Definition | Psychrobacter sp. PRwf-1 chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_009524 |
Length | 2,978,976 |
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The map label for this gene is fbpB2 [H]
Identifier: 148652679
GI number: 148652679
Start: 1030489
End: 1032090
Strand: Direct
Name: fbpB2 [H]
Synonym: PsycPRwf_0870
Alternate gene names: 148652679
Gene position: 1030489-1032090 (Clockwise)
Preceding gene: 148652678
Following gene: 148652680
Centisome position: 34.59
GC content: 47.0
Gene sequence:
>1602_bases ATGAAAGCAACTATCTCTAAAGGGTCCTTAATAGCGAAATCAATCTTAGTATTGGTTTCGCTATTTATGTTGATACCTGT CTTTATTGTTATGCGCTCTTGGCTTGAGCCCATGGCTGATATCTGGAAGCATTTGGCAGATTATGTACTGCCACAAGTAC TCAAAAACACCGCCTTAATCTTATTACTTGTCACGTTGATTGCGGGTAGTTTAGGTACTTATTTGGCGTGGCTGACCAGC ATGTATCGCTTTACCGGACAGAAGTTTTTTGTTTGGGCTTTAATGCTACCCTTTGCTATTCCTGCTTATGTGCTGGCCTT TGTTAGTGTTGGGCTCTTTGATTATAGCGGCGTGCTACAGACCACTTTAAGAGAGCTGAATATAACGGGCGCACTTGGGG CACAAATTCGTAGTGTCTGGGGCGCTGGAATTATCTTATCATTGGTATTTTATCCTTACGTGTATCTGCTGGCGCGGCAA GCCTTTTTATCCCAAGGCCAGCGTGCATTAGAGGCCGGACAAATGCTGGGACTTACCCGCAGACAGGCCTTTTTTAAAGT GGCACTACCACAGGCCATGCCTTGGATTGTGGGTGGTTTGCTGCTGACGTGGATGGAGACTTTGGCCGACTTTGGTGCGG TCTCAGTATTTAATCTAGATACCTTTACTACAGCCATTTACAAAGCTTGGTTTGGCTTCTTTAGCTTAACCACAGCTGCC CAGCTGGCCGCCTTGCTTATCATTACTGTGTTTTTAATTTTGATAATCGAGCGCTATTGGCAAAAAAAACGCAGCTATTT ACCCAGCGCTGGCCATCGTCAGCGTGAAGAGCTTACCGGACTGCGTAATCTATGGGCCTTTGGCTTTAGCCTGCTTATCT TTATTTTGGCTTTTGGCTTACCGATGACTCAGCTTATCGTCTGGGTGATAAAAAACTATCACATAGATCTAGATGAGCGC TATTGGGGCTTTGTCAAAAATACCTTGGTGATAGCAGGCGCTACGGCCATCGCCATTGCGTTAGTTGCGCTATTGATAGC TTGGATGCTGCGTCAATACCCAAGCCGCAGCAATCAGCTGTTGGTATCCTTGGCCAACTTGGGCTATGCCGTCCCAGGCA CGGTACTGGCAGTGGGGGTGTTTATTCCCATTGCTTGGATAGATAATTTATTAATTGCCCAGCACATTACCACCACTCAA GTGGTCAGTGGCAGTGTGATTGTCATGCTATGCGCTTTGGCCACCCGGTTTATGACGGTAGGCTTTCAGCCGATAGATCG CCAGTTGAATCGCTTAACGCCAAGTCAAGAGCAGGCGGCACAGCTATTGACCACCAACCGCTTCCAACGCTGGCGCCAGG TATATTTACCGGTGATTAGTCCTGGGGTATTTACTGCGCTGATTATGGTGTTTGTTGAGGTTACCAAAGAGATGCCAATT ACGCTAATGACACGCCGCCAAGGCTGGGATACTTTGGCAGTGCGGGTTTTTGAGATGACCTCTGAGGGGATGTATGAACG GGCCGCATTGCCAAGCTTAACCATCGTCTTGGTGGGATTGATTCCGGTTATTTTGTTAATTCGTCAATCGGATAAAACCT AG
Upstream 100 bases:
>100_bases TAGCAAGATTGTGACACTGCGCTAGAGAGAAAACCAAAATCAGTGCTAAAGTCAAAGGGCAGTGTTCACCGCTTGTCCTA GGGCTTGGCAATAGGGTTTT
Downstream 100 bases:
>100_bases CAGTGCTGCATAAAGCTTGGGTGACTCTAAGCCTTGATTTCTTCAAATATCAATAAGTTAGCTGTCTTAGAAGTAACTTG TTAGTGTGACAACCTTCTTA
Product: binding-protein-dependent transport systems inner membrane component
Products: ADP; phosphate; S2O32- [Cytoplasm]; SO42- [Cytoplasm] [C]
Alternate protein names: Iron(III)-transport system permease protein fbpB 2 [H]
Number of amino acids: Translated: 533; Mature: 533
Protein sequence:
>533_residues MKATISKGSLIAKSILVLVSLFMLIPVFIVMRSWLEPMADIWKHLADYVLPQVLKNTALILLLVTLIAGSLGTYLAWLTS MYRFTGQKFFVWALMLPFAIPAYVLAFVSVGLFDYSGVLQTTLRELNITGALGAQIRSVWGAGIILSLVFYPYVYLLARQ AFLSQGQRALEAGQMLGLTRRQAFFKVALPQAMPWIVGGLLLTWMETLADFGAVSVFNLDTFTTAIYKAWFGFFSLTTAA QLAALLIITVFLILIIERYWQKKRSYLPSAGHRQREELTGLRNLWAFGFSLLIFILAFGLPMTQLIVWVIKNYHIDLDER YWGFVKNTLVIAGATAIAIALVALLIAWMLRQYPSRSNQLLVSLANLGYAVPGTVLAVGVFIPIAWIDNLLIAQHITTTQ VVSGSVIVMLCALATRFMTVGFQPIDRQLNRLTPSQEQAAQLLTTNRFQRWRQVYLPVISPGVFTALIMVFVEVTKEMPI TLMTRRQGWDTLAVRVFEMTSEGMYERAALPSLTIVLVGLIPVILLIRQSDKT
Sequences:
>Translated_533_residues MKATISKGSLIAKSILVLVSLFMLIPVFIVMRSWLEPMADIWKHLADYVLPQVLKNTALILLLVTLIAGSLGTYLAWLTS MYRFTGQKFFVWALMLPFAIPAYVLAFVSVGLFDYSGVLQTTLRELNITGALGAQIRSVWGAGIILSLVFYPYVYLLARQ AFLSQGQRALEAGQMLGLTRRQAFFKVALPQAMPWIVGGLLLTWMETLADFGAVSVFNLDTFTTAIYKAWFGFFSLTTAA QLAALLIITVFLILIIERYWQKKRSYLPSAGHRQREELTGLRNLWAFGFSLLIFILAFGLPMTQLIVWVIKNYHIDLDER YWGFVKNTLVIAGATAIAIALVALLIAWMLRQYPSRSNQLLVSLANLGYAVPGTVLAVGVFIPIAWIDNLLIAQHITTTQ VVSGSVIVMLCALATRFMTVGFQPIDRQLNRLTPSQEQAAQLLTTNRFQRWRQVYLPVISPGVFTALIMVFVEVTKEMPI TLMTRRQGWDTLAVRVFEMTSEGMYERAALPSLTIVLVGLIPVILLIRQSDKT >Mature_533_residues MKATISKGSLIAKSILVLVSLFMLIPVFIVMRSWLEPMADIWKHLADYVLPQVLKNTALILLLVTLIAGSLGTYLAWLTS MYRFTGQKFFVWALMLPFAIPAYVLAFVSVGLFDYSGVLQTTLRELNITGALGAQIRSVWGAGIILSLVFYPYVYLLARQ AFLSQGQRALEAGQMLGLTRRQAFFKVALPQAMPWIVGGLLLTWMETLADFGAVSVFNLDTFTTAIYKAWFGFFSLTTAA QLAALLIITVFLILIIERYWQKKRSYLPSAGHRQREELTGLRNLWAFGFSLLIFILAFGLPMTQLIVWVIKNYHIDLDER YWGFVKNTLVIAGATAIAIALVALLIAWMLRQYPSRSNQLLVSLANLGYAVPGTVLAVGVFIPIAWIDNLLIAQHITTTQ VVSGSVIVMLCALATRFMTVGFQPIDRQLNRLTPSQEQAAQLLTTNRFQRWRQVYLPVISPGVFTALIMVFVEVTKEMPI TLMTRRQGWDTLAVRVFEMTSEGMYERAALPSLTIVLVGLIPVILLIRQSDKT
Specific function: Part of the ABC transporter complex fbpABC (TC 3.A.1.10.1) involved in Fe(3+) ions import. Probably responsible for the translocation of the substrate across the membrane [H]
COG id: COG1178
COG function: function code P; ABC-type Fe3+ transport system, permease component
Gene ontology:
Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 2 ABC transmembrane type-1 domains [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1788764, Length=180, Percent_Identity=29.4444444444444, Blast_Score=75, Evalue=1e-14, Organism=Escherichia coli, GI87082099, Length=284, Percent_Identity=26.7605633802817, Blast_Score=71, Evalue=2e-13,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR000515 [H]
Pfam domain/function: PF00528 BPD_transp_1 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 59724; Mature: 59724
Theoretical pI: Translated: 10.30; Mature: 10.30
Prosite motif: PS50928 ABC_TM1
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 3.4 %Met (Translated Protein) 3.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 3.4 %Met (Mature Protein) 3.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKATISKGSLIAKSILVLVSLFMLIPVFIVMRSWLEPMADIWKHLADYVLPQVLKNTALI CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLLVTLIAGSLGTYLAWLTSMYRFTGQKFFVWALMLPFAIPAYVLAFVSVGLFDYSGVLQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TTLRELNITGALGAQIRSVWGAGIILSLVFYPYVYLLARQAFLSQGQRALEAGQMLGLTR HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RQAFFKVALPQAMPWIVGGLLLTWMETLADFGAVSVFNLDTFTTAIYKAWFGFFSLTTAA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QLAALLIITVFLILIIERYWQKKRSYLPSAGHRQREELTGLRNLWAFGFSLLIFILAFGL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC PMTQLIVWVIKNYHIDLDERYWGFVKNTLVIAGATAIAIALVALLIAWMLRQYPSRSNQL CHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHH LVSLANLGYAVPGTVLAVGVFIPIAWIDNLLIAQHITTTQVVSGSVIVMLCALATRFMTV HHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHC GFQPIDRQLNRLTPSQEQAAQLLTTNRFQRWRQVYLPVISPGVFTALIMVFVEVTKEMPI CCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCE TLMTRRQGWDTLAVRVFEMTSEGMYERAALPSLTIVLVGLIPVILLIRQSDKT EEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC >Mature Secondary Structure MKATISKGSLIAKSILVLVSLFMLIPVFIVMRSWLEPMADIWKHLADYVLPQVLKNTALI CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLLVTLIAGSLGTYLAWLTSMYRFTGQKFFVWALMLPFAIPAYVLAFVSVGLFDYSGVLQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TTLRELNITGALGAQIRSVWGAGIILSLVFYPYVYLLARQAFLSQGQRALEAGQMLGLTR HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RQAFFKVALPQAMPWIVGGLLLTWMETLADFGAVSVFNLDTFTTAIYKAWFGFFSLTTAA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QLAALLIITVFLILIIERYWQKKRSYLPSAGHRQREELTGLRNLWAFGFSLLIFILAFGL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC PMTQLIVWVIKNYHIDLDERYWGFVKNTLVIAGATAIAIALVALLIAWMLRQYPSRSNQL CHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHH LVSLANLGYAVPGTVLAVGVFIPIAWIDNLLIAQHITTTQVVSGSVIVMLCALATRFMTV HHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHC GFQPIDRQLNRLTPSQEQAAQLLTTNRFQRWRQVYLPVISPGVFTALIMVFVEVTKEMPI CCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCE TLMTRRQGWDTLAVRVFEMTSEGMYERAALPSLTIVLVGLIPVILLIRQSDKT EEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: ATP; S2O32- [Periplasm]; H2O; SO42- [Periplasm]; ATP [C]
Specific reaction: ATP + S2O32- [Periplasm] + H2O = ADP + phosphate + S2O32- [Cytoplasm] SO42- [Periplasm] + H2O + ATP = SO42- [Cytoplasm] + phosphate + ADP [C]
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 7542800; 7927717 [H]