Definition Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 700970, complete genome.
Accession NC_002162
Length 751,719

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The map label for this gene is Not Available

Identifier: 13358091

GI number: 13358091

Start: 653483

End: 656398

Strand: Reverse

Name: Not Available

Synonym: UU527

Alternate gene names: NA

Gene position: 656398-653483 (Counterclockwise)

Preceding gene: 13358092

Following gene: 13358090

Centisome position: 87.32

GC content: 20.37

Gene sequence:

>2916_bases
ATGGCTAAATTAAAGTTTTGAAAAATAAGTACAAGTATTAATACATTTATTAAATATTTGATCTGCAATGAAAATAATGT
TAAAAAGATTTTTTCGAATGAGAAATTACACCTTGATACTAATGATCAAGAATGAAAAATTTTAATTAATGATAAAAATC
AAAAAAAAGTTGAATTTAGTTTTAAACGTTCATCTTATGAATTAATACGTGTTCTTTATTATTTACAAATTATTGTAGAT
AGTGATAAAAATAAAACAATTAATACATACAAAAATGACACTCTTAAAGATTATATATTTACTTTTAATGTATCAGATAA
CACCGAAAAAAGCATCAATAAACACATCACAAATGTTTTTGTTAATAAATTTTTAAGAAATTTAGATTTAAATGATTTTT
TTCAAAATGAAACAATAGATCAAAAAAATAAAGATTTTGTTTTAACTATTTTCTTATCATTACTACATTATAAAAAACAC
AATGATTATTTAACTAAAAAAGAATTATTTGAATACTACTATGAACCTAAGCAAAATGATAGCAATTTTAAGCATTTTAA
ACAATATAAAGAATTTGTTGAAAATTATTTTAAAGATCAAATAATTTCTAATGAATTAATTACCAAATTTGAAAACTATT
GAGCAAAAACTAATGATGAAAATAAAGCAAATCCAAACAATCAAACTAATATAAATAAAACTAAAAATAAACCAGATTTT
TTAAGAACAGCGAAAACTCAACAAGAAAAAGATAATAAAAAATTTAATTTTGAAGAATATAGTGATTCGTGTGAATTAGT
TACTAATTGAAAATTACCATTAATTTCAAATGACAATTCTATTGAAGTGACTAAATTAGATGGTACAAAGAAGTTGGCTT
CAGATAATGGTGATGCTTATATTTTTAATTTAGTATGATTGATTAAATTTTTAAACAAGAATGAAACAATTAAAATGAGT
ATTCCAGTTTTTCAACGTAATTATGTTTGAACAATTGATAATATTGAAAAATTGCTAGAAGATATTAATGATATTAGTAA
CAAACAAAATAATGAAAACCATTTTTTAGGTAGTATCATTAGTGTCTTAGTTAAAGAAGAATCTATTGATAATATTCAAA
TTATTGATGGTCAACAACGATTAACAACCTTATTTTTAATTACAAAAGCATTTATTATTTTCTTGTATAACAACAGAGAA
GAAATAACAAAATTTACAAACGAACAAATAAAGCAACTAAGTCATTTAAAAGATATCTTTTTTAACAGAGAGTTTATAAT
TGATCGCTTTAGTCGTATTGGTGGCAATCCTGACTATGAAGCTTTAAAACAAATATTATCTAATGATGAATTAGATAATA
AAAACAATCATATTTTTATGAATCTAAAAGATATTGTTGAATGATTTGAAGAAAAACCAAAAGAATTTAAAGAATGAGCG
AATTTTGCTAACGCCTTATTTAATAATTTAATCCTCAATTTAGTTATTTTAAAAAATGTTGATGAATTTAAAACTTTTGA
ATCATTAAATACTAATGCTAAAAAACTTAACGCTATTGAATTGTTAAAAAATAAGTTTTGTTGATATGAAAATTTTAAAG
AATCAATTTTTAAAAATAAAGAAGAATTCCAACAGAAATATAATGATTTAATAACGAAAAAATTTTTATTAAAAAAAGAT
GAAAATATTATTGAAGTAAAACGTTTTAACGAATTTGTTGATTCATTAAGTGCTTTAAATCTTTGTAAAGATGAGGATTT
AAAAAGATTTGAAAAAAACGATAAAGATGATGAATATTATAATAAAAGTTGATTTTTTATTATTGAAATTATTAATAAAA
AATTTACTTTAAAAAATAATTGAAAAGCGTGTTTGAAATATTTTAGTAAATATATAGATATTTACAATGACTTAACAATC
AAAGATAAATTCACAAACAATAATTGTAATTTTTATTTAATTAGTGATTATTTACTAATCTTAACGAACAAAAAGAAAAA
GAATTATATTCCTTTATTAGTTTATTTATTAGAGAAAATATTTACTGAGGATGTATTGTATGATTTTGATAACAATGGTA
ATTTTGATAAAAGCAAATTAAGAATTAATATTGAAGAATATGTTAGCGTGATTGCTAATTTTTCATTGAGAAATGTTTTA
TTAAATACTCGTGGTCAAAGTATTTTAAATAGTGTTATTAAATTAATTAAGTTAATTGATAATGATATTAACAAAAACAA
TATAAATTCCATTAAAAATATTAATTTATCAAAAAAATTTTTAGATGTTTTTAATAGCAATAATCAAATGGAAATAAAAA
ATATTAAAAATTTTTATAACAAAATGCTTGATGAAAAGGTTAGTGATATTCATTTGGCTTATTTAATTAGATTTGAAACT
TATTTAACTTTTTTTCTTGATGATACGCAAATAAATAAAAATAAGGATACAAAAGTATTTTTTTATCCACCAAGTAATGC
TGATAATGAAAAAGCAGATTTAACAATTGAACACATGTATTCACAATCATTAAAAGATGAAAGATTTAATATTGTTAAAA
ATAATATTGGTAATTTAATACCACTTACTAAAGAATACAACTCAGCTCTTAATAATAAAGAATTTAAAGATAAAAAACAA
CGTTATAAAAATGCACCTATCATTCAAAATCTTTGATTATACAAAGGATTAAATGAGGAACAAATAACAAAACTTTACAA
TGAATTCACAAAAATAAATGAAAAGTTAAAATCTAATAAAATTGATGTTAATGAAGATGTATTTAAAGAAGCACTTATGA
GTTTAAAATTAAGTGATAAAGAAGAACTTCAACCAGAACAAATTAAAAAACGAACTCAAGCTATTGCGTTGGTATTATCA
ATTGCTTTATTTAATGAAGATTGAGATGTAGAATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATCAAAAGCTAAAATGTATCAACAAGCTGGAAATTCAATTGTTGTTGATGTAATGGTTTATTTAATGAAATTAATTCAAG
AAAGATTTAATAAATAATTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAATTATAAAGTAAAAATTGTAGTTTACTTGTATATACAATTCATAATTATACAATAAGATTCATGATTTAATTTAATTA
ATTTTTTAAAAAAATAAATA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 971; Mature: 970

Protein sequence:

>971_residues
MAKLKFWKISTSINTFIKYLICNENNVKKIFSNEKLHLDTNDQEWKILINDKNQKKVEFSFKRSSYELIRVLYYLQIIVD
SDKNKTINTYKNDTLKDYIFTFNVSDNTEKSINKHITNVFVNKFLRNLDLNDFFQNETIDQKNKDFVLTIFLSLLHYKKH
NDYLTKKELFEYYYEPKQNDSNFKHFKQYKEFVENYFKDQIISNELITKFENYWAKTNDENKANPNNQTNINKTKNKPDF
LRTAKTQQEKDNKKFNFEEYSDSCELVTNWKLPLISNDNSIEVTKLDGTKKLASDNGDAYIFNLVWLIKFLNKNETIKMS
IPVFQRNYVWTIDNIEKLLEDINDISNKQNNENHFLGSIISVLVKEESIDNIQIIDGQQRLTTLFLITKAFIIFLYNNRE
EITKFTNEQIKQLSHLKDIFFNREFIIDRFSRIGGNPDYEALKQILSNDELDNKNNHIFMNLKDIVEWFEEKPKEFKEWA
NFANALFNNLILNLVILKNVDEFKTFESLNTNAKKLNAIELLKNKFCWYENFKESIFKNKEEFQQKYNDLITKKFLLKKD
ENIIEVKRFNEFVDSLSALNLCKDEDLKRFEKNDKDDEYYNKSWFFIIEIINKKFTLKNNWKACLKYFSKYIDIYNDLTI
KDKFTNNNCNFYLISDYLLILTNKKKKNYIPLLVYLLEKIFTEDVLYDFDNNGNFDKSKLRINIEEYVSVIANFSLRNVL
LNTRGQSILNSVIKLIKLIDNDINKNNINSIKNINLSKKFLDVFNSNNQMEIKNIKNFYNKMLDEKVSDIHLAYLIRFET
YLTFFLDDTQINKNKDTKVFFYPPSNADNEKADLTIEHMYSQSLKDERFNIVKNNIGNLIPLTKEYNSALNNKEFKDKKQ
RYKNAPIIQNLWLYKGLNEEQITKLYNEFTKINEKLKSNKIDVNEDVFKEALMSLKLSDKEELQPEQIKKRTQAIALVLS
IALFNEDWDVE

Sequences:

>Translated_971_residues
MAKLKF*KISTSINTFIKYLICNENNVKKIFSNEKLHLDTNDQE*KILINDKNQKKVEFSFKRSSYELIRVLYYLQIIVD
SDKNKTINTYKNDTLKDYIFTFNVSDNTEKSINKHITNVFVNKFLRNLDLNDFFQNETIDQKNKDFVLTIFLSLLHYKKH
NDYLTKKELFEYYYEPKQNDSNFKHFKQYKEFVENYFKDQIISNELITKFENY*AKTNDENKANPNNQTNINKTKNKPDF
LRTAKTQQEKDNKKFNFEEYSDSCELVTN*KLPLISNDNSIEVTKLDGTKKLASDNGDAYIFNLV*LIKFLNKNETIKMS
IPVFQRNYV*TIDNIEKLLEDINDISNKQNNENHFLGSIISVLVKEESIDNIQIIDGQQRLTTLFLITKAFIIFLYNNRE
EITKFTNEQIKQLSHLKDIFFNREFIIDRFSRIGGNPDYEALKQILSNDELDNKNNHIFMNLKDIVE*FEEKPKEFKE*A
NFANALFNNLILNLVILKNVDEFKTFESLNTNAKKLNAIELLKNKFC*YENFKESIFKNKEEFQQKYNDLITKKFLLKKD
ENIIEVKRFNEFVDSLSALNLCKDEDLKRFEKNDKDDEYYNKS*FFIIEIINKKFTLKNN*KACLKYFSKYIDIYNDLTI
KDKFTNNNCNFYLISDYLLILTNKKKKNYIPLLVYLLEKIFTEDVLYDFDNNGNFDKSKLRINIEEYVSVIANFSLRNVL
LNTRGQSILNSVIKLIKLIDNDINKNNINSIKNINLSKKFLDVFNSNNQMEIKNIKNFYNKMLDEKVSDIHLAYLIRFET
YLTFFLDDTQINKNKDTKVFFYPPSNADNEKADLTIEHMYSQSLKDERFNIVKNNIGNLIPLTKEYNSALNNKEFKDKKQ
RYKNAPIIQNL*LYKGLNEEQITKLYNEFTKINEKLKSNKIDVNEDVFKEALMSLKLSDKEELQPEQIKKRTQAIALVLS
IALFNED*DVE
>Mature_970_residues
AKLKF*KISTSINTFIKYLICNENNVKKIFSNEKLHLDTNDQE*KILINDKNQKKVEFSFKRSSYELIRVLYYLQIIVDS
DKNKTINTYKNDTLKDYIFTFNVSDNTEKSINKHITNVFVNKFLRNLDLNDFFQNETIDQKNKDFVLTIFLSLLHYKKHN
DYLTKKELFEYYYEPKQNDSNFKHFKQYKEFVENYFKDQIISNELITKFENY*AKTNDENKANPNNQTNINKTKNKPDFL
RTAKTQQEKDNKKFNFEEYSDSCELVTN*KLPLISNDNSIEVTKLDGTKKLASDNGDAYIFNLV*LIKFLNKNETIKMSI
PVFQRNYV*TIDNIEKLLEDINDISNKQNNENHFLGSIISVLVKEESIDNIQIIDGQQRLTTLFLITKAFIIFLYNNREE
ITKFTNEQIKQLSHLKDIFFNREFIIDRFSRIGGNPDYEALKQILSNDELDNKNNHIFMNLKDIVE*FEEKPKEFKE*AN
FANALFNNLILNLVILKNVDEFKTFESLNTNAKKLNAIELLKNKFC*YENFKESIFKNKEEFQQKYNDLITKKFLLKKDE
NIIEVKRFNEFVDSLSALNLCKDEDLKRFEKNDKDDEYYNKS*FFIIEIINKKFTLKNN*KACLKYFSKYIDIYNDLTIK
DKFTNNNCNFYLISDYLLILTNKKKKNYIPLLVYLLEKIFTEDVLYDFDNNGNFDKSKLRINIEEYVSVIANFSLRNVLL
NTRGQSILNSVIKLIKLIDNDINKNNINSIKNINLSKKFLDVFNSNNQMEIKNIKNFYNKMLDEKVSDIHLAYLIRFETY
LTFFLDDTQINKNKDTKVFFYPPSNADNEKADLTIEHMYSQSLKDERFNIVKNNIGNLIPLTKEYNSALNNKEFKDKKQR
YKNAPIIQNL*LYKGLNEEQITKLYNEFTKINEKLKSNKIDVNEDVFKEALMSLKLSDKEELQPEQIKKRTQAIALVLSI
ALFNED*DVE

Specific function: Unknown

COG id: COG1479

COG function: function code S; Uncharacterized conserved protein

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 113490; Mature: 113359

Theoretical pI: Translated: 8.50; Mature: 8.50

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
0.7 %Met     (Translated Protein)
1.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
0.6 %Met     (Mature Protein)
1.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MAKLKFKISTSINTFIKYLICNENNVKKIFSNEKLHLDTNDQEKILINDKNQKKVEFSFK
CCEEEEEECCCHHHHHHHHEECCCCHHHHHCCCEEEECCCCCCEEEEECCCCCEEEEEEC
RSSYELIRVLYYLQIIVDSDKNKTINTYKNDTLKDYIFTFNVSDNTEKSINKHITNVFVN
CCHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHH
KFLRNLDLNDFFQNETIDQKNKDFVLTIFLSLLHYKKHNDYLTKKELFEYYYEPKQNDSN
HHHHHCCCHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCH
FKHFKQYKEFVENYFKDQIISNELITKFENYAKTNDENKANPNNQTNINKTKNKPDFLRT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHH
AKTQQEKDNKKFNFEEYSDSCELVTNKLPLISNDNSIEVTKLDGTKKLASDNGDAYIFNL
HHHHHHHCCCCCCCHHHCCHHHHHHCCCCEEECCCCEEEEEECCCHHHHCCCCCEEHHHH
VLIKFLNKNETIKMSIPVFQRNYVTIDNIEKLLEDINDISNKQNNENHFLGSIISVLVKE
HHHHHHCCCCEEEEECCEECCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
ESIDNIQIIDGQQRLTTLFLITKAFIIFLYNNREEITKFTNEQIKQLSHLKDIFFNREFI
CCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHH
IDRFSRIGGNPDYEALKQILSNDELDNKNNHIFMNLKDIVEFEEKPKEFKEANFANALFN
HHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHH
NLILNLVILKNVDEFKTFESLNTNAKKLNAIELLKNKFCYENFKESIFKNKEEFQQKYND
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH
LITKKFLLKKDENIIEVKRFNEFVDSLSALNLCKDEDLKRFEKNDKDDEYYNKSFFIIEI
HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHCCCEEEEEE
INKKFTLKNNKACLKYFSKYIDIYNDLTIKDKFTNNNCNFYLISDYLLILTNKKKKNYIP
ECCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCEEECCCEEEEEECCCCCCCHH
LLVYLLEKIFTEDVLYDFDNNGNFDKSKLRINIEEYVSVIANFSLRNVLLNTRGQSILNS
HHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCHHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH
VIKLIKLIDNDINKNNINSIKNINLSKKFLDVFNSNNQMEIKNIKNFYNKMLDEKVSDIH
HHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LAYLIRFETYLTFFLDDTQINKNKDTKVFFYPPSNADNEKADLTIEHMYSQSLKDERFNI
HHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHH
VKNNIGNLIPLTKEYNSALNNKEFKDKKQRYKNAPIIQNLLYKGLNEEQITKLYNEFTKI
HHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH
NEKLKSNKIDVNEDVFKEALMSLKLSDKEELQPEQIKKRTQAIALVLSIALFNEDDVE
HHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
AKLKFKISTSINTFIKYLICNENNVKKIFSNEKLHLDTNDQEKILINDKNQKKVEFSFK
CEEEEEECCCHHHHHHHHEECCCCHHHHHCCCEEEECCCCCCEEEEECCCCCEEEEEEC
RSSYELIRVLYYLQIIVDSDKNKTINTYKNDTLKDYIFTFNVSDNTEKSINKHITNVFVN
CCHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHH
KFLRNLDLNDFFQNETIDQKNKDFVLTIFLSLLHYKKHNDYLTKKELFEYYYEPKQNDSN
HHHHHCCCHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCH
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VLIKFLNKNETIKMSIPVFQRNYVTIDNIEKLLEDINDISNKQNNENHFLGSIISVLVKE
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CCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHH
IDRFSRIGGNPDYEALKQILSNDELDNKNNHIFMNLKDIVEFEEKPKEFKEANFANALFN
HHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHH
NLILNLVILKNVDEFKTFESLNTNAKKLNAIELLKNKFCYENFKESIFKNKEEFQQKYND
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH
LITKKFLLKKDENIIEVKRFNEFVDSLSALNLCKDEDLKRFEKNDKDDEYYNKSFFIIEI
HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHCCCEEEEEE
INKKFTLKNNKACLKYFSKYIDIYNDLTIKDKFTNNNCNFYLISDYLLILTNKKKKNYIP
ECCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCEEECCCEEEEEECCCCCCCHH
LLVYLLEKIFTEDVLYDFDNNGNFDKSKLRINIEEYVSVIANFSLRNVLLNTRGQSILNS
HHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCHHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH
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HHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LAYLIRFETYLTFFLDDTQINKNKDTKVFFYPPSNADNEKADLTIEHMYSQSLKDERFNI
HHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHH
VKNNIGNLIPLTKEYNSALNNKEFKDKKQRYKNAPIIQNLLYKGLNEEQITKLYNEFTKI
HHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH
NEKLKSNKIDVNEDVFKEALMSLKLSDKEELQPEQIKKRTQAIALVLSIALFNEDDVE
HHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA