Definition | Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 700970, complete genome. |
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Accession | NC_002162 |
Length | 751,719 |
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Identifier: 13358052
GI number: 13358052
Start: 585101
End: 588112
Strand: Reverse
Name: Not Available
Synonym: UU489
Alternate gene names: NA
Gene position: 588112-585101 (Counterclockwise)
Preceding gene: 13358058
Following gene: 13358051
Centisome position: 78.24
GC content: 23.34
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases ATCATGACAATTAATATATAATTATTAATTAGTTAATATGAATGTTTTTATGAGTTTATAGTATTTCTAAAAATATGATT CAAGGTTAGTTGGTTTTACA
Downstream 100 bases:
>100_bases AAGAAAGATTTATAACGATTATGATCAATATTGATTACATTAAATCAAAAATCAGGGATGTACCAGACTTCCCTAAAAAA GGAATCGTTTTTAAGGATAT
Product: membrane lipoprotein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1003; Mature: 1002
Protein sequence:
>1003_residues MSFKTKIKFKQKWKKVLAFFGISTLTIAAIVGTGIGAANYANKNIKTGDFGDKISARTQVLLNDFQTEAEQLNLLKTTAN LSQKHLQALGVNNVSAKYAIYERINKNTKKHEKFGEIVYQFYPTNSKLDIVNFLTKTKPYEKINSKIQLLSLFTTANRLE LQNISSLFSPKPELSQNRDFDNTNWLTLNNDPKKISVKTTNNGQQVEILLPKTSFDHQKFNLDFFAKEFDANFNFNPMGN KTRAQAVATFDRTKQKRKAPVNSWLLWVNRDGLIARFNMLLTLAHAQKQKYVDPKSWDYVDTVYKNLNTNSEEKAFVDWL AKQDFDKYFINTNSIIEPINVQTDQLLNIIRAFYQSSSHKVKIKNANNQDETQNFKDNEMFYSWNINKLSLVRGFVYAID YNNFFNYFLAPKKDDKLTPAQQSIVKYTSDKLVLNKDNTTQSFINTAHNLKQYYLPTYFAQSVFSENNIKKDYAKTFYDL LNNFSTKPSNLKRAVIKTINPMDAILIGIAVLILIIAIIISLLYKIPGLIYSLLMAFSFVISLLLIKSSNLGFSTETYSA LIIGICWPLLNLVDFNNHIKHLIQQKFSYKNALRISLNKTIVNQGMFYLLMIFISLVFMYFGKNNISIFGFNLILITFSC LLISYILFIVMMYMLWSLAHHLPKLHLWRKYLVATNAINQNRFDDKFEWNDQQKYQRLIFKIMNQKVYRISFLIFIFILA FIGLFILGFIVPNHSFSFGSVYELIMKSDLKDFNSHEFKTILDYKINDGVVSMQFDAKKPNVLSEIDLISLNHRFSDAIV YRSSQYHLINNITNSIAAYFIIFAIILIWSSIWLKPQSIIPIIINLICTSLISFGIAGLLRLFNNQISIIAINTSFVLMT SFSLHICLNLKRTLDLMKHVTKKQLQFQIQDSLIKYFNTYNIIYIVILFALLWLMIFTPFVLISFNAIILFSLISTHYLS IIIIHYLWMKMVYISKGLLAKDDNADNVYDKFDEQEIMNINKF
Sequences:
>Translated_1003_residues MSFKTKIKFKQK*KKVLAFFGISTLTIAAIVGTGIGAANYANKNIKTGDFGDKISARTQVLLNDFQTEAEQLNLLKTTAN LSQKHLQALGVNNVSAKYAIYERINKNTKKHEKFGEIVYQFYPTNSKLDIVNFLTKTKPYEKINSKIQLLSLFTTANRLE LQNISSLFSPKPELSQNRDFDNTN*LTLNNDPKKISVKTTNNGQQVEILLPKTSFDHQKFNLDFFAKEFDANFNFNPMGN KTRAQAVATFDRTKQKRKAPVNS*LL*VNRDGLIARFNMLLTLAHAQKQKYVDPKS*DYVDTVYKNLNTNSEEKAFVD*L AKQDFDKYFINTNSIIEPINVQTDQLLNIIRAFYQSSSHKVKIKNANNQDETQNFKDNEMFYS*NINKLSLVRGFVYAID YNNFFNYFLAPKKDDKLTPAQQSIVKYTSDKLVLNKDNTTQSFINTAHNLKQYYLPTYFAQSVFSENNIKKDYAKTFYDL LNNFSTKPSNLKRAVIKTINPMDAILIGIAVLILIIAIIISLLYKIPGLIYSLLMAFSFVISLLLIKSSNLGFSTETYSA LIIGICWPLLNLVDFNNHIKHLIQQKFSYKNALRISLNKTIVNQGMFYLLMIFISLVFMYFGKNNISIFGFNLILITFSC LLISYILFIVMMYML*SLAHHLPKLHL*RKYLVATNAINQNRFDDKFE*NDQQKYQRLIFKIMNQKVYRISFLIFIFILA FIGLFILGFIVPNHSFSFGSVYELIMKSDLKDFNSHEFKTILDYKINDGVVSMQFDAKKPNVLSEIDLISLNHRFSDAIV YRSSQYHLINNITNSIAAYFIIFAIILI*SSI*LKPQSIIPIIINLICTSLISFGIAGLLRLFNNQISIIAINTSFVLMT SFSLHICLNLKRTLDLMKHVTKKQLQFQIQDSLIKYFNTYNIIYIVILFALL*LMIFTPFVLISFNAIILFSLISTHYLS IIIIHYL*MKMVYISKGLLAKDDNADNVYDKFDEQEIMNINKF >Mature_1002_residues SFKTKIKFKQK*KKVLAFFGISTLTIAAIVGTGIGAANYANKNIKTGDFGDKISARTQVLLNDFQTEAEQLNLLKTTANL SQKHLQALGVNNVSAKYAIYERINKNTKKHEKFGEIVYQFYPTNSKLDIVNFLTKTKPYEKINSKIQLLSLFTTANRLEL QNISSLFSPKPELSQNRDFDNTN*LTLNNDPKKISVKTTNNGQQVEILLPKTSFDHQKFNLDFFAKEFDANFNFNPMGNK TRAQAVATFDRTKQKRKAPVNS*LL*VNRDGLIARFNMLLTLAHAQKQKYVDPKS*DYVDTVYKNLNTNSEEKAFVD*LA KQDFDKYFINTNSIIEPINVQTDQLLNIIRAFYQSSSHKVKIKNANNQDETQNFKDNEMFYS*NINKLSLVRGFVYAIDY NNFFNYFLAPKKDDKLTPAQQSIVKYTSDKLVLNKDNTTQSFINTAHNLKQYYLPTYFAQSVFSENNIKKDYAKTFYDLL NNFSTKPSNLKRAVIKTINPMDAILIGIAVLILIIAIIISLLYKIPGLIYSLLMAFSFVISLLLIKSSNLGFSTETYSAL IIGICWPLLNLVDFNNHIKHLIQQKFSYKNALRISLNKTIVNQGMFYLLMIFISLVFMYFGKNNISIFGFNLILITFSCL LISYILFIVMMYML*SLAHHLPKLHL*RKYLVATNAINQNRFDDKFE*NDQQKYQRLIFKIMNQKVYRISFLIFIFILAF IGLFILGFIVPNHSFSFGSVYELIMKSDLKDFNSHEFKTILDYKINDGVVSMQFDAKKPNVLSEIDLISLNHRFSDAIVY RSSQYHLINNITNSIAAYFIIFAIILI*SSI*LKPQSIIPIIINLICTSLISFGIAGLLRLFNNQISIIAINTSFVLMTS FSLHICLNLKRTLDLMKHVTKKQLQFQIQDSLIKYFNTYNIIYIVILFALL*LMIFTPFVLISFNAIILFSLISTHYLSI IIIHYL*MKMVYISKGLLAKDDNADNVYDKFDEQEIMNINKF
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 113620; Mature: 113489
Theoretical pI: Translated: 10.05; Mature: 10.05
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 2.1 %Met (Translated Protein) 2.5 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 2.0 %Met (Mature Protein) 2.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSFKTKIKFKQKKKVLAFFGISTLTIAAIVGTGIGAANYANKNIKTGDFGDKISARTQVL CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH LNDFQTEAEQLNLLKTTANLSQKHLQALGVNNVSAKYAIYERINKNTKKHEKFGEIVYQF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHEEE YPTNSKLDIVNFLTKTKPYEKINSKIQLLSLFTTANRLELQNISSLFSPKPELSQNRDFD ECCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC NTNLTLNNDPKKISVKTTNNGQQVEILLPKTSFDHQKFNLDFFAKEFDANFNFNPMGNKT CCCEEECCCCCEEEEEECCCCCEEEEEECCCCCCCCEECHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCH RAQAVATFDRTKQKRKAPVNSLLVNRDGLIARFNMLLTLAHAQKQKYVDPKSDYVDTVYK HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHH NLNTNSEEKAFVDLAKQDFDKYFINTNSIIEPINVQTDQLLNIIRAFYQSSSHKVKIKNA HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECC NNQDETQNFKDNEMFYSNINKLSLVRGFVYAIDYNNFFNYFLAPKKDDKLTPAQQSIVKY CCCCCCCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHEEEECCCHHHHEECCCCCCCCCHHHHHHHHH TSDKLVLNKDNTTQSFINTAHNLKQYYLPTYFAQSVFSENNIKKDYAKTFYDLLNNFSTK CCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCC PSNLKRAVIKTINPMDAILIGIAVLILIIAIIISLLYKIPGLIYSLLMAFSFVISLLLIK CHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SSNLGFSTETYSALIIGICWPLLNLVDFNNHIKHLIQQKFSYKNALRISLNKTIVNQGMF CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHHHHHHH YLLMIFISLVFMYFGKNNISIFGFNLILITFSCLLISYILFIVMMYMLSLAHHLPKLHLR HHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHH KYLVATNAINQNRFDDKFENDQQKYQRLIFKIMNQKVYRISFLIFIFILAFIGLFILGFI HHHHHHCCCCCCCCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VPNHSFSFGSVYELIMKSDLKDFNSHEFKTILDYKINDGVVSMQFDAKKPNVLSEIDLIS CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCEEEEEECCCCCCCHHHHHEEE LNHRFSDAIVYRSSQYHLINNITNSIAAYFIIFAIILISSILKPQSIIPIIINLICTSLI ECCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH SFGIAGLLRLFNNQISIIAINTSFVLMTSFSLHICLNLKRTLDLMKHVTKKQLQFQIQDS HHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCEEEEECCCHHEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LIKYFNTYNIIYIVILFALLLMIFTPFVLISFNAIILFSLISTHYLSIIIIHYLMKMVYI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SKGLLAKDDNADNVYDKFDEQEIMNINKF HCCCCCCCCCCCHHHHHCCHHHHHCCCCC >Mature Secondary Structure SFKTKIKFKQKKKVLAFFGISTLTIAAIVGTGIGAANYANKNIKTGDFGDKISARTQVL CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH LNDFQTEAEQLNLLKTTANLSQKHLQALGVNNVSAKYAIYERINKNTKKHEKFGEIVYQF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHEEE YPTNSKLDIVNFLTKTKPYEKINSKIQLLSLFTTANRLELQNISSLFSPKPELSQNRDFD ECCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC NTNLTLNNDPKKISVKTTNNGQQVEILLPKTSFDHQKFNLDFFAKEFDANFNFNPMGNKT CCCEEECCCCCEEEEEECCCCCEEEEEECCCCCCCCEECHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCH RAQAVATFDRTKQKRKAPVNSLLVNRDGLIARFNMLLTLAHAQKQKYVDPKSDYVDTVYK HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHH NLNTNSEEKAFVDLAKQDFDKYFINTNSIIEPINVQTDQLLNIIRAFYQSSSHKVKIKNA HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECC NNQDETQNFKDNEMFYSNINKLSLVRGFVYAIDYNNFFNYFLAPKKDDKLTPAQQSIVKY CCCCCCCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHEEEECCCHHHHEECCCCCCCCCHHHHHHHHH TSDKLVLNKDNTTQSFINTAHNLKQYYLPTYFAQSVFSENNIKKDYAKTFYDLLNNFSTK CCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCC PSNLKRAVIKTINPMDAILIGIAVLILIIAIIISLLYKIPGLIYSLLMAFSFVISLLLIK CHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SSNLGFSTETYSALIIGICWPLLNLVDFNNHIKHLIQQKFSYKNALRISLNKTIVNQGMF CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHHHHHHH YLLMIFISLVFMYFGKNNISIFGFNLILITFSCLLISYILFIVMMYMLSLAHHLPKLHLR HHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHH KYLVATNAINQNRFDDKFENDQQKYQRLIFKIMNQKVYRISFLIFIFILAFIGLFILGFI HHHHHHCCCCCCCCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VPNHSFSFGSVYELIMKSDLKDFNSHEFKTILDYKINDGVVSMQFDAKKPNVLSEIDLIS CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCEEEEEECCCCCCCHHHHHEEE LNHRFSDAIVYRSSQYHLINNITNSIAAYFIIFAIILISSILKPQSIIPIIINLICTSLI ECCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH SFGIAGLLRLFNNQISIIAINTSFVLMTSFSLHICLNLKRTLDLMKHVTKKQLQFQIQDS HHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCEEEEECCCHHEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LIKYFNTYNIIYIVILFALLLMIFTPFVLISFNAIILFSLISTHYLSIIIIHYLMKMVYI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SKGLLAKDDNADNVYDKFDEQEIMNINKF HCCCCCCCCCCCHHHHHCCHHHHHCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA