| Definition | Flavobacterium johnsoniae UW101 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009441 |
| Length | 6,096,872 |
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The map label for this gene is 146300789
Identifier: 146300789
GI number: 146300789
Start: 3600240
End: 3605360
Strand: Reverse
Name: 146300789
Synonym: Fjoh_3041
Alternate gene names: NA
Gene position: 3605360-3600240 (Counterclockwise)
Preceding gene: 146300790
Following gene: 146300787
Centisome position: 59.13
GC content: 42.04
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases AATTGGTGACATGTTTCAGTAACTCGGAAAAAAACACAGAAAAGATAAAAAAGATTCACGGTATTTATGAACCGCACCAT TTTGTCTTTAATGACTGTAC
Product: AAA ATPase
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1706; Mature: 1705
Protein sequence:
>1706_residues MTAEKDFIVRIENPQGFGSGLLYSPAGQSEEAYVLTARHALVGDNGIPWEYDELSVGFLTDNGWSEYKLQEGDVILFGEN NATEDLGVLVIKKQFLPVSLDYDRCPGICLVPAKGHELEITGFPKVVLNKLKRTLHHLKPLKDRDYERQIQIEVSDPLTG EYNDDNLVEGYSGSPVFVKLNGRYFCCGLFLAYETKNKRILGIDLSLVNNLLASRSLPLLSLLQIETDPTVLEAAEKLNE NSFRVLSRIRDSVGKVNLPRTEISAAALEVIRNGKLAIFTGKPGSGKSAMVKKILDGLKNDFEIFAFQGEQLDKKSIEEI FADKPFCFGISLSEVLDSPLFAKKKIFLIDSIEKILETDNAETILDFFELLFRREDITLVFTCRSYAAEHLKIRFLRQFP AFPDFDVPALDGAELECIAESYPMLRTLAKNKSLLKVLQIPFNLDKAVSLPQNSLEDDIDTEARFKQIMWEYVIEGREKE SDPLKRQLRGETFMEIALKRASAMSAYATVGHARADILHELTADHIIDPEPVYRRSFAAAHDIYEDWALTRHIDSNYLQY IAEEGNYGAFYDAIGTSPAVRRAFRIWISEKIQAMDGSAGRLVKSTLNGSAIQNYWKDEILVAVMQSHYSSDFLRENKDF LFLDQFKYFIRIIFLVRVSCQKPDFSLLNALDVDKRTQVYHNINLVPYGEVWANLIEFIFLNLNLLQPQMRLILSMLLQW EKGLKKNGPFPAGAEHAAKILIWFYNNFTSGVSSDQGRAKTENLENGILMLFRLSDFVKDQLKSLIEDAFRNKNRDADFE IGNLYDKILEYALDGYEGQKICKNFPELVLEIAESKWFYYPPTPEQIAEMKRQSILGPYHRSMMHSEQDFGFRRSTERHY SPGSPYETPILNLLLYSPFATVDFLVKLFNHAADSYIKSDFGRDNEFLHPSDHRSQITVIMDDGREIKQHASPSLWMMFR GTYFNSPDVLKSCLMAAECYLLQIGRDIKENKHDQYTKFLKASWDYTFEAFLTRCNSVMGSAVLISVANEHMDLAGRRIF PLLKIREIYHLDFHRCLKESEAYSPLSYKKHRQLRHLQLQNFQTLKHRSKSIEDLVMNLSFGEFQTEIFEIIDNFYLESP TDQNWRFALARIDRRKFRIVKEVENGFLLETELEDDLQKVVEENKTKEEANHLVLYAAHWCMQKLKHETAEEDSYEKWSE FHKISVDAQDNINIAGRHKQPVLVAAIGIRDFYSSLSAAESEWCETKVNELFKYELFENRLLDFMNSKYTVYETDAAFSV VPILMLKSDEREKKIYKQNILYYLTHFHQRSEHNSLRASINSCLWKHDPGFVLNCIYCIVEYSKFSHLKHRLEHLSGYKS YKRNFFSIIKTAHYRIRLKINPHYKPKGRIAGHIKYNDALKQYSAGFDAIMNRVAEEETPVEIAIPEYQSNAGDWLFEAL KLVPAETELKILRDYFKNVLNFIFETFAKDSDPYDDTIHHSLQQFFQEKFALFLLSQPEDTAIENFKALIDWAYADGVKI LYSNKKYEFTVKCLEEVVNQFLNDESKAANFWILWSYLSHKILTAKMFIFDKAFLFNHRILFLTQLDWNPLKNKKHFFET FILQGGDLESSGRLTAGIGFEELMPDAVSWLAERIKKEWPGNKGWDFYLEKIIIQTYYDGRMRREITATARLRNDFIALL DKLIDQSASSTAYIIREDFISSKGLA
Sequences:
>Translated_1706_residues MTAEKDFIVRIENPQGFGSGLLYSPAGQSEEAYVLTARHALVGDNGIPWEYDELSVGFLTDNGWSEYKLQEGDVILFGEN NATEDLGVLVIKKQFLPVSLDYDRCPGICLVPAKGHELEITGFPKVVLNKLKRTLHHLKPLKDRDYERQIQIEVSDPLTG EYNDDNLVEGYSGSPVFVKLNGRYFCCGLFLAYETKNKRILGIDLSLVNNLLASRSLPLLSLLQIETDPTVLEAAEKLNE NSFRVLSRIRDSVGKVNLPRTEISAAALEVIRNGKLAIFTGKPGSGKSAMVKKILDGLKNDFEIFAFQGEQLDKKSIEEI FADKPFCFGISLSEVLDSPLFAKKKIFLIDSIEKILETDNAETILDFFELLFRREDITLVFTCRSYAAEHLKIRFLRQFP AFPDFDVPALDGAELECIAESYPMLRTLAKNKSLLKVLQIPFNLDKAVSLPQNSLEDDIDTEARFKQIMWEYVIEGREKE SDPLKRQLRGETFMEIALKRASAMSAYATVGHARADILHELTADHIIDPEPVYRRSFAAAHDIYEDWALTRHIDSNYLQY IAEEGNYGAFYDAIGTSPAVRRAFRIWISEKIQAMDGSAGRLVKSTLNGSAIQNYWKDEILVAVMQSHYSSDFLRENKDF LFLDQFKYFIRIIFLVRVSCQKPDFSLLNALDVDKRTQVYHNINLVPYGEVWANLIEFIFLNLNLLQPQMRLILSMLLQW EKGLKKNGPFPAGAEHAAKILIWFYNNFTSGVSSDQGRAKTENLENGILMLFRLSDFVKDQLKSLIEDAFRNKNRDADFE IGNLYDKILEYALDGYEGQKICKNFPELVLEIAESKWFYYPPTPEQIAEMKRQSILGPYHRSMMHSEQDFGFRRSTERHY SPGSPYETPILNLLLYSPFATVDFLVKLFNHAADSYIKSDFGRDNEFLHPSDHRSQITVIMDDGREIKQHASPSLWMMFR GTYFNSPDVLKSCLMAAECYLLQIGRDIKENKHDQYTKFLKASWDYTFEAFLTRCNSVMGSAVLISVANEHMDLAGRRIF PLLKIREIYHLDFHRCLKESEAYSPLSYKKHRQLRHLQLQNFQTLKHRSKSIEDLVMNLSFGEFQTEIFEIIDNFYLESP TDQNWRFALARIDRRKFRIVKEVENGFLLETELEDDLQKVVEENKTKEEANHLVLYAAHWCMQKLKHETAEEDSYEKWSE FHKISVDAQDNINIAGRHKQPVLVAAIGIRDFYSSLSAAESEWCETKVNELFKYELFENRLLDFMNSKYTVYETDAAFSV VPILMLKSDEREKKIYKQNILYYLTHFHQRSEHNSLRASINSCLWKHDPGFVLNCIYCIVEYSKFSHLKHRLEHLSGYKS YKRNFFSIIKTAHYRIRLKINPHYKPKGRIAGHIKYNDALKQYSAGFDAIMNRVAEEETPVEIAIPEYQSNAGDWLFEAL KLVPAETELKILRDYFKNVLNFIFETFAKDSDPYDDTIHHSLQQFFQEKFALFLLSQPEDTAIENFKALIDWAYADGVKI LYSNKKYEFTVKCLEEVVNQFLNDESKAANFWILWSYLSHKILTAKMFIFDKAFLFNHRILFLTQLDWNPLKNKKHFFET FILQGGDLESSGRLTAGIGFEELMPDAVSWLAERIKKEWPGNKGWDFYLEKIIIQTYYDGRMRREITATARLRNDFIALL DKLIDQSASSTAYIIREDFISSKGLA >Mature_1705_residues TAEKDFIVRIENPQGFGSGLLYSPAGQSEEAYVLTARHALVGDNGIPWEYDELSVGFLTDNGWSEYKLQEGDVILFGENN ATEDLGVLVIKKQFLPVSLDYDRCPGICLVPAKGHELEITGFPKVVLNKLKRTLHHLKPLKDRDYERQIQIEVSDPLTGE YNDDNLVEGYSGSPVFVKLNGRYFCCGLFLAYETKNKRILGIDLSLVNNLLASRSLPLLSLLQIETDPTVLEAAEKLNEN SFRVLSRIRDSVGKVNLPRTEISAAALEVIRNGKLAIFTGKPGSGKSAMVKKILDGLKNDFEIFAFQGEQLDKKSIEEIF ADKPFCFGISLSEVLDSPLFAKKKIFLIDSIEKILETDNAETILDFFELLFRREDITLVFTCRSYAAEHLKIRFLRQFPA FPDFDVPALDGAELECIAESYPMLRTLAKNKSLLKVLQIPFNLDKAVSLPQNSLEDDIDTEARFKQIMWEYVIEGREKES DPLKRQLRGETFMEIALKRASAMSAYATVGHARADILHELTADHIIDPEPVYRRSFAAAHDIYEDWALTRHIDSNYLQYI AEEGNYGAFYDAIGTSPAVRRAFRIWISEKIQAMDGSAGRLVKSTLNGSAIQNYWKDEILVAVMQSHYSSDFLRENKDFL FLDQFKYFIRIIFLVRVSCQKPDFSLLNALDVDKRTQVYHNINLVPYGEVWANLIEFIFLNLNLLQPQMRLILSMLLQWE KGLKKNGPFPAGAEHAAKILIWFYNNFTSGVSSDQGRAKTENLENGILMLFRLSDFVKDQLKSLIEDAFRNKNRDADFEI GNLYDKILEYALDGYEGQKICKNFPELVLEIAESKWFYYPPTPEQIAEMKRQSILGPYHRSMMHSEQDFGFRRSTERHYS PGSPYETPILNLLLYSPFATVDFLVKLFNHAADSYIKSDFGRDNEFLHPSDHRSQITVIMDDGREIKQHASPSLWMMFRG TYFNSPDVLKSCLMAAECYLLQIGRDIKENKHDQYTKFLKASWDYTFEAFLTRCNSVMGSAVLISVANEHMDLAGRRIFP LLKIREIYHLDFHRCLKESEAYSPLSYKKHRQLRHLQLQNFQTLKHRSKSIEDLVMNLSFGEFQTEIFEIIDNFYLESPT DQNWRFALARIDRRKFRIVKEVENGFLLETELEDDLQKVVEENKTKEEANHLVLYAAHWCMQKLKHETAEEDSYEKWSEF HKISVDAQDNINIAGRHKQPVLVAAIGIRDFYSSLSAAESEWCETKVNELFKYELFENRLLDFMNSKYTVYETDAAFSVV PILMLKSDEREKKIYKQNILYYLTHFHQRSEHNSLRASINSCLWKHDPGFVLNCIYCIVEYSKFSHLKHRLEHLSGYKSY KRNFFSIIKTAHYRIRLKINPHYKPKGRIAGHIKYNDALKQYSAGFDAIMNRVAEEETPVEIAIPEYQSNAGDWLFEALK LVPAETELKILRDYFKNVLNFIFETFAKDSDPYDDTIHHSLQQFFQEKFALFLLSQPEDTAIENFKALIDWAYADGVKIL YSNKKYEFTVKCLEEVVNQFLNDESKAANFWILWSYLSHKILTAKMFIFDKAFLFNHRILFLTQLDWNPLKNKKHFFETF ILQGGDLESSGRLTAGIGFEELMPDAVSWLAERIKKEWPGNKGWDFYLEKIIIQTYYDGRMRREITATARLRNDFIALLD KLIDQSASSTAYIIREDFISSKGLA
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 197608; Mature: 197477
Theoretical pI: Translated: 6.19; Mature: 6.19
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.1 %Cys (Translated Protein) 1.6 %Met (Translated Protein) 2.8 %Cys+Met (Translated Protein) 1.1 %Cys (Mature Protein) 1.6 %Met (Mature Protein) 2.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MTAEKDFIVRIENPQGFGSGLLYSPAGQSEEAYVLTARHALVGDNGIPWEYDELSVGFLT CCCCCCEEEEECCCCCCCCCCEECCCCCCCCEEEEEEEHHEECCCCCCCCCCCEEEEEEE DNGWSEYKLQEGDVILFGENNATEDLGVLVIKKQFLPVSLDYDRCPGICLVPAKGHELEI CCCCCCCEEECCCEEEECCCCCCCCCEEEEEEECCCCEEECCCCCCCEEEECCCCCEEEE TGFPKVVLNKLKRTLHHLKPLKDRDYERQIQIEVSDPLTGEYNDDNLVEGYSGSPVFVKL CCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEE NGRYFCCGLFLAYETKNKRILGIDLSLVNNLLASRSLPLLSLLQIETDPTVLEAAEKLNE CCEEEEEEEEEEEECCCCEEEEEEHHHHHHHHHHCCCCHHHHEEECCCCHHHHHHHHHCC NSFRVLSRIRDSVGKVNLPRTEISAAALEVIRNGKLAIFTGKPGSGKSAMVKKILDGLKN HHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCC DFEIFAFQGEQLDKKSIEEIFADKPFCFGISLSEVLDSPLFAKKKIFLIDSIEKILETDN CEEEEEECCCCCCHHHHHHHHCCCCEEECCCHHHHHCCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHCCC AETILDFFELLFRREDITLVFTCRSYAAEHLKIRFLRQFPAFPDFDVPALDGAELECIAE HHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHH SYPMLRTLAKNKSLLKVLQIPFNLDKAVSLPQNSLEDDIDTEARFKQIMWEYVIEGREKE 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