Definition | Borrelia burgdorferi B31 chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_001318 |
Length | 910,724 |
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The map label for this gene is 15594914
Identifier: 15594914
GI number: 15594914
Start: 581645
End: 583417
Strand: Direct
Name: 15594914
Synonym: BB0569
Alternate gene names: NA
Gene position: 581645-583417 (Clockwise)
Preceding gene: 15594913
Following gene: 15594915
Centisome position: 63.87
GC content: 25.83
Gene sequence:
>1773_bases ATGGATAATGACAATAATGGTTTTGATGCCAACGATTGTTTGGCAACCTTATTTCACAAACTTGAAGCTTTTGATGAAAG CACAAGGCATATTTATTCAAATTTAAGCAAATCAATTCCTAAATTAATAGAAAAAATTTCTAAAGATTCTAAGGATTTAT CTTTTAGTATTGATTTGATTTCCAATCTTGATCTTGATAATGATTCTTCTTTGAATAATTTTATAGCCAAAATTATAGGA GCATTAGATGATTTTGTTGCTTACTTTAATTCTTCAACAACTTCTCTTGAATCTCAATTTAGCATAATACGGAGTAAGGT TAAAGATATAGAAATACTTGAAGATGTTATTGAAAGAATGAAAAAAAGCTCTCTTGATATGGAAATAATGTCTATTAATA CGTTAACAGTTGCTATGAGAGCGGGTAAGGCTGGTGGAGCCTTTTCTTATATTACGAGTGAAATTAAGGTTTTAACCCAA TCTATGATCAAACAGGCAGATCAACTTACAAGCAAGGGTCGCGAGGTTAAAATTGGTCTGGATAGAGCTAAAAATCAAGT ATATGAAAGCAATACAGCTGAAAATAAAATTCTTGAAGAATTTAGAGATAATTTAATGAAAAAAATAGATGCTTTTTCAG ATGGAATAGGAAGTGTCATTGCTCTTTATGATGATATTTTAAAAGTTTTATCTGAATTTAAGTTTAAACTTGTAAATTCT ATTTCTTATCTTCAGTTTCAAGACAGGCTAACTCAATCTTTGCAACATTTAAATATTATGTATTCTAATATTGATGTTTT TAAATTTAGAGATATAAGTGAGATCCAAAAATTAAAAATTTTATCAGTTTTTACGGATACATCAAAAGTTATAGTAAAAG ATGTTCTTGAAAAGCTTGAAAAAAATTATACTGTTTTTGAGAAATTTATTGATTCCTCTCTTAGTTCTATTCAAACCATT AACGATTTAAGGTCTGATAATTCTTTATACATAGATATTCCTAAAATAATAGAACAATTTTCTAGTATTTTGTCTGATCT GCTTAGAAGAATTGATGATGTTGAGAAGAATAATTCTAATTTTTTGAATTTATATTATGAACAGGTCAAGCTTATAAAAT CATTAGAATTAATGTTTTCAAATATTTCAGCTATTTCTGCTAGGTTTCAAAATATTAATATAGCCTCAAAGATAGAAGTT GTCAAAAGATCTGAACTTAAAGCCATGGAGGGCAATATTTCAGAAATGTCTAAGATTATCAAAGAAATTGATTCTAACAT TACCAAGGGAATAGAATTTTTGGATCAAATAATCTTTTTTCTTGAAAAAGTTGTTAAGGATTATGACAATAGATTTTATC TTGAAAAGAATTATTTTAATAAATTTAAAAAATTATTCATAGAAATTAAAAATGATATTCTTGACATTAAGAATATAGCT ATTGATAATATTTTGTCTTATGAAGTTTTTTCAATTGAATTTATGGAAATATTTGAAGAGATTAAATTAGAAGTCTACAA TGTTAGAAATTTAAAAAATTCTCTTTTAGATATAGATAACTTTTTAAGCAATATGGAAAGCAAAATAAATTTCAATCTTA ATTTAGAATTATCTAAGGTTGGAATTCAATCTGTTGAGATTGAAGATAAAGAATTTGTTAATAGAATTGCTAATCGATTT ACTTTATTTGTTCATAAAAAACACTTATTATCTTTGATAGAGGAAGCCGAGGATGTTCATTCCTTTGATGAGGGTAGTGT AATTTTGTTTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases GTTGTTTTTGGTATGCCAATGGAAGCTATAAAAATAGGGGCTGTAGACAAAATCCTTCCTTTAAGCGAAATAGCAGATCA TGTTCTAAGGAGATCTTAAA
Downstream 100 bases:
>100_bases TTTTTATATACTTTTTAGGAGGGTTTTAGGAGAAAATTAGATGAAAAAAAGAATTTTGGTTATTGATGACAATAGGGCAA TAAGGCAAAGCGTTGCTTAT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 590; Mature: 590
Protein sequence:
>590_residues MDNDNNGFDANDCLATLFHKLEAFDESTRHIYSNLSKSIPKLIEKISKDSKDLSFSIDLISNLDLDNDSSLNNFIAKIIG ALDDFVAYFNSSTTSLESQFSIIRSKVKDIEILEDVIERMKKSSLDMEIMSINTLTVAMRAGKAGGAFSYITSEIKVLTQ SMIKQADQLTSKGREVKIGLDRAKNQVYESNTAENKILEEFRDNLMKKIDAFSDGIGSVIALYDDILKVLSEFKFKLVNS ISYLQFQDRLTQSLQHLNIMYSNIDVFKFRDISEIQKLKILSVFTDTSKVIVKDVLEKLEKNYTVFEKFIDSSLSSIQTI NDLRSDNSLYIDIPKIIEQFSSILSDLLRRIDDVEKNNSNFLNLYYEQVKLIKSLELMFSNISAISARFQNINIASKIEV VKRSELKAMEGNISEMSKIIKEIDSNITKGIEFLDQIIFFLEKVVKDYDNRFYLEKNYFNKFKKLFIEIKNDILDIKNIA IDNILSYEVFSIEFMEIFEEIKLEVYNVRNLKNSLLDIDNFLSNMESKINFNLNLELSKVGIQSVEIEDKEFVNRIANRF TLFVHKKHLLSLIEEAEDVHSFDEGSVILF
Sequences:
>Translated_590_residues MDNDNNGFDANDCLATLFHKLEAFDESTRHIYSNLSKSIPKLIEKISKDSKDLSFSIDLISNLDLDNDSSLNNFIAKIIG ALDDFVAYFNSSTTSLESQFSIIRSKVKDIEILEDVIERMKKSSLDMEIMSINTLTVAMRAGKAGGAFSYITSEIKVLTQ SMIKQADQLTSKGREVKIGLDRAKNQVYESNTAENKILEEFRDNLMKKIDAFSDGIGSVIALYDDILKVLSEFKFKLVNS ISYLQFQDRLTQSLQHLNIMYSNIDVFKFRDISEIQKLKILSVFTDTSKVIVKDVLEKLEKNYTVFEKFIDSSLSSIQTI NDLRSDNSLYIDIPKIIEQFSSILSDLLRRIDDVEKNNSNFLNLYYEQVKLIKSLELMFSNISAISARFQNINIASKIEV VKRSELKAMEGNISEMSKIIKEIDSNITKGIEFLDQIIFFLEKVVKDYDNRFYLEKNYFNKFKKLFIEIKNDILDIKNIA IDNILSYEVFSIEFMEIFEEIKLEVYNVRNLKNSLLDIDNFLSNMESKINFNLNLELSKVGIQSVEIEDKEFVNRIANRF TLFVHKKHLLSLIEEAEDVHSFDEGSVILF >Mature_590_residues MDNDNNGFDANDCLATLFHKLEAFDESTRHIYSNLSKSIPKLIEKISKDSKDLSFSIDLISNLDLDNDSSLNNFIAKIIG ALDDFVAYFNSSTTSLESQFSIIRSKVKDIEILEDVIERMKKSSLDMEIMSINTLTVAMRAGKAGGAFSYITSEIKVLTQ SMIKQADQLTSKGREVKIGLDRAKNQVYESNTAENKILEEFRDNLMKKIDAFSDGIGSVIALYDDILKVLSEFKFKLVNS ISYLQFQDRLTQSLQHLNIMYSNIDVFKFRDISEIQKLKILSVFTDTSKVIVKDVLEKLEKNYTVFEKFIDSSLSSIQTI NDLRSDNSLYIDIPKIIEQFSSILSDLLRRIDDVEKNNSNFLNLYYEQVKLIKSLELMFSNISAISARFQNINIASKIEV VKRSELKAMEGNISEMSKIIKEIDSNITKGIEFLDQIIFFLEKVVKDYDNRFYLEKNYFNKFKKLFIEIKNDILDIKNIA IDNILSYEVFSIEFMEIFEEIKLEVYNVRNLKNSLLDIDNFLSNMESKINFNLNLELSKVGIQSVEIEDKEFVNRIANRF TLFVHKKHLLSLIEEAEDVHSFDEGSVILF
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 68055; Mature: 68055
Theoretical pI: Translated: 4.76; Mature: 4.76
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 2.2 %Met (Translated Protein) 2.4 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 2.2 %Met (Mature Protein) 2.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MDNDNNGFDANDCLATLFHKLEAFDESTRHIYSNLSKSIPKLIEKISKDSKDLSFSIDLI CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEHH SNLDLDNDSSLNNFIAKIIGALDDFVAYFNSSTTSLESQFSIIRSKVKDIEILEDVIERM HCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KKSSLDMEIMSINTLTVAMRAGKAGGAFSYITSEIKVLTQSMIKQADQLTSKGREVKIGL HHHCCCEEEEEEHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEH DRAKNQVYESNTAENKILEEFRDNLMKKIDAFSDGIGSVIALYDDILKVLSEFKFKLVNS HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ISYLQFQDRLTQSLQHLNIMYSNIDVFKFRDISEIQKLKILSVFTDTSKVIVKDVLEKLE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH KNYTVFEKFIDSSLSSIQTINDLRSDNSLYIDIPKIIEQFSSILSDLLRRIDDVEKNNSN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC FLNLYYEQVKLIKSLELMFSNISAISARFQNINIASKIEVVKRSELKAMEGNISEMSKII HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH KEIDSNITKGIEFLDQIIFFLEKVVKDYDNRFYLEKNYFNKFKKLFIEIKNDILDIKNIA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IDNILSYEVFSIEFMEIFEEIKLEVYNVRNLKNSLLDIDNFLSNMESKINFNLNLELSKV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEHHC GIQSVEIEDKEFVNRIANRFTLFVHKKHLLSLIEEAEDVHSFDEGSVILF CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEC >Mature Secondary Structure MDNDNNGFDANDCLATLFHKLEAFDESTRHIYSNLSKSIPKLIEKISKDSKDLSFSIDLI CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEHH SNLDLDNDSSLNNFIAKIIGALDDFVAYFNSSTTSLESQFSIIRSKVKDIEILEDVIERM HCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KKSSLDMEIMSINTLTVAMRAGKAGGAFSYITSEIKVLTQSMIKQADQLTSKGREVKIGL HHHCCCEEEEEEHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEH DRAKNQVYESNTAENKILEEFRDNLMKKIDAFSDGIGSVIALYDDILKVLSEFKFKLVNS HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ISYLQFQDRLTQSLQHLNIMYSNIDVFKFRDISEIQKLKILSVFTDTSKVIVKDVLEKLE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH KNYTVFEKFIDSSLSSIQTINDLRSDNSLYIDIPKIIEQFSSILSDLLRRIDDVEKNNSN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC FLNLYYEQVKLIKSLELMFSNISAISARFQNINIASKIEVVKRSELKAMEGNISEMSKII HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH KEIDSNITKGIEFLDQIIFFLEKVVKDYDNRFYLEKNYFNKFKKLFIEIKNDILDIKNIA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IDNILSYEVFSIEFMEIFEEIKLEVYNVRNLKNSLLDIDNFLSNMESKINFNLNLELSKV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEHHC GIQSVEIEDKEFVNRIANRFTLFVHKKHLLSLIEEAEDVHSFDEGSVILF CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA