| Definition | Legionella pneumophila str. Corby chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009494 |
| Length | 3,576,470 |
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The map label for this gene is sdeB
Identifier: 148359686
GI number: 148359686
Start: 2493848
End: 2499613
Strand: Direct
Name: sdeB
Synonym: LPC_1605
Alternate gene names: NA
Gene position: 2493848-2499613 (Clockwise)
Preceding gene: 148359685
Following gene: 148359688
Centisome position: 69.73
GC content: 39.85
Gene sequence:
>5766_bases ATGCCTAAATACGTAGAAGGGGTAGAATTAACTCAAGAAGGCATGCATGCTATTTTTGCTCGTATGGGGCATGGCGATAT TACCAGCGGTAGCATTTATAATGGAGTACCGACTATTGACACAGATGCCCTGAACAGGCAAGGCTTTATGCCTGTATTAA CAGGGGTAGGCCCCAGAAGAGACTCCGGTCACTGGATCATGTTAATCAAAGGACCTGGTAATCAATACTTTCTCTTTGAC CCACTAGGTAAAACATCAGGCGAAGGTTATAAAAATACTTTATTAGCCCAATTACCCATAGCATCTACTCTTTCTGTTAT TCCCAATAACCCCGGCCTAAACATGGGACTATGCGGGTATTGGGTTGCCTCTGTCGGGCTAAAAGCTCGTGCTGAACTGA ACAAGGACAATCCTCCTGATTTAGAAACCCTGGGGCGAACCACGACAGAGGAAATGAGAAATGAATTAACCGATAACGGT TATCTGAAAATTACAGGGTGGTTACGTGCTGTGGCTGATAACTTTCCAGCAGGCGCCCCCCAACCTGATGCGAAAGCTTT AAGAGAAACTACCGAAAAAGATTTACACATAGAGCTCCCCTCCCCTGTTCCTCCAGTGAAAGACACAGCTCCTAAGGAAG TTTCTACAAAACCTACTGCACCACAAATAGCTCCCAAGCATTCTTTGGACAGTAAGTTATTAGAGAATGACGATGATGTT CTAGACACCATAAAGTATGTTCATAAAGAGTATTTAGGAAAACCATATCCTGGCCCATTAAAAAATCCAAAAGCACCGGA AGAAGGACGACTTCCTCCAAATGAAGGGCCCGATCGAGGACCTCATGGTCTTGCTCATACGGTAAGAACAATGGCTTGTG CTGAGGTGATGATAGAAGAAGCACGCAAAGCTCAACTGAGAGGAGAGACGTTAGGTAAAGCAAAAAATGGTCAGACTTTA 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Upstream 100 bases:
>100_bases TCTTAATACTGTAGTCCTATAATGAAAATAAACATAAGAATATTCACATCTATTAGAGCCAGTATTTGTACATACAAATA TCCGTTTGGGAGAAAGTAAA
Downstream 100 bases:
>100_bases GTGCTTGTTTGCTGGTTAAATGATTGAAATCGACAGCAGATGAGAAAATAAAGACTACGGGTACTTTATTTTCTTATCGC TAAAATTTTGTGATACTCAA
Product: Dot/Icm system substrate protein SdeB
Products: NA
Alternate protein names: Sid Related Protein-Like; Sid -Like Protein; SdeC Protein; Sid Proteins; SdeA Protein; SidE Protein
Number of amino acids: Translated: 1921; Mature: 1920
Protein sequence:
>1921_residues MPKYVEGVELTQEGMHAIFARMGHGDITSGSIYNGVPTIDTDALNRQGFMPVLTGVGPRRDSGHWIMLIKGPGNQYFLFD PLGKTSGEGYKNTLLAQLPIASTLSVIPNNPGLNMGLCGYWVASVGLKARAELNKDNPPDLETLGRTTTEEMRNELTDNG YLKITGWLRAVADNFPAGAPQPDAKALRETTEKDLHIELPSPVPPVKDTAPKEVSTKPTAPQIAPKHSLDSKLLENDDDV LDTIKYVHKEYLGKPYPGPLKNPKAPEEGRLPPNEGPDRGPHGLAHTVRTMACAEVMIEEARKAQLRGETLGKAKNGQTL ADVTPEELKKILIAQAFFVVGRDDERSGYDDVHKRNFYAEYHEKSEQAFRKYVEDNKLIGKIFKDQKEVDFYAAIILDKN HEWDASPAHILINQGHMVDLMRTKAPAEVALERTYNTLKGTVGSKGAEVILKAHRDFFFATGAVVPLVNPEAIDDPSRGG PYENPYSGEKFVIVDDKVPASKKDLPKAVNRDYKLKDNERFLTIKEYYAFPDVQQTYPGYKTRLEGSSYYFPTPFAGECE QNPAKCLGAIQKARSKLQTDAIKNGFQSSSDKERRQPNMDEIAAARIIQQIMANPDCIGNDHVSINGQELGEKFFRDLLA KCDMAVVGSLLNDTDIKNIDTLMRHEKDTEFHSTDPKAVPVRIGDAWENRIRKKGGNVTQMKQDLIFLMQNDAWYFSRVN AIAQNRDKGSTFKEVLFTALMTPLTNKSLMDTSHVPAPKKLYRGLNLPQEFTNKLINQANAIIANTENTLFTDLSAEAFK QIKLNDFSQMSGRTCASTTKNMKLLTDIWGSNVIFEMLDPDGLLHPKQVGTHMAGSEDEFSVYLPEDVALVPTKVTLDGK TDTGEDRYIFTLVAVKSPDFIPRHESGYAVEPFMKMQKEKVTQALDAIEKGKGGYNIDEQLKNLRIEMVRQAKLPLREGI FDRISHRLSLETSDNKISPERRDFLNQHVIPVLQECHIALRTNNMEMMQNALAKFPTDKQWSAFKSGEAVRAKAQMDVLK QQIEKKIMLQTQIIPALTECGEALDKQNVTEALQALNKLPAEKEIGKAKGIGQELRGQIVGVTQELTGNLESLQRAVTTP VVKDAEKMRVRYETLVTDVTKRVTDFEKIKPVNLDSYNKAIADLNNMQQELTLLRNEKIRMHTDKDKAVDFSDIEALEKR LQEAQPNLYPSLVEGTTKGIQELEKIPKSISFDDVKSMTSKINGYLETLEFIRNERVKKHGESTEPLDMSDLDKLKNQLQ GVSQHLAQILLNGAKNSLDKIKDPATLEKEGQYIKRCLDHFAELEKTLDSSVKGMKQKEDFNTYKNSLMEKQEKAYPEML QLQYKSEALITQLRNLCNIHHDNLAKTREEQQQLLNKTGGKLDGFFSQITTAISQAEAKKANELARFKTELNNDKNDVSQ LIQFLVKKKPSELEENLGISKENAEQLHGLLKQLDAKATPIDKLQENTRLIDEISTKMGSKPVSPEHVAATKAREYYQFL LYGTTQKIGNFEKVKPLDPESYKKAMSDLNNMQEALQFLRSEKSRIHDDKEKAVEFSDIEALEKRVKNAQPKLLTALLDK TTRDISALVKIPRKLTFEDIKSMTTKHNSYLETLELIRNERIKQHGESPELLDMSDLDSLKGQLQTFNQNLTGMILNATK DGLDRINNRANFNEGEPYVKTCLDLLTELEKTLDSSVKGMKQKEDISACRNSLLDKQEKANSGMLDLQSKSKDLVTQLRD ICKIHHGNLAEARRAKLHSLDNQEKGLLGGLWSVTNKLGVTTDTVGIERMQIKMKEQTLRAFKTELTNDKLNTDQIIAFL ANKKPSELEEGLGISKENAEELHGLLSKLTSKMTSKIEIEENTQLIDEISTKIGTEPVQLELTRTVDEDESDTYRRESGY I
Sequences:
>Translated_1921_residues MPKYVEGVELTQEGMHAIFARMGHGDITSGSIYNGVPTIDTDALNRQGFMPVLTGVGPRRDSGHWIMLIKGPGNQYFLFD PLGKTSGEGYKNTLLAQLPIASTLSVIPNNPGLNMGLCGYWVASVGLKARAELNKDNPPDLETLGRTTTEEMRNELTDNG YLKITGWLRAVADNFPAGAPQPDAKALRETTEKDLHIELPSPVPPVKDTAPKEVSTKPTAPQIAPKHSLDSKLLENDDDV LDTIKYVHKEYLGKPYPGPLKNPKAPEEGRLPPNEGPDRGPHGLAHTVRTMACAEVMIEEARKAQLRGETLGKAKNGQTL ADVTPEELKKILIAQAFFVVGRDDERSGYDDVHKRNFYAEYHEKSEQAFRKYVEDNKLIGKIFKDQKEVDFYAAIILDKN HEWDASPAHILINQGHMVDLMRTKAPAEVALERTYNTLKGTVGSKGAEVILKAHRDFFFATGAVVPLVNPEAIDDPSRGG PYENPYSGEKFVIVDDKVPASKKDLPKAVNRDYKLKDNERFLTIKEYYAFPDVQQTYPGYKTRLEGSSYYFPTPFAGECE QNPAKCLGAIQKARSKLQTDAIKNGFQSSSDKERRQPNMDEIAAARIIQQIMANPDCIGNDHVSINGQELGEKFFRDLLA KCDMAVVGSLLNDTDIKNIDTLMRHEKDTEFHSTDPKAVPVRIGDAWENRIRKKGGNVTQMKQDLIFLMQNDAWYFSRVN AIAQNRDKGSTFKEVLFTALMTPLTNKSLMDTSHVPAPKKLYRGLNLPQEFTNKLINQANAIIANTENTLFTDLSAEAFK QIKLNDFSQMSGRTCASTTKNMKLLTDIWGSNVIFEMLDPDGLLHPKQVGTHMAGSEDEFSVYLPEDVALVPTKVTLDGK TDTGEDRYIFTLVAVKSPDFIPRHESGYAVEPFMKMQKEKVTQALDAIEKGKGGYNIDEQLKNLRIEMVRQAKLPLREGI FDRISHRLSLETSDNKISPERRDFLNQHVIPVLQECHIALRTNNMEMMQNALAKFPTDKQWSAFKSGEAVRAKAQMDVLK QQIEKKIMLQTQIIPALTECGEALDKQNVTEALQALNKLPAEKEIGKAKGIGQELRGQIVGVTQELTGNLESLQRAVTTP VVKDAEKMRVRYETLVTDVTKRVTDFEKIKPVNLDSYNKAIADLNNMQQELTLLRNEKIRMHTDKDKAVDFSDIEALEKR LQEAQPNLYPSLVEGTTKGIQELEKIPKSISFDDVKSMTSKINGYLETLEFIRNERVKKHGESTEPLDMSDLDKLKNQLQ GVSQHLAQILLNGAKNSLDKIKDPATLEKEGQYIKRCLDHFAELEKTLDSSVKGMKQKEDFNTYKNSLMEKQEKAYPEML QLQYKSEALITQLRNLCNIHHDNLAKTREEQQQLLNKTGGKLDGFFSQITTAISQAEAKKANELARFKTELNNDKNDVSQ LIQFLVKKKPSELEENLGISKENAEQLHGLLKQLDAKATPIDKLQENTRLIDEISTKMGSKPVSPEHVAATKAREYYQFL LYGTTQKIGNFEKVKPLDPESYKKAMSDLNNMQEALQFLRSEKSRIHDDKEKAVEFSDIEALEKRVKNAQPKLLTALLDK TTRDISALVKIPRKLTFEDIKSMTTKHNSYLETLELIRNERIKQHGESPELLDMSDLDSLKGQLQTFNQNLTGMILNATK DGLDRINNRANFNEGEPYVKTCLDLLTELEKTLDSSVKGMKQKEDISACRNSLLDKQEKANSGMLDLQSKSKDLVTQLRD ICKIHHGNLAEARRAKLHSLDNQEKGLLGGLWSVTNKLGVTTDTVGIERMQIKMKEQTLRAFKTELTNDKLNTDQIIAFL ANKKPSELEEGLGISKENAEELHGLLSKLTSKMTSKIEIEENTQLIDEISTKIGTEPVQLELTRTVDEDESDTYRRESGY I >Mature_1920_residues PKYVEGVELTQEGMHAIFARMGHGDITSGSIYNGVPTIDTDALNRQGFMPVLTGVGPRRDSGHWIMLIKGPGNQYFLFDP LGKTSGEGYKNTLLAQLPIASTLSVIPNNPGLNMGLCGYWVASVGLKARAELNKDNPPDLETLGRTTTEEMRNELTDNGY LKITGWLRAVADNFPAGAPQPDAKALRETTEKDLHIELPSPVPPVKDTAPKEVSTKPTAPQIAPKHSLDSKLLENDDDVL DTIKYVHKEYLGKPYPGPLKNPKAPEEGRLPPNEGPDRGPHGLAHTVRTMACAEVMIEEARKAQLRGETLGKAKNGQTLA DVTPEELKKILIAQAFFVVGRDDERSGYDDVHKRNFYAEYHEKSEQAFRKYVEDNKLIGKIFKDQKEVDFYAAIILDKNH EWDASPAHILINQGHMVDLMRTKAPAEVALERTYNTLKGTVGSKGAEVILKAHRDFFFATGAVVPLVNPEAIDDPSRGGP YENPYSGEKFVIVDDKVPASKKDLPKAVNRDYKLKDNERFLTIKEYYAFPDVQQTYPGYKTRLEGSSYYFPTPFAGECEQ NPAKCLGAIQKARSKLQTDAIKNGFQSSSDKERRQPNMDEIAAARIIQQIMANPDCIGNDHVSINGQELGEKFFRDLLAK CDMAVVGSLLNDTDIKNIDTLMRHEKDTEFHSTDPKAVPVRIGDAWENRIRKKGGNVTQMKQDLIFLMQNDAWYFSRVNA IAQNRDKGSTFKEVLFTALMTPLTNKSLMDTSHVPAPKKLYRGLNLPQEFTNKLINQANAIIANTENTLFTDLSAEAFKQ IKLNDFSQMSGRTCASTTKNMKLLTDIWGSNVIFEMLDPDGLLHPKQVGTHMAGSEDEFSVYLPEDVALVPTKVTLDGKT DTGEDRYIFTLVAVKSPDFIPRHESGYAVEPFMKMQKEKVTQALDAIEKGKGGYNIDEQLKNLRIEMVRQAKLPLREGIF DRISHRLSLETSDNKISPERRDFLNQHVIPVLQECHIALRTNNMEMMQNALAKFPTDKQWSAFKSGEAVRAKAQMDVLKQ QIEKKIMLQTQIIPALTECGEALDKQNVTEALQALNKLPAEKEIGKAKGIGQELRGQIVGVTQELTGNLESLQRAVTTPV VKDAEKMRVRYETLVTDVTKRVTDFEKIKPVNLDSYNKAIADLNNMQQELTLLRNEKIRMHTDKDKAVDFSDIEALEKRL QEAQPNLYPSLVEGTTKGIQELEKIPKSISFDDVKSMTSKINGYLETLEFIRNERVKKHGESTEPLDMSDLDKLKNQLQG VSQHLAQILLNGAKNSLDKIKDPATLEKEGQYIKRCLDHFAELEKTLDSSVKGMKQKEDFNTYKNSLMEKQEKAYPEMLQ LQYKSEALITQLRNLCNIHHDNLAKTREEQQQLLNKTGGKLDGFFSQITTAISQAEAKKANELARFKTELNNDKNDVSQL IQFLVKKKPSELEENLGISKENAEQLHGLLKQLDAKATPIDKLQENTRLIDEISTKMGSKPVSPEHVAATKAREYYQFLL YGTTQKIGNFEKVKPLDPESYKKAMSDLNNMQEALQFLRSEKSRIHDDKEKAVEFSDIEALEKRVKNAQPKLLTALLDKT TRDISALVKIPRKLTFEDIKSMTTKHNSYLETLELIRNERIKQHGESPELLDMSDLDSLKGQLQTFNQNLTGMILNATKD GLDRINNRANFNEGEPYVKTCLDLLTELEKTLDSSVKGMKQKEDISACRNSLLDKQEKANSGMLDLQSKSKDLVTQLRDI CKIHHGNLAEARRAKLHSLDNQEKGLLGGLWSVTNKLGVTTDTVGIERMQIKMKEQTLRAFKTELTNDKLNTDQIIAFLA NKKPSELEEGLGISKENAEELHGLLSKLTSKMTSKIEIEENTQLIDEISTKIGTEPVQLELTRTVDEDESDTYRRESGYI
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 216183; Mature: 216052
Theoretical pI: Translated: 6.55; Mature: 6.55
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.7 %Cys (Translated Protein) 2.6 %Met (Translated Protein) 3.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.7 %Cys (Mature Protein) 2.6 %Met (Mature Protein) 3.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MPKYVEGVELTQEGMHAIFARMGHGDITSGSIYNGVPTIDTDALNRQGFMPVLTGVGPRR CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHCCCCCCHHHHHCCCCCC DSGHWIMLIKGPGNQYFLFDPLGKTSGEGYKNTLLAQLPIASTLSVIPNNPGLNMGLCGY CCCCEEEEEECCCCEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHH WVASVGLKARAELNKDNPPDLETLGRTTTEEMRNELTDNGYLKITGWLRAVADNFPAGAP HHHHHCCHHHHHCCCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHCCCCCCC QPDAKALRETTEKDLHIELPSPVPPVKDTAPKEVSTKPTAPQIAPKHSLDSKLLENDDDV CCHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCHHH LDTIKYVHKEYLGKPYPGPLKNPKAPEEGRLPPNEGPDRGPHGLAHTVRTMACAEVMIEE HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH ARKAQLRGETLGKAKNGQTLADVTPEELKKILIAQAFFVVGRDDERSGYDDVHKRNFYAE HHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH YHEKSEQAFRKYVEDNKLIGKIFKDQKEVDFYAAIILDKNHEWDASPAHILINQGHMVDL HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCHHHCEEEEEEEECCCCCCCCCCEEEEECCCEEHH MRTKAPAEVALERTYNTLKGTVGSKGAEVILKAHRDFFFATGAVVPLVNPEAIDDPSRGG 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CCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH FDRISHRLSLETSDNKISPERRDFLNQHVIPVLQECHIALRTNNMEMMQNALAKFPTDKQ HHHHHHHEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCC WSAFKSGEAVRAKAQMDVLKQQIEKKIMLQTQIIPALTECGEALDKQNVTEALQALNKLP HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC AEKEIGKAKGIGQELRGQIVGVTQELTGNLESLQRAVTTPVVKDAEKMRVRYETLVTDVT CHHHHHHHCCCCHHHCCHHEEEHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KRVTDFEKIKPVNLDSYNKAIADLNNMQQELTLLRNEKIRMHTDKDKAVDFSDIEALEKR HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHH LQEAQPNLYPSLVEGTTKGIQELEKIPKSISFDDVKSMTSKINGYLETLEFIRNERVKKH HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC GESTEPLDMSDLDKLKNQLQGVSQHLAQILLNGAKNSLDKIKDPATLEKEGQYIKRCLDH CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH FAELEKTLDSSVKGMKQKEDFNTYKNSLMEKQEKAYPEMLQLQYKSEALITQLRNLCNIH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC HDNLAKTREEQQQLLNKTGGKLDGFFSQITTAISQAEAKKANELARFKTELNNDKNDVSQ 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