Definition Parabacteroides distasonis ATCC 8503 chromosome, complete genome.
Accession NC_009615
Length 4,811,379

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The map label for this gene is 150008267

Identifier: 150008267

GI number: 150008267

Start: 1933867

End: 1936191

Strand: Reverse

Name: 150008267

Synonym: BDI_1636

Alternate gene names: NA

Gene position: 1936191-1933867 (Counterclockwise)

Preceding gene: 150008268

Following gene: 150008266

Centisome position: 40.24

GC content: 45.42

Gene sequence:

>2325_bases
ATGAGACAGCTATATTATACAATCCGTTATTTACTTCGAGGCCGAGGGGGAAATGTGATCAAGGTTCTGTCCTTGACACT
AGGACTTGGAGTGGGATTGATCCTGTTCGCTAGGGTCGCTTTTGAATTGAGCTTCGATACATTCTTTGACCAAGTGGAAG
ATTTGTATAGCGTGCATGTGCGATACAATGATGATAAAACGGGAGAGGAAGATGGGTCTCGTATCCTATTTGCCCCGATC
CCGGAGGCTTTGCGGCAAGAGTTCCCCGAGATACAGTATGCGACGGTTTGCCGGAGAAGATACGGAGCCGTATTGTATCA
TGGTGAGGATCGGTTCAAGCCCCGTTTGATGATGGCGGATTCCCTCTTTTTCCGTACGATGGGAATCAAGGTGCTAAGAG
GGGATGATCGTTTGTTGGGAATCGAAGATCAAGTTTTCTTATCGGAAAAAATGGCTGAACGTATATTTGGCAAGGAAGAT
CCGATCGGGAAACAACTGCTGTACGGAAAAAACTATCCTTATACGGTGGCCGGGATATTCCGTGACATACCGGAAAATAG
TCATTTACGTTTTGACGCTGTCGCTTCTTTCATTAATATGAAAACCCAGTTCGGTGCCTATGCCGGTTGGGGTGCCGACG
ATAGTTATCTGGGCTATATCCGCCTGAAACCGGGTGTGTTCCCGGAACAAATCAATCAGAAAATACCGGCTTTATTGCCT
AAATATATAGATGTAGAAAGAGAGAGGAAACAAGGTTTTGATATGGAGCTTTATATCAAGCCGGTCTCGGAGATATATAC
GCAAAGTACCGAGGTGAAGCGGATGGTGGTGATCATGAGCGTACTGGCTTTCGCTTTGTTATTCGTGGCGGCGATGAATT
ATATCTTGAACTCGGTATCTTCTCTGCCGATCCGGGCGAGATCCGTAGGAGTACACAAATGTAATGGAGCTTCCAGCAAG
GACATTTTCAATATGTTCTTGTTTGAGACGGCGGCTTTATTTGTAGTGGCTCTTGTATGTATGGCATTGCTTTTATTCGC
TTTCCGGGAATATGTAGCGGATATGGCGGCTGTTCCTACTTTGGGCACTTTATTGAATGCGCAGACTATATGGCTTCCTG
CGATCATGATCTTGGCTATATTCATTTTGTCCGCCTTGCTACCGGCCCGTTTGTTCAGCGTTATCCCGGTTACCCAAGTA
TTCCGGGTATCTACTTCGGGTAAGCAGGGATGGAAGCGGAGTTTGCTCTTTATCCAGTTTGGGGGAATTGCGTTTGTCAT
TACATTATTGGTGATCGTGTTATTGCAATATGATCGGCTAATGAATAATGATTTAGGATATGATCCGGAAAATATAGTGT
ATGCCCCCTTGAATAATATGGATGATCCGGAAACGGCCAAACTTACCGCCGAGTTCAAGAAGTTACCTTATGTCACGGCT
ACGGGGCTTTCGTCAATGGACATTCTAAGTGGTTATGGTGGTTTCCCTATTCTGGATAATGAGAAAAACTGGCTGTTCAC
GGCCCGACAGGTAAACTATGATGCCGATTATCTCTCTCTGATGAAAATCCCCTTGCTTGAGGGGCAACCACTAAAAGGTG
ACGGGGATATTTTAGTGAATGAGTCATTCGTGAGTAAACGTGGGTGGACGGATGCTGCGATCGGTAAATATATTTATGAT
GATGAGGGTAATTTAAAAGGAAAAATAGTGGGTGTAACCCGTGATTTCATGGTGAATTCCTTCTTCACTCCCCAGTTACC
GGTCATCATGTTTGGTAGTGACCGGATGAGTTATTGTAACTTTACGGTTCGTGTCTCCGAGCTAACTCCGGAATATTTGC
GGGAAATGAATGATCGGATTGCGGAACTATTCCCGGATGAGGATGTCGGTTTTACGGTGCTGAAAACGATTATAGAGTCT
CAGTATGAGGGAACCCGTCATTTCCGTGACGGTGTCTTTGTTGCCTCGATCGCTATCTTGCTGATCACCTTAATGGGATT
ATTAGGATATATTACGGACGAGATGCACCGTAGGAGCAAGGAGATAGCGATTCGCAAGGTGAATGGAGCGACGGCCCCGA
ATATTTTACGTCTTTTATCTAAGGACGTTTTGGTCACGGCTTTCCCGGCTATCCTTTTAGGAGTGATAGCCTCACGAGTC
GTGGGAGAGAGCTGGTTGAGGCAATTCGCGGATAAGATACCGCTGACTGTTTTTATTTTCATATCTACGGCTCTACTGGT
TCTAGCGATCATTTGGGGATGCGTGATCCTGAAATCTTGGAATATCGCCAATGAGAATCCGGTCCGTAGCATTAAGAACG
AATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTAGTCAACATGACATAAACACATACACACAAGAGTTTTTTATAAGCTAATTGGCCTGTGAAGGTCGGTTAGCTTTCAA
TTTAACTTAAATACAAATCG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TATAACAGGTAATATAAAATTACGTATGAAAACTATTTTGAGGAATCTCTTGAGTGTATTGCGCCGTTTCAAGATGGCGA
CACTTTTAAATGTATTAGGA

Product: putative ABC transporter membrane protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 774; Mature: 774

Protein sequence:

>774_residues
MRQLYYTIRYLLRGRGGNVIKVLSLTLGLGVGLILFARVAFELSFDTFFDQVEDLYSVHVRYNDDKTGEEDGSRILFAPI
PEALRQEFPEIQYATVCRRRYGAVLYHGEDRFKPRLMMADSLFFRTMGIKVLRGDDRLLGIEDQVFLSEKMAERIFGKED
PIGKQLLYGKNYPYTVAGIFRDIPENSHLRFDAVASFINMKTQFGAYAGWGADDSYLGYIRLKPGVFPEQINQKIPALLP
KYIDVERERKQGFDMELYIKPVSEIYTQSTEVKRMVVIMSVLAFALLFVAAMNYILNSVSSLPIRARSVGVHKCNGASSK
DIFNMFLFETAALFVVALVCMALLLFAFREYVADMAAVPTLGTLLNAQTIWLPAIMILAIFILSALLPARLFSVIPVTQV
FRVSTSGKQGWKRSLLFIQFGGIAFVITLLVIVLLQYDRLMNNDLGYDPENIVYAPLNNMDDPETAKLTAEFKKLPYVTA
TGLSSMDILSGYGGFPILDNEKNWLFTARQVNYDADYLSLMKIPLLEGQPLKGDGDILVNESFVSKRGWTDAAIGKYIYD
DEGNLKGKIVGVTRDFMVNSFFTPQLPVIMFGSDRMSYCNFTVRVSELTPEYLREMNDRIAELFPDEDVGFTVLKTIIES
QYEGTRHFRDGVFVASIAILLITLMGLLGYITDEMHRRSKEIAIRKVNGATAPNILRLLSKDVLVTAFPAILLGVIASRV
VGESWLRQFADKIPLTVFIFISTALLVLAIIWGCVILKSWNIANENPVRSIKNE

Sequences:

>Translated_774_residues
MRQLYYTIRYLLRGRGGNVIKVLSLTLGLGVGLILFARVAFELSFDTFFDQVEDLYSVHVRYNDDKTGEEDGSRILFAPI
PEALRQEFPEIQYATVCRRRYGAVLYHGEDRFKPRLMMADSLFFRTMGIKVLRGDDRLLGIEDQVFLSEKMAERIFGKED
PIGKQLLYGKNYPYTVAGIFRDIPENSHLRFDAVASFINMKTQFGAYAGWGADDSYLGYIRLKPGVFPEQINQKIPALLP
KYIDVERERKQGFDMELYIKPVSEIYTQSTEVKRMVVIMSVLAFALLFVAAMNYILNSVSSLPIRARSVGVHKCNGASSK
DIFNMFLFETAALFVVALVCMALLLFAFREYVADMAAVPTLGTLLNAQTIWLPAIMILAIFILSALLPARLFSVIPVTQV
FRVSTSGKQGWKRSLLFIQFGGIAFVITLLVIVLLQYDRLMNNDLGYDPENIVYAPLNNMDDPETAKLTAEFKKLPYVTA
TGLSSMDILSGYGGFPILDNEKNWLFTARQVNYDADYLSLMKIPLLEGQPLKGDGDILVNESFVSKRGWTDAAIGKYIYD
DEGNLKGKIVGVTRDFMVNSFFTPQLPVIMFGSDRMSYCNFTVRVSELTPEYLREMNDRIAELFPDEDVGFTVLKTIIES
QYEGTRHFRDGVFVASIAILLITLMGLLGYITDEMHRRSKEIAIRKVNGATAPNILRLLSKDVLVTAFPAILLGVIASRV
VGESWLRQFADKIPLTVFIFISTALLVLAIIWGCVILKSWNIANENPVRSIKNE
>Mature_774_residues
MRQLYYTIRYLLRGRGGNVIKVLSLTLGLGVGLILFARVAFELSFDTFFDQVEDLYSVHVRYNDDKTGEEDGSRILFAPI
PEALRQEFPEIQYATVCRRRYGAVLYHGEDRFKPRLMMADSLFFRTMGIKVLRGDDRLLGIEDQVFLSEKMAERIFGKED
PIGKQLLYGKNYPYTVAGIFRDIPENSHLRFDAVASFINMKTQFGAYAGWGADDSYLGYIRLKPGVFPEQINQKIPALLP
KYIDVERERKQGFDMELYIKPVSEIYTQSTEVKRMVVIMSVLAFALLFVAAMNYILNSVSSLPIRARSVGVHKCNGASSK
DIFNMFLFETAALFVVALVCMALLLFAFREYVADMAAVPTLGTLLNAQTIWLPAIMILAIFILSALLPARLFSVIPVTQV
FRVSTSGKQGWKRSLLFIQFGGIAFVITLLVIVLLQYDRLMNNDLGYDPENIVYAPLNNMDDPETAKLTAEFKKLPYVTA
TGLSSMDILSGYGGFPILDNEKNWLFTARQVNYDADYLSLMKIPLLEGQPLKGDGDILVNESFVSKRGWTDAAIGKYIYD
DEGNLKGKIVGVTRDFMVNSFFTPQLPVIMFGSDRMSYCNFTVRVSELTPEYLREMNDRIAELFPDEDVGFTVLKTIIES
QYEGTRHFRDGVFVASIAILLITLMGLLGYITDEMHRRSKEIAIRKVNGATAPNILRLLSKDVLVTAFPAILLGVIASRV
VGESWLRQFADKIPLTVFIFISTALLVLAIIWGCVILKSWNIANENPVRSIKNE

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 87338; Mature: 87338

Theoretical pI: Translated: 7.10; Mature: 7.10

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
3.1 %Met     (Translated Protein)
3.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
3.1 %Met     (Mature Protein)
3.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MRQLYYTIRYLLRGRGGNVIKVLSLTLGLGVGLILFARVAFELSFDTFFDQVEDLYSVHV
CCHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE
RYNDDKTGEEDGSRILFAPIPEALRQEFPEIQYATVCRRRYGAVLYHGEDRFKPRLMMAD
EECCCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCEEEECCCCCCCCHHHHHH
SLFFRTMGIKVLRGDDRLLGIEDQVFLSEKMAERIFGKEDPIGKQLLYGKNYPYTVAGIF
HHHHHHHCEEEEECCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHCCCCCCEEHHHHH
RDIPENSHLRFDAVASFINMKTQFGAYAGWGADDSYLGYIRLKPGVFPEQINQKIPALLP
HHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHCHHHHHHH
KYIDVERERKQGFDMELYIKPVSEIYTQSTEVKRMVVIMSVLAFALLFVAAMNYILNSVS
HHHCCHHHHHCCCCEEEEEECHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SLPIRARSVGVHKCNGASSKDIFNMFLFETAALFVVALVCMALLLFAFREYVADMAAVPT
CCCEEHHHCCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LGTLLNAQTIWLPAIMILAIFILSALLPARLFSVIPVTQVFRVSTSGKQGWKRSLLFIQF
HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHEECCCCCCCHHHEEEEEEE
GGIAFVITLLVIVLLQYDRLMNNDLGYDPENIVYAPLNNMDDPETAKLTAEFKKLPYVTA
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCEEEE
TGLSSMDILSGYGGFPILDNEKNWLFTARQVNYDADYLSLMKIPLLEGQPLKGDGDILVN
CCCCHHHHHHCCCCCCEEECCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEE
ESFVSKRGWTDAAIGKYIYDDEGNLKGKIVGVTRDFMVNSFFTPQLPVIMFGSDRMSYCN
HHHHHCCCCCHHHHCCEEECCCCCCCEEEEEEEHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCEEEE
FTVRVSELTPEYLREMNDRIAELFPDEDVGFTVLKTIIESQYEGTRHFRDGVFVASIAIL
EEEEEHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCHHHHHHHHHH
LITLMGLLGYITDEMHRRSKEIAIRKVNGATAPNILRLLSKDVLVTAFPAILLGVIASRV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VGESWLRQFADKIPLTVFIFISTALLVLAIIWGCVILKSWNIANENPVRSIKNE
HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MRQLYYTIRYLLRGRGGNVIKVLSLTLGLGVGLILFARVAFELSFDTFFDQVEDLYSVHV
CCHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE
RYNDDKTGEEDGSRILFAPIPEALRQEFPEIQYATVCRRRYGAVLYHGEDRFKPRLMMAD
EECCCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCEEEECCCCCCCCHHHHHH
SLFFRTMGIKVLRGDDRLLGIEDQVFLSEKMAERIFGKEDPIGKQLLYGKNYPYTVAGIF
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HHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHCHHHHHHH
KYIDVERERKQGFDMELYIKPVSEIYTQSTEVKRMVVIMSVLAFALLFVAAMNYILNSVS
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SLPIRARSVGVHKCNGASSKDIFNMFLFETAALFVVALVCMALLLFAFREYVADMAAVPT
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LGTLLNAQTIWLPAIMILAIFILSALLPARLFSVIPVTQVFRVSTSGKQGWKRSLLFIQF
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GGIAFVITLLVIVLLQYDRLMNNDLGYDPENIVYAPLNNMDDPETAKLTAEFKKLPYVTA
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TGLSSMDILSGYGGFPILDNEKNWLFTARQVNYDADYLSLMKIPLLEGQPLKGDGDILVN
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HHHHHCCCCCHHHHCCEEECCCCCCCEEEEEEEHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCEEEE
FTVRVSELTPEYLREMNDRIAELFPDEDVGFTVLKTIIESQYEGTRHFRDGVFVASIAIL
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LITLMGLLGYITDEMHRRSKEIAIRKVNGATAPNILRLLSKDVLVTAFPAILLGVIASRV
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HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA