
Downstream 100 bases:
>100_bases TGAATGATATATTAAGTGCTTTTTTACATGGTATTGTTTTAGCTCTTGGTTTAATAATGCCGCTTGGAGTACAGAATATT TTTATATTTAATCAAGGAGC
Product: AmpG-related permease
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 439; Mature: 439
Protein sequence:
>439_residues MLNNSRLCIIWLFGLISGFNLMITGNTLNYWLAKEDITLQTIGILSFITLPYSINFLLAPIFDTVQIKYLNKIFGHRLSW ICFTSTALIFLIYSFSFLDPRTNLVLFTFTALIISFFSAAQDTILSALRTEIVPKESLGFTSGIYIFGYRVGMLLAGSGA IYLSIYFTFNEIYKIFAGLVCIYLILLIVATRYTNSFCLVEEKICYPCGSGNPENKQNKNEFLIKRYYSNFLKIFLDSRF HGNDIESGNDISISYFIILILIFLVLYRLPDNLINVMINPFLLHLEYDAFEIASVGKFWGVVGAIIGGLLGGFIMKHKNI LNSILLFGIIHALGHILFIFLEIKGKNSLLLFITIGIESITGGMTMTAYIAFISSLCQGKFRATQYSCLSSMMGISRSIF PIISGYMVVNFGWQNFFLFTTIITIPSLLILLKIKTKLQ
Sequences:
>Translated_439_residues MLNNSRLCIIWLFGLISGFNLMITGNTLNYWLAKEDITLQTIGILSFITLPYSINFLLAPIFDTVQIKYLNKIFGHRLSW ICFTSTALIFLIYSFSFLDPRTNLVLFTFTALIISFFSAAQDTILSALRTEIVPKESLGFTSGIYIFGYRVGMLLAGSGA IYLSIYFTFNEIYKIFAGLVCIYLILLIVATRYTNSFCLVEEKICYPCGSGNPENKQNKNEFLIKRYYSNFLKIFLDSRF HGNDIESGNDISISYFIILILIFLVLYRLPDNLINVMINPFLLHLEYDAFEIASVGKFWGVVGAIIGGLLGGFIMKHKNI LNSILLFGIIHALGHILFIFLEIKGKNSLLLFITIGIESITGGMTMTAYIAFISSLCQGKFRATQYSCLSSMMGISRSIF PIISGYMVVNFGWQNFFLFTTIITIPSLLILLKIKTKLQ >Mature_439_residues MLNNSRLCIIWLFGLISGFNLMITGNTLNYWLAKEDITLQTIGILSFITLPYSINFLLAPIFDTVQIKYLNKIFGHRLSW ICFTSTALIFLIYSFSFLDPRTNLVLFTFTALIISFFSAAQDTILSALRTEIVPKESLGFTSGIYIFGYRVGMLLAGSGA IYLSIYFTFNEIYKIFAGLVCIYLILLIVATRYTNSFCLVEEKICYPCGSGNPENKQNKNEFLIKRYYSNFLKIFLDSRF HGNDIESGNDISISYFIILILIFLVLYRLPDNLINVMINPFLLHLEYDAFEIASVGKFWGVVGAIIGGLLGGFIMKHKNI LNSILLFGIIHALGHILFIFLEIKGKNSLLLFITIGIESITGGMTMTAYIAFISSLCQGKFRATQYSCLSSMMGISRSIF PIISGYMVVNFGWQNFFLFTTIITIPSLLILLKIKTKLQ
Specific function: Probably Acts As A Permease In The Beta-Lactamase Induction System And In Peptidoglycan Recycling. [C]
COG id: COG0477
COG function: function code GEPR; Permeases of the major facilitator superfamily
Gene ontology:
Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the major facilitator superfamily [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1786636, Length=442, Percent_Identity=28.0542986425339, Blast_Score=196, Evalue=3e-51,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR004752 - InterPro: IPR020846 - InterPro: IPR011701 - InterPro: IPR016196 [H]
Pfam domain/function: PF07690 MFS_1 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 49635; Mature: 49635
Theoretical pI: Translated: 8.93; Mature: 8.93
Prosite motif: PS50850 MFS
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.8 %Cys (Translated Protein) 2.3 %Met (Translated Protein) 4.1 %Cys+Met (Translated Protein) 1.8 %Cys (Mature Protein) 2.3 %Met (Mature Protein) 4.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLNNSRLCIIWLFGLISGFNLMITGNTLNYWLAKEDITLQTIGILSFITLPYSINFLLAP CCCCCCCHHHHHHHHHCCCEEEEECCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IFDTVQIKYLNKIFGHRLSWICFTSTALIFLIYSFSFLDPRTNLVLFTFTALIISFFSAA HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH QDTILSALRTEIVPKESLGFTSGIYIFGYRVGMLLAGSGAIYLSIYFTFNEIYKIFAGLV HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHEECCCEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHH CIYLILLIVATRYTNSFCLVEEKICYPCGSGNPENKQNKNEFLIKRYYSNFLKIFLDSRF HHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC HGNDIESGNDISISYFIILILIFLVLYRLPDNLINVMINPFLLHLEYDAFEIASVGKFWG CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHH VVGAIIGGLLGGFIMKHKNILNSILLFGIIHALGHILFIFLEIKGKNSLLLFITIGIESI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCEEEEEEEEHHHH TGGMTMTAYIAFISSLCQGKFRATQYSCLSSMMGISRSIFPIISGYMVVNFGWQNFFLFT CCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCHHHHHH TIITIPSLLILLKIKTKLQ HHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MLNNSRLCIIWLFGLISGFNLMITGNTLNYWLAKEDITLQTIGILSFITLPYSINFLLAP CCCCCCCHHHHHHHHHCCCEEEEECCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IFDTVQIKYLNKIFGHRLSWICFTSTALIFLIYSFSFLDPRTNLVLFTFTALIISFFSAA HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH QDTILSALRTEIVPKESLGFTSGIYIFGYRVGMLLAGSGAIYLSIYFTFNEIYKIFAGLV HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHEECCCEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHH CIYLILLIVATRYTNSFCLVEEKICYPCGSGNPENKQNKNEFLIKRYYSNFLKIFLDSRF HHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC HGNDIESGNDISISYFIILILIFLVLYRLPDNLINVMINPFLLHLEYDAFEIASVGKFWG CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHH VVGAIIGGLLGGFIMKHKNILNSILLFGIIHALGHILFIFLEIKGKNSLLLFITIGIESI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCEEEEEEEEHHHH TGGMTMTAYIAFISSLCQGKFRATQYSCLSSMMGISRSIFPIISGYMVVNFGWQNFFLFT CCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCHHHHHH TIITIPSLLILLKIKTKLQ HHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA