| Definition | Parabacteroides distasonis ATCC 8503 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009615 |
| Length | 4,811,379 |
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The map label for this gene is 150008267
Identifier: 150008267
GI number: 150008267
Start: 1933867
End: 1936191
Strand: Reverse
Name: 150008267
Synonym: BDI_1636
Alternate gene names: NA
Gene position: 1936191-1933867 (Counterclockwise)
Preceding gene: 150008268
Following gene: 150008266
Centisome position: 40.24
GC content: 45.42
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases TATAACAGGTAATATAAAATTACGTATGAAAACTATTTTGAGGAATCTCTTGAGTGTATTGCGCCGTTTCAAGATGGCGA CACTTTTAAATGTATTAGGA
Product: putative ABC transporter membrane protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 774; Mature: 774
Protein sequence:
>774_residues MRQLYYTIRYLLRGRGGNVIKVLSLTLGLGVGLILFARVAFELSFDTFFDQVEDLYSVHVRYNDDKTGEEDGSRILFAPI PEALRQEFPEIQYATVCRRRYGAVLYHGEDRFKPRLMMADSLFFRTMGIKVLRGDDRLLGIEDQVFLSEKMAERIFGKED PIGKQLLYGKNYPYTVAGIFRDIPENSHLRFDAVASFINMKTQFGAYAGWGADDSYLGYIRLKPGVFPEQINQKIPALLP KYIDVERERKQGFDMELYIKPVSEIYTQSTEVKRMVVIMSVLAFALLFVAAMNYILNSVSSLPIRARSVGVHKCNGASSK DIFNMFLFETAALFVVALVCMALLLFAFREYVADMAAVPTLGTLLNAQTIWLPAIMILAIFILSALLPARLFSVIPVTQV FRVSTSGKQGWKRSLLFIQFGGIAFVITLLVIVLLQYDRLMNNDLGYDPENIVYAPLNNMDDPETAKLTAEFKKLPYVTA TGLSSMDILSGYGGFPILDNEKNWLFTARQVNYDADYLSLMKIPLLEGQPLKGDGDILVNESFVSKRGWTDAAIGKYIYD DEGNLKGKIVGVTRDFMVNSFFTPQLPVIMFGSDRMSYCNFTVRVSELTPEYLREMNDRIAELFPDEDVGFTVLKTIIES QYEGTRHFRDGVFVASIAILLITLMGLLGYITDEMHRRSKEIAIRKVNGATAPNILRLLSKDVLVTAFPAILLGVIASRV VGESWLRQFADKIPLTVFIFISTALLVLAIIWGCVILKSWNIANENPVRSIKNE
Sequences:
>Translated_774_residues MRQLYYTIRYLLRGRGGNVIKVLSLTLGLGVGLILFARVAFELSFDTFFDQVEDLYSVHVRYNDDKTGEEDGSRILFAPI PEALRQEFPEIQYATVCRRRYGAVLYHGEDRFKPRLMMADSLFFRTMGIKVLRGDDRLLGIEDQVFLSEKMAERIFGKED PIGKQLLYGKNYPYTVAGIFRDIPENSHLRFDAVASFINMKTQFGAYAGWGADDSYLGYIRLKPGVFPEQINQKIPALLP KYIDVERERKQGFDMELYIKPVSEIYTQSTEVKRMVVIMSVLAFALLFVAAMNYILNSVSSLPIRARSVGVHKCNGASSK DIFNMFLFETAALFVVALVCMALLLFAFREYVADMAAVPTLGTLLNAQTIWLPAIMILAIFILSALLPARLFSVIPVTQV FRVSTSGKQGWKRSLLFIQFGGIAFVITLLVIVLLQYDRLMNNDLGYDPENIVYAPLNNMDDPETAKLTAEFKKLPYVTA TGLSSMDILSGYGGFPILDNEKNWLFTARQVNYDADYLSLMKIPLLEGQPLKGDGDILVNESFVSKRGWTDAAIGKYIYD DEGNLKGKIVGVTRDFMVNSFFTPQLPVIMFGSDRMSYCNFTVRVSELTPEYLREMNDRIAELFPDEDVGFTVLKTIIES QYEGTRHFRDGVFVASIAILLITLMGLLGYITDEMHRRSKEIAIRKVNGATAPNILRLLSKDVLVTAFPAILLGVIASRV VGESWLRQFADKIPLTVFIFISTALLVLAIIWGCVILKSWNIANENPVRSIKNE >Mature_774_residues MRQLYYTIRYLLRGRGGNVIKVLSLTLGLGVGLILFARVAFELSFDTFFDQVEDLYSVHVRYNDDKTGEEDGSRILFAPI PEALRQEFPEIQYATVCRRRYGAVLYHGEDRFKPRLMMADSLFFRTMGIKVLRGDDRLLGIEDQVFLSEKMAERIFGKED PIGKQLLYGKNYPYTVAGIFRDIPENSHLRFDAVASFINMKTQFGAYAGWGADDSYLGYIRLKPGVFPEQINQKIPALLP KYIDVERERKQGFDMELYIKPVSEIYTQSTEVKRMVVIMSVLAFALLFVAAMNYILNSVSSLPIRARSVGVHKCNGASSK DIFNMFLFETAALFVVALVCMALLLFAFREYVADMAAVPTLGTLLNAQTIWLPAIMILAIFILSALLPARLFSVIPVTQV FRVSTSGKQGWKRSLLFIQFGGIAFVITLLVIVLLQYDRLMNNDLGYDPENIVYAPLNNMDDPETAKLTAEFKKLPYVTA TGLSSMDILSGYGGFPILDNEKNWLFTARQVNYDADYLSLMKIPLLEGQPLKGDGDILVNESFVSKRGWTDAAIGKYIYD DEGNLKGKIVGVTRDFMVNSFFTPQLPVIMFGSDRMSYCNFTVRVSELTPEYLREMNDRIAELFPDEDVGFTVLKTIIES QYEGTRHFRDGVFVASIAILLITLMGLLGYITDEMHRRSKEIAIRKVNGATAPNILRLLSKDVLVTAFPAILLGVIASRV VGESWLRQFADKIPLTVFIFISTALLVLAIIWGCVILKSWNIANENPVRSIKNE
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 87338; Mature: 87338
Theoretical pI: Translated: 7.10; Mature: 7.10
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.6 %Cys (Translated Protein) 3.1 %Met (Translated Protein) 3.7 %Cys+Met (Translated Protein) 0.6 %Cys (Mature Protein) 3.1 %Met (Mature Protein) 3.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MRQLYYTIRYLLRGRGGNVIKVLSLTLGLGVGLILFARVAFELSFDTFFDQVEDLYSVHV CCHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE RYNDDKTGEEDGSRILFAPIPEALRQEFPEIQYATVCRRRYGAVLYHGEDRFKPRLMMAD EECCCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCEEEECCCCCCCCHHHHHH SLFFRTMGIKVLRGDDRLLGIEDQVFLSEKMAERIFGKEDPIGKQLLYGKNYPYTVAGIF HHHHHHHCEEEEECCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHCCCCCCEEHHHHH RDIPENSHLRFDAVASFINMKTQFGAYAGWGADDSYLGYIRLKPGVFPEQINQKIPALLP HHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHCHHHHHHH KYIDVERERKQGFDMELYIKPVSEIYTQSTEVKRMVVIMSVLAFALLFVAAMNYILNSVS HHHCCHHHHHCCCCEEEEEECHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SLPIRARSVGVHKCNGASSKDIFNMFLFETAALFVVALVCMALLLFAFREYVADMAAVPT CCCEEHHHCCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LGTLLNAQTIWLPAIMILAIFILSALLPARLFSVIPVTQVFRVSTSGKQGWKRSLLFIQF HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHEECCCCCCCHHHEEEEEEE GGIAFVITLLVIVLLQYDRLMNNDLGYDPENIVYAPLNNMDDPETAKLTAEFKKLPYVTA CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCEEEE TGLSSMDILSGYGGFPILDNEKNWLFTARQVNYDADYLSLMKIPLLEGQPLKGDGDILVN CCCCHHHHHHCCCCCCEEECCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEE ESFVSKRGWTDAAIGKYIYDDEGNLKGKIVGVTRDFMVNSFFTPQLPVIMFGSDRMSYCN HHHHHCCCCCHHHHCCEEECCCCCCCEEEEEEEHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCEEEE FTVRVSELTPEYLREMNDRIAELFPDEDVGFTVLKTIIESQYEGTRHFRDGVFVASIAIL EEEEEHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCHHHHHHHHHH LITLMGLLGYITDEMHRRSKEIAIRKVNGATAPNILRLLSKDVLVTAFPAILLGVIASRV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VGESWLRQFADKIPLTVFIFISTALLVLAIIWGCVILKSWNIANENPVRSIKNE HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHCCCC >Mature Secondary Structure MRQLYYTIRYLLRGRGGNVIKVLSLTLGLGVGLILFARVAFELSFDTFFDQVEDLYSVHV CCHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE RYNDDKTGEEDGSRILFAPIPEALRQEFPEIQYATVCRRRYGAVLYHGEDRFKPRLMMAD EECCCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCEEEECCCCCCCCHHHHHH SLFFRTMGIKVLRGDDRLLGIEDQVFLSEKMAERIFGKEDPIGKQLLYGKNYPYTVAGIF HHHHHHHCEEEEECCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHCCCCCCEEHHHHH RDIPENSHLRFDAVASFINMKTQFGAYAGWGADDSYLGYIRLKPGVFPEQINQKIPALLP HHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHCHHHHHHH KYIDVERERKQGFDMELYIKPVSEIYTQSTEVKRMVVIMSVLAFALLFVAAMNYILNSVS HHHCCHHHHHCCCCEEEEEECHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SLPIRARSVGVHKCNGASSKDIFNMFLFETAALFVVALVCMALLLFAFREYVADMAAVPT CCCEEHHHCCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LGTLLNAQTIWLPAIMILAIFILSALLPARLFSVIPVTQVFRVSTSGKQGWKRSLLFIQF HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHEECCCCCCCHHHEEEEEEE GGIAFVITLLVIVLLQYDRLMNNDLGYDPENIVYAPLNNMDDPETAKLTAEFKKLPYVTA CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCEEEE TGLSSMDILSGYGGFPILDNEKNWLFTARQVNYDADYLSLMKIPLLEGQPLKGDGDILVN CCCCHHHHHHCCCCCCEEECCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEE ESFVSKRGWTDAAIGKYIYDDEGNLKGKIVGVTRDFMVNSFFTPQLPVIMFGSDRMSYCN HHHHHCCCCCHHHHCCEEECCCCCCCEEEEEEEHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCEEEE FTVRVSELTPEYLREMNDRIAELFPDEDVGFTVLKTIIESQYEGTRHFRDGVFVASIAIL EEEEEHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCHHHHHHHHHH LITLMGLLGYITDEMHRRSKEIAIRKVNGATAPNILRLLSKDVLVTAFPAILLGVIASRV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VGESWLRQFADKIPLTVFIFISTALLVLAIIWGCVILKSWNIANENPVRSIKNE HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA