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The map label for this gene is 146301397

Identifier: 146301397

GI number: 146301397

Start: 4346439

End: 4348820

Strand: Direct

Name: 146301397

Synonym: Fjoh_3655

Alternate gene names: NA

Gene position: 4346439-4348820 (Clockwise)

Preceding gene: 146301396

Following gene: 146301398

Centisome position: 71.29

GC content: 32.41

Gene sequence:

>2382_bases
ATGCATTTAAAATCTATTACAGTTAAAAATTTTAGAAGGCTAAAAAAAACTCAAATTGACTTAGAAAAAGATGATTCAAT
TTTTGTTGGCGCAAATAATAGTGGAAAAACTTCGGCTACCTATCTTTTATATCGCTTTTTAGAAGATCAAAAAGCTAAAT
TTTCTTTGCATGACTTTAGTAGTCATTGTTGGAAAATATTCGATGATTTAGGTAACTCGGAAACTTTACTAAAAGCCTCG
GAATTCCCGTCAATTTCTCTCGATTTATGGTTTCAAATTCAAAGTTCAGATTTGCATAGAGTATTAGATTTACTACCAAG
TTTAGAATGGCAAAATGCTCCTGTTGGAGCTAGAGTTGAATTCAGTGTAAAGGATGTTTCCACACTTATGGAAAATTATA
AACAGGCTAAAAGTAAGGCAGTCGCGAACAAAAAAGAACAATATCATCCTTGGCCTAAAAATCTCTCTGATTATCTACGG
AAAAATCTTAATCAAGAATTCAATTTTAAATTCTATGTTCTTGACTTTGAAAAATTTGACAATGATTTCAATCAGGAGGA
GGGATATGAACCGCTAACATTAGGAAACGACACAGATAGATCTGGGAGTAAGATAATAAAATCAATAATAAAAGTTGATA
TCCTAAATGCTCAAAGGCATCTTACAGATAACAACTCGGCTAGATCTGAAGACCTCTCAAAAAGAATGAATCGTTTTTAC
GAGAGAAATCTTAGGAAAAAAGAAAACGATTATGAAGCGATGCGAGCTCTTGATAATTCTGAAAAAGAATTGACAGCTCA
CTTATCCGAAGTTTTTGCACCAACATTACAAAGTCTAAATAATTTAGGATACAGAGGCTTTAATGACCCTAAACTTCTTA
TTAAAGCAGCTTTGAATTCTGAGATGATTGCTAGTCAGACTAAATTACATTATGCTCTTAGTGACGATCCAGAGTTAATG
GCTTTACCTGACCAATATAATGGTCTAGGATTTAAGAATCTTATATATATGGTAATTGAAATTCTTGATTTTCATGCTCG
GTGGATGGACGATGAAGAAAATCGAGCACCACTTCATCTAGTAATTATTGAAGAGCCAGAAGTTCATCTTCACGCTCAGC
TTCAGCAGGTTTTTATTCGTGAAATTCGTAAGGTAATTCAAAAAGCTGAAACAAGTGAGTTTTTTGCTACACAAGTTGTA
ATATCTACTCATTCCCCTCACATAATTTACGAAAGCGGTTTTAAGCCCATACGTTATTTTCAACGAGAAATAGATGATGA
TGGACATCAAAAGTCAAATGTTCTAAATCTTTCTACATTTTACGATGGTTCGAGACCAAAGACAATAAAATTTCTTCAGC
AATATATGAAGTTAACTCATTGCGATCTTTTCTTCGCTGATGGAACAATTTTAGTAGAAGGAAATGTTGAAAGATTGCTT
TTGCCCATGATGATCAATAAAAGTGCCTCTGAGCTTAATGCTTCTTATATAACTATTATAGAAGTTGGTGGTGCTTTCGC
TCACCTATTCAAAAAGCTTATAAATTTCTTAGGGTTAAAATGCTTAATAATAACGGATATTGACAGTATGTTAGGAAGAG
ATGAAACATCGAAAACCTTGTCTTCAACCGTGTGTTTTGATAATAAAACACCATTTAAAGATAGTCCAGATTCTTTAGAA
AATGGGGAATCTGCTAGCAATATTTTAAACGAAGATGATGAAGATGATGAAGATGATGAAGATGATGAAGATGAAGATGA
TGAAGATGAAGATGAAGATGAAGATGAAGATGAAGATGTAAAAAAAGAAAATAAAAATGGGAAGTGTCCAACCGATACAG
AAAACGCTGTCACTTCAAATCAGACTTTAATAAAATGGTTGCCAAAATTATCAAAAATTTCAGAATTATTCGAAGCAAAT
GATGATGCAAAAACTCAAATTCCATCTGCGATATCTAAGTCTCATGTATTTATAACATACCAAACGCCACAAAAAGTTAC
TTGGGAAGGTAAAAGCAAAAAAATATCTGGGCGAACCATTGAGGAAGCATTTGCATTAGAAAATTTGGCTTGGACGCAAA
AAGTTGAGCATAAAGATTTGAAATTGCGTGTTATAACATTAATTGATAACCGATCACTTGATGAAGTTAAGGATCGTTTG
TATAGGAGAATTAACTTAAATAATTTTAATAAAACTGATTTTGCGCTAAGACTGATGATGAAAAATTCCGAAGAATGGAA
AGTTCCATCGTATATCGATTTAGGATTAAAATGGTTGCAAAAACAGTTATCCGAAGAGCAACAGATTATTAAGAAGACAA
TAACAGTGCAAAAAAAAGATCCTAAGCCAAAAAAAAATAATAAAAAACAAGATCAAATATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGCTTGCAAGAGCATGAGTAAAAATGAATATTCTAATGACATCTCAGTAATATTATTTAATATTACCTTATTACAGTAAC
TTATAATAATATATTTTTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GCGGAAGAATAAATAAACCAGATACTCCTGCTGATAAGAAATTACGTAACTGTTTAAAGACGAAGACGAGCTTTGTAATG
ATTGCAGGCGCGGGATCAGG

