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The map label for this gene is ypbD

Identifier: 15673467

GI number: 15673467

Start: 1514246

End: 1515991

Strand: Reverse

Name: ypbD

Synonym: L113994

Alternate gene names: NA

Gene position: 1515991-1514246 (Counterclockwise)

Preceding gene: 15673468

Following gene: 15673464

Centisome position: 64.09

GC content: 37.11

Gene sequence:

>1746_bases
ATGGTTGACAATGAAAAAATAAATTTTTTTAGGGAATTTTTTAGTTTCAAAACAAACAAAGCAGAAGGAGTAATTGGGTT
TCATCGAGCTTTAGGAATTGGTTCATGGGATATGTTTAATGGAGGAACTGGTGGCCTTATTGGTTCCTGGCTCTTATATT
TTATGACCTCTTTTGGTGGGGTTAATCCTGGATTAGCTGCACTTTTAATTTCAGCTCGACTCGTTATAGATATGTTCTGG
GCTCCTGCCGTTGCTGTTATTTCAGATAATTTTTATCACTTTGCACTCGGCCTAAAATATGGGCGTAGACGCTTCTTTTT
GATTTTTGCAATTCCAACTTCGATTGCTTTTGCAGCGATGTGGATTCCAATGGCAGGTGGCCTTTCTTGGCTTTATTATC
TTGTGTCATTTATACTTTTTGACTTTTGTTTGGATTTAGTTCTCATTCCTTGGGAAGCTATCCCTGCAGAAATTACCTCT
ACATATACACAACGTAATAAAATGGGGTCAATCAGAATGTGGGCTTCAGGTTTAGCACAACCCTTAATCGCTTTTGTCCC
AACTCTCTTTATGAAACTTTTACCTGCTGAACATGGAATGCAAACTTCCGCCTGGGCCTTATTTGCAACAGCTTGTGTTT
GGGGTGTGATTGGGATTATATTTACACTCTTTGTTTACTTTTCTTCTTGGGACCCTATTCTGATTTCTAAAGAAAAGATA
GAACTTATGTTGCGACACTTAGATGAAGAAAGAAAACGAGCTAAAACTCCTGCTAGGTTATTCTTGGAAAATATTGCTAA
TTTACTTTTAACCTTAAGGATTAAAACTTTTCGTAAACATCTAGTTCTTTATTTCTCTACTTTTGGGATTATTGATTCTT
TTACAGCTATTTTTGTTATCTTTGCGACGATTTCGTTTTTGCCAACTCTAACACTTGATCCAGCGCAAGCAGCTCTTATT
TTAGCGACACCCTTATTGATTATGACAATTGCATATACACCATTTGGAGCATGGCTTTTTAATCACCCCAAAATTGGACC
ACGCCTGCTTTACCTAATTGGTTTTGGCATTGGTATTTTAGCATGTATCACTTATGGTATTGTTTATTTCACAAGAGGAA
GTTTATCAGAAGCTCAGATTACGGGACTCATCATTTTTACAACTTGTGTTTTCACTGTGGGTCGTAACATCATTGGGGGC
CTTCCTTGGGTCGTCTTTCCTTTAATTCCTGATATTGATATGATCATTCATAAAGAACAGCGGGCAGGAGTTTTTGCTGG
AGCTATGACTTTTGTACGTAAATTCACTAATATTGTCTTTAATGTTGTCATTGGAGCGGTTATGGGAGCTGCTGGATATA
ACCAACATGTTTCTAATGTGGCAGACAAAATGTCAAATTATGTACAAGTGCACCATGTGACGACCAGACAAGCTTTTCAC
CATTTGGTAACAAGTTCTACTTTAGAACATCAGATTCAAAGTGCGGGCTTTGGAATTGCTATGCTGATGACGTTTTTAGT
TGGAGGCTTGATGCTGATTGCTTTATGGAATGCTTTTACTTTTAAACTTAATTCAAAAACACATGCTATTTTGGTTGAAG
AAATTTCACGTCTACAAAAGGCTGATTCGATTGGGGGAGAAGTGGCAGTAAAAAATGCTAAAGAGTCAGCTGACCTCAAA
ACAAAACAAACAATTGAAGCTTTATCAGGCTTAAATTATGATAAATACGTCTGGACTGGAAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TATGTTTTGCAATATTTAAGAGTAAAAAATCTTTAATTTGCAACCTAATATAATTGTAACTTTTTACTTTCAAGAAATAT
ATTTAAATTTGGAGAAGGTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TATATAAAAAAACGAGGCCATAAATTTCCTCGTTTTTAATATATTATTCAGCAACGGCTAATTCAGGTTGATTTTCCATA
AGTTTACCATTGTTTAATTT

Product: sugar transport symporter

Products: NA

Alternate protein names: Facilitator Superfamily Transporter; Na-Galactoside Symporter; Olgogalacturonide Transporter; Melibiose Carrier Protein; Rhamnogalacturonide Transporter RhiT; NaGalactoside Symporter Family Permease; Na+/Melibiose Symporter; SugarCation Symporter Family Protein; Sugar Transport Symporter; Facilitator Transporter; Facilitator Family Transporter; Xyloside Transporter; Sugar Transporter

Number of amino acids: Translated: 581; Mature: 581

Protein sequence:

>581_residues
MVDNEKINFFREFFSFKTNKAEGVIGFHRALGIGSWDMFNGGTGGLIGSWLLYFMTSFGGVNPGLAALLISARLVIDMFW
APAVAVISDNFYHFALGLKYGRRRFFLIFAIPTSIAFAAMWIPMAGGLSWLYYLVSFILFDFCLDLVLIPWEAIPAEITS
TYTQRNKMGSIRMWASGLAQPLIAFVPTLFMKLLPAEHGMQTSAWALFATACVWGVIGIIFTLFVYFSSWDPILISKEKI
ELMLRHLDEERKRAKTPARLFLENIANLLLTLRIKTFRKHLVLYFSTFGIIDSFTAIFVIFATISFLPTLTLDPAQAALI
LATPLLIMTIAYTPFGAWLFNHPKIGPRLLYLIGFGIGILACITYGIVYFTRGSLSEAQITGLIIFTTCVFTVGRNIIGG
LPWVVFPLIPDIDMIIHKEQRAGVFAGAMTFVRKFTNIVFNVVIGAVMGAAGYNQHVSNVADKMSNYVQVHHVTTRQAFH
HLVTSSTLEHQIQSAGFGIAMLMTFLVGGLMLIALWNAFTFKLNSKTHAILVEEISRLQKADSIGGEVAVKNAKESADLK
TKQTIEALSGLNYDKYVWTGK

Sequences:

>Translated_581_residues
MVDNEKINFFREFFSFKTNKAEGVIGFHRALGIGSWDMFNGGTGGLIGSWLLYFMTSFGGVNPGLAALLISARLVIDMFW
APAVAVISDNFYHFALGLKYGRRRFFLIFAIPTSIAFAAMWIPMAGGLSWLYYLVSFILFDFCLDLVLIPWEAIPAEITS
TYTQRNKMGSIRMWASGLAQPLIAFVPTLFMKLLPAEHGMQTSAWALFATACVWGVIGIIFTLFVYFSSWDPILISKEKI
ELMLRHLDEERKRAKTPARLFLENIANLLLTLRIKTFRKHLVLYFSTFGIIDSFTAIFVIFATISFLPTLTLDPAQAALI
LATPLLIMTIAYTPFGAWLFNHPKIGPRLLYLIGFGIGILACITYGIVYFTRGSLSEAQITGLIIFTTCVFTVGRNIIGG
LPWVVFPLIPDIDMIIHKEQRAGVFAGAMTFVRKFTNIVFNVVIGAVMGAAGYNQHVSNVADKMSNYVQVHHVTTRQAFH
HLVTSSTLEHQIQSAGFGIAMLMTFLVGGLMLIALWNAFTFKLNSKTHAILVEEISRLQKADSIGGEVAVKNAKESADLK
TKQTIEALSGLNYDKYVWTGK
>Mature_581_residues
MVDNEKINFFREFFSFKTNKAEGVIGFHRALGIGSWDMFNGGTGGLIGSWLLYFMTSFGGVNPGLAALLISARLVIDMFW
APAVAVISDNFYHFALGLKYGRRRFFLIFAIPTSIAFAAMWIPMAGGLSWLYYLVSFILFDFCLDLVLIPWEAIPAEITS
TYTQRNKMGSIRMWASGLAQPLIAFVPTLFMKLLPAEHGMQTSAWALFATACVWGVIGIIFTLFVYFSSWDPILISKEKI
ELMLRHLDEERKRAKTPARLFLENIANLLLTLRIKTFRKHLVLYFSTFGIIDSFTAIFVIFATISFLPTLTLDPAQAALI
LATPLLIMTIAYTPFGAWLFNHPKIGPRLLYLIGFGIGILACITYGIVYFTRGSLSEAQITGLIIFTTCVFTVGRNIIGG
LPWVVFPLIPDIDMIIHKEQRAGVFAGAMTFVRKFTNIVFNVVIGAVMGAAGYNQHVSNVADKMSNYVQVHHVTTRQAFH
HLVTSSTLEHQIQSAGFGIAMLMTFLVGGLMLIALWNAFTFKLNSKTHAILVEEISRLQKADSIGGEVAVKNAKESADLK
TKQTIEALSGLNYDKYVWTGK

Specific function: Unknown

COG id: COG2211

COG function: function code G; Na+/melibiose symporter and related transporters

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 64707; Mature: 64707

Theoretical pI: Translated: 9.69; Mature: 9.69

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
3.3 %Met     (Translated Protein)
4.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
3.3 %Met     (Mature Protein)
4.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MVDNEKINFFREFFSFKTNKAEGVIGFHRALGIGSWDMFNGGTGGLIGSWLLYFMTSFGG
CCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCC
VNPGLAALLISARLVIDMFWAPAVAVISDNFYHFALGLKYGRRRFFLIFAIPTSIAFAAM
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEEEEHHHCCEEEEEEEEEHHHHHHHHH
WIPMAGGLSWLYYLVSFILFDFCLDLVLIPWEAIPAEITSTYTQRNKMGSIRMWASGLAQ
HHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH
PLIAFVPTLFMKLLPAEHGMQTSAWALFATACVWGVIGIIFTLFVYFSSWDPILISKEKI
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECHHHH
ELMLRHLDEERKRAKTPARLFLENIANLLLTLRIKTFRKHLVLYFSTFGIIDSFTAIFVI
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FATISFLPTLTLDPAQAALILATPLLIMTIAYTPFGAWLFNHPKIGPRLLYLIGFGIGIL
HHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
ACITYGIVYFTRGSLSEAQITGLIIFTTCVFTVGRNIIGGLPWVVFPLIPDIDMIIHKEQ
HHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCHHHHEECHH
RAGVFAGAMTFVRKFTNIVFNVVIGAVMGAAGYNQHVSNVADKMSNYVQVHHVTTRQAFH
HCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEEEEHHHHHHHH
HLVTSSTLEHQIQSAGFGIAMLMTFLVGGLMLIALWNAFTFKLNSKTHAILVEEISRLQK
HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCHHHHHHHHHHHHHH
ADSIGGEVAVKNAKESADLKTKQTIEALSGLNYDKYVWTGK
HHCCCCCEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCC
>Mature Secondary Structure
MVDNEKINFFREFFSFKTNKAEGVIGFHRALGIGSWDMFNGGTGGLIGSWLLYFMTSFGG
CCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCC
VNPGLAALLISARLVIDMFWAPAVAVISDNFYHFALGLKYGRRRFFLIFAIPTSIAFAAM
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEEEEHHHCCEEEEEEEEEHHHHHHHHH
WIPMAGGLSWLYYLVSFILFDFCLDLVLIPWEAIPAEITSTYTQRNKMGSIRMWASGLAQ
HHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH
PLIAFVPTLFMKLLPAEHGMQTSAWALFATACVWGVIGIIFTLFVYFSSWDPILISKEKI
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECHHHH
ELMLRHLDEERKRAKTPARLFLENIANLLLTLRIKTFRKHLVLYFSTFGIIDSFTAIFVI
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FATISFLPTLTLDPAQAALILATPLLIMTIAYTPFGAWLFNHPKIGPRLLYLIGFGIGIL
HHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
ACITYGIVYFTRGSLSEAQITGLIIFTTCVFTVGRNIIGGLPWVVFPLIPDIDMIIHKEQ
HHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCHHHHEECHH
RAGVFAGAMTFVRKFTNIVFNVVIGAVMGAAGYNQHVSNVADKMSNYVQVHHVTTRQAFH
HCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEEEEHHHHHHHH
HLVTSSTLEHQIQSAGFGIAMLMTFLVGGLMLIALWNAFTFKLNSKTHAILVEEISRLQK
HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCHHHHHHHHHHHHHH
ADSIGGEVAVKNAKESADLKTKQTIEALSGLNYDKYVWTGK
HHCCCCCEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA