| Definition | Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 700970, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_002162 |
| Length | 751,719 |
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Identifier: 13358137
GI number: 13358137
Start: 716191
End: 717927
Strand: Direct
Name: Not Available
Synonym: UU572
Alternate gene names: NA
Gene position: 716191-717927 (Clockwise)
Preceding gene: 13358129
Following gene: 13358138
Centisome position: 95.27
GC content: 26.02
Gene sequence:
>1737_bases ATGAGAAATAATTTATCTGATTTGGAAATCGAAAAATTGACCAAAACATTAGTATCAAAAAACAAAAGAGTTGTAGCTTT ATATGGCGTTCCCGAAAACACTTCTTATAAACTAATGAACGATCTAATTAGTTTAATGGATGTAGAAATTCCTAATTGAT CATCAATTTCAAGCGCAACTGAAGACCAATGTATTAATGATATTAAAAATTTTTTACTGTCAAATGCAAGTTTAGAAAAC TTTAAAAACTTGCCTTCTAATAACCCTTTAATTAATTGGTGGAAAAGACGCCGTTTAAATACTGTTGTTAAAAAGATTGA AGAAATCAACTCAGCGTTCGCAGACCGTGAAATAACATCTCGTTCAAAAATCTTTTTGATGCCTGTTTTAACAGCATTTA GTACTTTAGGAACTACACTAGCTGTTCCTTTAATATCTGTTACTTTTTTACGGGGTGATGCAATTATTAATTTGTGGGGT AAAGATGGATATATTGCTTTCTTAAGTTTACTATTTTCTTTAGTTGTTGCTGTTATTATTTCAGCTTTTGTCGCTTTATT TAGTAGTTTAAAAAATAATAAACGTAATTATATTGTTTCAAACATGACCAAAGGTCTTAAAAGAATATATGATAAATATT TTATCGAAAGTAATTCTCAAGAAAAGATTAATGCTAAAGTAACTTTTTATTCACGCTTTTTAGAACGTTCTAAATTCGTT GTTCAAAATAATTACACATTTTTTTATGATGTTGTAGATATTAATAGTGATCAATATCCTAAAATATTAAAATATTTCAA AACCTTAAACCAATTAAATAATACAGTAATCTTCGATGCTAGTGGTTTTAAATATTTAGACGAACGTAAAATTTTCCGTA ACATTATCGATTTAGAGAAAACAAATGTTGTCCGTTTGGATCGTTATAAAACAAAAACAAGCGGACGTCGCTTAATGAGT TTTATTTTCTATCAATTATCAATCATTGCTAATGTTAATACACGAAAACTTTTACAAAAATTTCCTTTCTTTGTCAACTC TTTATATCGTTTTTTAGATTACAGCGAAAAAAATACTGAGTTATTAACACTTTTATTAGACATTAAAAAACACGCTTCAA AAACAGAAATTCCATTAAACGATGAATCACAATTATTTTTTGTAGACTTTTTTACATTCGTGGTTTTTAAAGCTTTGGAT GAATTAGGATTTGAGACGCTAATGAATGATTTAACAGTCTATGGTCGTCCATCTGAAATCACTAAGAAAAATATAACTTA TAATTCATTAAAATTGGATTACATCATTAATCGTAATGCGCGTAATTTTGGACAACAAGCATTATTGTTTAACTTATTAG ATTATTTTGATGAGACAGTAAATAAAAATATCTTTAACGAATTAGGAAATAGTAATAAAAACATGATTTTTTCTAAAAAT CATCAATTAAATTTAGCCAATGAAGCTTTAAGTAAAAAAGGTTTTACAAAGCGTGAAATTGATTTAAATAATCATTGATA TGATGCTTTATATTCTAATCTTCATGATGATGAAGACATGTTTGTTAAAATTATTGAAATTAAAGATAATGTTGATATCT TAAATGTATTAGATGAACTCTTTGTTCGTGCTCAAAATGATGGTGTTAAAAATTTATTAATTTATGTTTTTAATGTAAAA ATGTTATATTCATTAATAGATAATGAATACGAGTTGGTTAATGAGTCAATTATTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTCATATTTTTAATCTACATTTAAAAAATAACTTTGTTATAAAGTTGTATAATTATATAACATACAAATTAAATGGATTA AGTAAGCAAACTAAATTTAT
Downstream 100 bases:
>100_bases TACTTAATATATAAGTTTTTAAATTTAATTATTTTATTTAAAATAATAGGAGTAAAATAAAACGATGACAAATGATGAGC GTAAAGAATTTATTAGAAAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 578; Mature: 578
Protein sequence:
>578_residues MRNNLSDLEIEKLTKTLVSKNKRVVALYGVPENTSYKLMNDLISLMDVEIPNWSSISSATEDQCINDIKNFLLSNASLEN FKNLPSNNPLINWWKRRRLNTVVKKIEEINSAFADREITSRSKIFLMPVLTAFSTLGTTLAVPLISVTFLRGDAIINLWG KDGYIAFLSLLFSLVVAVIISAFVALFSSLKNNKRNYIVSNMTKGLKRIYDKYFIESNSQEKINAKVTFYSRFLERSKFV VQNNYTFFYDVVDINSDQYPKILKYFKTLNQLNNTVIFDASGFKYLDERKIFRNIIDLEKTNVVRLDRYKTKTSGRRLMS FIFYQLSIIANVNTRKLLQKFPFFVNSLYRFLDYSEKNTELLTLLLDIKKHASKTEIPLNDESQLFFVDFFTFVVFKALD ELGFETLMNDLTVYGRPSEITKKNITYNSLKLDYIINRNARNFGQQALLFNLLDYFDETVNKNIFNELGNSNKNMIFSKN HQLNLANEALSKKGFTKREIDLNNHWYDALYSNLHDDEDMFVKIIEIKDNVDILNVLDELFVRAQNDGVKNLLIYVFNVK MLYSLIDNEYELVNESII
Sequences:
>Translated_578_residues MRNNLSDLEIEKLTKTLVSKNKRVVALYGVPENTSYKLMNDLISLMDVEIPN*SSISSATEDQCINDIKNFLLSNASLEN FKNLPSNNPLINWWKRRRLNTVVKKIEEINSAFADREITSRSKIFLMPVLTAFSTLGTTLAVPLISVTFLRGDAIINLWG KDGYIAFLSLLFSLVVAVIISAFVALFSSLKNNKRNYIVSNMTKGLKRIYDKYFIESNSQEKINAKVTFYSRFLERSKFV VQNNYTFFYDVVDINSDQYPKILKYFKTLNQLNNTVIFDASGFKYLDERKIFRNIIDLEKTNVVRLDRYKTKTSGRRLMS FIFYQLSIIANVNTRKLLQKFPFFVNSLYRFLDYSEKNTELLTLLLDIKKHASKTEIPLNDESQLFFVDFFTFVVFKALD ELGFETLMNDLTVYGRPSEITKKNITYNSLKLDYIINRNARNFGQQALLFNLLDYFDETVNKNIFNELGNSNKNMIFSKN HQLNLANEALSKKGFTKREIDLNNH*YDALYSNLHDDEDMFVKIIEIKDNVDILNVLDELFVRAQNDGVKNLLIYVFNVK MLYSLIDNEYELVNESII >Mature_578_residues MRNNLSDLEIEKLTKTLVSKNKRVVALYGVPENTSYKLMNDLISLMDVEIPN*SSISSATEDQCINDIKNFLLSNASLEN FKNLPSNNPLINWWKRRRLNTVVKKIEEINSAFADREITSRSKIFLMPVLTAFSTLGTTLAVPLISVTFLRGDAIINLWG KDGYIAFLSLLFSLVVAVIISAFVALFSSLKNNKRNYIVSNMTKGLKRIYDKYFIESNSQEKINAKVTFYSRFLERSKFV VQNNYTFFYDVVDINSDQYPKILKYFKTLNQLNNTVIFDASGFKYLDERKIFRNIIDLEKTNVVRLDRYKTKTSGRRLMS FIFYQLSIIANVNTRKLLQKFPFFVNSLYRFLDYSEKNTELLTLLLDIKKHASKTEIPLNDESQLFFVDFFTFVVFKALD ELGFETLMNDLTVYGRPSEITKKNITYNSLKLDYIINRNARNFGQQALLFNLLDYFDETVNKNIFNELGNSNKNMIFSKN HQLNLANEALSKKGFTKREIDLNNH*YDALYSNLHDDEDMFVKIIEIKDNVDILNVLDELFVRAQNDGVKNLLIYVFNVK MLYSLIDNEYELVNESII
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 66994; Mature: 66994
Theoretical pI: Translated: 9.34; Mature: 9.34
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 1.7 %Met (Translated Protein) 1.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 1.7 %Met (Mature Protein) 1.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MRNNLSDLEIEKLTKTLVSKNKRVVALYGVPENTSYKLMNDLISLMDVEIPNSSISSATE CCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHH DQCINDIKNFLLSNASLENFKNLPSNNPLINWWKRRRLNTVVKKIEEINSAFADREITSR HHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCC SKIFLMPVLTAFSTLGTTLAVPLISVTFLRGDAIINLWGKDGYIAFLSLLFSLVVAVIIS CCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH AFVALFSSLKNNKRNYIVSNMTKGLKRIYDKYFIESNSQEKINAKVTFYSRFLERSKFVV HHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHEEHHHHHHHHHHHCCEEE QNNYTFFYDVVDINSDQYPKILKYFKTLNQLNNTVIFDASGFKYLDERKIFRNIIDLEKT ECCCEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCC NVVRLDRYKTKTSGRRLMSFIFYQLSIIANVNTRKLLQKFPFFVNSLYRFLDYSEKNTEL CEEEEECHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHH LTLLLDIKKHASKTEIPLNDESQLFFVDFFTFVVFKALDELGFETLMNDLTVYGRPSEIT HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCHHH KKNITYNSLKLDYIINRNARNFGQQALLFNLLDYFDETVNKNIFNELGNSNKNMIFSKNH HCCCEECCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCC QLNLANEALSKKGFTKREIDLNNHYDALYSNLHDDEDMFVKIIEIKDNVDILNVLDELFV CCCHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHH RAQNDGVKNLLIYVFNVKMLYSLIDNEYELVNESII HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MRNNLSDLEIEKLTKTLVSKNKRVVALYGVPENTSYKLMNDLISLMDVEIPNSSISSATE CCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHH DQCINDIKNFLLSNASLENFKNLPSNNPLINWWKRRRLNTVVKKIEEINSAFADREITSR HHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCC SKIFLMPVLTAFSTLGTTLAVPLISVTFLRGDAIINLWGKDGYIAFLSLLFSLVVAVIIS CCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH AFVALFSSLKNNKRNYIVSNMTKGLKRIYDKYFIESNSQEKINAKVTFYSRFLERSKFVV HHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHEEHHHHHHHHHHHCCEEE QNNYTFFYDVVDINSDQYPKILKYFKTLNQLNNTVIFDASGFKYLDERKIFRNIIDLEKT ECCCEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCC NVVRLDRYKTKTSGRRLMSFIFYQLSIIANVNTRKLLQKFPFFVNSLYRFLDYSEKNTEL CEEEEECHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHH LTLLLDIKKHASKTEIPLNDESQLFFVDFFTFVVFKALDELGFETLMNDLTVYGRPSEIT HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCHHH KKNITYNSLKLDYIINRNARNFGQQALLFNLLDYFDETVNKNIFNELGNSNKNMIFSKNH HCCCEECCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCC QLNLANEALSKKGFTKREIDLNNHYDALYSNLHDDEDMFVKIIEIKDNVDILNVLDELFV CCCHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHH RAQNDGVKNLLIYVFNVKMLYSLIDNEYELVNESII HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA