Definition Rickettsia akari str. Hartford, complete genome.
Accession NC_009881
Length 1,231,060

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The map label for this gene is tlcB [H]

Identifier: 157825646

GI number: 157825646

Start: 513830

End: 515353

Strand: Reverse

Name: tlcB [H]

Synonym: A1C_02830

Alternate gene names: 157825646

Gene position: 515353-513830 (Counterclockwise)

Preceding gene: 157825647

Following gene: 157825645

Centisome position: 41.86

GC content: 31.96

Gene sequence:

>1524_bases
ATGGATGCCGTGGATTCTAACTTCACAATTTGGAATAAAGCCAGAAACAGTAAATTTAGGCATGTAGTGTGGCCAATTAG
ATCGTATGAATTAACCAAGTTCATCCCGATGGCTTTACTAATGTTTTTTATTCTACTTAATCAAAACTTAGTTCGTAGTA
TTAAAGATAGTTTTGTTGTTACCTTAATTAGCTCGGAAGTATTGAGTTTTATCAAACTTTGGGGCGAAATGCCGATGGGA
ATTTTATTTGTTATTCTTTATTCTAAACTCTGTAATATTATGACAACAGAGCAAGTGTTTAGGATAATTACCGGTACTTT
TTTATTTTTCTTCGCAATTTTTGGTTTTATTTTATTTCCGTACAAAGATTTTTTTCATCCTGATCCTGAATTAATTAAGC
ACTATATCACTGTTCTTCCTCACTTAAAATGGTTTTTAATAATTTGGGGACAGTGGAGTTTAGTATTATTCTATATTATG
GGAGAATTATGGCCAGTTATAGTCTTTACTCTTTTATATTGGCAGCTTGCAAATAAAATTACTAAAGTCGAAGAAGCACC
AAGATTTTACTCATTTTTTACTTTATTCGGACAAACGAATTTACTCATATCAGGAACCGTAATTATTTATTTTGCTAAGA
GTGAGCATTTCTTATTACCTTTATTTTCTTATCTAAACGATACAAACGAAATCCTTTTGAAATCATTTATTACGGTTATT
TTAATATCCGGATTAATTTGCCTAGCTCTTCATAAACTTATTGATAAATCAGTAGTAGAAGCAGATAAAAATATTAAATT
TAAAAACCAAAGAACGGATATATTAAAATTAAGCTTGATCGAAAGTGCAAAAGTAATATTCACTTCTAGATATCTCGGTT
TTATTTGTCTTCTTGTAATGTCTTATTCTATGAGCATTAGCCTCATAGAAGGATTATGGATGTCAAAAGTAAAACAACTC
TATCCTGCTACAAAGGATTTTATATCCTATCACGGTGAAGTGTTTTTTTGGACGGGAGTACTCACGTTAGTTAGTGCGTT
TTTAGGAAGTAGTTTAATTAGAATATGCGGATGGTTTTGGGGAGCTATTATAACACCGATTATGATGTTTGGAGCAGGCG
TTATGTTCTTTTCATTCACGGTGTTTGAAAATCACCTAGGAAATATCATAAATACTCTCGGCTATAGTTCACCGCTTGTC
GTTATAGTTTTTATCGGCGGACTTTGGCATGTACTTTCTAAATCCGTAAAATATTCACTTTTCGATGCTACTAAAGAAAT
GGTATATATTCCTCTCGATAGTGAAATCAAGACTAAAGGTAAAGCTGCTGTTGATGTTATGGGTACTAAAATCGGTAAAT
CAATAGGTGCTATTATTCAATTCATATCCTTTAGTATGTTCCCGAACGCCGTACATAACGACATAGCAGGTTTATTGATG
TTTAGTTTTATTATCGTATGTCTATTATGGCTATATGGAGTGAAAGTTTTATCGGCACACTATAATAAGATGATCAAACG
TTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CAACTCAAGAAGTGTCTTACTCTATGTCATGCGCGCAAGCAGGAATGACATATAATAAAAACTATCCGGTACTTAAAAAA
AATAAGCTCATACTAAATCA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAATTTTGTGGATCATCCTGCAAGACATTGCAAGCGTGAATACTAAATTGTAATTGCAAGCGCGCTTGTTGCGTATATCA
ATTGTACCTCTATCACTCCG

Product: ADP,ATP carrier protein

Products: NA

Alternate protein names: ADP/ATP translocase 2 [H]

Number of amino acids: Translated: 507; Mature: 507

Protein sequence:

>507_residues
MDAVDSNFTIWNKARNSKFRHVVWPIRSYELTKFIPMALLMFFILLNQNLVRSIKDSFVVTLISSEVLSFIKLWGEMPMG
ILFVILYSKLCNIMTTEQVFRIITGTFLFFFAIFGFILFPYKDFFHPDPELIKHYITVLPHLKWFLIIWGQWSLVLFYIM
GELWPVIVFTLLYWQLANKITKVEEAPRFYSFFTLFGQTNLLISGTVIIYFAKSEHFLLPLFSYLNDTNEILLKSFITVI
LISGLICLALHKLIDKSVVEADKNIKFKNQRTDILKLSLIESAKVIFTSRYLGFICLLVMSYSMSISLIEGLWMSKVKQL
YPATKDFISYHGEVFFWTGVLTLVSAFLGSSLIRICGWFWGAIITPIMMFGAGVMFFSFTVFENHLGNIINTLGYSSPLV
VIVFIGGLWHVLSKSVKYSLFDATKEMVYIPLDSEIKTKGKAAVDVMGTKIGKSIGAIIQFISFSMFPNAVHNDIAGLLM
FSFIIVCLLWLYGVKVLSAHYNKMIKR

Sequences:

>Translated_507_residues
MDAVDSNFTIWNKARNSKFRHVVWPIRSYELTKFIPMALLMFFILLNQNLVRSIKDSFVVTLISSEVLSFIKLWGEMPMG
ILFVILYSKLCNIMTTEQVFRIITGTFLFFFAIFGFILFPYKDFFHPDPELIKHYITVLPHLKWFLIIWGQWSLVLFYIM
GELWPVIVFTLLYWQLANKITKVEEAPRFYSFFTLFGQTNLLISGTVIIYFAKSEHFLLPLFSYLNDTNEILLKSFITVI
LISGLICLALHKLIDKSVVEADKNIKFKNQRTDILKLSLIESAKVIFTSRYLGFICLLVMSYSMSISLIEGLWMSKVKQL
YPATKDFISYHGEVFFWTGVLTLVSAFLGSSLIRICGWFWGAIITPIMMFGAGVMFFSFTVFENHLGNIINTLGYSSPLV
VIVFIGGLWHVLSKSVKYSLFDATKEMVYIPLDSEIKTKGKAAVDVMGTKIGKSIGAIIQFISFSMFPNAVHNDIAGLLM
FSFIIVCLLWLYGVKVLSAHYNKMIKR
>Mature_507_residues
MDAVDSNFTIWNKARNSKFRHVVWPIRSYELTKFIPMALLMFFILLNQNLVRSIKDSFVVTLISSEVLSFIKLWGEMPMG
ILFVILYSKLCNIMTTEQVFRIITGTFLFFFAIFGFILFPYKDFFHPDPELIKHYITVLPHLKWFLIIWGQWSLVLFYIM
GELWPVIVFTLLYWQLANKITKVEEAPRFYSFFTLFGQTNLLISGTVIIYFAKSEHFLLPLFSYLNDTNEILLKSFITVI
LISGLICLALHKLIDKSVVEADKNIKFKNQRTDILKLSLIESAKVIFTSRYLGFICLLVMSYSMSISLIEGLWMSKVKQL
YPATKDFISYHGEVFFWTGVLTLVSAFLGSSLIRICGWFWGAIITPIMMFGAGVMFFSFTVFENHLGNIINTLGYSSPLV
VIVFIGGLWHVLSKSVKYSLFDATKEMVYIPLDSEIKTKGKAAVDVMGTKIGKSIGAIIQFISFSMFPNAVHNDIAGLLM
FSFIIVCLLWLYGVKVLSAHYNKMIKR

Specific function: Provides the rickettsial cell with host ATP in exchange for rickettsial ADP. This is an obligate exchange system. This energy acquiring activity is an important component of rickettsial parasitism [H]

COG id: COG3202

COG function: function code C; ATP/ADP translocase

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the ADP/ATP translocase tlc family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004667 [H]

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 58283; Mature: 58283

Theoretical pI: Translated: 9.68; Mature: 9.68

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
3.6 %Met     (Translated Protein)
4.5 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
3.6 %Met     (Mature Protein)
4.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MDAVDSNFTIWNKARNSKFRHVVWPIRSYELTKFIPMALLMFFILLNQNLVRSIKDSFVV
CCCCCCCCEEEEHHCCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHH
TLISSEVLSFIKLWGEMPMGILFVILYSKLCNIMTTEQVFRIITGTFLFFFAIFGFILFP
HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YKDFFHPDPELIKHYITVLPHLKWFLIIWGQWSLVLFYIMGELWPVIVFTLLYWQLANKI
HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TKVEEAPRFYSFFTLFGQTNLLISGTVIIYFAKSEHFLLPLFSYLNDTNEILLKSFITVI
HHHHHCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH
LISGLICLALHKLIDKSVVEADKNIKFKNQRTDILKLSLIESAKVIFTSRYLGFICLLVM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SYSMSISLIEGLWMSKVKQLYPATKDFISYHGEVFFWTGVLTLVSAFLGSSLIRICGWFW
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GAIITPIMMFGAGVMFFSFTVFENHLGNIINTLGYSSPLVVIVFIGGLWHVLSKSVKYSL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FDATKEMVYIPLDSEIKTKGKAAVDVMGTKIGKSIGAIIQFISFSMFPNAVHNDIAGLLM
HHCCCCEEEEECCCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
FSFIIVCLLWLYGVKVLSAHYNKMIKR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MDAVDSNFTIWNKARNSKFRHVVWPIRSYELTKFIPMALLMFFILLNQNLVRSIKDSFVV
CCCCCCCCEEEEHHCCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHH
TLISSEVLSFIKLWGEMPMGILFVILYSKLCNIMTTEQVFRIITGTFLFFFAIFGFILFP
HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YKDFFHPDPELIKHYITVLPHLKWFLIIWGQWSLVLFYIMGELWPVIVFTLLYWQLANKI
HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TKVEEAPRFYSFFTLFGQTNLLISGTVIIYFAKSEHFLLPLFSYLNDTNEILLKSFITVI
HHHHHCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH
LISGLICLALHKLIDKSVVEADKNIKFKNQRTDILKLSLIESAKVIFTSRYLGFICLLVM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SYSMSISLIEGLWMSKVKQLYPATKDFISYHGEVFFWTGVLTLVSAFLGSSLIRICGWFW
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GAIITPIMMFGAGVMFFSFTVFENHLGNIINTLGYSSPLVVIVFIGGLWHVLSKSVKYSL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FDATKEMVYIPLDSEIKTKGKAAVDVMGTKIGKSIGAIIQFISFSMFPNAVHNDIAGLLM
HHCCCCEEEEECCCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
FSFIIVCLLWLYGVKVLSAHYNKMIKR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA