| Definition | Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 700970, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_002162 |
| Length | 751,719 |
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Identifier: 13358091
GI number: 13358091
Start: 653483
End: 656398
Strand: Reverse
Name: Not Available
Synonym: UU527
Alternate gene names: NA
Gene position: 656398-653483 (Counterclockwise)
Preceding gene: 13358092
Following gene: 13358090
Centisome position: 87.32
GC content: 20.37
Gene sequence:
>2916_bases ATGGCTAAATTAAAGTTTTGAAAAATAAGTACAAGTATTAATACATTTATTAAATATTTGATCTGCAATGAAAATAATGT TAAAAAGATTTTTTCGAATGAGAAATTACACCTTGATACTAATGATCAAGAATGAAAAATTTTAATTAATGATAAAAATC AAAAAAAAGTTGAATTTAGTTTTAAACGTTCATCTTATGAATTAATACGTGTTCTTTATTATTTACAAATTATTGTAGAT AGTGATAAAAATAAAACAATTAATACATACAAAAATGACACTCTTAAAGATTATATATTTACTTTTAATGTATCAGATAA CACCGAAAAAAGCATCAATAAACACATCACAAATGTTTTTGTTAATAAATTTTTAAGAAATTTAGATTTAAATGATTTTT TTCAAAATGAAACAATAGATCAAAAAAATAAAGATTTTGTTTTAACTATTTTCTTATCATTACTACATTATAAAAAACAC AATGATTATTTAACTAAAAAAGAATTATTTGAATACTACTATGAACCTAAGCAAAATGATAGCAATTTTAAGCATTTTAA ACAATATAAAGAATTTGTTGAAAATTATTTTAAAGATCAAATAATTTCTAATGAATTAATTACCAAATTTGAAAACTATT GAGCAAAAACTAATGATGAAAATAAAGCAAATCCAAACAATCAAACTAATATAAATAAAACTAAAAATAAACCAGATTTT TTAAGAACAGCGAAAACTCAACAAGAAAAAGATAATAAAAAATTTAATTTTGAAGAATATAGTGATTCGTGTGAATTAGT TACTAATTGAAAATTACCATTAATTTCAAATGACAATTCTATTGAAGTGACTAAATTAGATGGTACAAAGAAGTTGGCTT CAGATAATGGTGATGCTTATATTTTTAATTTAGTATGATTGATTAAATTTTTAAACAAGAATGAAACAATTAAAATGAGT ATTCCAGTTTTTCAACGTAATTATGTTTGAACAATTGATAATATTGAAAAATTGCTAGAAGATATTAATGATATTAGTAA CAAACAAAATAATGAAAACCATTTTTTAGGTAGTATCATTAGTGTCTTAGTTAAAGAAGAATCTATTGATAATATTCAAA TTATTGATGGTCAACAACGATTAACAACCTTATTTTTAATTACAAAAGCATTTATTATTTTCTTGTATAACAACAGAGAA GAAATAACAAAATTTACAAACGAACAAATAAAGCAACTAAGTCATTTAAAAGATATCTTTTTTAACAGAGAGTTTATAAT TGATCGCTTTAGTCGTATTGGTGGCAATCCTGACTATGAAGCTTTAAAACAAATATTATCTAATGATGAATTAGATAATA AAAACAATCATATTTTTATGAATCTAAAAGATATTGTTGAATGATTTGAAGAAAAACCAAAAGAATTTAAAGAATGAGCG AATTTTGCTAACGCCTTATTTAATAATTTAATCCTCAATTTAGTTATTTTAAAAAATGTTGATGAATTTAAAACTTTTGA ATCATTAAATACTAATGCTAAAAAACTTAACGCTATTGAATTGTTAAAAAATAAGTTTTGTTGATATGAAAATTTTAAAG AATCAATTTTTAAAAATAAAGAAGAATTCCAACAGAAATATAATGATTTAATAACGAAAAAATTTTTATTAAAAAAAGAT GAAAATATTATTGAAGTAAAACGTTTTAACGAATTTGTTGATTCATTAAGTGCTTTAAATCTTTGTAAAGATGAGGATTT AAAAAGATTTGAAAAAAACGATAAAGATGATGAATATTATAATAAAAGTTGATTTTTTATTATTGAAATTATTAATAAAA AATTTACTTTAAAAAATAATTGAAAAGCGTGTTTGAAATATTTTAGTAAATATATAGATATTTACAATGACTTAACAATC AAAGATAAATTCACAAACAATAATTGTAATTTTTATTTAATTAGTGATTATTTACTAATCTTAACGAACAAAAAGAAAAA GAATTATATTCCTTTATTAGTTTATTTATTAGAGAAAATATTTACTGAGGATGTATTGTATGATTTTGATAACAATGGTA ATTTTGATAAAAGCAAATTAAGAATTAATATTGAAGAATATGTTAGCGTGATTGCTAATTTTTCATTGAGAAATGTTTTA TTAAATACTCGTGGTCAAAGTATTTTAAATAGTGTTATTAAATTAATTAAGTTAATTGATAATGATATTAACAAAAACAA TATAAATTCCATTAAAAATATTAATTTATCAAAAAAATTTTTAGATGTTTTTAATAGCAATAATCAAATGGAAATAAAAA ATATTAAAAATTTTTATAACAAAATGCTTGATGAAAAGGTTAGTGATATTCATTTGGCTTATTTAATTAGATTTGAAACT TATTTAACTTTTTTTCTTGATGATACGCAAATAAATAAAAATAAGGATACAAAAGTATTTTTTTATCCACCAAGTAATGC TGATAATGAAAAAGCAGATTTAACAATTGAACACATGTATTCACAATCATTAAAAGATGAAAGATTTAATATTGTTAAAA ATAATATTGGTAATTTAATACCACTTACTAAAGAATACAACTCAGCTCTTAATAATAAAGAATTTAAAGATAAAAAACAA CGTTATAAAAATGCACCTATCATTCAAAATCTTTGATTATACAAAGGATTAAATGAGGAACAAATAACAAAACTTTACAA TGAATTCACAAAAATAAATGAAAAGTTAAAATCTAATAAAATTGATGTTAATGAAGATGTATTTAAAGAAGCACTTATGA GTTTAAAATTAAGTGATAAAGAAGAACTTCAACCAGAACAAATTAAAAAACGAACTCAAGCTATTGCGTTGGTATTATCA ATTGCTTTATTTAATGAAGATTGAGATGTAGAATAG
Upstream 100 bases:
>100_bases ATCAAAAGCTAAAATGTATCAACAAGCTGGAAATTCAATTGTTGTTGATGTAATGGTTTATTTAATGAAATTAATTCAAG AAAGATTTAATAAATAATTT
Downstream 100 bases:
>100_bases AAATTATAAAGTAAAAATTGTAGTTTACTTGTATATACAATTCATAATTATACAATAAGATTCATGATTTAATTTAATTA ATTTTTTAAAAAAATAAATA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 971; Mature: 970
Protein sequence:
>971_residues MAKLKFWKISTSINTFIKYLICNENNVKKIFSNEKLHLDTNDQEWKILINDKNQKKVEFSFKRSSYELIRVLYYLQIIVD SDKNKTINTYKNDTLKDYIFTFNVSDNTEKSINKHITNVFVNKFLRNLDLNDFFQNETIDQKNKDFVLTIFLSLLHYKKH NDYLTKKELFEYYYEPKQNDSNFKHFKQYKEFVENYFKDQIISNELITKFENYWAKTNDENKANPNNQTNINKTKNKPDF LRTAKTQQEKDNKKFNFEEYSDSCELVTNWKLPLISNDNSIEVTKLDGTKKLASDNGDAYIFNLVWLIKFLNKNETIKMS IPVFQRNYVWTIDNIEKLLEDINDISNKQNNENHFLGSIISVLVKEESIDNIQIIDGQQRLTTLFLITKAFIIFLYNNRE EITKFTNEQIKQLSHLKDIFFNREFIIDRFSRIGGNPDYEALKQILSNDELDNKNNHIFMNLKDIVEWFEEKPKEFKEWA NFANALFNNLILNLVILKNVDEFKTFESLNTNAKKLNAIELLKNKFCWYENFKESIFKNKEEFQQKYNDLITKKFLLKKD ENIIEVKRFNEFVDSLSALNLCKDEDLKRFEKNDKDDEYYNKSWFFIIEIINKKFTLKNNWKACLKYFSKYIDIYNDLTI KDKFTNNNCNFYLISDYLLILTNKKKKNYIPLLVYLLEKIFTEDVLYDFDNNGNFDKSKLRINIEEYVSVIANFSLRNVL LNTRGQSILNSVIKLIKLIDNDINKNNINSIKNINLSKKFLDVFNSNNQMEIKNIKNFYNKMLDEKVSDIHLAYLIRFET YLTFFLDDTQINKNKDTKVFFYPPSNADNEKADLTIEHMYSQSLKDERFNIVKNNIGNLIPLTKEYNSALNNKEFKDKKQ RYKNAPIIQNLWLYKGLNEEQITKLYNEFTKINEKLKSNKIDVNEDVFKEALMSLKLSDKEELQPEQIKKRTQAIALVLS IALFNEDWDVE
Sequences:
>Translated_971_residues MAKLKF*KISTSINTFIKYLICNENNVKKIFSNEKLHLDTNDQE*KILINDKNQKKVEFSFKRSSYELIRVLYYLQIIVD SDKNKTINTYKNDTLKDYIFTFNVSDNTEKSINKHITNVFVNKFLRNLDLNDFFQNETIDQKNKDFVLTIFLSLLHYKKH NDYLTKKELFEYYYEPKQNDSNFKHFKQYKEFVENYFKDQIISNELITKFENY*AKTNDENKANPNNQTNINKTKNKPDF LRTAKTQQEKDNKKFNFEEYSDSCELVTN*KLPLISNDNSIEVTKLDGTKKLASDNGDAYIFNLV*LIKFLNKNETIKMS IPVFQRNYV*TIDNIEKLLEDINDISNKQNNENHFLGSIISVLVKEESIDNIQIIDGQQRLTTLFLITKAFIIFLYNNRE EITKFTNEQIKQLSHLKDIFFNREFIIDRFSRIGGNPDYEALKQILSNDELDNKNNHIFMNLKDIVE*FEEKPKEFKE*A NFANALFNNLILNLVILKNVDEFKTFESLNTNAKKLNAIELLKNKFC*YENFKESIFKNKEEFQQKYNDLITKKFLLKKD ENIIEVKRFNEFVDSLSALNLCKDEDLKRFEKNDKDDEYYNKS*FFIIEIINKKFTLKNN*KACLKYFSKYIDIYNDLTI KDKFTNNNCNFYLISDYLLILTNKKKKNYIPLLVYLLEKIFTEDVLYDFDNNGNFDKSKLRINIEEYVSVIANFSLRNVL LNTRGQSILNSVIKLIKLIDNDINKNNINSIKNINLSKKFLDVFNSNNQMEIKNIKNFYNKMLDEKVSDIHLAYLIRFET YLTFFLDDTQINKNKDTKVFFYPPSNADNEKADLTIEHMYSQSLKDERFNIVKNNIGNLIPLTKEYNSALNNKEFKDKKQ RYKNAPIIQNL*LYKGLNEEQITKLYNEFTKINEKLKSNKIDVNEDVFKEALMSLKLSDKEELQPEQIKKRTQAIALVLS IALFNED*DVE >Mature_970_residues AKLKF*KISTSINTFIKYLICNENNVKKIFSNEKLHLDTNDQE*KILINDKNQKKVEFSFKRSSYELIRVLYYLQIIVDS DKNKTINTYKNDTLKDYIFTFNVSDNTEKSINKHITNVFVNKFLRNLDLNDFFQNETIDQKNKDFVLTIFLSLLHYKKHN DYLTKKELFEYYYEPKQNDSNFKHFKQYKEFVENYFKDQIISNELITKFENY*AKTNDENKANPNNQTNINKTKNKPDFL RTAKTQQEKDNKKFNFEEYSDSCELVTN*KLPLISNDNSIEVTKLDGTKKLASDNGDAYIFNLV*LIKFLNKNETIKMSI PVFQRNYV*TIDNIEKLLEDINDISNKQNNENHFLGSIISVLVKEESIDNIQIIDGQQRLTTLFLITKAFIIFLYNNREE ITKFTNEQIKQLSHLKDIFFNREFIIDRFSRIGGNPDYEALKQILSNDELDNKNNHIFMNLKDIVE*FEEKPKEFKE*AN FANALFNNLILNLVILKNVDEFKTFESLNTNAKKLNAIELLKNKFC*YENFKESIFKNKEEFQQKYNDLITKKFLLKKDE NIIEVKRFNEFVDSLSALNLCKDEDLKRFEKNDKDDEYYNKS*FFIIEIINKKFTLKNN*KACLKYFSKYIDIYNDLTIK DKFTNNNCNFYLISDYLLILTNKKKKNYIPLLVYLLEKIFTEDVLYDFDNNGNFDKSKLRINIEEYVSVIANFSLRNVLL NTRGQSILNSVIKLIKLIDNDINKNNINSIKNINLSKKFLDVFNSNNQMEIKNIKNFYNKMLDEKVSDIHLAYLIRFETY LTFFLDDTQINKNKDTKVFFYPPSNADNEKADLTIEHMYSQSLKDERFNIVKNNIGNLIPLTKEYNSALNNKEFKDKKQR YKNAPIIQNL*LYKGLNEEQITKLYNEFTKINEKLKSNKIDVNEDVFKEALMSLKLSDKEELQPEQIKKRTQAIALVLSI ALFNED*DVE
Specific function: Unknown
COG id: COG1479
COG function: function code S; Uncharacterized conserved protein
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 113490; Mature: 113359
Theoretical pI: Translated: 8.50; Mature: 8.50
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.6 %Cys (Translated Protein) 0.7 %Met (Translated Protein) 1.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.6 %Cys (Mature Protein) 0.6 %Met (Mature Protein) 1.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MAKLKFKISTSINTFIKYLICNENNVKKIFSNEKLHLDTNDQEKILINDKNQKKVEFSFK CCEEEEEECCCHHHHHHHHEECCCCHHHHHCCCEEEECCCCCCEEEEECCCCCEEEEEEC RSSYELIRVLYYLQIIVDSDKNKTINTYKNDTLKDYIFTFNVSDNTEKSINKHITNVFVN CCHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHH KFLRNLDLNDFFQNETIDQKNKDFVLTIFLSLLHYKKHNDYLTKKELFEYYYEPKQNDSN HHHHHCCCHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCH FKHFKQYKEFVENYFKDQIISNELITKFENYAKTNDENKANPNNQTNINKTKNKPDFLRT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHH AKTQQEKDNKKFNFEEYSDSCELVTNKLPLISNDNSIEVTKLDGTKKLASDNGDAYIFNL HHHHHHHCCCCCCCHHHCCHHHHHHCCCCEEECCCCEEEEEECCCHHHHCCCCCEEHHHH VLIKFLNKNETIKMSIPVFQRNYVTIDNIEKLLEDINDISNKQNNENHFLGSIISVLVKE HHHHHHCCCCEEEEECCEECCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH ESIDNIQIIDGQQRLTTLFLITKAFIIFLYNNREEITKFTNEQIKQLSHLKDIFFNREFI CCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHH IDRFSRIGGNPDYEALKQILSNDELDNKNNHIFMNLKDIVEFEEKPKEFKEANFANALFN HHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHH NLILNLVILKNVDEFKTFESLNTNAKKLNAIELLKNKFCYENFKESIFKNKEEFQQKYND HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH LITKKFLLKKDENIIEVKRFNEFVDSLSALNLCKDEDLKRFEKNDKDDEYYNKSFFIIEI HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHCCCEEEEEE INKKFTLKNNKACLKYFSKYIDIYNDLTIKDKFTNNNCNFYLISDYLLILTNKKKKNYIP ECCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCEEECCCEEEEEECCCCCCCHH LLVYLLEKIFTEDVLYDFDNNGNFDKSKLRINIEEYVSVIANFSLRNVLLNTRGQSILNS HHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCHHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH VIKLIKLIDNDINKNNINSIKNINLSKKFLDVFNSNNQMEIKNIKNFYNKMLDEKVSDIH HHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LAYLIRFETYLTFFLDDTQINKNKDTKVFFYPPSNADNEKADLTIEHMYSQSLKDERFNI HHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHH VKNNIGNLIPLTKEYNSALNNKEFKDKKQRYKNAPIIQNLLYKGLNEEQITKLYNEFTKI HHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH NEKLKSNKIDVNEDVFKEALMSLKLSDKEELQPEQIKKRTQAIALVLSIALFNEDDVE HHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC >Mature Secondary Structure AKLKFKISTSINTFIKYLICNENNVKKIFSNEKLHLDTNDQEKILINDKNQKKVEFSFK CEEEEEECCCHHHHHHHHEECCCCHHHHHCCCEEEECCCCCCEEEEECCCCCEEEEEEC RSSYELIRVLYYLQIIVDSDKNKTINTYKNDTLKDYIFTFNVSDNTEKSINKHITNVFVN CCHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHH KFLRNLDLNDFFQNETIDQKNKDFVLTIFLSLLHYKKHNDYLTKKELFEYYYEPKQNDSN HHHHHCCCHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCH FKHFKQYKEFVENYFKDQIISNELITKFENYAKTNDENKANPNNQTNINKTKNKPDFLRT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHH AKTQQEKDNKKFNFEEYSDSCELVTNKLPLISNDNSIEVTKLDGTKKLASDNGDAYIFNL HHHHHHHCCCCCCCHHHCCHHHHHHCCCCEEECCCCEEEEEECCCHHHHCCCCCEEHHHH VLIKFLNKNETIKMSIPVFQRNYVTIDNIEKLLEDINDISNKQNNENHFLGSIISVLVKE HHHHHHCCCCEEEEECCEECCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH ESIDNIQIIDGQQRLTTLFLITKAFIIFLYNNREEITKFTNEQIKQLSHLKDIFFNREFI CCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHH IDRFSRIGGNPDYEALKQILSNDELDNKNNHIFMNLKDIVEFEEKPKEFKEANFANALFN HHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHH NLILNLVILKNVDEFKTFESLNTNAKKLNAIELLKNKFCYENFKESIFKNKEEFQQKYND HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH LITKKFLLKKDENIIEVKRFNEFVDSLSALNLCKDEDLKRFEKNDKDDEYYNKSFFIIEI HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHCCCEEEEEE INKKFTLKNNKACLKYFSKYIDIYNDLTIKDKFTNNNCNFYLISDYLLILTNKKKKNYIP ECCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCEEECCCEEEEEECCCCCCCHH LLVYLLEKIFTEDVLYDFDNNGNFDKSKLRINIEEYVSVIANFSLRNVLLNTRGQSILNS HHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCHHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH VIKLIKLIDNDINKNNINSIKNINLSKKFLDVFNSNNQMEIKNIKNFYNKMLDEKVSDIH HHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LAYLIRFETYLTFFLDDTQINKNKDTKVFFYPPSNADNEKADLTIEHMYSQSLKDERFNI HHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHH VKNNIGNLIPLTKEYNSALNNKEFKDKKQRYKNAPIIQNLLYKGLNEEQITKLYNEFTKI HHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH NEKLKSNKIDVNEDVFKEALMSLKLSDKEELQPEQIKKRTQAIALVLSIALFNEDDVE HHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA