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The map label for this gene is yccS [H]

Identifier: 146300286

GI number: 146300286

Start: 3013546

End: 3015768

Strand: Reverse

Name: yccS [H]

Synonym: Fjoh_2531

Alternate gene names: 146300286

Gene position: 3015768-3013546 (Counterclockwise)

Preceding gene: 146300290

Following gene: 146300279

Centisome position: 49.46

GC content: 31.71

Gene sequence:

>2223_bases
ATGTTTGACCGCATCTCAAAATTTACAAACAGTACTTCTTTTTTAAACGCTTCAAAAGTAACAATTGCTTCAGTTGTGCC
CGTTTTAATTTTGAATTTTTTAGGCCATTTCGAAATAGGTTTTACTATTGCACTGGGTGCTTTTTATACTTATCCCAGTG
ATATCCCAAGTTCTTTAAGCCACAAAATTAAAGGATTAATCGTTGCATCGTTTATCGTATCGGGTGTAAATTTATTAGTA
AATCTTGCTTATCCTTTTCCTTTTTTATTTTATCCTTTTTTAGGATTTTTATTGTTTTTATGTTCGATGATTTCAGTTTA
TGGACAGCGTGCCACACTGGTTTCGTTTTCTGCCTTATTGTCTATTTCGTTATCGTTTGGACATTTGCACGAAGGCTGGG
AAGCTTTTCAATATTCTGGGTTTATTTTTATTGGAGGAATTTTATATCTGATAGTTTCACTTGTTTTTCATTTTGTACAG
CCCTATAAATATGTAGAATTGCAAATTGCAGAAGGTATAAAGCTGACGGCAAAATATTTAAAACTAAGAGGAGATTTATG
GAGTCCAGAAGCGAATCGCGAAAAAATAATTGAAAAACAGCTTGCCATACAAGTCGATTTGAATTTGATTCATGAAGATT
TGCGTAAAATGCTTATAGGAAATCAAAATGCATCTGGAACAACAAGCCAAAACCGAAAAATGCTTTTGGTTTTTATTACT
TTGGTTGAAATTCAGGAACTTGCATTATATACATCATTCGATCATAGTAAACTTCATGAAAAATTTGCTAAACATCCTGA
AGTTCTTCGTACGTATCAAAATGTAGCTTACAAACTGGCTTCAACACTTAAAAAGCTTTCTAAAAATGTACATCATATTG
CGGTTTATGTTGACAAAGACGATCTTAAAAATGAATTAGATGCTTTAGAATTTGCCATTTTTGATTATGAAAAAACATTA
GGAAAAGAAGAAGCTGCAGAAGGCGTTTTAATGCTGACCAATATGCTGAAATATGCCAAAAATCAGGTTGGAAAAATTAA
AATTATTCAGCGTGCGTTATCACTGGCAATGCAGTCTTATAAATTGAAAGATAAAGATAAGGAGTTAGAAAAATTCTTAA
CACCTCAATACTACCCTTTAAGAACACTTACTGAAAATTTAAGTTACTCTTCGTCTATTTTCAGGCATTCTCTGCGATTA
ACCATTACGATTTTAATTGGTTTATTTATTGGAGAAATGCTGGATCTTCAAAACGTTTATTGGATTTTACTAACCATTGT
AGTAATTATGCGCCCTGGTTACGGATTAACCAAAGAACGATCTTATAATCGTATGTTTGGGACTATTCTAGGCGGATTAT
TAGCCTTTGGAATTGTGTCCATAATTCAAAATCATGTTGCATTAAGTATTTTTTCAATTGTATGCATGCTTTTAGGTATT
TCTTTTACTCAAATTAACTATAAAATAAGTGCAACATTTGTAACTATGTATGTTGTATTTATCTATGGTATTTTAACTCC
AAATGTTGTAGAAGTTATTCAGTTTAGAATTTTAGATACGCTTACCGGAGCGACTTTGGCATTTATAGCCAATCAGTTTT
TATGGCCTGCCTGGGAGTTTATAAACACGCCTATTCATATCGAAAATGCAATCAGGGCAAATCGAAATTACCTTAAAGAA
ATTGCTGATTTTTATAATAAAAAAGGAGAAATTCCAACTTCATACCGATTAGCCAGAAAAAATGCTTTTGTTGAAATTGG
AAATTTAATGACTTCTTTTCAGCGTATGATGCAGGAGCCAAAATCTAAGCAAAAAACAATGCCTTTGGTAAATAAACTGG
TAGTTTTAAATCATTCGCTTTTGTCTGCATTAGCGTCTTTATCAACTTATATTCAGTCACATCAAACAACATCTGCTTCA
GATTCATTCAATTATATTATAAAAACCATTTTATCTAATTTAGATAACTCTATTTCTATTTTAAGAAATGAAACTATAAT
TACGGATACTTTTTTTGACAAAGAAGATGTGACTTTACAGTTTGAGGAACTAAAACGCAAAAACTTCACTCGTCTGGCAA
CAGATGATGAATTGGATAAAGAAACTCGTCAGGCAAAAATGCAGGAAGCTTCAATGGTTATTGAGCAGTTAATCTGGATG
AGCAATCTTGCCGAGAAAATTTTAAAAATAACAAAAGAATTAAAAGCCGTAAAGAACGATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CGCACATTATAACATATTTTTTATATGCTTTGGAAAACTCAGCTATAATTATGCCAAAATATTTCGTACAATTCTTAACT
TTGCTAGTAAACCTCATTAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GGCTTTTAATTCTTTTATTTTCTTTGTTTTTATTTGATATTTTGTTTTACAAAATCAGTTGTTACAACAGCTGCAAATTC
ATTGTTTAAACTTGCCAAAG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 740; Mature: 740

Protein sequence:

>740_residues
MFDRISKFTNSTSFLNASKVTIASVVPVLILNFLGHFEIGFTIALGAFYTYPSDIPSSLSHKIKGLIVASFIVSGVNLLV
NLAYPFPFLFYPFLGFLLFLCSMISVYGQRATLVSFSALLSISLSFGHLHEGWEAFQYSGFIFIGGILYLIVSLVFHFVQ
PYKYVELQIAEGIKLTAKYLKLRGDLWSPEANREKIIEKQLAIQVDLNLIHEDLRKMLIGNQNASGTTSQNRKMLLVFIT
LVEIQELALYTSFDHSKLHEKFAKHPEVLRTYQNVAYKLASTLKKLSKNVHHIAVYVDKDDLKNELDALEFAIFDYEKTL
GKEEAAEGVLMLTNMLKYAKNQVGKIKIIQRALSLAMQSYKLKDKDKELEKFLTPQYYPLRTLTENLSYSSSIFRHSLRL
TITILIGLFIGEMLDLQNVYWILLTIVVIMRPGYGLTKERSYNRMFGTILGGLLAFGIVSIIQNHVALSIFSIVCMLLGI
SFTQINYKISATFVTMYVVFIYGILTPNVVEVIQFRILDTLTGATLAFIANQFLWPAWEFINTPIHIENAIRANRNYLKE
IADFYNKKGEIPTSYRLARKNAFVEIGNLMTSFQRMMQEPKSKQKTMPLVNKLVVLNHSLLSALASLSTYIQSHQTTSAS
DSFNYIIKTILSNLDNSISILRNETIITDTFFDKEDVTLQFEELKRKNFTRLATDDELDKETRQAKMQEASMVIEQLIWM
SNLAEKILKITKELKAVKND

Sequences:

>Translated_740_residues
MFDRISKFTNSTSFLNASKVTIASVVPVLILNFLGHFEIGFTIALGAFYTYPSDIPSSLSHKIKGLIVASFIVSGVNLLV
NLAYPFPFLFYPFLGFLLFLCSMISVYGQRATLVSFSALLSISLSFGHLHEGWEAFQYSGFIFIGGILYLIVSLVFHFVQ
PYKYVELQIAEGIKLTAKYLKLRGDLWSPEANREKIIEKQLAIQVDLNLIHEDLRKMLIGNQNASGTTSQNRKMLLVFIT
LVEIQELALYTSFDHSKLHEKFAKHPEVLRTYQNVAYKLASTLKKLSKNVHHIAVYVDKDDLKNELDALEFAIFDYEKTL
GKEEAAEGVLMLTNMLKYAKNQVGKIKIIQRALSLAMQSYKLKDKDKELEKFLTPQYYPLRTLTENLSYSSSIFRHSLRL
TITILIGLFIGEMLDLQNVYWILLTIVVIMRPGYGLTKERSYNRMFGTILGGLLAFGIVSIIQNHVALSIFSIVCMLLGI
SFTQINYKISATFVTMYVVFIYGILTPNVVEVIQFRILDTLTGATLAFIANQFLWPAWEFINTPIHIENAIRANRNYLKE
IADFYNKKGEIPTSYRLARKNAFVEIGNLMTSFQRMMQEPKSKQKTMPLVNKLVVLNHSLLSALASLSTYIQSHQTTSAS
DSFNYIIKTILSNLDNSISILRNETIITDTFFDKEDVTLQFEELKRKNFTRLATDDELDKETRQAKMQEASMVIEQLIWM
SNLAEKILKITKELKAVKND
>Mature_740_residues
MFDRISKFTNSTSFLNASKVTIASVVPVLILNFLGHFEIGFTIALGAFYTYPSDIPSSLSHKIKGLIVASFIVSGVNLLV
NLAYPFPFLFYPFLGFLLFLCSMISVYGQRATLVSFSALLSISLSFGHLHEGWEAFQYSGFIFIGGILYLIVSLVFHFVQ
PYKYVELQIAEGIKLTAKYLKLRGDLWSPEANREKIIEKQLAIQVDLNLIHEDLRKMLIGNQNASGTTSQNRKMLLVFIT
LVEIQELALYTSFDHSKLHEKFAKHPEVLRTYQNVAYKLASTLKKLSKNVHHIAVYVDKDDLKNELDALEFAIFDYEKTL
GKEEAAEGVLMLTNMLKYAKNQVGKIKIIQRALSLAMQSYKLKDKDKELEKFLTPQYYPLRTLTENLSYSSSIFRHSLRL
TITILIGLFIGEMLDLQNVYWILLTIVVIMRPGYGLTKERSYNRMFGTILGGLLAFGIVSIIQNHVALSIFSIVCMLLGI
SFTQINYKISATFVTMYVVFIYGILTPNVVEVIQFRILDTLTGATLAFIANQFLWPAWEFINTPIHIENAIRANRNYLKE
IADFYNKKGEIPTSYRLARKNAFVEIGNLMTSFQRMMQEPKSKQKTMPLVNKLVVLNHSLLSALASLSTYIQSHQTTSAS
DSFNYIIKTILSNLDNSISILRNETIITDTFFDKEDVTLQFEELKRKNFTRLATDDELDKETRQAKMQEASMVIEQLIWM
SNLAEKILKITKELKAVKND

Specific function: Unknown

COG id: COG1289

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the yccS/yhfK family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI87081808, Length=751, Percent_Identity=22.5033288948069, Blast_Score=178, Evalue=1e-45,
Organism=Escherichia coli, GI87082248, Length=610, Percent_Identity=23.1147540983607, Blast_Score=77, Evalue=4e-15,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR010019
- InterPro:   IPR010020 [H]

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 84399; Mature: 84399

Theoretical pI: Translated: 9.47; Mature: 9.47

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
2.6 %Met     (Translated Protein)
2.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
2.6 %Met     (Mature Protein)
2.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MFDRISKFTNSTSFLNASKVTIASVVPVLILNFLGHFEIGFTIALGAFYTYPSDIPSSLS
CCCHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHH
HKIKGLIVASFIVSGVNLLVNLAYPFPFLFYPFLGFLLFLCSMISVYGQRATLVSFSALL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
SISLSFGHLHEGWEAFQYSGFIFIGGILYLIVSLVFHFVQPYKYVELQIAEGIKLTAKYL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCHHHHHHHH
KLRGDLWSPEANREKIIEKQLAIQVDLNLIHEDLRKMLIGNQNASGTTSQNRKMLLVFIT
HHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHH
LVEIQELALYTSFDHSKLHEKFAKHPEVLRTYQNVAYKLASTLKKLSKNVHHIAVYVDKD
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEHH
DLKNELDALEFAIFDYEKTLGKEEAAEGVLMLTNMLKYAKNQVGKIKIIQRALSLAMQSY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
KLKDKDKELEKFLTPQYYPLRTLTENLSYSSSIFRHSLRLTITILIGLFIGEMLDLQNVY
CCCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
WILLTIVVIMRPGYGLTKERSYNRMFGTILGGLLAFGIVSIIQNHVALSIFSIVCMLLGI
HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
SFTQINYKISATFVTMYVVFIYGILTPNVVEVIQFRILDTLTGATLAFIANQFLWPAWEF
HHHEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHH
INTPIHIENAIRANRNYLKEIADFYNKKGEIPTSYRLARKNAFVEIGNLMTSFQRMMQEP
HCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCH
KSKQKTMPLVNKLVVLNHSLLSALASLSTYIQSHQTTSASDSFNYIIKTILSNLDNSISI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
LRNETIITDTFFDKEDVTLQFEELKRKNFTRLATDDELDKETRQAKMQEASMVIEQLIWM
HHCCEEEEECCCCCCCCEEEHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SNLAEKILKITKELKAVKND
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MFDRISKFTNSTSFLNASKVTIASVVPVLILNFLGHFEIGFTIALGAFYTYPSDIPSSLS
CCCHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHH
HKIKGLIVASFIVSGVNLLVNLAYPFPFLFYPFLGFLLFLCSMISVYGQRATLVSFSALL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
SISLSFGHLHEGWEAFQYSGFIFIGGILYLIVSLVFHFVQPYKYVELQIAEGIKLTAKYL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCHHHHHHHH
KLRGDLWSPEANREKIIEKQLAIQVDLNLIHEDLRKMLIGNQNASGTTSQNRKMLLVFIT
HHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHH
LVEIQELALYTSFDHSKLHEKFAKHPEVLRTYQNVAYKLASTLKKLSKNVHHIAVYVDKD
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEHH
DLKNELDALEFAIFDYEKTLGKEEAAEGVLMLTNMLKYAKNQVGKIKIIQRALSLAMQSY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
KLKDKDKELEKFLTPQYYPLRTLTENLSYSSSIFRHSLRLTITILIGLFIGEMLDLQNVY
CCCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
WILLTIVVIMRPGYGLTKERSYNRMFGTILGGLLAFGIVSIIQNHVALSIFSIVCMLLGI
HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
SFTQINYKISATFVTMYVVFIYGILTPNVVEVIQFRILDTLTGATLAFIANQFLWPAWEF
HHHEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHH
INTPIHIENAIRANRNYLKEIADFYNKKGEIPTSYRLARKNAFVEIGNLMTSFQRMMQEP
HCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCH
KSKQKTMPLVNKLVVLNHSLLSALASLSTYIQSHQTTSASDSFNYIIKTILSNLDNSISI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
LRNETIITDTFFDKEDVTLQFEELKRKNFTRLATDDELDKETRQAKMQEASMVIEQLIWM
HHCCEEEEECCCCCCCCEEEHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SNLAEKILKITKELKAVKND
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8905232; 9278503 [H]