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The map label for this gene is norM [H]

Identifier: 15594928

GI number: 15594928

Start: 599495

End: 600844

Strand: Direct

Name: norM [H]

Synonym: BB0583

Alternate gene names: 15594928

Gene position: 599495-600844 (Clockwise)

Preceding gene: 15594926

Following gene: 15594929

Centisome position: 65.83

GC content: 28.89

Gene sequence:

>1350_bases
ATGATCAAAAAGTTTAAAAATTATGACCAGATAATAAAAGAGCTATTTGTTATAGCTATTCCTACAGCTTTTGAATCGCT
TTTATTTCAAATGGTAACTTTTTTTGATAATTTTATGATCTCCTATTTGGGCTCTTTTCATGTTACGGGAGTTTCTTTGG
CAAATAGAGTAACTTTTCTTTTTTTTATTATTGTGTTTGGACTTGGTACGGCTTTAAGCGCTTACGTTTCCCAAGCAATT
GCAAAAAAGAAGTTTCTTCAAGTAAGACAATCTTTTGCTTATATATTATTAATTGGAACTACAATAGGAATAATTTTTTT
TATATTTTCATTTCTTTTTCCAAGAAACATTATAAAGCTATTTACAGCTAATCAGGATTCTTTAAATTTTGGATCAGAGT
ATTTAAAAATTATTTCATTGTCTTATGTGCTAATGGCATATTCTTTTTTATCTGCTATGGGATTTAAGAGTGCTAAAGAA
GTAAAAATACCCTTATATGTTACTTCTATTGTTGTTTTAATAAATATTGTTTTTAATTATATTCTTATTTTTGGCTTTAG
CATGGGAATAAAAGGTGCCGCATATGCTACTGTGCTTGCTAGAATTGTTGAGTTTGTTTTCTATTTTTTATATAGTTTGA
TAAGCAGTAATTCATATTATCGGATTAAGTTTGGCGATTTTTTTGCTCCAAAGGTAGTTACTAGGGCTAATTTGAAACTA
ATTATACCTGTTTTGTCTCACGAGATTTTTTGGGTTTTAAGTATAACTATTTTGCATGCATTTTATGCTCGTGTTGGGAG
CATTGAATACGCTTCATTTGCTGTTGCATCAAATCTTTTTGATATTTGTTTTGTATTGCTTCATGGTATGGGACTTGCAA
CAGGGGTTGTTATTGGCCATTTAATGATTTACGATAAGAAACATGTTAGATCAGTTGGATTTTTTTTATCTTTTTTAGGA
TTTCTTTTGGGCATTTTTGTAGTTATTTTGCTTATTGGAATATCGAGCTTTGCACCTTATATTTTTAGTAAATTAGATTC
TCCCGAACTTGTTAGCGTGTTTATTTATGTTTTTGCAAGTATTGTAATTTTTAAAGCTTTTACGGCACAAGTTCTTGTTG
GGGTTTTTAGGGCTAGCGGTATACCAAATGTTTGTTTTTTTATTGAATCGGGAGTAATTGTTTTTTATACCCTTCCAGTT
GCTTATTTATTGGTGTTTTATACAAATTTAAGTTTACCAATAGTTGTTTTTATTGTAAATCTGGAAGAGATTATTAAAAA
TATATTTATTATAATTGAATTTTTTCACGATGATTGGATACGAGAGATTGAGTATGAAGAACTTGCTTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTTTAGTATAATTAATAGTTAATTCTAAATATATGTATATTCTAGATTGGATTAAATTTAGTTAAAAGTAATAAATAAA
GGAGACTGTATATAAGGAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GTATGGGATAGCGTGATATATTTAGTGTTAATAAAGATTTTAATAATCTTGGTGGATCTAGAATTCATTCTGATTATACT
AATTTGAAAGCAATTCCTTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Multidrug-efflux transporter [H]

Number of amino acids: Translated: 449; Mature: 449

Protein sequence:

>449_residues
MIKKFKNYDQIIKELFVIAIPTAFESLLFQMVTFFDNFMISYLGSFHVTGVSLANRVTFLFFIIVFGLGTALSAYVSQAI
AKKKFLQVRQSFAYILLIGTTIGIIFFIFSFLFPRNIIKLFTANQDSLNFGSEYLKIISLSYVLMAYSFLSAMGFKSAKE
VKIPLYVTSIVVLINIVFNYILIFGFSMGIKGAAYATVLARIVEFVFYFLYSLISSNSYYRIKFGDFFAPKVVTRANLKL
IIPVLSHEIFWVLSITILHAFYARVGSIEYASFAVASNLFDICFVLLHGMGLATGVVIGHLMIYDKKHVRSVGFFLSFLG
FLLGIFVVILLIGISSFAPYIFSKLDSPELVSVFIYVFASIVIFKAFTAQVLVGVFRASGIPNVCFFIESGVIVFYTLPV
AYLLVFYTNLSLPIVVFIVNLEEIIKNIFIIIEFFHDDWIREIEYEELA

Sequences:

>Translated_449_residues
MIKKFKNYDQIIKELFVIAIPTAFESLLFQMVTFFDNFMISYLGSFHVTGVSLANRVTFLFFIIVFGLGTALSAYVSQAI
AKKKFLQVRQSFAYILLIGTTIGIIFFIFSFLFPRNIIKLFTANQDSLNFGSEYLKIISLSYVLMAYSFLSAMGFKSAKE
VKIPLYVTSIVVLINIVFNYILIFGFSMGIKGAAYATVLARIVEFVFYFLYSLISSNSYYRIKFGDFFAPKVVTRANLKL
IIPVLSHEIFWVLSITILHAFYARVGSIEYASFAVASNLFDICFVLLHGMGLATGVVIGHLMIYDKKHVRSVGFFLSFLG
FLLGIFVVILLIGISSFAPYIFSKLDSPELVSVFIYVFASIVIFKAFTAQVLVGVFRASGIPNVCFFIESGVIVFYTLPV
AYLLVFYTNLSLPIVVFIVNLEEIIKNIFIIIEFFHDDWIREIEYEELA
>Mature_449_residues
MIKKFKNYDQIIKELFVIAIPTAFESLLFQMVTFFDNFMISYLGSFHVTGVSLANRVTFLFFIIVFGLGTALSAYVSQAI
AKKKFLQVRQSFAYILLIGTTIGIIFFIFSFLFPRNIIKLFTANQDSLNFGSEYLKIISLSYVLMAYSFLSAMGFKSAKE
VKIPLYVTSIVVLINIVFNYILIFGFSMGIKGAAYATVLARIVEFVFYFLYSLISSNSYYRIKFGDFFAPKVVTRANLKL
IIPVLSHEIFWVLSITILHAFYARVGSIEYASFAVASNLFDICFVLLHGMGLATGVVIGHLMIYDKKHVRSVGFFLSFLG
FLLGIFVVILLIGISSFAPYIFSKLDSPELVSVFIYVFASIVIFKAFTAQVLVGVFRASGIPNVCFFIESGVIVFYTLPV
AYLLVFYTNLSLPIVVFIVNLEEIIKNIFIIIEFFHDDWIREIEYEELA

Specific function: Multidrug efflux pump [H]

COG id: COG0534

COG function: function code V; Na+-driven multidrug efflux pump

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the multi antimicrobial extrusion (MATE) (TC 2.A.66.1) family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI226510954, Length=238, Percent_Identity=25.6302521008403, Blast_Score=62, Evalue=6e-11,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002528 [H]

Pfam domain/function: PF01554 MatE [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 50891; Mature: 50891

Theoretical pI: Translated: 9.26; Mature: 9.26

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
1.8 %Met     (Translated Protein)
2.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
1.8 %Met     (Mature Protein)
2.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIKKFKNYDQIIKELFVIAIPTAFESLLFQMVTFFDNFMISYLGSFHVTGVSLANRVTFL
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FFIIVFGLGTALSAYVSQAIAKKKFLQVRQSFAYILLIGTTIGIIFFIFSFLFPRNIIKL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FTANQDSLNFGSEYLKIISLSYVLMAYSFLSAMGFKSAKEVKIPLYVTSIVVLINIVFNY
HCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH
ILIFGFSMGIKGAAYATVLARIVEFVFYFLYSLISSNSYYRIKFGDFFAPKVVTRANLKL
HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHCCHHE
IIPVLSHEIFWVLSITILHAFYARVGSIEYASFAVASNLFDICFVLLHGMGLATGVVIGH
EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LMIYDKKHVRSVGFFLSFLGFLLGIFVVILLIGISSFAPYIFSKLDSPELVSVFIYVFAS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
IVIFKAFTAQVLVGVFRASGIPNVCFFIESGVIVFYTLPVAYLLVFYTNLSLPIVVFIVN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCHHEEHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH
LEEIIKNIFIIIEFFHDDWIREIEYEELA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 10360571 [H]