Definition | Borrelia burgdorferi B31 chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_001318 |
Length | 910,724 |
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The map label for this gene is 15594919
Identifier: 15594919
GI number: 15594919
Start: 587031
End: 587882
Strand: Direct
Name: 15594919
Synonym: BB0574
Alternate gene names: NA
Gene position: 587031-587882 (Clockwise)
Preceding gene: 15594918
Following gene: 15594920
Centisome position: 64.46
GC content: 21.6
Gene sequence:
>852_bases ATGTTTAGCTTAAAAAGATTTTTGAATTTATTTTATTTTGATTTTATTTACAATAAAAAATTCTATACTTTATTAATAAT TCAAGTTTTAGGAATGATATTTATATCTTATTTGCTTGTTAGATTTTATTTTAATTTTTCAGCAACTGATTTTTTAAAAT TTTTTGCTCCTAAAATTTTTATTTTAACCTTGATTATATCGATTTTTACCATGTGTGATTATTACAAAGTAATTCACGAT CCGTTCAGAAATATTCTTTATTTATCTTTGCCTGTTTCAACTTTTGAGCATTATTTTTTCAATTTAATTAAATATTTATT TGCACTACCTTTAATTTTAATATTTATTTATTATTTAGGGGTTAATATTTTTTTATTCCTAGATAATGCATTCTTTTTAA GAGGCGAGGGTACTCCATTCTTAGAATTAAGATATTTTTATGATTTTTTATTTGTTCGTTATTTTAATTTTTTATCTATT TTTCCAATCTTTATGTTTTTTAGAATAACTTTTAAAACGCATCCTTTTGTTAAGGTTTTGATATTCTTTTTAGGGACCAT TGTGTTATTGTTTTTTTCTACGTCTTTTCTTTATTTGGGTTTTAAATATGTGCCATGTTCTTCGGATTTAATTTTTTCTT TTGACAGATTTTTAGGCGACCTATTTTTTAAAATAGTTTATAGTTTGGGATTTTTTTTATATTTGGCTTCATATTTTAAG ATAGTAGACTTTGGAAGTATTAGAAAAAAAAGCAATTTGTTTGCTATTCTTGGGTTTTTAGTTTTTTTGGCAATGTTTAA TTATTACTATTTAACCAAAGGTTCATTATATTGTTTTGTTAATTATAATTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TAAGGCGCTTTATTTTGAGAGTAGCAATGGCGCTGAAGTTGTTGATATTGAGTTTTTCTTTTTATATGTTACTGAAAATA AAAAGAAGAGGTAATAAAAG
Downstream 100 bases:
>100_bases AATAGTTTAAAAGATTTAAAACAATGGCTTAGAAATAGCTTTTTAGCTAAGCATTAATAATTTTTATTTTAATTTAATGT TTTTGTTTGTTTTAATGCAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 283; Mature: 283
Protein sequence:
>283_residues MFSLKRFLNLFYFDFIYNKKFYTLLIIQVLGMIFISYLLVRFYFNFSATDFLKFFAPKIFILTLIISIFTMCDYYKVIHD PFRNILYLSLPVSTFEHYFFNLIKYLFALPLILIFIYYLGVNIFLFLDNAFFLRGEGTPFLELRYFYDFLFVRYFNFLSI FPIFMFFRITFKTHPFVKVLIFFLGTIVLLFFSTSFLYLGFKYVPCSSDLIFSFDRFLGDLFFKIVYSLGFFLYLASYFK IVDFGSIRKKSNLFAILGFLVFLAMFNYYYLTKGSLYCFVNYN
Sequences:
>Translated_283_residues MFSLKRFLNLFYFDFIYNKKFYTLLIIQVLGMIFISYLLVRFYFNFSATDFLKFFAPKIFILTLIISIFTMCDYYKVIHD PFRNILYLSLPVSTFEHYFFNLIKYLFALPLILIFIYYLGVNIFLFLDNAFFLRGEGTPFLELRYFYDFLFVRYFNFLSI FPIFMFFRITFKTHPFVKVLIFFLGTIVLLFFSTSFLYLGFKYVPCSSDLIFSFDRFLGDLFFKIVYSLGFFLYLASYFK IVDFGSIRKKSNLFAILGFLVFLAMFNYYYLTKGSLYCFVNYN >Mature_283_residues MFSLKRFLNLFYFDFIYNKKFYTLLIIQVLGMIFISYLLVRFYFNFSATDFLKFFAPKIFILTLIISIFTMCDYYKVIHD PFRNILYLSLPVSTFEHYFFNLIKYLFALPLILIFIYYLGVNIFLFLDNAFFLRGEGTPFLELRYFYDFLFVRYFNFLSI FPIFMFFRITFKTHPFVKVLIFFLGTIVLLFFSTSFLYLGFKYVPCSSDLIFSFDRFLGDLFFKIVYSLGFFLYLASYFK IVDFGSIRKKSNLFAILGFLVFLAMFNYYYLTKGSLYCFVNYN
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 34257; Mature: 34257
Theoretical pI: Translated: 9.63; Mature: 9.63
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.1 %Cys (Translated Protein) 1.8 %Met (Translated Protein) 2.8 %Cys+Met (Translated Protein) 1.1 %Cys (Mature Protein) 1.8 %Met (Mature Protein) 2.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MFSLKRFLNLFYFDFIYNKKFYTLLIIQVLGMIFISYLLVRFYFNFSATDFLKFFAPKIF CCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH ILTLIISIFTMCDYYKVIHDPFRNILYLSLPVSTFEHYFFNLIKYLFALPLILIFIYYLG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VNIFLFLDNAFFLRGEGTPFLELRYFYDFLFVRYFNFLSIFPIFMFFRITFKTHPFVKVL HHHHEEECCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH IFFLGTIVLLFFSTSFLYLGFKYVPCSSDLIFSFDRFLGDLFFKIVYSLGFFLYLASYFK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IVDFGSIRKKSNLFAILGFLVFLAMFNYYYLTKGSLYCFVNYN HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCEEEEEECC >Mature Secondary Structure MFSLKRFLNLFYFDFIYNKKFYTLLIIQVLGMIFISYLLVRFYFNFSATDFLKFFAPKIF CCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH ILTLIISIFTMCDYYKVIHDPFRNILYLSLPVSTFEHYFFNLIKYLFALPLILIFIYYLG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VNIFLFLDNAFFLRGEGTPFLELRYFYDFLFVRYFNFLSIFPIFMFFRITFKTHPFVKVL HHHHEEECCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH IFFLGTIVLLFFSTSFLYLGFKYVPCSSDLIFSFDRFLGDLFFKIVYSLGFFLYLASYFK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IVDFGSIRKKSNLFAILGFLVFLAMFNYYYLTKGSLYCFVNYN HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCEEEEEECC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 10.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA