Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 150008264

Identifier: 150008264

GI number: 150008264

Start: 1926348

End: 1928714

Strand: Reverse

Name: 150008264

Synonym: BDI_1633

Alternate gene names: NA

Gene position: 1928714-1926348 (Counterclockwise)

Preceding gene: 150008265

Following gene: 150008261

Centisome position: 40.09

GC content: 45.37

Gene sequence:

>2367_bases
ATGAAAACGATTATTCGGAACTTTCTGAGTGTGTTGAGGCGGTTTAAAATGGCGACCGCATTGAACGTAGCCGGTCTTGC
GGTTGCTTTCGCCGCTTTTATCGTGATTTTGATACAGATTAATTTTGAGCGGACTTTTGATCGTTGCCATCCTACGTCCG
GGCGGATTTTTAGGGTGGACTTGACCATTCCGGGTACTTTCGGGACAATATTACCCCGTGCCTTTGTGGAGGCTGTCATC
CAATCTTCCCCGCATATAGAGGCGGGTACATTGTTGACTCCTTCTTTTGGCCAGAATGGTGTTTATCTCTCGGTGGATAG
AAACGGGCAACCGTTTGGGTTTAAGGAAATCGTGACAACCTGCCACGCTAGTTTACCGAAGATATTCGCGTTCCCGATCG
TGGAAGGCGATATCGATTGCTTGAAAGATCCTGAGAAAGTAATGGTACCCCGAAGCTTGGCTGACAAGTTGTTTGGGGAA
GACATCTCTGCGGTTGGTAAGACGTTGCGAGCGGAAGAAAATATCTGGACTAAATCGGCTAAACTCTTTACGATTGGTGC
GGTTTATAAGGATTTCCCGGAGAACACGCAGCTTCGGAACGTGGTCTATACGGCGATCGATCCGGATTATAATATCAATA
ATTTTAGCTCAAGTAACTGGGTTTGTTATTTATTGCTTGATAATCCTGCCATGGCAGATGAGGTTGCCGATAATTTCAAC
CGTCATTTTGATTTCAAGAAGATTTACCATGAAGGAGAACAGATCCGGCTCGTCCCGCTGACTGATATTTATTATATGAA
TGAGACGCAAGACGGTGGTACATTCCGGAGCGGAAACAAGGAAGTCACGGCCTTATTGTTCGGTATAGCCCTTCTGATTG
TCATTGTCGCGGCTATTAACTTCACGAACTTTAGCACTTCTTTGACTCCGTTGCGAATCAAAAGCATCAATACGCAGAAG
GTATTGGGTAGCTCGGATACTTTGTTGCGCAGATCTTTATTGATAGAGGCAGCCCTTATTAGTTTTATGGCGTGGCTGGT
AAGTCTCGTTATCGTTTGGGGATTGGATTGGGCGGAAGCGTTACCTTTTATCGAGGCCGATTTGAGTTTGGTCTCAAATC
TTCCGATCGTTTTCTTGTGTGGCATCGTAGCGTTGGTTATCGGTTGGCTGGCGGGTATTTATCCTGCTTATTATATAACT
TCTTTTCCTCCGGCCTTGGTGCTGAAGGGCAGCTTCGGGTTATCTCCTTCCGGGCGTAAGTTACGTACGACATTGATTTG
TGTCCAGTTCGTTGTTTCGATCGTGTTGATTATCGGGGCTTGCTTTGTGCAAATCCAGAATAGTTATATGAGGAATTTCT
CTTTAGGATTCGATAAGGATCAGGTAGCTATCGTGGAGCTGAATGAGACAATGTATAATAAGCATCACGATACATATGTG
AATCGCTTGAAAGAGAATTCGGGGATCGAGGATGTAGCTTTCGCTATGGAGAAAGTGGGCTCTAAGGACGGGTATAACAC
GAATGGCGGTAATTATAAGGGTAAGGACTTTCAGTATTTCATAATTATAGCATCTTCCAATTTCTTGCGGGTGATGGGGA
TTCCGGTTATAGAAGGGAGAGATTTCTCAAAGGCGGACGAACTTTCGGATCATGTGTCTTATATATTCAATCGTACGGCG
ATGGAGGGGTTGGATATGCAAGTGGGGGACGCGTTCGATAGCTATTCTTCCGGTCATCTTATCGGTTTCTCCGACGATGT
GAAATTCACCTCGCTTCGTGGTGGAGAGGATAATATCGCTTTCTTGGTCGGAAACTTTGGTTATTCTTTGCCAATCTCTT
ATATCCGCTTGAAAGCCGGATCGGACTTTCATGCCGTAGTAGGTCACATCCAGGAGACGATGAGAGAATTAGATCCTTCT
TATCCGTTCAATATCGAGTTCTATGATGAGATCTTTAATCATCTTTACCAGAAAGAGGAGAACCTACGCGATCTGGTTAC
GATCTTTAGCTTGCTGGCGATTATTATCTCTTTGGTCGGGGTATTTGGCTTAGTGGTGTTCGAGACTCAATACCGCCGTA
AGGAAATAGGTATCCGCAAGGTACATGGAGCTACGGTAGGGGAGATCCTGCTGATGTTTAATAAGGCCTATCTGAGGATT
GTAGGTATTTGCTTCGTGATAGCGGCGCCGATCGCTTGGCAGGGCGTGAGGATGTGGCTCGAGGGTTTCGCTTATAAGAC
TCCACTTCATTGGTGGGTATTCTTAATCGCCTTATTGATCGTAACCGTAATCACGTTATTGACCGTGAGTTTCCAGAACT
GGAAAGCGGCGAACGAGAACCCGGTAAATAGTATCAAGAGCGAGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATAACGATGTTTACGGTAACTTTCCAGAACTGGCGTGCGGCGAACGCGAACCCGGTGGATAGCATTAAGACGGAATAATA
AATGAAACTATAATAATAAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCCACCATCCCATCTTCCACGCCAGCAGCAAGATAAGTAGGGAAAGGACCAAGCAGGCTAATAGCAACCAAACTCCCAAT
CCGTTTACGAAAAGGATGGG

Product: putative transporter permease

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 788; Mature: 788

Protein sequence:

>788_residues
MKTIIRNFLSVLRRFKMATALNVAGLAVAFAAFIVILIQINFERTFDRCHPTSGRIFRVDLTIPGTFGTILPRAFVEAVI
QSSPHIEAGTLLTPSFGQNGVYLSVDRNGQPFGFKEIVTTCHASLPKIFAFPIVEGDIDCLKDPEKVMVPRSLADKLFGE
DISAVGKTLRAEENIWTKSAKLFTIGAVYKDFPENTQLRNVVYTAIDPDYNINNFSSSNWVCYLLLDNPAMADEVADNFN
RHFDFKKIYHEGEQIRLVPLTDIYYMNETQDGGTFRSGNKEVTALLFGIALLIVIVAAINFTNFSTSLTPLRIKSINTQK
VLGSSDTLLRRSLLIEAALISFMAWLVSLVIVWGLDWAEALPFIEADLSLVSNLPIVFLCGIVALVIGWLAGIYPAYYIT
SFPPALVLKGSFGLSPSGRKLRTTLICVQFVVSIVLIIGACFVQIQNSYMRNFSLGFDKDQVAIVELNETMYNKHHDTYV
NRLKENSGIEDVAFAMEKVGSKDGYNTNGGNYKGKDFQYFIIIASSNFLRVMGIPVIEGRDFSKADELSDHVSYIFNRTA
MEGLDMQVGDAFDSYSSGHLIGFSDDVKFTSLRGGEDNIAFLVGNFGYSLPISYIRLKAGSDFHAVVGHIQETMRELDPS
YPFNIEFYDEIFNHLYQKEENLRDLVTIFSLLAIIISLVGVFGLVVFETQYRRKEIGIRKVHGATVGEILLMFNKAYLRI
VGICFVIAAPIAWQGVRMWLEGFAYKTPLHWWVFLIALLIVTVITLLTVSFQNWKAANENPVNSIKSE

Sequences:

>Translated_788_residues
MKTIIRNFLSVLRRFKMATALNVAGLAVAFAAFIVILIQINFERTFDRCHPTSGRIFRVDLTIPGTFGTILPRAFVEAVI
QSSPHIEAGTLLTPSFGQNGVYLSVDRNGQPFGFKEIVTTCHASLPKIFAFPIVEGDIDCLKDPEKVMVPRSLADKLFGE
DISAVGKTLRAEENIWTKSAKLFTIGAVYKDFPENTQLRNVVYTAIDPDYNINNFSSSNWVCYLLLDNPAMADEVADNFN
RHFDFKKIYHEGEQIRLVPLTDIYYMNETQDGGTFRSGNKEVTALLFGIALLIVIVAAINFTNFSTSLTPLRIKSINTQK
VLGSSDTLLRRSLLIEAALISFMAWLVSLVIVWGLDWAEALPFIEADLSLVSNLPIVFLCGIVALVIGWLAGIYPAYYIT
SFPPALVLKGSFGLSPSGRKLRTTLICVQFVVSIVLIIGACFVQIQNSYMRNFSLGFDKDQVAIVELNETMYNKHHDTYV
NRLKENSGIEDVAFAMEKVGSKDGYNTNGGNYKGKDFQYFIIIASSNFLRVMGIPVIEGRDFSKADELSDHVSYIFNRTA
MEGLDMQVGDAFDSYSSGHLIGFSDDVKFTSLRGGEDNIAFLVGNFGYSLPISYIRLKAGSDFHAVVGHIQETMRELDPS
YPFNIEFYDEIFNHLYQKEENLRDLVTIFSLLAIIISLVGVFGLVVFETQYRRKEIGIRKVHGATVGEILLMFNKAYLRI
VGICFVIAAPIAWQGVRMWLEGFAYKTPLHWWVFLIALLIVTVITLLTVSFQNWKAANENPVNSIKSE
>Mature_788_residues
MKTIIRNFLSVLRRFKMATALNVAGLAVAFAAFIVILIQINFERTFDRCHPTSGRIFRVDLTIPGTFGTILPRAFVEAVI
QSSPHIEAGTLLTPSFGQNGVYLSVDRNGQPFGFKEIVTTCHASLPKIFAFPIVEGDIDCLKDPEKVMVPRSLADKLFGE
DISAVGKTLRAEENIWTKSAKLFTIGAVYKDFPENTQLRNVVYTAIDPDYNINNFSSSNWVCYLLLDNPAMADEVADNFN
RHFDFKKIYHEGEQIRLVPLTDIYYMNETQDGGTFRSGNKEVTALLFGIALLIVIVAAINFTNFSTSLTPLRIKSINTQK
VLGSSDTLLRRSLLIEAALISFMAWLVSLVIVWGLDWAEALPFIEADLSLVSNLPIVFLCGIVALVIGWLAGIYPAYYIT
SFPPALVLKGSFGLSPSGRKLRTTLICVQFVVSIVLIIGACFVQIQNSYMRNFSLGFDKDQVAIVELNETMYNKHHDTYV
NRLKENSGIEDVAFAMEKVGSKDGYNTNGGNYKGKDFQYFIIIASSNFLRVMGIPVIEGRDFSKADELSDHVSYIFNRTA
MEGLDMQVGDAFDSYSSGHLIGFSDDVKFTSLRGGEDNIAFLVGNFGYSLPISYIRLKAGSDFHAVVGHIQETMRELDPS
YPFNIEFYDEIFNHLYQKEENLRDLVTIFSLLAIIISLVGVFGLVVFETQYRRKEIGIRKVHGATVGEILLMFNKAYLRI
VGICFVIAAPIAWQGVRMWLEGFAYKTPLHWWVFLIALLIVTVITLLTVSFQNWKAANENPVNSIKSE

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 88220; Mature: 88220

Theoretical pI: Translated: 6.29; Mature: 6.29

Prosite motif: PS00157 RUBISCO_LARGE

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
1.9 %Met     (Translated Protein)
2.9 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
1.9 %Met     (Mature Protein)
2.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKTIIRNFLSVLRRFKMATALNVAGLAVAFAAFIVILIQINFERTFDRCHPTSGRIFRVD
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECHHHHHHHCCCCCCCEEEEE
LTIPGTFGTILPRAFVEAVIQSSPHIEAGTLLTPSFGQNGVYLSVDRNGQPFGFKEIVTT
EEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEECCCCCCCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHH
CHASLPKIFAFPIVEGDIDCLKDPEKVMVPRSLADKLFGEDISAVGKTLRAEENIWTKSA
HHHCCCHHEEEEEECCCHHHCCCCHHHCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCHHCCCC
KLFTIGAVYKDFPENTQLRNVVYTAIDPDYNINNFSSSNWVCYLLLDNPAMADEVADNFN
EEEEEEHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHH
RHFDFKKIYHEGEQIRLVPLTDIYYMNETQDGGTFRSGNKEVTALLFGIALLIVIVAAIN
HCCCHHHHHCCCCEEEEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
FTNFSTSLTPLRIKSINTQKVLGSSDTLLRRSLLIEAALISFMAWLVSLVIVWGLDWAEA
CCCCCCCCCCEEEECCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
LPFIEADLSLVSNLPIVFLCGIVALVIGWLAGIYPAYYITSFPPALVLKGSFGLSPSGRK
CCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCCCCH
LRTTLICVQFVVSIVLIIGACFVQIQNSYMRNFSLGFDKDQVAIVELNETMYNKHHDTYV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEECHHHHHCHHHHHH
NRLKENSGIEDVAFAMEKVGSKDGYNTNGGNYKGKDFQYFIIIASSNFLRVMGIPVIEGR
HHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCEEEEECCEEECCC
DFSKADELSDHVSYIFNRTAMEGLDMQVGDAFDSYSSGHLIGFSDDVKFTSLRGGEDNIA
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHCCCCCCCCCCCEEEECCCCEEEEECCCCCCEE
FLVGNFGYSLPISYIRLKAGSDFHAVVGHIQETMRELDPSYPFNIEFYDEIFNHLYQKEE
EEEECCCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHH
NLRDLVTIFSLLAIIISLVGVFGLVVFETQYRRKEIGIRKVHGATVGEILLMFNKAYLRI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHH
VGICFVIAAPIAWQGVRMWLEGFAYKTPLHWWVFLIALLIVTVITLLTVSFQNWKAANEN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC
PVNSIKSE
CCHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MKTIIRNFLSVLRRFKMATALNVAGLAVAFAAFIVILIQINFERTFDRCHPTSGRIFRVD
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECHHHHHHHCCCCCCCEEEEE
LTIPGTFGTILPRAFVEAVIQSSPHIEAGTLLTPSFGQNGVYLSVDRNGQPFGFKEIVTT
EEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEECCCCCCCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHH
CHASLPKIFAFPIVEGDIDCLKDPEKVMVPRSLADKLFGEDISAVGKTLRAEENIWTKSA
HHHCCCHHEEEEEECCCHHHCCCCHHHCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCHHCCCC
KLFTIGAVYKDFPENTQLRNVVYTAIDPDYNINNFSSSNWVCYLLLDNPAMADEVADNFN
EEEEEEHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHH
RHFDFKKIYHEGEQIRLVPLTDIYYMNETQDGGTFRSGNKEVTALLFGIALLIVIVAAIN
HCCCHHHHHCCCCEEEEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
FTNFSTSLTPLRIKSINTQKVLGSSDTLLRRSLLIEAALISFMAWLVSLVIVWGLDWAEA
CCCCCCCCCCEEEECCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
LPFIEADLSLVSNLPIVFLCGIVALVIGWLAGIYPAYYITSFPPALVLKGSFGLSPSGRK
CCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCCCCH
LRTTLICVQFVVSIVLIIGACFVQIQNSYMRNFSLGFDKDQVAIVELNETMYNKHHDTYV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEECHHHHHCHHHHHH
NRLKENSGIEDVAFAMEKVGSKDGYNTNGGNYKGKDFQYFIIIASSNFLRVMGIPVIEGR
HHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCEEEEECCEEECCC
DFSKADELSDHVSYIFNRTAMEGLDMQVGDAFDSYSSGHLIGFSDDVKFTSLRGGEDNIA
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHCCCCCCCCCCCEEEECCCCEEEEECCCCCCEE
FLVGNFGYSLPISYIRLKAGSDFHAVVGHIQETMRELDPSYPFNIEFYDEIFNHLYQKEE
EEEECCCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHH
NLRDLVTIFSLLAIIISLVGVFGLVVFETQYRRKEIGIRKVHGATVGEILLMFNKAYLRI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHH
VGICFVIAAPIAWQGVRMWLEGFAYKTPLHWWVFLIALLIVTVITLLTVSFQNWKAANEN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC
PVNSIKSE
CCHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA