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The map label for this gene is yjbG [H]

Identifier: 148267433

GI number: 148267433

Start: 1052614

End: 1054422

Strand: Direct

Name: yjbG [H]

Synonym: SaurJH9_0999

Alternate gene names: 148267433

Gene position: 1052614-1054422 (Clockwise)

Preceding gene: 148267432

Following gene: 148267437

Centisome position: 36.21

GC content: 32.17

Gene sequence:

>1809_bases
ATGAGTCAACAATTATCGAGAGAAGAACAGGAACGTAAATATCCTGAATATACATGGGACTTAACAACAATTTTCAAAGA
TGATGAAGCTTTTGAGGCTGCATTTAAAGAAGTTGAAAATGAGTTAGGCAAAGAAGAACAATTTAAAGGACACATTGGTG
ATAGTGCTGAGACATTATACAATGCGTTAGAATTAGAAGATACATTAGGTACTAAATTAGAAAAAGTATATGTATACGCG
CACCTAAAACAAGACCAAGACACAACGAACGACAAGTATACTGGTATGGAGTCAAGAGCACATCAATTAATTATTAAATT
TAGCTCGGCATGGAGTTTCTTAGTGCCAGAGATTTTACAAATTGATGAAGATAAAATTCAATCATTTGTAAATTCATATG
ATAAATTACAAAAATTCGCATTTGATTTGAAGTTGATTAATGAAAAACGTCCTCATATTTTAGATGCTGAAACTGAAAAG
TTATTAACAGAAGCGCAGGACGCGTTATCAACGCCATCAAATGTATACGGTATGTTTAGCAACGCTGATTTAGTATTTGA
AGATGCGATTGATAAAGATGGAAATGCACACCCGTTAACACAAGGTACATTTATTAAGTATTTAGAATCAGATGATCGCA
AACTAAGAGAAAGTGCTTTTAGAAATGTATATAAAGCATATGGTGCTCATAATAATACGCTTGGCGCTACGCTAGCAGGT
GAAGTGAAGAAAAATGTATTTAATGCTCGTACACACAATTACAAAACTGCAAGAGAAAAAGCATTAAGTAATAATCATAT
TCCAGAAAATGTATATGACAATCTAGTAAAAACTGTACATAAATATTTACCATTGCTACATAGATATACTGAATTGCGCA
AAGAATTGCTAGGTTTAGATGACTTGAAAATGTATGATTTATATACACCATTAATTAAAGATATTAAGTTTGAAATGCCT
TATGAAGAAGCTAAAGAGTGGATGTTAAAAGCTTTAGAACCAATGGGTGAAGAATATTTAAATGTAGTTAAAGAAGGCTT
AAACAATCGTTGGGTCGATGTCTATGAGAATAAAGGTAAACGTTCAGGTGGCTATTCATCAGGTGCACATTTAACTAATC
CATTTATTCTACTTAACTGGTCTAATACTATTTCAGACTTATACACATTAGTTCATGAATTTGGGCATTCAGCACATAGT
TACTTCAGTAGAAAATTCCAACCGTCAAATTCTAGTGACTACACTATTTTTGTCGCTGAAGTTGCATCAACTTGTAACGA
AGCACTTTTAAGTGATTATATGGATAAACATCTTGATGATGAAAAACGCTTATTATTATTAAACCAAGAATTAGAACGTT
TCAGAGCTACATTATTCCGACAAACAATGTTCGCAGAATTTGAGCATAAAATTCATGCAATTGAAGAAGCAGGTGAACCA
TTAACGCCAACCAGAATGAATGAAGAATATGCCAAATTAAATAAATTATACTTCGGTGATTCTGTAGAAACTGATGAAGA
TATTAGTAAGGAATGGTCACGTATTCCACACTTCTATATGAATTATTATGTATATCAATACGCAACTGGTTACAGTGCAG
CTCAAAGCTTAAGTCATCAAATTTTAACAGAAGGTAAGCCAGCAGTAGATAGATATATTAATGAATTCTTGAAAAAAGGT
AGCTCAAATTATCCAATTGAGATATTAAAAAATGCTGGTGTAGATATGACAACACCTGAACCAATTGAACAAGCTTGTGA
AGTTTTTGAACAAAAATTGAACGCTTTTGAAAAATTAATGAAAGCTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTATTTAAATATTTGTTCAGATAGAGGTAATGACGTGCAAATTTTGTTCTAAAATGAGAAAATTATATCAATTATATTT
TATTAGGAGGTTTACTACAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TACTATTGTATTCGCTTACATTATGAACAGATTGTGACAATTTAAATTAAGTACTATTAAAAGGTTGAAATGGTAGAGAT
AGCATGTTATATTATGAACA

Product: oligoendopeptidase F

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 602; Mature: 601

Protein sequence:

>602_residues
MSQQLSREEQERKYPEYTWDLTTIFKDDEAFEAAFKEVENELGKEEQFKGHIGDSAETLYNALELEDTLGTKLEKVYVYA
HLKQDQDTTNDKYTGMESRAHQLIIKFSSAWSFLVPEILQIDEDKIQSFVNSYDKLQKFAFDLKLINEKRPHILDAETEK
LLTEAQDALSTPSNVYGMFSNADLVFEDAIDKDGNAHPLTQGTFIKYLESDDRKLRESAFRNVYKAYGAHNNTLGATLAG
EVKKNVFNARTHNYKTAREKALSNNHIPENVYDNLVKTVHKYLPLLHRYTELRKELLGLDDLKMYDLYTPLIKDIKFEMP
YEEAKEWMLKALEPMGEEYLNVVKEGLNNRWVDVYENKGKRSGGYSSGAHLTNPFILLNWSNTISDLYTLVHEFGHSAHS
YFSRKFQPSNSSDYTIFVAEVASTCNEALLSDYMDKHLDDEKRLLLLNQELERFRATLFRQTMFAEFEHKIHAIEEAGEP
LTPTRMNEEYAKLNKLYFGDSVETDEDISKEWSRIPHFYMNYYVYQYATGYSAAQSLSHQILTEGKPAVDRYINEFLKKG
SSNYPIEILKNAGVDMTTPEPIEQACEVFEQKLNAFEKLMKA

Sequences:

>Translated_602_residues
MSQQLSREEQERKYPEYTWDLTTIFKDDEAFEAAFKEVENELGKEEQFKGHIGDSAETLYNALELEDTLGTKLEKVYVYA
HLKQDQDTTNDKYTGMESRAHQLIIKFSSAWSFLVPEILQIDEDKIQSFVNSYDKLQKFAFDLKLINEKRPHILDAETEK
LLTEAQDALSTPSNVYGMFSNADLVFEDAIDKDGNAHPLTQGTFIKYLESDDRKLRESAFRNVYKAYGAHNNTLGATLAG
EVKKNVFNARTHNYKTAREKALSNNHIPENVYDNLVKTVHKYLPLLHRYTELRKELLGLDDLKMYDLYTPLIKDIKFEMP
YEEAKEWMLKALEPMGEEYLNVVKEGLNNRWVDVYENKGKRSGGYSSGAHLTNPFILLNWSNTISDLYTLVHEFGHSAHS
YFSRKFQPSNSSDYTIFVAEVASTCNEALLSDYMDKHLDDEKRLLLLNQELERFRATLFRQTMFAEFEHKIHAIEEAGEP
LTPTRMNEEYAKLNKLYFGDSVETDEDISKEWSRIPHFYMNYYVYQYATGYSAAQSLSHQILTEGKPAVDRYINEFLKKG
SSNYPIEILKNAGVDMTTPEPIEQACEVFEQKLNAFEKLMKA
>Mature_601_residues
SQQLSREEQERKYPEYTWDLTTIFKDDEAFEAAFKEVENELGKEEQFKGHIGDSAETLYNALELEDTLGTKLEKVYVYAH
LKQDQDTTNDKYTGMESRAHQLIIKFSSAWSFLVPEILQIDEDKIQSFVNSYDKLQKFAFDLKLINEKRPHILDAETEKL
LTEAQDALSTPSNVYGMFSNADLVFEDAIDKDGNAHPLTQGTFIKYLESDDRKLRESAFRNVYKAYGAHNNTLGATLAGE
VKKNVFNARTHNYKTAREKALSNNHIPENVYDNLVKTVHKYLPLLHRYTELRKELLGLDDLKMYDLYTPLIKDIKFEMPY
EEAKEWMLKALEPMGEEYLNVVKEGLNNRWVDVYENKGKRSGGYSSGAHLTNPFILLNWSNTISDLYTLVHEFGHSAHSY
FSRKFQPSNSSDYTIFVAEVASTCNEALLSDYMDKHLDDEKRLLLLNQELERFRATLFRQTMFAEFEHKIHAIEEAGEPL
TPTRMNEEYAKLNKLYFGDSVETDEDISKEWSRIPHFYMNYYVYQYATGYSAAQSLSHQILTEGKPAVDRYINEFLKKGS
SNYPIEILKNAGVDMTTPEPIEQACEVFEQKLNAFEKLMKA

Specific function: Unknown

COG id: COG1164

COG function: function code E; Oligoendopeptidase F

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the peptidase M3B family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001567
- InterPro:   IPR004438
- InterPro:   IPR013647 [H]

Pfam domain/function: PF01432 Peptidase_M3; PF08439 Peptidase_M3_N [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 69806; Mature: 69675

Theoretical pI: Translated: 4.92; Mature: 4.92

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
2.2 %Met     (Translated Protein)
2.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
2.0 %Met     (Mature Protein)
2.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSQQLSREEQERKYPEYTWDLTTIFKDDEAFEAAFKEVENELGKEEQFKGHIGDSAETLY
CCCHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCHHHHHH
NALELEDTLGTKLEKVYVYAHLKQDQDTTNDKYTGMESRAHQLIIKFSSAWSFLVPEILQ
HHHHHHHHHCCHHHHEEEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH
IDEDKIQSFVNSYDKLQKFAFDLKLINEKRPHILDAETEKLLTEAQDALSTPSNVYGMFS
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHEECC
NADLVFEDAIDKDGNAHPLTQGTFIKYLESDDRKLRESAFRNVYKAYGAHNNTLGATLAG
CCCEEEHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHH
EVKKNVFNARTHNYKTAREKALSNNHIPENVYDNLVKTVHKYLPLLHRYTELRKELLGLD
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
DLKMYDLYTPLIKDIKFEMPYEEAKEWMLKALEPMGEEYLNVVKEGLNNRWVDVYENKGK
CHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHCCCCC
RSGGYSSGAHLTNPFILLNWSNTISDLYTLVHEFGHSAHSYFSRKFQPSNSSDYTIFVAE
CCCCCCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEHHH
VASTCNEALLSDYMDKHLDDEKRLLLLNQELERFRATLFRQTMFAEFEHKIHAIEEAGEP
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
LTPTRMNEEYAKLNKLYFGDSVETDEDISKEWSRIPHFYMNYYVYQYATGYSAAQSLSHQ
CCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH
ILTEGKPAVDRYINEFLKKGSSNYPIEILKNAGVDMTTPEPIEQACEVFEQKLNAFEKLM
HHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KA
CC
>Mature Secondary Structure 
SQQLSREEQERKYPEYTWDLTTIFKDDEAFEAAFKEVENELGKEEQFKGHIGDSAETLY
CCHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCHHHHHH
NALELEDTLGTKLEKVYVYAHLKQDQDTTNDKYTGMESRAHQLIIKFSSAWSFLVPEILQ
HHHHHHHHHCCHHHHEEEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH
IDEDKIQSFVNSYDKLQKFAFDLKLINEKRPHILDAETEKLLTEAQDALSTPSNVYGMFS
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHEECC
NADLVFEDAIDKDGNAHPLTQGTFIKYLESDDRKLRESAFRNVYKAYGAHNNTLGATLAG
CCCEEEHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHH
EVKKNVFNARTHNYKTAREKALSNNHIPENVYDNLVKTVHKYLPLLHRYTELRKELLGLD
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
DLKMYDLYTPLIKDIKFEMPYEEAKEWMLKALEPMGEEYLNVVKEGLNNRWVDVYENKGK
CHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHCCCCC
RSGGYSSGAHLTNPFILLNWSNTISDLYTLVHEFGHSAHSYFSRKFQPSNSSDYTIFVAE
CCCCCCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEHHH
VASTCNEALLSDYMDKHLDDEKRLLLLNQELERFRATLFRQTMFAEFEHKIHAIEEAGEP
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
LTPTRMNEEYAKLNKLYFGDSVETDEDISKEWSRIPHFYMNYYVYQYATGYSAAQSLSHQ
CCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH
ILTEGKPAVDRYINEFLKKGSSNYPIEILKNAGVDMTTPEPIEQACEVFEQKLNAFEKLM
HHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KA
CC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]