Product: ATP-dependent OLD family endonuclease

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 793; Mature: 793

Protein sequence:

>793_residues
MHLKSITVKNFRRLKKTQIDLEKDDSIFVGANNSGKTSATYLLYRFLEDQKAKFSLHDFSSHCWKIFDDLGNSETLLKAS
EFPSISLDLWFQIQSSDLHRVLDLLPSLEWQNAPVGARVEFSVKDVSTLMENYKQAKSKAVANKKEQYHPWPKNLSDYLR
KNLNQEFNFKFYVLDFEKFDNDFNQEEGYEPLTLGNDTDRSGSKIIKSIIKVDILNAQRHLTDNNSARSEDLSKRMNRFY
ERNLRKKENDYEAMRALDNSEKELTAHLSEVFAPTLQSLNNLGYRGFNDPKLLIKAALNSEMIASQTKLHYALSDDPELM
ALPDQYNGLGFKNLIYMVIEILDFHARWMDDEENRAPLHLVIIEEPEVHLHAQLQQVFIREIRKVIQKAETSEFFATQVV
ISTHSPHIIYESGFKPIRYFQREIDDDGHQKSNVLNLSTFYDGSRPKTIKFLQQYMKLTHCDLFFADGTILVEGNVERLL
LPMMINKSASELNASYITIIEVGGAFAHLFKKLINFLGLKCLIITDIDSMLGRDETSKTLSSTVCFDNKTPFKDSPDSLE
NGESASNILNEDDEDDEDDEDDEDEDDEDEDEDEDEDEDVKKENKNGKCPTDTENAVTSNQTLIKWLPKLSKISELFEAN
DDAKTQIPSAISKSHVFITYQTPQKVTWEGKSKKISGRTIEEAFALENLAWTQKVEHKDLKLRVITLIDNRSLDEVKDRL
YRRINLNNFNKTDFALRLMMKNSEEWKVPSYIDLGLKWLQKQLSEEQQIIKKTITVQKKDPKPKKNNKKQDQI

Sequences:

>Translated_793_residues
MHLKSITVKNFRRLKKTQIDLEKDDSIFVGANNSGKTSATYLLYRFLEDQKAKFSLHDFSSHCWKIFDDLGNSETLLKAS
EFPSISLDLWFQIQSSDLHRVLDLLPSLEWQNAPVGARVEFSVKDVSTLMENYKQAKSKAVANKKEQYHPWPKNLSDYLR
KNLNQEFNFKFYVLDFEKFDNDFNQEEGYEPLTLGNDTDRSGSKIIKSIIKVDILNAQRHLTDNNSARSEDLSKRMNRFY
ERNLRKKENDYEAMRALDNSEKELTAHLSEVFAPTLQSLNNLGYRGFNDPKLLIKAALNSEMIASQTKLHYALSDDPELM
ALPDQYNGLGFKNLIYMVIEILDFHARWMDDEENRAPLHLVIIEEPEVHLHAQLQQVFIREIRKVIQKAETSEFFATQVV
ISTHSPHIIYESGFKPIRYFQREIDDDGHQKSNVLNLSTFYDGSRPKTIKFLQQYMKLTHCDLFFADGTILVEGNVERLL
LPMMINKSASELNASYITIIEVGGAFAHLFKKLINFLGLKCLIITDIDSMLGRDETSKTLSSTVCFDNKTPFKDSPDSLE
NGESASNILNEDDEDDEDDEDDEDEDDEDEDEDEDEDEDVKKENKNGKCPTDTENAVTSNQTLIKWLPKLSKISELFEAN
DDAKTQIPSAISKSHVFITYQTPQKVTWEGKSKKISGRTIEEAFALENLAWTQKVEHKDLKLRVITLIDNRSLDEVKDRL
YRRINLNNFNKTDFALRLMMKNSEEWKVPSYIDLGLKWLQKQLSEEQQIIKKTITVQKKDPKPKKNNKKQDQI
>Mature_793_residues
MHLKSITVKNFRRLKKTQIDLEKDDSIFVGANNSGKTSATYLLYRFLEDQKAKFSLHDFSSHCWKIFDDLGNSETLLKAS
EFPSISLDLWFQIQSSDLHRVLDLLPSLEWQNAPVGARVEFSVKDVSTLMENYKQAKSKAVANKKEQYHPWPKNLSDYLR
KNLNQEFNFKFYVLDFEKFDNDFNQEEGYEPLTLGNDTDRSGSKIIKSIIKVDILNAQRHLTDNNSARSEDLSKRMNRFY
ERNLRKKENDYEAMRALDNSEKELTAHLSEVFAPTLQSLNNLGYRGFNDPKLLIKAALNSEMIASQTKLHYALSDDPELM
ALPDQYNGLGFKNLIYMVIEILDFHARWMDDEENRAPLHLVIIEEPEVHLHAQLQQVFIREIRKVIQKAETSEFFATQVV
ISTHSPHIIYESGFKPIRYFQREIDDDGHQKSNVLNLSTFYDGSRPKTIKFLQQYMKLTHCDLFFADGTILVEGNVERLL
LPMMINKSASELNASYITIIEVGGAFAHLFKKLINFLGLKCLIITDIDSMLGRDETSKTLSSTVCFDNKTPFKDSPDSLE
NGESASNILNEDDEDDEDDEDDEDEDDEDEDEDEDEDEDVKKENKNGKCPTDTENAVTSNQTLIKWLPKLSKISELFEAN
DDAKTQIPSAISKSHVFITYQTPQKVTWEGKSKKISGRTIEEAFALENLAWTQKVEHKDLKLRVITLIDNRSLDEVKDRL
YRRINLNNFNKTDFALRLMMKNSEEWKVPSYIDLGLKWLQKQLSEEQQIIKKTITVQKKDPKPKKNNKKQDQI

Specific function: Unknown

COG id: COG3593

COG function: function code L; Predicted ATP-dependent endonuclease of the OLD family

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 91810; Mature: 91810

Theoretical pI: Translated: 5.12; Mature: 5.12

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
1.8 %Met     (Translated Protein)
2.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
1.8 %Met     (Mature Protein)
2.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MHLKSITVKNFRRLKKTQIDLEKDDSIFVGANNSGKTSATYLLYRFLEDQKAKFSLHDFS
CCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHH
SHCWKIFDDLGNSETLLKASEFPSISLDLWFQIQSSDLHRVLDLLPSLEWQNAPVGARVE
HHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEE
FSVKDVSTLMENYKQAKSKAVANKKEQYHPWPKNLSDYLRKNLNQEFNFKFYVLDFEKFD
EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEHHHHC
NDFNQEEGYEPLTLGNDTDRSGSKIIKSIIKVDILNAQRHLTDNNSARSEDLSKRMNRFY
CCCCHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
ERNLRKKENDYEAMRALDNSEKELTAHLSEVFAPTLQSLNNLGYRGFNDPKLLIKAALNS
HHHHHCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCH
EMIASQTKLHYALSDDPELMALPDQYNGLGFKNLIYMVIEILDFHARWMDDEENRAPLHL
HHHHHHHHEEEEECCCCCEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEE
VIIEEPEVHLHAQLQQVFIREIRKVIQKAETSEFFATQVVISTHSPHIIYESGFKPIRYF
EEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHEEEEEEECCCCEEEEECCCHHHHHH
QREIDDDGHQKSNVLNLSTFYDGSRPKTIKFLQQYMKLTHCDLFFADGTILVEGNVERLL
HHHCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCEEEEECCEEEEECCHHHHH
LPMMINKSASELNASYITIIEVGGAFAHLFKKLINFLGLKCLIITDIDSMLGRDETSKTL
HHHHHCCCHHHCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECHHHHHCCCHHHHHH
SSTVCFDNKTPFKDSPDSLENGESASNILNEDDEDDEDDEDDEDEDDEDEDEDEDEDEDV
HHHEEECCCCCCCCCCCHHCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHH
KKENKNGKCPTDTENAVTSNQTLIKWLPKLSKISELFEANDDAKTQIPSAISKSHVFITY
HHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCHHHCCCEEEEEE
QTPQKVTWEGKSKKISGRTIEEAFALENLAWTQKVEHKDLKLRVITLIDNRSLDEVKDRL
ECCCEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHH
YRRINLNNFNKTDFALRLMMKNSEEWKVPSYIDLGLKWLQKQLSEEQQIIKKTITVQKKD
HHHCCCCCCCCHHHHHEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCC
PKPKKNNKKQDQI
CCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MHLKSITVKNFRRLKKTQIDLEKDDSIFVGANNSGKTSATYLLYRFLEDQKAKFSLHDFS
CCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHH
SHCWKIFDDLGNSETLLKASEFPSISLDLWFQIQSSDLHRVLDLLPSLEWQNAPVGARVE
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FSVKDVSTLMENYKQAKSKAVANKKEQYHPWPKNLSDYLRKNLNQEFNFKFYVLDFEKFD
EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEHHHHC
NDFNQEEGYEPLTLGNDTDRSGSKIIKSIIKVDILNAQRHLTDNNSARSEDLSKRMNRFY
CCCCHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
ERNLRKKENDYEAMRALDNSEKELTAHLSEVFAPTLQSLNNLGYRGFNDPKLLIKAALNS
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VIIEEPEVHLHAQLQQVFIREIRKVIQKAETSEFFATQVVISTHSPHIIYESGFKPIRYF
EEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHEEEEEEECCCCEEEEECCCHHHHHH
QREIDDDGHQKSNVLNLSTFYDGSRPKTIKFLQQYMKLTHCDLFFADGTILVEGNVERLL
HHHCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCEEEEECCEEEEECCHHHHH
LPMMINKSASELNASYITIIEVGGAFAHLFKKLINFLGLKCLIITDIDSMLGRDETSKTL
HHHHHCCCHHHCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECHHHHHCCCHHHHHH
SSTVCFDNKTPFKDSPDSLENGESASNILNEDDEDDEDDEDDEDEDDEDEDEDEDEDEDV
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KKENKNGKCPTDTENAVTSNQTLIKWLPKLSKISELFEANDDAKTQIPSAISKSHVFITY
HHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCHHHCCCEEEEEE
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ECCCEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHH
YRRINLNNFNKTDFALRLMMKNSEEWKVPSYIDLGLKWLQKQLSEEQQIIKKTITVQKKD
HHHCCCCCCCCHHHHHEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCC
PKPKKNNKKQDQI
CCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA