Definition | Yersinia pseudotuberculosis IP 31758, complete genome. |
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Accession | NC_009708 |
Length | 4,723,306 |
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The map label for this gene is 153947771
Identifier: 153947771
GI number: 153947771
Start: 3370664
End: 3372871
Strand: Direct
Name: 153947771
Synonym: YpsIP31758_2992
Alternate gene names: NA
Gene position: 3370664-3372871 (Clockwise)
Preceding gene: 153950349
Following gene: 153947177
Centisome position: 71.36
GC content: 48.91
Gene sequence:
>2208_bases ATGGCTGAACCGAAACCCGCGTCTTGGATGCCTTCACATGCAGCAGCGCAACTCTGCCGCCAGTTGCAGTCACTCTTGCC AATGCATCTTCTTGCACCTGCGGCCTTTGAACAGATATTACGTTATTGCGGTGTCCGGCCCGGACGTCAGGCTTGGCGTT TGTTTCTCAGTAGAACGCTGCTACTGGCCGGGTCCCTCGCGGTCATCTGTGGCGTCATCTTTTTCTTTGCGTGGAACTGG GCAGCAATGCCCGCAATGGCAAAGTTCGGTATCATCGAATTGCTGATCGTGGCCTTGGCCATTCTCATCTGGTGGCGCTG GTATGATGCCGTCAGTCGCACGACATTATTGGCTGCTGGGTTCCTCTTTGGTGCGCTGTTTGCCGTCTTCGGGCAGATTT ACCAAACCGGGGCCGATAGCTGGGAGTTATTCCGCGCTTGGGCACTAATTCTTCTCCCTTTAGCGTTGCTCAGCAGGCAG GGGGGATTATGGTTTTTAACCTGGCTGGTGACCAATATTGGCCTGAATCTCTTTTTCTTCAGTTACTCATCGCCGTTTAC GGTCTCTTTCTCACTGTTCGACAGCATTTTTTATCTCAACACCTTGTTCACGTATGGTTATTTGCTTTTTCAGGGATTAT GTCTTTTGGCCTGGGAAGTGACACAAAGATTCGGCAAAACCCAATCCCCCGATAAAACGGTAAATCGCTGGTTTCCGAGG CTCATGGCAGCCTATTTTTTACTGTCACTGACAACCCCAATAATCAGTGAACTCACTTACTTTCACTTCCAACAGCCTGG CTACGTTTTACTACTTTGCTGGGTAGCGGTTATGGCCGGTGGCTACTGGTGGTATCGCTATCGCCAACCCGATTTATGCA TGCTGACACTGGGTGTTTGCAGCTTATTAGCGGTGGGAACTGCCGCTATCCTTACCTCGGCGGGTTGGGGTTGGTATAGA AATGTTGGCTCCCTGTTCCTGATTGGGATATTAATCGCCCTATTGCTTGGCGCAGGGGGCAAATTGTTACTCCACTGGCG CCGAAAGATGTATCCAAATCAAGCCGTGGAGTTATCCCGATCAGCCTACGACGAACTGTTAGTTAATCTCGAACAGCATT CGTTGCTCAACGCAGACCAAAAAGCGGTGTTGCTTGCTGAACAAGGCAAGTTAACTCTGCCTTGGTATATTCGTACCGCT TTTGCGTTCGGCGGGTGGATCGCGGCATTAATCCTGTTAGCTCTGTTGATATTGCTAGGATTTGTCAGTGGGATGTTTGA CAATCTCAATGCTGGAACAATTATTGTTGTTTCACTGATAGGCGGTGCCTTTGCCGCGTTCTTGCTCACCCGACCGGGTA TGGGGATACAGCAGATTGGTTTGGTATGGGCAATAGCATCCTCGATCGGGTTATATAGCGGAATAATATTAATCCAGGAT TCAAGCAGCAGATCGATGCTGATGCAAAGTCTGTGGTTCATTCCTGTTTTGGCGGTTCTGATTGTGGTATTCCACAATGA TATGTATCGCTTTCTGGCGACGGGCACGTTGGTATTCATGAGTATTGTTACGACAAGCTACGCTCTGATATGGCACTTGG CACCCGATAACCAACAGCTCTTTTTCTTCATTCCAATCCTGATAGTCACCGTCATTGTCATGTTGATTCTTTGGCTGATC TGCAATGAAACTAAATTGCTGGCGACCATCAATGCACCACTGATTCATCCGTTAATGTATGGCGGGATCGGGGGCATACT GGTGGTTTGCCTGCACAGCATTCAGATGGGGAATATCCATGAATTCTACTGGATGTCAGATCGGGGGCTTTATTTGGAAC AGAGTTTGAGCTACGGGATCCCTGCCGCTTTCTTGCTGTTTACGCTAATTCAATGGGTTTTGCATCGCAGTAAGCTCAAG CCACTCTGGTTGATAGCGGCGGTCGTAACCTCCCTTGCAGCCTATTTTGCACCGGGAATGGGTTTTGGTTTGGCACTGTT ATTGATTGCCCGTTATCAAGGGAATCAATGGTTACTGGGGGTTGCAGCCTGTTTTCTCGCGGTTTACACCAGTAGCTGGT ATTACTTCCTCGGATTCAGCTTGTTGTATAAATCCTTGTTATTAATCGGGTGTGGTGTCTTGCTGCTGGTTTTGGCCGCC GTATTGAATCGAGTACTCTCTGCTGGGGAGGTCAATCAACATGCTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AGAAACCAGAGATGACTCGCCATCTTGCCGCCGTCAGAGCCTATCGGCAACAAGACGGCATTTGATATCCCTTTCGCTTT CAGAAACAAGGATGTAAACC
Downstream 100 bases:
>100_bases GAGAAAATGGCTCAGCATCGCGGTCATTATCGTTGCCCTGATCGTGGTGAATATCTCTATTTATCAGAAGCAACATTTGT TGGCTAAAGGTGACATCATT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 735; Mature: 734
Protein sequence:
>735_residues MAEPKPASWMPSHAAAQLCRQLQSLLPMHLLAPAAFEQILRYCGVRPGRQAWRLFLSRTLLLAGSLAVICGVIFFFAWNW AAMPAMAKFGIIELLIVALAILIWWRWYDAVSRTTLLAAGFLFGALFAVFGQIYQTGADSWELFRAWALILLPLALLSRQ GGLWFLTWLVTNIGLNLFFFSYSSPFTVSFSLFDSIFYLNTLFTYGYLLFQGLCLLAWEVTQRFGKTQSPDKTVNRWFPR LMAAYFLLSLTTPIISELTYFHFQQPGYVLLLCWVAVMAGGYWWYRYRQPDLCMLTLGVCSLLAVGTAAILTSAGWGWYR NVGSLFLIGILIALLLGAGGKLLLHWRRKMYPNQAVELSRSAYDELLVNLEQHSLLNADQKAVLLAEQGKLTLPWYIRTA FAFGGWIAALILLALLILLGFVSGMFDNLNAGTIIVVSLIGGAFAAFLLTRPGMGIQQIGLVWAIASSIGLYSGIILIQD SSSRSMLMQSLWFIPVLAVLIVVFHNDMYRFLATGTLVFMSIVTTSYALIWHLAPDNQQLFFFIPILIVTVIVMLILWLI CNETKLLATINAPLIHPLMYGGIGGILVVCLHSIQMGNIHEFYWMSDRGLYLEQSLSYGIPAAFLLFTLIQWVLHRSKLK PLWLIAAVVTSLAAYFAPGMGFGLALLLIARYQGNQWLLGVAACFLAVYTSSWYYFLGFSLLYKSLLLIGCGVLLLVLAA VLNRVLSAGEVNQHA
Sequences:
>Translated_735_residues MAEPKPASWMPSHAAAQLCRQLQSLLPMHLLAPAAFEQILRYCGVRPGRQAWRLFLSRTLLLAGSLAVICGVIFFFAWNW AAMPAMAKFGIIELLIVALAILIWWRWYDAVSRTTLLAAGFLFGALFAVFGQIYQTGADSWELFRAWALILLPLALLSRQ GGLWFLTWLVTNIGLNLFFFSYSSPFTVSFSLFDSIFYLNTLFTYGYLLFQGLCLLAWEVTQRFGKTQSPDKTVNRWFPR LMAAYFLLSLTTPIISELTYFHFQQPGYVLLLCWVAVMAGGYWWYRYRQPDLCMLTLGVCSLLAVGTAAILTSAGWGWYR NVGSLFLIGILIALLLGAGGKLLLHWRRKMYPNQAVELSRSAYDELLVNLEQHSLLNADQKAVLLAEQGKLTLPWYIRTA FAFGGWIAALILLALLILLGFVSGMFDNLNAGTIIVVSLIGGAFAAFLLTRPGMGIQQIGLVWAIASSIGLYSGIILIQD SSSRSMLMQSLWFIPVLAVLIVVFHNDMYRFLATGTLVFMSIVTTSYALIWHLAPDNQQLFFFIPILIVTVIVMLILWLI CNETKLLATINAPLIHPLMYGGIGGILVVCLHSIQMGNIHEFYWMSDRGLYLEQSLSYGIPAAFLLFTLIQWVLHRSKLK PLWLIAAVVTSLAAYFAPGMGFGLALLLIARYQGNQWLLGVAACFLAVYTSSWYYFLGFSLLYKSLLLIGCGVLLLVLAA VLNRVLSAGEVNQHA >Mature_734_residues AEPKPASWMPSHAAAQLCRQLQSLLPMHLLAPAAFEQILRYCGVRPGRQAWRLFLSRTLLLAGSLAVICGVIFFFAWNWA AMPAMAKFGIIELLIVALAILIWWRWYDAVSRTTLLAAGFLFGALFAVFGQIYQTGADSWELFRAWALILLPLALLSRQG GLWFLTWLVTNIGLNLFFFSYSSPFTVSFSLFDSIFYLNTLFTYGYLLFQGLCLLAWEVTQRFGKTQSPDKTVNRWFPRL MAAYFLLSLTTPIISELTYFHFQQPGYVLLLCWVAVMAGGYWWYRYRQPDLCMLTLGVCSLLAVGTAAILTSAGWGWYRN VGSLFLIGILIALLLGAGGKLLLHWRRKMYPNQAVELSRSAYDELLVNLEQHSLLNADQKAVLLAEQGKLTLPWYIRTAF AFGGWIAALILLALLILLGFVSGMFDNLNAGTIIVVSLIGGAFAAFLLTRPGMGIQQIGLVWAIASSIGLYSGIILIQDS SSRSMLMQSLWFIPVLAVLIVVFHNDMYRFLATGTLVFMSIVTTSYALIWHLAPDNQQLFFFIPILIVTVIVMLILWLIC NETKLLATINAPLIHPLMYGGIGGILVVCLHSIQMGNIHEFYWMSDRGLYLEQSLSYGIPAAFLLFTLIQWVLHRSKLKP LWLIAAVVTSLAAYFAPGMGFGLALLLIARYQGNQWLLGVAACFLAVYTSSWYYFLGFSLLYKSLLLIGCGVLLLVLAAV LNRVLSAGEVNQHA
Specific function: Unknown
COG id: COG4984
COG function: function code S; Predicted membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 82110; Mature: 81979
Theoretical pI: Translated: 9.15; Mature: 9.15
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.5 %Cys (Translated Protein) 2.7 %Met (Translated Protein) 4.2 %Cys+Met (Translated Protein) 1.5 %Cys (Mature Protein) 2.6 %Met (Mature Protein) 4.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MAEPKPASWMPSHAAAQLCRQLQSLLPMHLLAPAAFEQILRYCGVRPGRQAWRLFLSRTL CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH LLAGSLAVICGVIFFFAWNWAAMPAMAKFGIIELLIVALAILIWWRWYDAVSRTTLLAAG HHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FLFGALFAVFGQIYQTGADSWELFRAWALILLPLALLSRQGGLWFLTWLVTNIGLNLFFF HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCHHEEEE SYSSPFTVSFSLFDSIFYLNTLFTYGYLLFQGLCLLAWEVTQRFGKTQSPDKTVNRWFPR ECCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHH LMAAYFLLSLTTPIISELTYFHFQQPGYVLLLCWVAVMAGGYWWYRYRQPDLCMLTLGVC HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCHHHHHHHHH SLLAVGTAAILTSAGWGWYRNVGSLFLIGILIALLLGAGGKLLLHWRRKMYPNQAVELSR HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH SAYDELLVNLEQHSLLNADQKAVLLAEQGKLTLPWYIRTAFAFGGWIAALILLALLILLG HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FVSGMFDNLNAGTIIVVSLIGGAFAAFLLTRPGMGIQQIGLVWAIASSIGLYSGIILIQD HHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEC SSSRSMLMQSLWFIPVLAVLIVVFHNDMYRFLATGTLVFMSIVTTSYALIWHLAPDNQQL CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCH FFFIPILIVTVIVMLILWLICNETKLLATINAPLIHPLMYGGIGGILVVCLHSIQMGNIH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCE EFYWMSDRGLYLEQSLSYGIPAAFLLFTLIQWVLHRSKLKPLWLIAAVVTSLAAYFAPGM EEEEECCCCCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC GFGLALLLIARYQGNQWLLGVAACFLAVYTSSWYYFLGFSLLYKSLLLIGCGVLLLVLAA HHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VLNRVLSAGEVNQHA HHHHHHHCCCCCCCC >Mature Secondary Structure AEPKPASWMPSHAAAQLCRQLQSLLPMHLLAPAAFEQILRYCGVRPGRQAWRLFLSRTL CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH LLAGSLAVICGVIFFFAWNWAAMPAMAKFGIIELLIVALAILIWWRWYDAVSRTTLLAAG HHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FLFGALFAVFGQIYQTGADSWELFRAWALILLPLALLSRQGGLWFLTWLVTNIGLNLFFF HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCHHEEEE SYSSPFTVSFSLFDSIFYLNTLFTYGYLLFQGLCLLAWEVTQRFGKTQSPDKTVNRWFPR ECCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHH LMAAYFLLSLTTPIISELTYFHFQQPGYVLLLCWVAVMAGGYWWYRYRQPDLCMLTLGVC HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCHHHHHHHHH SLLAVGTAAILTSAGWGWYRNVGSLFLIGILIALLLGAGGKLLLHWRRKMYPNQAVELSR HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH SAYDELLVNLEQHSLLNADQKAVLLAEQGKLTLPWYIRTAFAFGGWIAALILLALLILLG HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FVSGMFDNLNAGTIIVVSLIGGAFAAFLLTRPGMGIQQIGLVWAIASSIGLYSGIILIQD HHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEC SSSRSMLMQSLWFIPVLAVLIVVFHNDMYRFLATGTLVFMSIVTTSYALIWHLAPDNQQL CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCH FFFIPILIVTVIVMLILWLICNETKLLATINAPLIHPLMYGGIGGILVVCLHSIQMGNIH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCE EFYWMSDRGLYLEQSLSYGIPAAFLLFTLIQWVLHRSKLKPLWLIAAVVTSLAAYFAPGM EEEEECCCCCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC GFGLALLLIARYQGNQWLLGVAACFLAVYTSSWYYFLGFSLLYKSLLLIGCGVLLLVLAA HHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VLNRVLSAGEVNQHA HHHHHHHCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA