Definition Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 700970, complete genome.
Accession NC_002162
Length 751,719

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Identifier: 13358137

GI number: 13358137

Start: 716191

End: 717927

Strand: Direct

Name: Not Available

Synonym: UU572

Alternate gene names: NA

Gene position: 716191-717927 (Clockwise)

Preceding gene: 13358129

Following gene: 13358138

Centisome position: 95.27

GC content: 26.02

Gene sequence:

>1737_bases
ATGAGAAATAATTTATCTGATTTGGAAATCGAAAAATTGACCAAAACATTAGTATCAAAAAACAAAAGAGTTGTAGCTTT
ATATGGCGTTCCCGAAAACACTTCTTATAAACTAATGAACGATCTAATTAGTTTAATGGATGTAGAAATTCCTAATTGAT
CATCAATTTCAAGCGCAACTGAAGACCAATGTATTAATGATATTAAAAATTTTTTACTGTCAAATGCAAGTTTAGAAAAC
TTTAAAAACTTGCCTTCTAATAACCCTTTAATTAATTGGTGGAAAAGACGCCGTTTAAATACTGTTGTTAAAAAGATTGA
AGAAATCAACTCAGCGTTCGCAGACCGTGAAATAACATCTCGTTCAAAAATCTTTTTGATGCCTGTTTTAACAGCATTTA
GTACTTTAGGAACTACACTAGCTGTTCCTTTAATATCTGTTACTTTTTTACGGGGTGATGCAATTATTAATTTGTGGGGT
AAAGATGGATATATTGCTTTCTTAAGTTTACTATTTTCTTTAGTTGTTGCTGTTATTATTTCAGCTTTTGTCGCTTTATT
TAGTAGTTTAAAAAATAATAAACGTAATTATATTGTTTCAAACATGACCAAAGGTCTTAAAAGAATATATGATAAATATT
TTATCGAAAGTAATTCTCAAGAAAAGATTAATGCTAAAGTAACTTTTTATTCACGCTTTTTAGAACGTTCTAAATTCGTT
GTTCAAAATAATTACACATTTTTTTATGATGTTGTAGATATTAATAGTGATCAATATCCTAAAATATTAAAATATTTCAA
AACCTTAAACCAATTAAATAATACAGTAATCTTCGATGCTAGTGGTTTTAAATATTTAGACGAACGTAAAATTTTCCGTA
ACATTATCGATTTAGAGAAAACAAATGTTGTCCGTTTGGATCGTTATAAAACAAAAACAAGCGGACGTCGCTTAATGAGT
TTTATTTTCTATCAATTATCAATCATTGCTAATGTTAATACACGAAAACTTTTACAAAAATTTCCTTTCTTTGTCAACTC
TTTATATCGTTTTTTAGATTACAGCGAAAAAAATACTGAGTTATTAACACTTTTATTAGACATTAAAAAACACGCTTCAA
AAACAGAAATTCCATTAAACGATGAATCACAATTATTTTTTGTAGACTTTTTTACATTCGTGGTTTTTAAAGCTTTGGAT
GAATTAGGATTTGAGACGCTAATGAATGATTTAACAGTCTATGGTCGTCCATCTGAAATCACTAAGAAAAATATAACTTA
TAATTCATTAAAATTGGATTACATCATTAATCGTAATGCGCGTAATTTTGGACAACAAGCATTATTGTTTAACTTATTAG
ATTATTTTGATGAGACAGTAAATAAAAATATCTTTAACGAATTAGGAAATAGTAATAAAAACATGATTTTTTCTAAAAAT
CATCAATTAAATTTAGCCAATGAAGCTTTAAGTAAAAAAGGTTTTACAAAGCGTGAAATTGATTTAAATAATCATTGATA
TGATGCTTTATATTCTAATCTTCATGATGATGAAGACATGTTTGTTAAAATTATTGAAATTAAAGATAATGTTGATATCT
TAAATGTATTAGATGAACTCTTTGTTCGTGCTCAAAATGATGGTGTTAAAAATTTATTAATTTATGTTTTTAATGTAAAA
ATGTTATATTCATTAATAGATAATGAATACGAGTTGGTTAATGAGTCAATTATTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTCATATTTTTAATCTACATTTAAAAAATAACTTTGTTATAAAGTTGTATAATTATATAACATACAAATTAAATGGATTA
AGTAAGCAAACTAAATTTAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TACTTAATATATAAGTTTTTAAATTTAATTATTTTATTTAAAATAATAGGAGTAAAATAAAACGATGACAAATGATGAGC
GTAAAGAATTTATTAGAAAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 578; Mature: 578

Protein sequence:

>578_residues
MRNNLSDLEIEKLTKTLVSKNKRVVALYGVPENTSYKLMNDLISLMDVEIPNWSSISSATEDQCINDIKNFLLSNASLEN
FKNLPSNNPLINWWKRRRLNTVVKKIEEINSAFADREITSRSKIFLMPVLTAFSTLGTTLAVPLISVTFLRGDAIINLWG
KDGYIAFLSLLFSLVVAVIISAFVALFSSLKNNKRNYIVSNMTKGLKRIYDKYFIESNSQEKINAKVTFYSRFLERSKFV
VQNNYTFFYDVVDINSDQYPKILKYFKTLNQLNNTVIFDASGFKYLDERKIFRNIIDLEKTNVVRLDRYKTKTSGRRLMS
FIFYQLSIIANVNTRKLLQKFPFFVNSLYRFLDYSEKNTELLTLLLDIKKHASKTEIPLNDESQLFFVDFFTFVVFKALD
ELGFETLMNDLTVYGRPSEITKKNITYNSLKLDYIINRNARNFGQQALLFNLLDYFDETVNKNIFNELGNSNKNMIFSKN
HQLNLANEALSKKGFTKREIDLNNHWYDALYSNLHDDEDMFVKIIEIKDNVDILNVLDELFVRAQNDGVKNLLIYVFNVK
MLYSLIDNEYELVNESII

Sequences:

>Translated_578_residues
MRNNLSDLEIEKLTKTLVSKNKRVVALYGVPENTSYKLMNDLISLMDVEIPN*SSISSATEDQCINDIKNFLLSNASLEN
FKNLPSNNPLINWWKRRRLNTVVKKIEEINSAFADREITSRSKIFLMPVLTAFSTLGTTLAVPLISVTFLRGDAIINLWG
KDGYIAFLSLLFSLVVAVIISAFVALFSSLKNNKRNYIVSNMTKGLKRIYDKYFIESNSQEKINAKVTFYSRFLERSKFV
VQNNYTFFYDVVDINSDQYPKILKYFKTLNQLNNTVIFDASGFKYLDERKIFRNIIDLEKTNVVRLDRYKTKTSGRRLMS
FIFYQLSIIANVNTRKLLQKFPFFVNSLYRFLDYSEKNTELLTLLLDIKKHASKTEIPLNDESQLFFVDFFTFVVFKALD
ELGFETLMNDLTVYGRPSEITKKNITYNSLKLDYIINRNARNFGQQALLFNLLDYFDETVNKNIFNELGNSNKNMIFSKN
HQLNLANEALSKKGFTKREIDLNNH*YDALYSNLHDDEDMFVKIIEIKDNVDILNVLDELFVRAQNDGVKNLLIYVFNVK
MLYSLIDNEYELVNESII
>Mature_578_residues
MRNNLSDLEIEKLTKTLVSKNKRVVALYGVPENTSYKLMNDLISLMDVEIPN*SSISSATEDQCINDIKNFLLSNASLEN
FKNLPSNNPLINWWKRRRLNTVVKKIEEINSAFADREITSRSKIFLMPVLTAFSTLGTTLAVPLISVTFLRGDAIINLWG
KDGYIAFLSLLFSLVVAVIISAFVALFSSLKNNKRNYIVSNMTKGLKRIYDKYFIESNSQEKINAKVTFYSRFLERSKFV
VQNNYTFFYDVVDINSDQYPKILKYFKTLNQLNNTVIFDASGFKYLDERKIFRNIIDLEKTNVVRLDRYKTKTSGRRLMS
FIFYQLSIIANVNTRKLLQKFPFFVNSLYRFLDYSEKNTELLTLLLDIKKHASKTEIPLNDESQLFFVDFFTFVVFKALD
ELGFETLMNDLTVYGRPSEITKKNITYNSLKLDYIINRNARNFGQQALLFNLLDYFDETVNKNIFNELGNSNKNMIFSKN
HQLNLANEALSKKGFTKREIDLNNH*YDALYSNLHDDEDMFVKIIEIKDNVDILNVLDELFVRAQNDGVKNLLIYVFNVK
MLYSLIDNEYELVNESII

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 66994; Mature: 66994

Theoretical pI: Translated: 9.34; Mature: 9.34

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
1.7 %Met     (Translated Protein)
1.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
1.7 %Met     (Mature Protein)
1.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MRNNLSDLEIEKLTKTLVSKNKRVVALYGVPENTSYKLMNDLISLMDVEIPNSSISSATE
CCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHH
DQCINDIKNFLLSNASLENFKNLPSNNPLINWWKRRRLNTVVKKIEEINSAFADREITSR
HHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCC
SKIFLMPVLTAFSTLGTTLAVPLISVTFLRGDAIINLWGKDGYIAFLSLLFSLVVAVIIS
CCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AFVALFSSLKNNKRNYIVSNMTKGLKRIYDKYFIESNSQEKINAKVTFYSRFLERSKFVV
HHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHEEHHHHHHHHHHHCCEEE
QNNYTFFYDVVDINSDQYPKILKYFKTLNQLNNTVIFDASGFKYLDERKIFRNIIDLEKT
ECCCEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCC
NVVRLDRYKTKTSGRRLMSFIFYQLSIIANVNTRKLLQKFPFFVNSLYRFLDYSEKNTEL
CEEEEECHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHH
LTLLLDIKKHASKTEIPLNDESQLFFVDFFTFVVFKALDELGFETLMNDLTVYGRPSEIT
HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCHHH
KKNITYNSLKLDYIINRNARNFGQQALLFNLLDYFDETVNKNIFNELGNSNKNMIFSKNH
HCCCEECCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCC
QLNLANEALSKKGFTKREIDLNNHYDALYSNLHDDEDMFVKIIEIKDNVDILNVLDELFV
CCCHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHH
RAQNDGVKNLLIYVFNVKMLYSLIDNEYELVNESII
HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MRNNLSDLEIEKLTKTLVSKNKRVVALYGVPENTSYKLMNDLISLMDVEIPNSSISSATE
CCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHH
DQCINDIKNFLLSNASLENFKNLPSNNPLINWWKRRRLNTVVKKIEEINSAFADREITSR
HHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCC
SKIFLMPVLTAFSTLGTTLAVPLISVTFLRGDAIINLWGKDGYIAFLSLLFSLVVAVIIS
CCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AFVALFSSLKNNKRNYIVSNMTKGLKRIYDKYFIESNSQEKINAKVTFYSRFLERSKFVV
HHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHEEHHHHHHHHHHHCCEEE
QNNYTFFYDVVDINSDQYPKILKYFKTLNQLNNTVIFDASGFKYLDERKIFRNIIDLEKT
ECCCEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCC
NVVRLDRYKTKTSGRRLMSFIFYQLSIIANVNTRKLLQKFPFFVNSLYRFLDYSEKNTEL
CEEEEECHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHH
LTLLLDIKKHASKTEIPLNDESQLFFVDFFTFVVFKALDELGFETLMNDLTVYGRPSEIT
HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCHHH
KKNITYNSLKLDYIINRNARNFGQQALLFNLLDYFDETVNKNIFNELGNSNKNMIFSKNH
HCCCEECCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCC
QLNLANEALSKKGFTKREIDLNNHYDALYSNLHDDEDMFVKIIEIKDNVDILNVLDELFV
CCCHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHH
RAQNDGVKNLLIYVFNVKMLYSLIDNEYELVNESII
HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA