| Definition | Flavobacterium johnsoniae UW101 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009441 |
| Length | 6,096,872 |
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The map label for this gene is 146300911
Identifier: 146300911
GI number: 146300911
Start: 3765543
End: 3769544
Strand: Direct
Name: 146300911
Synonym: Fjoh_3166
Alternate gene names: NA
Gene position: 3765543-3769544 (Clockwise)
Preceding gene: 146300910
Following gene: 146300912
Centisome position: 61.76
GC content: 38.56
Gene sequence:
>4002_bases ATGCCAGTTTTAACCAAAAAAACAAATACGAATCCTTCGCACTCCTCGTCACACCATGACAAGGGGAAGGAATCTTTTTT TGGTATAAAGGCAAAATTGAATATAGGAAAATCTAACGATAAATTTGAAATTGAAGCCGATAGAGTGGCTGACCAGGTAG TTGCCAATAAACAAACTGCAAAAACTGAATCTTTCTTTTCGCCGTCGCCCGTAATGCAAAAGAAATTGGCGCGTGATGTT CAAAAACAAGAAGAGCAAAATAAAGACGTACAGCAAAAAACCGCAGCCCAAACCATAACTCCTGTTGTACAGTTAAAAGA GGATTTAATACAAAACAAACTCGATTCCAGAATAACAGAAAAACGAGAAACCAATCCGGTTTTTTCTGCCTCAAAAACGT TAATTCAGCATAAGCTCGAAGATAAAATCCTGAAAAAAGAGGAAACAATTCAGAATAAGACAGAAGTCAAAAAAACAGAA ACTGCCTCAAAAAACATACTTTCACCCAAACCTTTAATTCAAAATAAAGGAGAAGAAGAAAATCTACAACAGAAAAAAGA AGAAGAGAAACAAGCCAAAGACGATGAAAAGCAGCTGCAAAAGAGCCCTTCCGGGGATGCCAGCCCTAGTGATAATTCTA ATTTAGAATCCAAATTAAACAGCAGTAAAGGCGGAGGCTCTCCTCTATCCGGAAAAGTAAAAACCGAAATGGAATCAGGC ATCGGAGCTGATTTCAGCAATGTCCGTATTCACAATGATTCTAATGCTGTTCAAATGAACAAGCAATTAGGTGCGCAGGC TTTTGCTACCGGAAACAATATTTATTTTAACGAAGGAAAATACAATCCCAATTCAAAAGACGGCAAACATTTACTAGCCC ACGAATTAACACATACTGTACAGCAGGGAGCGGCAATTAGAAAAAAACCGGAACCAGTCTCCCCTGCTCCCGAAATGATT CAGGGATCATTATTGTCCTTTGCGATTCCTGATTTCATAAAAGACAACGTTAGACATGTTCCCGGCTATACACTGCTTAC AGTTGTAGCGGGTTATGATCCTTTGAATGACGTAAATGTCGAAAGAAATGCCGTCAATCTTATTGAAGGATTTATGGGAT TGATTCCTTTTGGAACTGCCATATTTGATAAATTACAGGAATATGGTATTATTGATCGTGTTTTTGACTGGGTCAACAGT CGTTTGAGTGAACTGGGGCTAAGTATGGATGCATTACTCCAACTGGTTAAGGATGCTTGGGACGAATCTTCAATTTCAAC TTTTATAGATGTTGTTAGAACCAAATTTAATGACTTGGTAAATCGGGTAACCACTTTCGCATCTTCGCTTGTCGATCAAA TTATAACCTGGATAAAAGAAGCATTGATTGAAGTTGCAGAACCATTATTGGCCGAAAACAAAGCCTATTCACTTCTCAAA AAAATAATCAAATACGATCCGCTGCGCGATAAAGAAGTTACTGCCACAACTGTAGAAATATTAGAAGATTTCTTATTACT GATAGACAAGCAGACAGAGCTTGAGCAAATGCGTGAAAAAGGCACACTGCAAAAAACGGCTGACTGGCTTGATACGCAAG TTGGAACTTTCAATTCACTATTAGGTGAACTCCGCGGACTCATAACTACAGCCTGGAATGCTATTCAGCCTTCGAATCTG GCCAATATCAGCGATAACCTTTCGGCACTTGCTGTTCAGGCTGGAGGATTTTTACAAAGAGTATGGGATTTTGCTTCAGG CGTAGCATTAAAAGTATTAGAACTTGTTAAGGAGTCACTATTAGGATGGCTTTCTGATCAGGCTAAAACGGTAAGAGGTT ATTCGCTTGTTAAAGTAATCATCGGAAAAGATCCTTTTACACAAGAAGTCGTACCCCGCACTGTACCCAATATGATAAAA GGCTTTATGAGCCTTATGGATGGCGGTGAAGAACAATATGCACAAATGGTTGAATCTGGCGCAATAGCCAGAATTACAGG CGAAATTGAAGCCGCAGTAGCGACACTCAACATGACGCCTCAATCTATTATACAGCTCTTTACTGATATTTGGGATTCGA TGACTATTGATGACCTCGTTCATCCAATAGATGCATTCATGAGAATCATTGAGAAATTTGGAGAACCTATAGGCCGACTA ATTGCTTTTGTGGCAGAAATTGTTCGAATCGTAATTATGGCCATTCTCGAAATCATGAATTTCCCATTCGATCTAATAGG AAACATCATTACAAGAGCCTTAGAAGCGATTGATGATATTAAGAAAGATCCAATTGGTTTCTTAAAAAATATACTGCGAG CGCTTAAACAAGGATTCGTACAGTTCTTTGACAATATTGTTACGCATTTAATAAATGGTGTAACCGGCTGGTTAATGAGC GAGTTGAAAGATGCCAATATTCCGGTACTGACTGATTTCTCTTTAAAAGGTGTTATTACCTGGATTATGGAAGTGCTGAA TATCTCGATGGAAAAAATCTGGGAAAAACTAGCCGCACATCCGCGCATTGGCCCGGCAAGAGTAGCCAGAATCCGCAGTA TGATTAATACACTTGAAGGTATCTGGACATTCATTAAAGATGTTCAGGAACGTGGTATGGCCGCCATTTGGGACAAAATA CAAGAACAGCTTAGTAATTTATGGAATACCGTTCTCGATGCCGTGAAAAACTTTGTCATGGAACGTATCGTGAATAGAAT TACAGCCAGACTTTTAAGCATGTTAGACCCAACAGGAATCATGGCTGTTATAAACGGTGCTATGGCGTTCTTTAATGCGG TACAAAGTTTTATTAAATACCTGCGTGAAATGCTCGAAGTTGTCAATTCGTTTGTCAATGGTATAGCCGATTTAGCCAGA GGCAATGTCGCCACAGCCGCAGATTATCTGGAAAGAACTATGGGACAAGCCATGCCTGTTGTGATAGGTTTCTTGGCAAA TCAAGTTGGTTTAACTGGTATTGGAGCAAGAATTGGTGAAATGATTATTTCTGTTCAGCAAATGGTCGATGAAGCGCTGA CTTGGTTAGTCAATAAAGCAGTTGATACCGGAATGAGTATTATTGACAGATTAATGGGAGGCAGCGGTACAGATAATCTG GCAGTTGTAAAACAAAATCTGCATCAGGAAGAACAATCAAAATTGACAAACGGAGCTATTAAAAGAGAAGAAGCTCAGGA AGTAGCCCAAAATGTGGCAACACTAAATAATACATTGGTAAATTCTATATCTGTAGTTGATGGCGGACAAACCTGGAATT ACAATATTGTTCAAAAAACAGACGAAGAAGATGGTCCAAGAAAAGAAGAAATCTCCATTGAAAATGCCACATTAGAAGTA GTTTTTGAAGGAAATAAAATAAGACTAAATTTTGTTGATGAAGAAACAACGGCAGTTATAGCTCCCGCAGTAAGTGATGC AAGATTGCTTCAAGTTCTAGAACAATTAAAAATGGATGAGGAACAAGCAAAAGCATTTTTTGATGAACTAAAAAACAGAA ATATAATAAACACAAACGAATTCAAACAATTGCTAATTGCTCACGCTCGACCTAAAAGTGCGGGAATGGATCCTATTGCA TTTCTAACTAGTAAACTAAGTCTGAATCAATCAACTGCAGCTGCGTGGAGTCGACCTCAGGGAAGTTCAATGAGAAACAG AGGGGTTAACCTAGGTCCTGACGCAGACGGGAATCAACGTGAGACTCTTTCTCAATATGCACAAATTTTTTATGAAAAAG AAGTTGGAGACTGGATGAGCAGACCATTAGAAAGAGATGCAGGTCCAGATGAACCGCGTATACTCGAATACATTTATCAA AAAGAAGGAAATCCTGATGTTATCTCCTTAGGAGTCGTTGAGCTAAATGATAGTGGCGAAATTATACAAATAATAAAAGT TAATTCAAATAATATAAGTGGTGGACAGCAAGGTCTAATTCAATTATTAAAAAGAAAAGGATGGGCAATGAGAATTCCTT AA
Upstream 100 bases:
>100_bases GGCTATAATGGCGATCCAACACATTGCAGTTTAGCAGGAAGAGTTGACATTGATGCAACCTGATAACGAAATGATTTTCT GTAAAATATAATAATCAAAT
Downstream 100 bases:
>100_bases AATGATAAGAAACAATGTTGAAAAAAACATTTTTGCTTGGTGTCTTTTCAAATTGAAAAAACTTGATAAGAAAAATTTTT ATAAACTTAAAAAACATTAG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1333; Mature: 1332
Protein sequence:
>1333_residues MPVLTKKTNTNPSHSSSHHDKGKESFFGIKAKLNIGKSNDKFEIEADRVADQVVANKQTAKTESFFSPSPVMQKKLARDV QKQEEQNKDVQQKTAAQTITPVVQLKEDLIQNKLDSRITEKRETNPVFSASKTLIQHKLEDKILKKEETIQNKTEVKKTE TASKNILSPKPLIQNKGEEENLQQKKEEEKQAKDDEKQLQKSPSGDASPSDNSNLESKLNSSKGGGSPLSGKVKTEMESG IGADFSNVRIHNDSNAVQMNKQLGAQAFATGNNIYFNEGKYNPNSKDGKHLLAHELTHTVQQGAAIRKKPEPVSPAPEMI QGSLLSFAIPDFIKDNVRHVPGYTLLTVVAGYDPLNDVNVERNAVNLIEGFMGLIPFGTAIFDKLQEYGIIDRVFDWVNS RLSELGLSMDALLQLVKDAWDESSISTFIDVVRTKFNDLVNRVTTFASSLVDQIITWIKEALIEVAEPLLAENKAYSLLK KIIKYDPLRDKEVTATTVEILEDFLLLIDKQTELEQMREKGTLQKTADWLDTQVGTFNSLLGELRGLITTAWNAIQPSNL ANISDNLSALAVQAGGFLQRVWDFASGVALKVLELVKESLLGWLSDQAKTVRGYSLVKVIIGKDPFTQEVVPRTVPNMIK GFMSLMDGGEEQYAQMVESGAIARITGEIEAAVATLNMTPQSIIQLFTDIWDSMTIDDLVHPIDAFMRIIEKFGEPIGRL IAFVAEIVRIVIMAILEIMNFPFDLIGNIITRALEAIDDIKKDPIGFLKNILRALKQGFVQFFDNIVTHLINGVTGWLMS ELKDANIPVLTDFSLKGVITWIMEVLNISMEKIWEKLAAHPRIGPARVARIRSMINTLEGIWTFIKDVQERGMAAIWDKI QEQLSNLWNTVLDAVKNFVMERIVNRITARLLSMLDPTGIMAVINGAMAFFNAVQSFIKYLREMLEVVNSFVNGIADLAR GNVATAADYLERTMGQAMPVVIGFLANQVGLTGIGARIGEMIISVQQMVDEALTWLVNKAVDTGMSIIDRLMGGSGTDNL AVVKQNLHQEEQSKLTNGAIKREEAQEVAQNVATLNNTLVNSISVVDGGQTWNYNIVQKTDEEDGPRKEEISIENATLEV VFEGNKIRLNFVDEETTAVIAPAVSDARLLQVLEQLKMDEEQAKAFFDELKNRNIINTNEFKQLLIAHARPKSAGMDPIA FLTSKLSLNQSTAAAWSRPQGSSMRNRGVNLGPDADGNQRETLSQYAQIFYEKEVGDWMSRPLERDAGPDEPRILEYIYQ KEGNPDVISLGVVELNDSGEIIQIIKVNSNNISGGQQGLIQLLKRKGWAMRIP
Sequences:
>Translated_1333_residues MPVLTKKTNTNPSHSSSHHDKGKESFFGIKAKLNIGKSNDKFEIEADRVADQVVANKQTAKTESFFSPSPVMQKKLARDV QKQEEQNKDVQQKTAAQTITPVVQLKEDLIQNKLDSRITEKRETNPVFSASKTLIQHKLEDKILKKEETIQNKTEVKKTE TASKNILSPKPLIQNKGEEENLQQKKEEEKQAKDDEKQLQKSPSGDASPSDNSNLESKLNSSKGGGSPLSGKVKTEMESG IGADFSNVRIHNDSNAVQMNKQLGAQAFATGNNIYFNEGKYNPNSKDGKHLLAHELTHTVQQGAAIRKKPEPVSPAPEMI QGSLLSFAIPDFIKDNVRHVPGYTLLTVVAGYDPLNDVNVERNAVNLIEGFMGLIPFGTAIFDKLQEYGIIDRVFDWVNS RLSELGLSMDALLQLVKDAWDESSISTFIDVVRTKFNDLVNRVTTFASSLVDQIITWIKEALIEVAEPLLAENKAYSLLK KIIKYDPLRDKEVTATTVEILEDFLLLIDKQTELEQMREKGTLQKTADWLDTQVGTFNSLLGELRGLITTAWNAIQPSNL ANISDNLSALAVQAGGFLQRVWDFASGVALKVLELVKESLLGWLSDQAKTVRGYSLVKVIIGKDPFTQEVVPRTVPNMIK GFMSLMDGGEEQYAQMVESGAIARITGEIEAAVATLNMTPQSIIQLFTDIWDSMTIDDLVHPIDAFMRIIEKFGEPIGRL IAFVAEIVRIVIMAILEIMNFPFDLIGNIITRALEAIDDIKKDPIGFLKNILRALKQGFVQFFDNIVTHLINGVTGWLMS ELKDANIPVLTDFSLKGVITWIMEVLNISMEKIWEKLAAHPRIGPARVARIRSMINTLEGIWTFIKDVQERGMAAIWDKI QEQLSNLWNTVLDAVKNFVMERIVNRITARLLSMLDPTGIMAVINGAMAFFNAVQSFIKYLREMLEVVNSFVNGIADLAR GNVATAADYLERTMGQAMPVVIGFLANQVGLTGIGARIGEMIISVQQMVDEALTWLVNKAVDTGMSIIDRLMGGSGTDNL AVVKQNLHQEEQSKLTNGAIKREEAQEVAQNVATLNNTLVNSISVVDGGQTWNYNIVQKTDEEDGPRKEEISIENATLEV VFEGNKIRLNFVDEETTAVIAPAVSDARLLQVLEQLKMDEEQAKAFFDELKNRNIINTNEFKQLLIAHARPKSAGMDPIA FLTSKLSLNQSTAAAWSRPQGSSMRNRGVNLGPDADGNQRETLSQYAQIFYEKEVGDWMSRPLERDAGPDEPRILEYIYQ KEGNPDVISLGVVELNDSGEIIQIIKVNSNNISGGQQGLIQLLKRKGWAMRIP >Mature_1332_residues PVLTKKTNTNPSHSSSHHDKGKESFFGIKAKLNIGKSNDKFEIEADRVADQVVANKQTAKTESFFSPSPVMQKKLARDVQ KQEEQNKDVQQKTAAQTITPVVQLKEDLIQNKLDSRITEKRETNPVFSASKTLIQHKLEDKILKKEETIQNKTEVKKTET ASKNILSPKPLIQNKGEEENLQQKKEEEKQAKDDEKQLQKSPSGDASPSDNSNLESKLNSSKGGGSPLSGKVKTEMESGI GADFSNVRIHNDSNAVQMNKQLGAQAFATGNNIYFNEGKYNPNSKDGKHLLAHELTHTVQQGAAIRKKPEPVSPAPEMIQ GSLLSFAIPDFIKDNVRHVPGYTLLTVVAGYDPLNDVNVERNAVNLIEGFMGLIPFGTAIFDKLQEYGIIDRVFDWVNSR LSELGLSMDALLQLVKDAWDESSISTFIDVVRTKFNDLVNRVTTFASSLVDQIITWIKEALIEVAEPLLAENKAYSLLKK IIKYDPLRDKEVTATTVEILEDFLLLIDKQTELEQMREKGTLQKTADWLDTQVGTFNSLLGELRGLITTAWNAIQPSNLA NISDNLSALAVQAGGFLQRVWDFASGVALKVLELVKESLLGWLSDQAKTVRGYSLVKVIIGKDPFTQEVVPRTVPNMIKG FMSLMDGGEEQYAQMVESGAIARITGEIEAAVATLNMTPQSIIQLFTDIWDSMTIDDLVHPIDAFMRIIEKFGEPIGRLI AFVAEIVRIVIMAILEIMNFPFDLIGNIITRALEAIDDIKKDPIGFLKNILRALKQGFVQFFDNIVTHLINGVTGWLMSE LKDANIPVLTDFSLKGVITWIMEVLNISMEKIWEKLAAHPRIGPARVARIRSMINTLEGIWTFIKDVQERGMAAIWDKIQ EQLSNLWNTVLDAVKNFVMERIVNRITARLLSMLDPTGIMAVINGAMAFFNAVQSFIKYLREMLEVVNSFVNGIADLARG NVATAADYLERTMGQAMPVVIGFLANQVGLTGIGARIGEMIISVQQMVDEALTWLVNKAVDTGMSIIDRLMGGSGTDNLA VVKQNLHQEEQSKLTNGAIKREEAQEVAQNVATLNNTLVNSISVVDGGQTWNYNIVQKTDEEDGPRKEEISIENATLEVV FEGNKIRLNFVDEETTAVIAPAVSDARLLQVLEQLKMDEEQAKAFFDELKNRNIINTNEFKQLLIAHARPKSAGMDPIAF LTSKLSLNQSTAAAWSRPQGSSMRNRGVNLGPDADGNQRETLSQYAQIFYEKEVGDWMSRPLERDAGPDEPRILEYIYQK EGNPDVISLGVVELNDSGEIIQIIKVNSNNISGGQQGLIQLLKRKGWAMRIP
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 148215; Mature: 148083
Theoretical pI: Translated: 5.07; Mature: 5.07
Prosite motif: PS00142 ZINC_PROTEASE
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 2.9 %Met (Translated Protein) 2.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 2.8 %Met (Mature Protein) 2.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MPVLTKKTNTNPSHSSSHHDKGKESFFGIKAKLNIGKSNDKFEIEADRVADQVVANKQTA CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHEEEEEEEECCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHCCHHH KTESFFSPSPVMQKKLARDVQKQEEQNKDVQQKTAAQTITPVVQLKEDLIQNKLDSRITE HHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KRETNPVFSASKTLIQHKLEDKILKKEETIQNKTEVKKTETASKNILSPKPLIQNKGEEE HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHCCCCHH NLQQKKEEEKQAKDDEKQLQKSPSGDASPSDNSNLESKLNSSKGGGSPLSGKVKTEMESG HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHC IGADFSNVRIHNDSNAVQMNKQLGAQAFATGNNIYFNEGKYNPNSKDGKHLLAHELTHTV CCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHCCHHEECCCEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH QQGAAIRKKPEPVSPAPEMIQGSLLSFAIPDFIKDNVRHVPGYTLLTVVAGYDPLNDVNV HHCCHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCC ERNAVNLIEGFMGLIPFGTAIFDKLQEYGIIDRVFDWVNSRLSELGLSMDALLQLVKDAW HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHC DESSISTFIDVVRTKFNDLVNRVTTFASSLVDQIITWIKEALIEVAEPLLAENKAYSLLK CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHH KIIKYDPLRDKEVTATTVEILEDFLLLIDKQTELEQMREKGTLQKTADWLDTQVGTFNSL HHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH LGELRGLITTAWNAIQPSNLANISDNLSALAVQAGGFLQRVWDFASGVALKVLELVKESL HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LGWLSDQAKTVRGYSLVKVIIGKDPFTQEVVPRTVPNMIKGFMSLMDGGEEQYAQMVESG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCC AIARITGEIEAAVATLNMTPQSIIQLFTDIWDSMTIDDLVHPIDAFMRIIEKFGEPIGRL CEEEEHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHH IAFVAEIVRIVIMAILEIMNFPFDLIGNIITRALEAIDDIKKDPIGFLKNILRALKQGFV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH QFFDNIVTHLINGVTGWLMSELKDANIPVLTDFSLKGVITWIMEVLNISMEKIWEKLAAH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC PRIGPARVARIRSMINTLEGIWTFIKDVQERGMAAIWDKIQEQLSNLWNTVLDAVKNFVM CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ERIVNRITARLLSMLDPTGIMAVINGAMAFFNAVQSFIKYLREMLEVVNSFVNGIADLAR 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PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA