Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is Not Available

Identifier: 15004843

GI number: 15004843

Start: 150495

End: 151889

Strand: Direct

Name: Not Available

Synonym: CA_P0140

Alternate gene names: NA

Gene position: 150495-151889 (Clockwise)

Preceding gene: 15004835

Following gene: 15004844

Centisome position: 78.38

GC content: 33.69

Gene sequence:

>1395_bases
TTGTTTTTATCATTAATTCCTGCACTAATTACAATAATTTTAACTTTTAAAACAAAAAAATTAATTATATCCTTATTTGC
AGGTGTTTTATCTGGAACAATTATACATAATGGGCTAATTGGAGGAATTACAGCTATAGGTGAATACACCATGCGAGCAA
TAAGTGATAAAGAAAGTGCTTACACTCTATCCTTTTTCATTGCATTTGGTTCTTTAGCCGATTTAATACAAATGGCAGGA
GGAATTTCAGGTTTTAGCGATATAGTTGGAAAGTGGATTAAAAATGAAAAAAGTCTTTTATTATGGGCTTGGCTTTTAAG
TCTAATAACCTTCTTTCACAGTTCTTTTCATACCATTGCTGTAGGTACTGTCTTAACGCCTTCTTTAAAAAAGCTAAAAC
TCTCTGGCGAAAAGCTTGCTTTCATACTTTCAGTTACAAGCACTCAACTAATCTTGCTTATTCCCATTGCAACCTCTTAC
CTAGGCTATATGGTGACACTAGTTACAAATAATATAAAGCATAAAGGCATAAGTGAAAAAGCCTATTCCATATTAGTAAA
AAGCATCGCTTGGAACTTTTTCCCTTGGGCAATGCTTATTATAGGTATCGGTATAACTCTATTTGGTCTTGGCTTTGGCA
AACTTAAACTAGGAAAAACAGATGAAAATAATACAGAACTTACAAAAGGCCATATTGAAAAGGAAAAAGCCTACAATACC
TCTATTGAAGAATATCCTGAAGACAGCAAAAATTTAATCATTCCCATAATAATACTTCTCTCAAGTACTATCTTCTTTTT
TTGGTGGACCGGAAGACCATATGCAAAAGGCTTTATAAATGCTTTAGCCTTTGCTAAATTCAATGTTTCCATATTTTCTG
GAATTATGCTTACTTTACTTTTAACTAGCTTATACTATATGTACCAAAAAATTAGTATTGCAGAAATAGAAGCGCACATT
ATACGCGGAGGAGAAAAGGTTCTTTCTTTGGTTATGATATTAATCTTAAGCTGGGCATTGACATCCATAACACAGGATTT
AGGAATTAATAGCTTAATAAATGGACCTTTTATTAGAAGCGTACCCAAATTTTTAATGCCTGCCGTGCTTTTTATAATTA
GCGGACTTGTAGCTTACGCCATGGGATCTTCCTGGGCAACCTGGGCTCTTATGATGCCTTTAGCTATAAATTTTTCTATT
AATTCCTCCATATCAGTTCCTCTTATGGTAGGTACTGTTTGGTCTGGAGGCGCAGTTGCTGATGTTATTTCTCCCTTAGC
TGCAAAAATGGCTGACATTTCCTATGGAGAACATTTAACAACATCTTTTCCATATTTAATTTTAGGAATAGCAATTACTA
TAGTGTCTTATCTTATTGTTGGGCTAAGGATATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATAATCATATACCTTCATAGAATTAAATTTTTTTGTATATTTAAATCTTACTTACACAAAATAATCCTAATTATGTCTAA
GTCTAATAGGAGGTAATCCC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGCCTATTTTCAAATAAAACATAGTCCCTTTTCTACCTTCTTTCTTCCGTATATTTTCCTTAACTAAAGAATAGATTTAA
ATATATCTATTTTGTGAGGC

Product: membrane protein, transporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 464; Mature: 464

Protein sequence:

>464_residues
MFLSLIPALITIILTFKTKKLIISLFAGVLSGTIIHNGLIGGITAIGEYTMRAISDKESAYTLSFFIAFGSLADLIQMAG
GISGFSDIVGKWIKNEKSLLLWAWLLSLITFFHSSFHTIAVGTVLTPSLKKLKLSGEKLAFILSVTSTQLILLIPIATSY
LGYMVTLVTNNIKHKGISEKAYSILVKSIAWNFFPWAMLIIGIGITLFGLGFGKLKLGKTDENNTELTKGHIEKEKAYNT
SIEEYPEDSKNLIIPIIILLSSTIFFFWWTGRPYAKGFINALAFAKFNVSIFSGIMLTLLLTSLYYMYQKISIAEIEAHI
IRGGEKVLSLVMILILSWALTSITQDLGINSLINGPFIRSVPKFLMPAVLFIISGLVAYAMGSSWATWALMMPLAINFSI
NSSISVPLMVGTVWSGGAVADVISPLAAKMADISYGEHLTTSFPYLILGIAITIVSYLIVGLRI

Sequences:

>Translated_464_residues
MFLSLIPALITIILTFKTKKLIISLFAGVLSGTIIHNGLIGGITAIGEYTMRAISDKESAYTLSFFIAFGSLADLIQMAG
GISGFSDIVGKWIKNEKSLLLWAWLLSLITFFHSSFHTIAVGTVLTPSLKKLKLSGEKLAFILSVTSTQLILLIPIATSY
LGYMVTLVTNNIKHKGISEKAYSILVKSIAWNFFPWAMLIIGIGITLFGLGFGKLKLGKTDENNTELTKGHIEKEKAYNT
SIEEYPEDSKNLIIPIIILLSSTIFFFWWTGRPYAKGFINALAFAKFNVSIFSGIMLTLLLTSLYYMYQKISIAEIEAHI
IRGGEKVLSLVMILILSWALTSITQDLGINSLINGPFIRSVPKFLMPAVLFIISGLVAYAMGSSWATWALMMPLAINFSI
NSSISVPLMVGTVWSGGAVADVISPLAAKMADISYGEHLTTSFPYLILGIAITIVSYLIVGLRI
>Mature_464_residues
MFLSLIPALITIILTFKTKKLIISLFAGVLSGTIIHNGLIGGITAIGEYTMRAISDKESAYTLSFFIAFGSLADLIQMAG
GISGFSDIVGKWIKNEKSLLLWAWLLSLITFFHSSFHTIAVGTVLTPSLKKLKLSGEKLAFILSVTSTQLILLIPIATSY
LGYMVTLVTNNIKHKGISEKAYSILVKSIAWNFFPWAMLIIGIGITLFGLGFGKLKLGKTDENNTELTKGHIEKEKAYNT
SIEEYPEDSKNLIIPIIILLSSTIFFFWWTGRPYAKGFINALAFAKFNVSIFSGIMLTLLLTSLYYMYQKISIAEIEAHI
IRGGEKVLSLVMILILSWALTSITQDLGINSLINGPFIRSVPKFLMPAVLFIISGLVAYAMGSSWATWALMMPLAINFSI
NSSISVPLMVGTVWSGGAVADVISPLAAKMADISYGEHLTTSFPYLILGIAITIVSYLIVGLRI

Specific function: Unknown

COG id: COG1757

COG function: function code C; Na+/H+ antiporter

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR018461 [H]

Pfam domain/function: PF03553 Na_H_antiporter [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 50744; Mature: 50744

Theoretical pI: Translated: 9.84; Mature: 9.84

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
3.0 %Met     (Translated Protein)
3.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
3.0 %Met     (Mature Protein)
3.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MFLSLIPALITIILTFKTKKLIISLFAGVLSGTIIHNGLIGGITAIGEYTMRAISDKESA
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCH
YTLSFFIAFGSLADLIQMAGGISGFSDIVGKWIKNEKSLLLWAWLLSLITFFHSSFHTIA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEE
VGTVLTPSLKKLKLSGEKLAFILSVTSTQLILLIPIATSYLGYMVTLVTNNIKHKGISEK
EHHHHCCCHHHHHCCCCEEEEEEEECCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHH
AYSILVKSIAWNFFPWAMLIIGIGITLFGLGFGKLKLGKTDENNTELTKGHIEKEKAYNT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCC
SIEEYPEDSKNLIIPIIILLSSTIFFFWWTGRPYAKGFINALAFAKFNVSIFSGIMLTLL
CHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LTSLYYMYQKISIAEIEAHIIRGGEKVLSLVMILILSWALTSITQDLGINSLINGPFIRS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCHHHHH
VPKFLMPAVLFIISGLVAYAMGSSWATWALMMPLAINFSINSSISVPLMVGTVWSGGAVA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCEEEEEECCCCCHHH
DVISPLAAKMADISYGEHLTTSFPYLILGIAITIVSYLIVGLRI
HHHHHHHHHHHHCCCCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MFLSLIPALITIILTFKTKKLIISLFAGVLSGTIIHNGLIGGITAIGEYTMRAISDKESA
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCH
YTLSFFIAFGSLADLIQMAGGISGFSDIVGKWIKNEKSLLLWAWLLSLITFFHSSFHTIA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEE
VGTVLTPSLKKLKLSGEKLAFILSVTSTQLILLIPIATSYLGYMVTLVTNNIKHKGISEK
EHHHHCCCHHHHHCCCCEEEEEEEECCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHH
AYSILVKSIAWNFFPWAMLIIGIGITLFGLGFGKLKLGKTDENNTELTKGHIEKEKAYNT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCC
SIEEYPEDSKNLIIPIIILLSSTIFFFWWTGRPYAKGFINALAFAKFNVSIFSGIMLTLL
CHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LTSLYYMYQKISIAEIEAHIIRGGEKVLSLVMILILSWALTSITQDLGINSLINGPFIRS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCHHHHH
VPKFLMPAVLFIISGLVAYAMGSSWATWALMMPLAINFSINSSISVPLMVGTVWSGGAVA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCEEEEEECCCCCHHH
DVISPLAAKMADISYGEHLTTSFPYLILGIAITIVSYLIVGLRI
HHHHHHHHHHHHCCCCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800 [H]