Definition | Escherichia coli HS, complete genome. |
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Accession | NC_009800 |
Length | 4,643,538 |
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The map label for this gene is yjgN [H]
Identifier: 157163732
GI number: 157163732
Start: 4515915
End: 4517111
Strand: Direct
Name: yjgN [H]
Synonym: EcHS_A4513
Alternate gene names: 157163732
Gene position: 4515915-4517111 (Clockwise)
Preceding gene: 157163730
Following gene: 157163736
Centisome position: 97.25
GC content: 37.34
Gene sequence:
>1197_bases ATGGCTCAAGTTATTAATGAAATGGATGTTCCGTCCCATTCGTTTGTTTTTCATGGTACAGGTGAGAGATATTTTCTTAT TTGTGTGGTGAATGTGTTGTTAACGATTATAACGCTAGGTATCTATTTGCCATGGGCATTAATGAAATGTAAGCGTTATC TCTATGCTAATATGGAAGTTAACGGACAACGATTTTCTTATGGAATTACTGGTGGGAATGTTTTTGTTAGTTGTCTTGTT TTTGTTTTTTGCTATTTCGCAATCTTAATGACAGTGTCAGCAGATATGCCACTTGTTGGCTGTGTTTTGACTTTGTTACT GTTGGTTTTGCTTATATTTATGGCAGCAAAAGGACTGCGTTATCAGGCCTTGATGACCAGTCTCAACGGCGTAAGATTTA GTTTTAATTGCTCTATGAAAGGGTTCTGGTGGGTAACCTTTTTCTTGCCGATTTTAATGGCCATTGGGATGGGGACTGTT TTCTTTATCTCGACAAAGATGCTACATGCCAATAGTTCAAGTAGTGTTATTATATCTGTGGTTCTGATGGCAATAGTTGG TATTGTTTCCATTGGTATTTTTAATGGTACTTTATATAGCCTGGTAATGAGTTTTCTCTGGAGCAATACCAGTTTCGGTA TACATCGTTTCAAGGTGAAATTAGATACTACGTATTGTATAAAATATGCCATTCTCGCATTTTTAGCTTTATTACCTTTT CTCGCTGTTGCTGGTTATATTATCTTCGATCAAATATTAAATGCATATGATAGTTCTGTGTATGCAAATGATGATATTGA GAATTTACAGCAATTTATGGAAATGCAACGTAAAATGATAATCGCGCAGTTAATCTATTATTTTGGGATTGCTGTTAGCA CCAGTTATTTAACGGTGTCGTTGCGAAATCATTTTATGAGCAACCTGTCACTGAATGATGGGCGTATTCGTTTTCGCTCA ACTTTAACGTACCACGGTATGCTTTATCGCATGTGTGCGTTGGTGGTGATATCCGGGATTACGGGCGGTCTGGCTTATCC ACTGCTGAAATTATGGATGATTGACTGGCAGGCAAAAAATACGTATTTGCTGGGCGATTTGGATGACCTTCCTTTAATCA ATAAAGAAGAACAACCAGATAAAGGCTTCTTAGCCAGGATTTCACGGGGAATTATGCCTTCTTTACCATTTCTGTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TGCCAGCCTATTACTGATAAGAGTATTGTAACGTGGCAGAACATTTTGCTGTCTGTATATATAAATTATATCAATGGATT TTTTAATTCAGGGAATTTTT
Downstream 100 bases:
>100_bases GAGATAAAAAAGGCCGGAGCATGCTCCGGCCTTCGTTTTCATTACTGTGTTTTGATTACAGCGCGGCGATAACAGCCTGC TGTTCAATCAGCTTCGCTTT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 398; Mature: 397
Protein sequence:
>398_residues MAQVINEMDVPSHSFVFHGTGERYFLICVVNVLLTIITLGIYLPWALMKCKRYLYANMEVNGQRFSYGITGGNVFVSCLV FVFCYFAILMTVSADMPLVGCVLTLLLLVLLIFMAAKGLRYQALMTSLNGVRFSFNCSMKGFWWVTFFLPILMAIGMGTV FFISTKMLHANSSSSVIISVVLMAIVGIVSIGIFNGTLYSLVMSFLWSNTSFGIHRFKVKLDTTYCIKYAILAFLALLPF LAVAGYIIFDQILNAYDSSVYANDDIENLQQFMEMQRKMIIAQLIYYFGIAVSTSYLTVSLRNHFMSNLSLNDGRIRFRS TLTYHGMLYRMCALVVISGITGGLAYPLLKLWMIDWQAKNTYLLGDLDDLPLINKEEQPDKGFLARISRGIMPSLPFL
Sequences:
>Translated_398_residues MAQVINEMDVPSHSFVFHGTGERYFLICVVNVLLTIITLGIYLPWALMKCKRYLYANMEVNGQRFSYGITGGNVFVSCLV FVFCYFAILMTVSADMPLVGCVLTLLLLVLLIFMAAKGLRYQALMTSLNGVRFSFNCSMKGFWWVTFFLPILMAIGMGTV FFISTKMLHANSSSSVIISVVLMAIVGIVSIGIFNGTLYSLVMSFLWSNTSFGIHRFKVKLDTTYCIKYAILAFLALLPF LAVAGYIIFDQILNAYDSSVYANDDIENLQQFMEMQRKMIIAQLIYYFGIAVSTSYLTVSLRNHFMSNLSLNDGRIRFRS TLTYHGMLYRMCALVVISGITGGLAYPLLKLWMIDWQAKNTYLLGDLDDLPLINKEEQPDKGFLARISRGIMPSLPFL >Mature_397_residues AQVINEMDVPSHSFVFHGTGERYFLICVVNVLLTIITLGIYLPWALMKCKRYLYANMEVNGQRFSYGITGGNVFVSCLVF VFCYFAILMTVSADMPLVGCVLTLLLLVLLIFMAAKGLRYQALMTSLNGVRFSFNCSMKGFWWVTFFLPILMAIGMGTVF FISTKMLHANSSSSVIISVVLMAIVGIVSIGIFNGTLYSLVMSFLWSNTSFGIHRFKVKLDTTYCIKYAILAFLALLPFL AVAGYIIFDQILNAYDSSVYANDDIENLQQFMEMQRKMIIAQLIYYFGIAVSTSYLTVSLRNHFMSNLSLNDGRIRFRST LTYHGMLYRMCALVVISGITGGLAYPLLKLWMIDWQAKNTYLLGDLDDLPLINKEEQPDKGFLARISRGIMPSLPFL
Specific function: Unknown
COG id: COG4269
COG function: function code S; Predicted membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]
Metaboloic importance: Unknown [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI48995003, Length=398, Percent_Identity=97.7386934673367, Blast_Score=694, Evalue=0.0,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR010295 [H]
Pfam domain/function: PF05987 DUF898 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 44899; Mature: 44768
Theoretical pI: Translated: 8.80; Mature: 8.80
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
2.0 %Cys (Translated Protein) 5.5 %Met (Translated Protein) 7.5 %Cys+Met (Translated Protein) 2.0 %Cys (Mature Protein) 5.3 %Met (Mature Protein) 7.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MAQVINEMDVPSHSFVFHGTGERYFLICVVNVLLTIITLGIYLPWALMKCKRYLYANMEV CCCHHHHCCCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEE NGQRFSYGITGGNVFVSCLVFVFCYFAILMTVSADMPLVGCVLTLLLLVLLIFMAAKGLR CCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH YQALMTSLNGVRFSFNCSMKGFWWVTFFLPILMAIGMGTVFFISTKMLHANSSSSVIISV HHHHHHHHCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHH VLMAIVGIVSIGIFNGTLYSLVMSFLWSNTSFGIHRFKVKLDTTYCIKYAILAFLALLPF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHH LAVAGYIIFDQILNAYDSSVYANDDIENLQQFMEMQRKMIIAQLIYYFGIAVSTSYLTVS HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LRNHFMSNLSLNDGRIRFRSTLTYHGMLYRMCALVVISGITGGLAYPLLKLWMIDWQAKN HHHHHHHCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHEEECCC TYLLGDLDDLPLINKEEQPDKGFLARISRGIMPSLPFL EEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure AQVINEMDVPSHSFVFHGTGERYFLICVVNVLLTIITLGIYLPWALMKCKRYLYANMEV CCHHHHCCCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEE NGQRFSYGITGGNVFVSCLVFVFCYFAILMTVSADMPLVGCVLTLLLLVLLIFMAAKGLR CCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH YQALMTSLNGVRFSFNCSMKGFWWVTFFLPILMAIGMGTVFFISTKMLHANSSSSVIISV HHHHHHHHCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHH VLMAIVGIVSIGIFNGTLYSLVMSFLWSNTSFGIHRFKVKLDTTYCIKYAILAFLALLPF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHH LAVAGYIIFDQILNAYDSSVYANDDIENLQQFMEMQRKMIIAQLIYYFGIAVSTSYLTVS HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LRNHFMSNLSLNDGRIRFRSTLTYHGMLYRMCALVVISGITGGLAYPLLKLWMIDWQAKN HHHHHHHCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHEEECCC TYLLGDLDDLPLINKEEQPDKGFLARISRGIMPSLPFL EEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 11206551; 11258796 [H]