Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is ymjE

Identifier: 15673247

GI number: 15673247

Start: 1296101

End: 1298575

Strand: Reverse

Name: ymjE

Synonym: L95846

Alternate gene names: 15673247

Gene position: 1298575-1296101 (Counterclockwise)

Preceding gene: 15673248

Following gene: 15673246

Centisome position: 54.89

GC content: 30.79

Gene sequence:

>2475_bases
ATGAAAAATAAAAAAATTAATTTAAAGTCTTTCCAGTCTGTCTGTCTCATTTTTATCTTCCTTTTTAATTTTGAGTTTAT
TTTCCGCTTATCAAATTTTACTTCTAGAGAAAAATTCTTTACCATTTTCTTTTTTGTGGCTCCTTTGATGCTTAGCTCAT
TTTTTATCATTACGGATAGCGAAAAAATTCCGAATTCAGTTAGAAATTTGAGTATTCTCGGTGTCTTTGGTTTCCTGATG
TATGGTTCCAATCGCTTAATCGTTTCCTTGACTTACCTCATAGGTGGGGAACATGCTGTTCCACAGTTATTTCCCTTCCG
ATTTTTGATTGCTATCTTCATTTTACTTTGTTGTGCTTTAGCTTATTATGTTTCAACAAAGAAGATGTTAATTTATAAAT
TGGCAACATTGATTGCTTCTTTGTGGTTCGTTACATTGCCAATTATAACGATTCAATTCATTATTAAATTCTTGGTTGAA
CATCAAGGGTTTGATTTCTCGATTGTCAGTAATATGGATATCAGGTATCTGATTGTACCATTTATGCCAATCATGTATTT
GAGTTTTTGTAAATTTAGTGGGATTGATGCCAAACAATTAGGAAAGAATATCAAATATACGGTTTATGTGCTCTTAGTTG
TCTACATCGTTGCATTAATCGTTTATTCAGGAACTCAAGTAAATATTACCTTTAATTTTGCTCAAGAAGGTTTCTTTAAT
AGCATTGAGCTTAATTATAATGTCTTTTTGGCACATTGGATAGAAGGATTGACTGTATTTTCTCAATTCGTCCTACCAAT
TATTGCTTTTGCTTTAGTTATTGGATATAAGGGAGAAAAATCAAAGAAAAAGATACTGTCATTAAAACCAATTTATGTAT
TAATACTGGTTACTCTGGGAGTTTATGCTTATCTTTTCCTTCTTAATCCACCAACTAATTTTATTCATTTTAATAACAAA
ATTTTTAATAGTTATTTTGCGCTACAAATTTTTGAAGTTGTTGTGATTATGCTTTTGACAATCTATACAGGTTTGAAAAA
ATTTATCAGACCAAGAACGAAGATATTGCTATATATTGGTTCAAGCTTGCCTTTCCTCTATTTATATATTGTAAGATATC
ATTATTGGAAACAAAGTTATTTGGTTTTTGATATTTTTGACCGTATCAATTATATTTTCTTTCTTTTTTCAATTTTTGTT
TTTCTTTATTATACTGTGGAAGTCTTCATTCTTTGGTATTCTTATAGTAAAAGACAAAGAATTAACGCTCTTACTTTAAA
AAATGAAGGACTAAAAAAGCAGTTCCATATCTATGTTTTAATCCCATGTCTGAATGAAGAATTAGTGATTCAAACAACTT
TAAAAAGTATTTTAAAAAATGATTACGAAAATCTAGTGGTAACTGTTATTGATGATGCAAGTGATGATCGGAGCTTAGAA
AAAATTTCTGAAATTCAAGATTCTCGATTGAATGTTCTAAGACGTATTAAACCTAATGCGCAAAAAGGAAAAGGGACGGC
TTTGAATTGGGCTTATTATCAAATTAGTGAGCAAATTCAAGAAGCTGGAATTGCTCCGGAGGATGTTCTTATTGCGATAA
TTGATGCCGATACAAAACTTGATAACAATTATTTTGAAAAAGTAAATATGGCTTTCAATCATGATGCTAAGCTTACTGGT
TTGCAATCCAAGGTTCGTGTTGCCAATTTGATTAAAGATGCTTCACAAGACTTGGAATTTTCTGAAATTATCAATGCGAC
ACAGATGTTTCGGACTTTGACCAATACAGTTGCTTTTGGTGGAAATGGACAGTTCTGTAAATTAAGTACTCTTCAGGCAT
TGAATGAAGACCCTTGGACAGATTCACTTGTTGAAGATTTTGATTTATCAACTCGTCTCTTTCTGTCAGATATTGAAGTT
AAAAATGCTCAATTTGATGATATTTACATTGAACAGACAGGGATTATCAATGATAATGAAGCTTTGGTTAAACAACGAGT
GCGATGGGCACAGGGAAATATTCAATCTTCAAAATATATTTTACCGACGATTCGGTCAAAAAAATTGCAGAATAAACAGA
AGTTTGAATTATTGATGACCCTACTGAAACCTTGGTTAATGGGGATTGAATATATCATTGTAATTTATACACTGATTATG
ATTGTTAATTCTGCTATCCTATCAGGGATTACTCAATCACTTAAAATTGTTGTTGTGCTTTTTATCGTGATGTCAATTTA
TATTATCTTTGTGAATTTTGTATGGGCTATTCTTTATAACAAAGGAAAATCTCAAGAAAAAACAAGGGTGTGGGATGTAG
TGAAAGATACGGTTAATCTGACGAAATTTCTACTTATTTTAACTCAAATTTATCCGCAGTCAGCCATTCGATATTTCAAC
TCTAAAAATGATTGGGTAAAAACTAATCGTCAAGAAGAAAGTGTTGACCCTCATATTGATGAGCATAAAAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AGGACTTTACTGACAGACAAGACTAAATATGAAAGGATGTCAGGAAGTAAGAATCCTTATGGTGACGGAACAACTTCCTT
GCAGATTGTTAATATTCTAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GAAAAACCTGCCTTTTGGGCTAGGTTTTTTCTTTTGTATATTTGCGAAATTAGTTTTTTTAGTTTAAATATGTTAAAGTA
GTTGTAGTTTTAATAATAAA

Product: glycosyl transferase

Products: NA

Alternate protein names: PNAG synthase; Poly-beta-1,6-GlcNAc synthase; Biofilm polysaccharide intercellular adhesin synthesis protein IcaA; Biofilm PIA synthesis protein IcaA; Intercellular adhesion protein A; N-acetylglucosaminyltransferase IcaA [H]

Number of amino acids: Translated: 824; Mature: 824

Protein sequence:

>824_residues
MKNKKINLKSFQSVCLIFIFLFNFEFIFRLSNFTSREKFFTIFFFVAPLMLSSFFIITDSEKIPNSVRNLSILGVFGFLM
YGSNRLIVSLTYLIGGEHAVPQLFPFRFLIAIFILLCCALAYYVSTKKMLIYKLATLIASLWFVTLPIITIQFIIKFLVE
HQGFDFSIVSNMDIRYLIVPFMPIMYLSFCKFSGIDAKQLGKNIKYTVYVLLVVYIVALIVYSGTQVNITFNFAQEGFFN
SIELNYNVFLAHWIEGLTVFSQFVLPIIAFALVIGYKGEKSKKKILSLKPIYVLILVTLGVYAYLFLLNPPTNFIHFNNK
IFNSYFALQIFEVVVIMLLTIYTGLKKFIRPRTKILLYIGSSLPFLYLYIVRYHYWKQSYLVFDIFDRINYIFFLFSIFV
FLYYTVEVFILWYSYSKRQRINALTLKNEGLKKQFHIYVLIPCLNEELVIQTTLKSILKNDYENLVVTVIDDASDDRSLE
KISEIQDSRLNVLRRIKPNAQKGKGTALNWAYYQISEQIQEAGIAPEDVLIAIIDADTKLDNNYFEKVNMAFNHDAKLTG
LQSKVRVANLIKDASQDLEFSEIINATQMFRTLTNTVAFGGNGQFCKLSTLQALNEDPWTDSLVEDFDLSTRLFLSDIEV
KNAQFDDIYIEQTGIINDNEALVKQRVRWAQGNIQSSKYILPTIRSKKLQNKQKFELLMTLLKPWLMGIEYIIVIYTLIM
IVNSAILSGITQSLKIVVVLFIVMSIYIIFVNFVWAILYNKGKSQEKTRVWDVVKDTVNLTKFLLILTQIYPQSAIRYFN
SKNDWVKTNRQEESVDPHIDEHKK

Sequences:

>Translated_824_residues
MKNKKINLKSFQSVCLIFIFLFNFEFIFRLSNFTSREKFFTIFFFVAPLMLSSFFIITDSEKIPNSVRNLSILGVFGFLM
YGSNRLIVSLTYLIGGEHAVPQLFPFRFLIAIFILLCCALAYYVSTKKMLIYKLATLIASLWFVTLPIITIQFIIKFLVE
HQGFDFSIVSNMDIRYLIVPFMPIMYLSFCKFSGIDAKQLGKNIKYTVYVLLVVYIVALIVYSGTQVNITFNFAQEGFFN
SIELNYNVFLAHWIEGLTVFSQFVLPIIAFALVIGYKGEKSKKKILSLKPIYVLILVTLGVYAYLFLLNPPTNFIHFNNK
IFNSYFALQIFEVVVIMLLTIYTGLKKFIRPRTKILLYIGSSLPFLYLYIVRYHYWKQSYLVFDIFDRINYIFFLFSIFV
FLYYTVEVFILWYSYSKRQRINALTLKNEGLKKQFHIYVLIPCLNEELVIQTTLKSILKNDYENLVVTVIDDASDDRSLE
KISEIQDSRLNVLRRIKPNAQKGKGTALNWAYYQISEQIQEAGIAPEDVLIAIIDADTKLDNNYFEKVNMAFNHDAKLTG
LQSKVRVANLIKDASQDLEFSEIINATQMFRTLTNTVAFGGNGQFCKLSTLQALNEDPWTDSLVEDFDLSTRLFLSDIEV
KNAQFDDIYIEQTGIINDNEALVKQRVRWAQGNIQSSKYILPTIRSKKLQNKQKFELLMTLLKPWLMGIEYIIVIYTLIM
IVNSAILSGITQSLKIVVVLFIVMSIYIIFVNFVWAILYNKGKSQEKTRVWDVVKDTVNLTKFLLILTQIYPQSAIRYFN
SKNDWVKTNRQEESVDPHIDEHKK
>Mature_824_residues
MKNKKINLKSFQSVCLIFIFLFNFEFIFRLSNFTSREKFFTIFFFVAPLMLSSFFIITDSEKIPNSVRNLSILGVFGFLM
YGSNRLIVSLTYLIGGEHAVPQLFPFRFLIAIFILLCCALAYYVSTKKMLIYKLATLIASLWFVTLPIITIQFIIKFLVE
HQGFDFSIVSNMDIRYLIVPFMPIMYLSFCKFSGIDAKQLGKNIKYTVYVLLVVYIVALIVYSGTQVNITFNFAQEGFFN
SIELNYNVFLAHWIEGLTVFSQFVLPIIAFALVIGYKGEKSKKKILSLKPIYVLILVTLGVYAYLFLLNPPTNFIHFNNK
IFNSYFALQIFEVVVIMLLTIYTGLKKFIRPRTKILLYIGSSLPFLYLYIVRYHYWKQSYLVFDIFDRINYIFFLFSIFV
FLYYTVEVFILWYSYSKRQRINALTLKNEGLKKQFHIYVLIPCLNEELVIQTTLKSILKNDYENLVVTVIDDASDDRSLE
KISEIQDSRLNVLRRIKPNAQKGKGTALNWAYYQISEQIQEAGIAPEDVLIAIIDADTKLDNNYFEKVNMAFNHDAKLTG
LQSKVRVANLIKDASQDLEFSEIINATQMFRTLTNTVAFGGNGQFCKLSTLQALNEDPWTDSLVEDFDLSTRLFLSDIEV
KNAQFDDIYIEQTGIINDNEALVKQRVRWAQGNIQSSKYILPTIRSKKLQNKQKFELLMTLLKPWLMGIEYIIVIYTLIM
IVNSAILSGITQSLKIVVVLFIVMSIYIIFVNFVWAILYNKGKSQEKTRVWDVVKDTVNLTKFLLILTQIYPQSAIRYFN
SKNDWVKTNRQEESVDPHIDEHKK

Specific function: N-acetylglucosaminyltransferase that catalyzes the polymerization of single monomer units of UDP-N-acetylglucosamine to produce the linear homopolymer poly-beta-1,6-N-acetyl-D- glucosamine (PNAG, also referred to as PIA), a biofilm adhesin polysaccharide.

COG id: COG1215

COG function: function code M; Glycosyltransferases, probably involved in cell wall biogenesis

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the glycosyltransferase 2 family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001173 [H]

Pfam domain/function: PF00535 Glycos_transf_2 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 95779; Mature: 95779

Theoretical pI: Translated: 9.52; Mature: 9.52

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
1.7 %Met     (Translated Protein)
2.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
1.7 %Met     (Mature Protein)
2.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKNKKINLKSFQSVCLIFIFLFNFEFIFRLSNFTSREKFFTIFFFVAPLMLSSFFIITDS
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECC
EKIPNSVRNLSILGVFGFLMYGSNRLIVSLTYLIGGEHAVPQLFPFRFLIAIFILLCCAL
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AYYVSTKKMLIYKLATLIASLWFVTLPIITIQFIIKFLVEHQGFDFSIVSNMDIRYLIVP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCEEHHHHH
FMPIMYLSFCKFSGIDAKQLGKNIKYTVYVLLVVYIVALIVYSGTQVNITFNFAQEGFFN
HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCCCCC
SIELNYNVFLAHWIEGLTVFSQFVLPIIAFALVIGYKGEKSKKKILSLKPIYVLILVTLG
EEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
VYAYLFLLNPPTNFIHFNNKIFNSYFALQIFEVVVIMLLTIYTGLKKFIRPRTKILLYIG
HHHHHHHCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEEEEEC
SSLPFLYLYIVRYHYWKQSYLVFDIFDRINYIFFLFSIFVFLYYTVEVFILWYSYSKRQR
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
INALTLKNEGLKKQFHIYVLIPCLNEELVIQTTLKSILKNDYENLVVTVIDDASDDRSLE
CCEEEECCCCCCCEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCHHHH
KISEIQDSRLNVLRRIKPNAQKGKGTALNWAYYQISEQIQEAGIAPEDVLIAIIDADTKL
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCC
DNNYFEKVNMAFNHDAKLTGLQSKVRVANLIKDASQDLEFSEIINATQMFRTLTNTVAFG
CCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEC
GNGQFCKLSTLQALNEDPWTDSLVEDFDLSTRLFLSDIEVKNAQFDDIYIEQTGIINDNE
CCCCEEEEHHHHHCCCCCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCCCH
ALVKQRVRWAQGNIQSSKYILPTIRSKKLQNKQKFELLMTLLKPWLMGIEYIIVIYTLIM
HHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IVNSAILSGITQSLKIVVVLFIVMSIYIIFVNFVWAILYNKGKSQEKTRVWDVVKDTVNL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
TKFLLILTQIYPQSAIRYFNSKNDWVKTNRQEESVDPHIDEHKK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MKNKKINLKSFQSVCLIFIFLFNFEFIFRLSNFTSREKFFTIFFFVAPLMLSSFFIITDS
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECC
EKIPNSVRNLSILGVFGFLMYGSNRLIVSLTYLIGGEHAVPQLFPFRFLIAIFILLCCAL
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AYYVSTKKMLIYKLATLIASLWFVTLPIITIQFIIKFLVEHQGFDFSIVSNMDIRYLIVP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCEEHHHHH
FMPIMYLSFCKFSGIDAKQLGKNIKYTVYVLLVVYIVALIVYSGTQVNITFNFAQEGFFN
HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCCCCC
SIELNYNVFLAHWIEGLTVFSQFVLPIIAFALVIGYKGEKSKKKILSLKPIYVLILVTLG
EEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
VYAYLFLLNPPTNFIHFNNKIFNSYFALQIFEVVVIMLLTIYTGLKKFIRPRTKILLYIG
HHHHHHHCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEEEEEC
SSLPFLYLYIVRYHYWKQSYLVFDIFDRINYIFFLFSIFVFLYYTVEVFILWYSYSKRQR
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
INALTLKNEGLKKQFHIYVLIPCLNEELVIQTTLKSILKNDYENLVVTVIDDASDDRSLE
CCEEEECCCCCCCEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCHHHH
KISEIQDSRLNVLRRIKPNAQKGKGTALNWAYYQISEQIQEAGIAPEDVLIAIIDADTKL
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCC
DNNYFEKVNMAFNHDAKLTGLQSKVRVANLIKDASQDLEFSEIINATQMFRTLTNTVAFG
CCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEC
GNGQFCKLSTLQALNEDPWTDSLVEDFDLSTRLFLSDIEVKNAQFDDIYIEQTGIINDNE
CCCCEEEEHHHHHCCCCCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCCCH
ALVKQRVRWAQGNIQSSKYILPTIRSKKLQNKQKFELLMTLLKPWLMGIEYIIVIYTLIM
HHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IVNSAILSGITQSLKIVVVLFIVMSIYIIFVNFVWAILYNKGKSQEKTRVWDVVKDTVNL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
TKFLLILTQIYPQSAIRYFNSKNDWVKTNRQEESVDPHIDEHKK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA