Definition Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 700970, complete genome.
Accession NC_002162
Length 751,719

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Identifier: 13358052

GI number: 13358052

Start: 585101

End: 588112

Strand: Reverse

Name: Not Available

Synonym: UU489

Alternate gene names: NA

Gene position: 588112-585101 (Counterclockwise)

Preceding gene: 13358058

Following gene: 13358051

Centisome position: 78.24

GC content: 23.34

Gene sequence:

>3012_bases
ATGTCATTTAAAACAAAAATAAAATTCAAACAGAAATGAAAAAAAGTTTTAGCATTTTTTGGAATTAGTACATTAACAAT
TGCAGCAATTGTAGGCACTGGTATTGGGGCTGCTAATTATGCTAATAAGAATATAAAAACTGGTGATTTTGGTGATAAAA
TATCAGCAAGAACACAAGTTTTATTGAATGATTTTCAAACAGAAGCAGAGCAGTTAAATTTATTAAAAACCACAGCGAAT
CTAAGTCAAAAACACTTACAAGCATTGGGTGTAAATAATGTTAGTGCTAAATATGCTATTTATGAACGTATTAATAAAAA
TACAAAAAAACATGAAAAATTTGGGGAAATTGTTTATCAATTTTATCCTACAAATTCAAAATTAGATATCGTTAATTTTC
TAACTAAAACAAAGCCATACGAAAAAATTAATTCAAAAATCCAACTTTTAAGCTTATTTACTACCGCTAACCGTTTAGAA
TTACAAAACATTTCTTCACTTTTTTCACCAAAACCTGAACTTTCACAAAACAGGGATTTTGATAATACAAATTGATTAAC
TTTAAATAATGATCCTAAAAAAATTAGTGTTAAAACAACTAATAATGGTCAGCAAGTTGAAATTTTATTGCCAAAAACTA
GTTTTGATCATCAAAAATTTAATTTAGATTTTTTTGCTAAAGAGTTTGATGCTAATTTTAATTTCAATCCAATGGGTAAT
AAAACAAGAGCTCAAGCTGTAGCGACTTTTGATAGAACAAAACAAAAACGAAAAGCTCCAGTTAATTCTTGATTGTTATG
AGTTAATCGTGATGGATTAATTGCAAGATTTAATATGTTATTGACATTAGCGCATGCTCAAAAACAAAAATATGTTGATC
CTAAAAGTTGAGATTATGTTGATACTGTTTATAAAAATTTAAATACAAACAGCGAGGAAAAAGCTTTTGTTGATTGATTA
GCAAAACAAGATTTTGATAAATATTTTATTAATACAAACTCTATTATTGAACCAATCAATGTTCAAACAGATCAATTATT
GAATATAATTCGCGCTTTTTATCAATCTTCATCACATAAAGTAAAAATTAAAAATGCAAATAATCAAGATGAAACACAAA
ATTTTAAAGATAATGAAATGTTTTATTCATGAAACATTAATAAGTTATCTTTAGTAAGAGGTTTTGTTTACGCAATTGAT
TATAATAATTTTTTTAACTACTTTCTAGCACCAAAAAAAGATGATAAATTAACTCCTGCCCAACAAAGCATTGTTAAATA
TACCTCTGACAAGCTAGTTTTAAATAAAGATAATACAACTCAATCTTTTATTAATACAGCTCATAATCTAAAACAATACT
ATTTACCAACTTATTTTGCACAATCAGTTTTTAGTGAAAATAATATTAAAAAGGATTACGCTAAAACTTTTTATGACTTA
TTAAATAATTTTAGTACAAAACCATCTAATTTAAAACGTGCAGTAATTAAAACAATTAATCCTATGGATGCGATTTTGAT
TGGAATTGCAGTTTTAATCTTAATCATCGCTATTATTATTAGTCTTTTATATAAAATTCCAGGTTTAATTTATAGTTTGT
TAATGGCTTTTAGTTTTGTTATTAGTTTATTATTAATAAAATCAAGTAATTTAGGATTTAGTACAGAAACTTATAGTGCA
TTAATTATTGGTATTTGTTGGCCATTATTAAATTTAGTTGATTTCAATAACCATATAAAACATTTAATTCAACAAAAATT
TTCTTATAAAAACGCTTTAAGAATTAGTTTAAATAAAACGATTGTTAATCAAGGAATGTTTTATTTATTAATGATTTTTA
TCAGTTTAGTTTTTATGTATTTTGGTAAAAATAACATTAGTATTTTTGGTTTTAATTTGATTTTAATAACTTTTTCTTGT
TTGTTAATATCTTATATATTATTTATTGTAATGATGTATATGTTGTGATCACTTGCTCATCATCTTCCAAAACTACATCT
ATGAAGAAAATATTTAGTTGCAACTAATGCAATTAACCAAAATCGTTTTGATGATAAATTTGAATGAAACGATCAACAAA
AATACCAACGATTGATTTTTAAAATCATGAATCAAAAGGTTTATAGAATTAGTTTTTTAATTTTTATCTTTATTTTAGCT
TTTATTGGCTTATTTATTTTAGGTTTTATTGTTCCAAACCATAGTTTTAGTTTTGGTTCTGTATATGAGTTAATTATGAA
AAGTGATTTAAAAGACTTTAATTCTCACGAGTTCAAAACTATTTTAGATTATAAGATTAATGATGGAGTAGTATCAATGC
AATTTGATGCTAAAAAACCAAATGTTTTAAGTGAAATAGATTTGATCAGTTTAAATCACCGGTTTAGTGATGCAATTGTT
TATAGAAGTAGTCAATATCATTTAATTAATAATATTACAAATTCAATTGCTGCGTATTTTATTATCTTTGCTATTATTTT
AATTTGATCAAGCATTTGACTAAAACCCCAATCAATAATCCCCATAATAATTAATCTCATTTGTACATCGTTAATTAGCT
TTGGTATTGCTGGATTATTACGTTTATTTAATAATCAAATATCAATTATTGCAATTAACACGAGTTTTGTTTTAATGACT
AGTTTTAGTTTACATATTTGTTTAAATTTAAAACGAACTTTGGATTTAATGAAGCATGTAACAAAAAAACAATTACAATT
TCAAATTCAAGATTCTTTAATTAAATACTTTAATACTTATAATATAATATACATTGTGATATTATTTGCATTATTGTGAT
TAATGATTTTTACACCATTTGTTTTAATTAGTTTTAATGCAATTATTTTATTTAGTTTAATATCTACTCATTATTTATCA
ATCATAATTATTCATTATTTATGAATGAAAATGGTTTATATTAGTAAAGGTTTATTAGCTAAGGATGATAATGCAGATAA
TGTTTATGATAAATTTGATGAACAAGAAATTATGAATATAAATAAATTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATCATGACAATTAATATATAATTATTAATTAGTTAATATGAATGTTTTTATGAGTTTATAGTATTTCTAAAAATATGATT
CAAGGTTAGTTGGTTTTACA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAGAAAGATTTATAACGATTATGATCAATATTGATTACATTAAATCAAAAATCAGGGATGTACCAGACTTCCCTAAAAAA
GGAATCGTTTTTAAGGATAT

Product: membrane lipoprotein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 1003; Mature: 1002

Protein sequence:

>1003_residues
MSFKTKIKFKQKWKKVLAFFGISTLTIAAIVGTGIGAANYANKNIKTGDFGDKISARTQVLLNDFQTEAEQLNLLKTTAN
LSQKHLQALGVNNVSAKYAIYERINKNTKKHEKFGEIVYQFYPTNSKLDIVNFLTKTKPYEKINSKIQLLSLFTTANRLE
LQNISSLFSPKPELSQNRDFDNTNWLTLNNDPKKISVKTTNNGQQVEILLPKTSFDHQKFNLDFFAKEFDANFNFNPMGN
KTRAQAVATFDRTKQKRKAPVNSWLLWVNRDGLIARFNMLLTLAHAQKQKYVDPKSWDYVDTVYKNLNTNSEEKAFVDWL
AKQDFDKYFINTNSIIEPINVQTDQLLNIIRAFYQSSSHKVKIKNANNQDETQNFKDNEMFYSWNINKLSLVRGFVYAID
YNNFFNYFLAPKKDDKLTPAQQSIVKYTSDKLVLNKDNTTQSFINTAHNLKQYYLPTYFAQSVFSENNIKKDYAKTFYDL
LNNFSTKPSNLKRAVIKTINPMDAILIGIAVLILIIAIIISLLYKIPGLIYSLLMAFSFVISLLLIKSSNLGFSTETYSA
LIIGICWPLLNLVDFNNHIKHLIQQKFSYKNALRISLNKTIVNQGMFYLLMIFISLVFMYFGKNNISIFGFNLILITFSC
LLISYILFIVMMYMLWSLAHHLPKLHLWRKYLVATNAINQNRFDDKFEWNDQQKYQRLIFKIMNQKVYRISFLIFIFILA
FIGLFILGFIVPNHSFSFGSVYELIMKSDLKDFNSHEFKTILDYKINDGVVSMQFDAKKPNVLSEIDLISLNHRFSDAIV
YRSSQYHLINNITNSIAAYFIIFAIILIWSSIWLKPQSIIPIIINLICTSLISFGIAGLLRLFNNQISIIAINTSFVLMT
SFSLHICLNLKRTLDLMKHVTKKQLQFQIQDSLIKYFNTYNIIYIVILFALLWLMIFTPFVLISFNAIILFSLISTHYLS
IIIIHYLWMKMVYISKGLLAKDDNADNVYDKFDEQEIMNINKF

Sequences:

>Translated_1003_residues
MSFKTKIKFKQK*KKVLAFFGISTLTIAAIVGTGIGAANYANKNIKTGDFGDKISARTQVLLNDFQTEAEQLNLLKTTAN
LSQKHLQALGVNNVSAKYAIYERINKNTKKHEKFGEIVYQFYPTNSKLDIVNFLTKTKPYEKINSKIQLLSLFTTANRLE
LQNISSLFSPKPELSQNRDFDNTN*LTLNNDPKKISVKTTNNGQQVEILLPKTSFDHQKFNLDFFAKEFDANFNFNPMGN
KTRAQAVATFDRTKQKRKAPVNS*LL*VNRDGLIARFNMLLTLAHAQKQKYVDPKS*DYVDTVYKNLNTNSEEKAFVD*L
AKQDFDKYFINTNSIIEPINVQTDQLLNIIRAFYQSSSHKVKIKNANNQDETQNFKDNEMFYS*NINKLSLVRGFVYAID
YNNFFNYFLAPKKDDKLTPAQQSIVKYTSDKLVLNKDNTTQSFINTAHNLKQYYLPTYFAQSVFSENNIKKDYAKTFYDL
LNNFSTKPSNLKRAVIKTINPMDAILIGIAVLILIIAIIISLLYKIPGLIYSLLMAFSFVISLLLIKSSNLGFSTETYSA
LIIGICWPLLNLVDFNNHIKHLIQQKFSYKNALRISLNKTIVNQGMFYLLMIFISLVFMYFGKNNISIFGFNLILITFSC
LLISYILFIVMMYML*SLAHHLPKLHL*RKYLVATNAINQNRFDDKFE*NDQQKYQRLIFKIMNQKVYRISFLIFIFILA
FIGLFILGFIVPNHSFSFGSVYELIMKSDLKDFNSHEFKTILDYKINDGVVSMQFDAKKPNVLSEIDLISLNHRFSDAIV
YRSSQYHLINNITNSIAAYFIIFAIILI*SSI*LKPQSIIPIIINLICTSLISFGIAGLLRLFNNQISIIAINTSFVLMT
SFSLHICLNLKRTLDLMKHVTKKQLQFQIQDSLIKYFNTYNIIYIVILFALL*LMIFTPFVLISFNAIILFSLISTHYLS
IIIIHYL*MKMVYISKGLLAKDDNADNVYDKFDEQEIMNINKF
>Mature_1002_residues
SFKTKIKFKQK*KKVLAFFGISTLTIAAIVGTGIGAANYANKNIKTGDFGDKISARTQVLLNDFQTEAEQLNLLKTTANL
SQKHLQALGVNNVSAKYAIYERINKNTKKHEKFGEIVYQFYPTNSKLDIVNFLTKTKPYEKINSKIQLLSLFTTANRLEL
QNISSLFSPKPELSQNRDFDNTN*LTLNNDPKKISVKTTNNGQQVEILLPKTSFDHQKFNLDFFAKEFDANFNFNPMGNK
TRAQAVATFDRTKQKRKAPVNS*LL*VNRDGLIARFNMLLTLAHAQKQKYVDPKS*DYVDTVYKNLNTNSEEKAFVD*LA
KQDFDKYFINTNSIIEPINVQTDQLLNIIRAFYQSSSHKVKIKNANNQDETQNFKDNEMFYS*NINKLSLVRGFVYAIDY
NNFFNYFLAPKKDDKLTPAQQSIVKYTSDKLVLNKDNTTQSFINTAHNLKQYYLPTYFAQSVFSENNIKKDYAKTFYDLL
NNFSTKPSNLKRAVIKTINPMDAILIGIAVLILIIAIIISLLYKIPGLIYSLLMAFSFVISLLLIKSSNLGFSTETYSAL
IIGICWPLLNLVDFNNHIKHLIQQKFSYKNALRISLNKTIVNQGMFYLLMIFISLVFMYFGKNNISIFGFNLILITFSCL
LISYILFIVMMYML*SLAHHLPKLHL*RKYLVATNAINQNRFDDKFE*NDQQKYQRLIFKIMNQKVYRISFLIFIFILAF
IGLFILGFIVPNHSFSFGSVYELIMKSDLKDFNSHEFKTILDYKINDGVVSMQFDAKKPNVLSEIDLISLNHRFSDAIVY
RSSQYHLINNITNSIAAYFIIFAIILI*SSI*LKPQSIIPIIINLICTSLISFGIAGLLRLFNNQISIIAINTSFVLMTS
FSLHICLNLKRTLDLMKHVTKKQLQFQIQDSLIKYFNTYNIIYIVILFALL*LMIFTPFVLISFNAIILFSLISTHYLSI
IIIHYL*MKMVYISKGLLAKDDNADNVYDKFDEQEIMNINKF

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 113620; Mature: 113489

Theoretical pI: Translated: 10.05; Mature: 10.05

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
2.1 %Met     (Translated Protein)
2.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
2.0 %Met     (Mature Protein)
2.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSFKTKIKFKQKKKVLAFFGISTLTIAAIVGTGIGAANYANKNIKTGDFGDKISARTQVL
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH
LNDFQTEAEQLNLLKTTANLSQKHLQALGVNNVSAKYAIYERINKNTKKHEKFGEIVYQF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHEEE
YPTNSKLDIVNFLTKTKPYEKINSKIQLLSLFTTANRLELQNISSLFSPKPELSQNRDFD
ECCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC
NTNLTLNNDPKKISVKTTNNGQQVEILLPKTSFDHQKFNLDFFAKEFDANFNFNPMGNKT
CCCEEECCCCCEEEEEECCCCCEEEEEECCCCCCCCEECHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCH
RAQAVATFDRTKQKRKAPVNSLLVNRDGLIARFNMLLTLAHAQKQKYVDPKSDYVDTVYK
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHH
NLNTNSEEKAFVDLAKQDFDKYFINTNSIIEPINVQTDQLLNIIRAFYQSSSHKVKIKNA
HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECC
NNQDETQNFKDNEMFYSNINKLSLVRGFVYAIDYNNFFNYFLAPKKDDKLTPAQQSIVKY
CCCCCCCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHEEEECCCHHHHEECCCCCCCCCHHHHHHHHH
TSDKLVLNKDNTTQSFINTAHNLKQYYLPTYFAQSVFSENNIKKDYAKTFYDLLNNFSTK
CCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCC
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CHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SSNLGFSTETYSALIIGICWPLLNLVDFNNHIKHLIQQKFSYKNALRISLNKTIVNQGMF
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHHHHHHH
YLLMIFISLVFMYFGKNNISIFGFNLILITFSCLLISYILFIVMMYMLSLAHHLPKLHLR
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHH
KYLVATNAINQNRFDDKFENDQQKYQRLIFKIMNQKVYRISFLIFIFILAFIGLFILGFI
HHHHHHCCCCCCCCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VPNHSFSFGSVYELIMKSDLKDFNSHEFKTILDYKINDGVVSMQFDAKKPNVLSEIDLIS
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCEEEEEECCCCCCCHHHHHEEE
LNHRFSDAIVYRSSQYHLINNITNSIAAYFIIFAIILISSILKPQSIIPIIINLICTSLI
ECCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
SFGIAGLLRLFNNQISIIAINTSFVLMTSFSLHICLNLKRTLDLMKHVTKKQLQFQIQDS
HHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCEEEEECCCHHEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIKYFNTYNIIYIVILFALLLMIFTPFVLISFNAIILFSLISTHYLSIIIIHYLMKMVYI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SKGLLAKDDNADNVYDKFDEQEIMNINKF
HCCCCCCCCCCCHHHHHCCHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure 
SFKTKIKFKQKKKVLAFFGISTLTIAAIVGTGIGAANYANKNIKTGDFGDKISARTQVL
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH
LNDFQTEAEQLNLLKTTANLSQKHLQALGVNNVSAKYAIYERINKNTKKHEKFGEIVYQF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHEEE
YPTNSKLDIVNFLTKTKPYEKINSKIQLLSLFTTANRLELQNISSLFSPKPELSQNRDFD
ECCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC
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CCCEEECCCCCEEEEEECCCCCEEEEEECCCCCCCCEECHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCH
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NLNTNSEEKAFVDLAKQDFDKYFINTNSIIEPINVQTDQLLNIIRAFYQSSSHKVKIKNA
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CCCCCCCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHEEEECCCHHHHEECCCCCCCCCHHHHHHHHH
TSDKLVLNKDNTTQSFINTAHNLKQYYLPTYFAQSVFSENNIKKDYAKTFYDLLNNFSTK
CCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCC
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SSNLGFSTETYSALIIGICWPLLNLVDFNNHIKHLIQQKFSYKNALRISLNKTIVNQGMF
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CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCEEEEEECCCCCCCHHHHHEEE
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ECCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
SFGIAGLLRLFNNQISIIAINTSFVLMTSFSLHICLNLKRTLDLMKHVTKKQLQFQIQDS
HHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCEEEEECCCHHEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIKYFNTYNIIYIVILFALLLMIFTPFVLISFNAIILFSLISTHYLSIIIIHYLMKMVYI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SKGLLAKDDNADNVYDKFDEQEIMNINKF
HCCCCCCCCCCCHHHHHCCHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA