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The map label for this gene is 153952113

Identifier: 153952113

GI number: 153952113

Start: 1035033

End: 1036766

Strand: Direct

Name: 153952113

Synonym: JJD26997_1182

Alternate gene names: NA

Gene position: 1035033-1036766 (Clockwise)

Preceding gene: 153950969

Following gene: 153952276

Centisome position: 56.1

GC content: 34.26

Gene sequence:

>1734_bases
ATGAATAAATTTTTAGTTTTATTGTTTTTACCTTTAGTTGCATTTGCAAACTCCTCAGAAGCAGCTGCAAATGCTAATTT
ATTCGGAACTTTTACGCTTATACCACCTTTAGTTGCTATTGCTTTAGCCTTTATCACAAAAGATGTTATTTTGTCACTCT
TTGCTGGGGTTTTAAGTGGAACTTTTCTACTTAGCCTTTCTGCAAATATTTTTAAAGCGCAACATTTAGCTTTTGTAAAT
TTTTATAATACTGCAGTAGAATCTTTTTCAAAAATTATTTCCTATATCTTAGGTTCAACTTCTGATCCAGTAAATGCAGG
AATTATTTTACAAATTCTTTGTATAGGTGGTCTTGTGGCGCTTATCACAAAAATGGGTGGTGCAAAAGCTGTAGCGTTAA
AATTTGCCAAAAGAGCCAAATCAGCTGTATCAGCTCAAGTTAACACTTGGTTTTTAGGGCTTTTAATATTTTTTGATGAT
TATGCTAATTTACTGATCGTAGGTCCAATTATGCGTCCTTTGGCAGATAAATTTAAAATTTCTCGTGAAAAATTTGCCTT
TATTATTGACTCTACTGCCGCTCCTGTAGCAGGAATAGCTGTAATTTCTACTTGGATAGGTTTAGAAGTTTCTTTAATTA
AAACCGCTTATGAACACATAGGTATTAGTGATATTAGCGCTTTTGGAATTTTTGTTGAAACCATACCTTATCGTTTTTAT
AATATCTTCATGCTTTTCTTTGTAATCATGACTGCAATCATGGGGCGTGAGTTTGGCTCTATGTATAAGGCTGAAGTGCG
CGCAAGAACCACAGGGCAAATTGCACCTTTACCTAAATCAGGCACACTAGATACTGCCGAATTAGAAGATCAGTTTTTAG
CACCAAAAGAAGGTATTAAAATTCGTGCTTTTGATGCTATTGTTCCTATTTTTACTTTAATCATTTTAGCTATATTAGGA
TTTTATTTTAATGGACTTAGCACTTTAGAAGGCGAAGAACTTGCAAAAGCAAGTACCAATCCTTTGTCTTTTGAAACTTT
TAGAGCTGCTTTTGGAAATGCTGATTCTTCTGTGGTATTATTCCAAGCTGCTTTGTTTGCTGCTATTGTAGCGATTTTTA
TCGGGGTGCGTCGTAAAATTTTCAATCTTAAAGAAGCGGTAGAAACTTGGATATATGGCTGGAAAACCATGATTTTTACT
ATAGTATTGCTTTTATTTGCTTGGTCGCTTTCAAGTATAGTAAAAGATCTAGGGACTTCTTTATTTATCACTAGTCTACT
TGCGGATAAATTGCCTGAGTTTATTTTACCTGCTACTATTTTTGCTTTTGCTTCAGCTATTTCTTTTGCCATAGGAACAA
GCTATGGAACCATGGGAATTTTAATGCCTTTGGCTGTGCCTTTAGCTCATGAAATCTCCAAAATCAATGGTATGGATGCA
AATGCTATGCATCATTATATGGTTATTAATATAAGCTGCGTTTTAACAGGTGCGATTTTTGGAAACCATTGCTCACCAAT
TTCAGATAATGTAATCCTTTCATCTATGAGTGCGAAATGCGATCATATGGAGCATGTAAGAACACAAATTCCTTATGCTT
TATTTATCTGTGGTATTTCTTTAATCGCTGGATATATTCCTGTATCTTTAGGGATTAGCGTTTGGTTTGTCTTGCCTTTA
AATTTCATACTTATTGCGCTTTTACTAAGACTCATCGGAAAGAAAGTTCCATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAATGTCTATCATTAACCTACCAAGTCATATTAATGTTAATGAAATCGAGCTTATGCCGGTAACACAAACTTGGAATGGA
TTTTATATAGAAAGAGATGA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GTCTTGAAAATTTTGGAAATTTTCTCACTTTAGATGAAAAACATTCTTTCATAAAAAAATATTTTAAAGAATTTTATACA
AAGGATTTTAAACTTTTTAC

Product: Na+/H+ antiporter family protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 577; Mature: 577

Protein sequence:

>577_residues
MNKFLVLLFLPLVAFANSSEAAANANLFGTFTLIPPLVAIALAFITKDVILSLFAGVLSGTFLLSLSANIFKAQHLAFVN
FYNTAVESFSKIISYILGSTSDPVNAGIILQILCIGGLVALITKMGGAKAVALKFAKRAKSAVSAQVNTWFLGLLIFFDD
YANLLIVGPIMRPLADKFKISREKFAFIIDSTAAPVAGIAVISTWIGLEVSLIKTAYEHIGISDISAFGIFVETIPYRFY
NIFMLFFVIMTAIMGREFGSMYKAEVRARTTGQIAPLPKSGTLDTAELEDQFLAPKEGIKIRAFDAIVPIFTLIILAILG
FYFNGLSTLEGEELAKASTNPLSFETFRAAFGNADSSVVLFQAALFAAIVAIFIGVRRKIFNLKEAVETWIYGWKTMIFT
IVLLLFAWSLSSIVKDLGTSLFITSLLADKLPEFILPATIFAFASAISFAIGTSYGTMGILMPLAVPLAHEISKINGMDA
NAMHHYMVINISCVLTGAIFGNHCSPISDNVILSSMSAKCDHMEHVRTQIPYALFICGISLIAGYIPVSLGISVWFVLPL
NFILIALLLRLIGKKVP

Sequences:

>Translated_577_residues
MNKFLVLLFLPLVAFANSSEAAANANLFGTFTLIPPLVAIALAFITKDVILSLFAGVLSGTFLLSLSANIFKAQHLAFVN
FYNTAVESFSKIISYILGSTSDPVNAGIILQILCIGGLVALITKMGGAKAVALKFAKRAKSAVSAQVNTWFLGLLIFFDD
YANLLIVGPIMRPLADKFKISREKFAFIIDSTAAPVAGIAVISTWIGLEVSLIKTAYEHIGISDISAFGIFVETIPYRFY
NIFMLFFVIMTAIMGREFGSMYKAEVRARTTGQIAPLPKSGTLDTAELEDQFLAPKEGIKIRAFDAIVPIFTLIILAILG
FYFNGLSTLEGEELAKASTNPLSFETFRAAFGNADSSVVLFQAALFAAIVAIFIGVRRKIFNLKEAVETWIYGWKTMIFT
IVLLLFAWSLSSIVKDLGTSLFITSLLADKLPEFILPATIFAFASAISFAIGTSYGTMGILMPLAVPLAHEISKINGMDA
NAMHHYMVINISCVLTGAIFGNHCSPISDNVILSSMSAKCDHMEHVRTQIPYALFICGISLIAGYIPVSLGISVWFVLPL
NFILIALLLRLIGKKVP
>Mature_577_residues
MNKFLVLLFLPLVAFANSSEAAANANLFGTFTLIPPLVAIALAFITKDVILSLFAGVLSGTFLLSLSANIFKAQHLAFVN
FYNTAVESFSKIISYILGSTSDPVNAGIILQILCIGGLVALITKMGGAKAVALKFAKRAKSAVSAQVNTWFLGLLIFFDD
YANLLIVGPIMRPLADKFKISREKFAFIIDSTAAPVAGIAVISTWIGLEVSLIKTAYEHIGISDISAFGIFVETIPYRFY
NIFMLFFVIMTAIMGREFGSMYKAEVRARTTGQIAPLPKSGTLDTAELEDQFLAPKEGIKIRAFDAIVPIFTLIILAILG
FYFNGLSTLEGEELAKASTNPLSFETFRAAFGNADSSVVLFQAALFAAIVAIFIGVRRKIFNLKEAVETWIYGWKTMIFT
IVLLLFAWSLSSIVKDLGTSLFITSLLADKLPEFILPATIFAFASAISFAIGTSYGTMGILMPLAVPLAHEISKINGMDA
NAMHHYMVINISCVLTGAIFGNHCSPISDNVILSSMSAKCDHMEHVRTQIPYALFICGISLIAGYIPVSLGISVWFVLPL
NFILIALLLRLIGKKVP

Specific function: Unknown

COG id: COG1757

COG function: function code C; Na+/H+ antiporter

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR018461 [H]

Pfam domain/function: PF03553 Na_H_antiporter [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 62602; Mature: 62602

Theoretical pI: Translated: 8.64; Mature: 8.64

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
2.6 %Met     (Translated Protein)
3.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
2.6 %Met     (Mature Protein)
3.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNKFLVLLFLPLVAFANSSEAAANANLFGTFTLIPPLVAIALAFITKDVILSLFAGVLSG
CCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TFLLSLSANIFKAQHLAFVNFYNTAVESFSKIISYILGSTSDPVNAGIILQILCIGGLVA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
LITKMGGAKAVALKFAKRAKSAVSAQVNTWFLGLLIFFDDYANLLIVGPIMRPLADKFKI
HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHC
SREKFAFIIDSTAAPVAGIAVISTWIGLEVSLIKTAYEHIGISDISAFGIFVETIPYRFY
CHHHEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NIFMLFFVIMTAIMGREFGSMYKAEVRARTTGQIAPLPKSGTLDTAELEDQFLAPKEGIK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCE
IRAFDAIVPIFTLIILAILGFYFNGLSTLEGEELAKASTNPLSFETFRAAFGNADSSVVL
EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHH
FQAALFAAIVAIFIGVRRKIFNLKEAVETWIYGWKTMIFTIVLLLFAWSLSSIVKDLGTS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LFITSLLADKLPEFILPATIFAFASAISFAIGTSYGTMGILMPLAVPLAHEISKINGMDA
HHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
NAMHHYMVINISCVLTGAIFGNHCSPISDNVILSSMSAKCDHMEHVRTQIPYALFICGIS
CHHHEEEEEEEHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH
LIAGYIPVSLGISVWFVLPLNFILIALLLRLIGKKVP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure
MNKFLVLLFLPLVAFANSSEAAANANLFGTFTLIPPLVAIALAFITKDVILSLFAGVLSG
CCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TFLLSLSANIFKAQHLAFVNFYNTAVESFSKIISYILGSTSDPVNAGIILQILCIGGLVA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
LITKMGGAKAVALKFAKRAKSAVSAQVNTWFLGLLIFFDDYANLLIVGPIMRPLADKFKI
HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHC
SREKFAFIIDSTAAPVAGIAVISTWIGLEVSLIKTAYEHIGISDISAFGIFVETIPYRFY
CHHHEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NIFMLFFVIMTAIMGREFGSMYKAEVRARTTGQIAPLPKSGTLDTAELEDQFLAPKEGIK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCE
IRAFDAIVPIFTLIILAILGFYFNGLSTLEGEELAKASTNPLSFETFRAAFGNADSSVVL
EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHH
FQAALFAAIVAIFIGVRRKIFNLKEAVETWIYGWKTMIFTIVLLLFAWSLSSIVKDLGTS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LFITSLLADKLPEFILPATIFAFASAISFAIGTSYGTMGILMPLAVPLAHEISKINGMDA
HHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
NAMHHYMVINISCVLTGAIFGNHCSPISDNVILSSMSAKCDHMEHVRTQIPYALFICGIS
CHHHEEEEEEEHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH
LIAGYIPVSLGISVWFVLPLNFILIALLLRLIGKKVP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800 [H]