Definition | Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 700970, complete genome. |
---|---|
Accession | NC_002162 |
Length | 751,719 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is Not Available
Identifier: 13358050
GI number: 13358050
Start: 581604
End: 584345
Strand: Reverse
Name: Not Available
Synonym: UU487
Alternate gene names: NA
Gene position: 584345-581604 (Counterclockwise)
Preceding gene: 13358051
Following gene: 13358049
Centisome position: 77.73
GC content: 22.43
Gene sequence:
>2742_bases ATGAGATTAAAAAATAAAAATAAATACTGAAACTTACTTATTGCTTCATTAATATCAATACCTATTATCAGCACCATTTC TGCATGTAGTTTTAGTGAAACCAGATATAAATTAAAAGTTTTAGATTATTTTTTAAAAACAGAAAATGACGATTATTATA TTGCTTATGAATTTAATAAATTAACAAATGAAGATATGCAAAAAATGCCAAAAGTTATTTTTTCAACAAGTATTATTAAT AGTTCAAACCAAAAAATTGCTTTTTATGTTGATATAAAACCAATTATTATAAATAATCGTATTTATATTCGCTTACCCCA ACGTCCTAAACCCAATGAAAAAATTATTATAAATTCAAGTCAAGAATTTGTTGGCGTTCAAGTGATTCAAACTAATAAAA TGTTGACTAGATCCATTAATTTTAATTTTAATAAAGAAGATCATTTAATTAAAGTTGTTGACCAGAGTGCCCGATTTACT AACATTAAAAAAACAGAAGTTGAATTCGAAATTAAGCTTTTAAATTTAAATCTTAATGATATTAAAGATAAAAATATTGA AATTGAATTAACAAATAAAAAAACAAATAAAACCTTTAAATTGCATTTTCTAAAATATCAATTTAATCACTTAACACAAC AAAATAAAAAACCAGTATTAACTATTACTGCTAATTTAAATGCTGATGCAAATAACCAATTAGATGATGGCGAATATTTT ATTTCTAAATTAGTTTTAGACCAAAAAAAACTTGAAATTAACCAAAGCGTTTATAAACCAAGTGGGTTACAGTTAGATGG AAGTATTAATAATCAAAGACCAACTTATTTATTAATTCCATCTGTTTTTTCAAAATGAACAAAAATAAATGTTTTAGATA CTAAAGTGATTAAAAATGATGGAATTCCACAACAATTACAACTTTCATATGATCATTTTATTAACCCATATAATTTTAAA GATAATATGTTAAGTGCAGATATTGAACTTATATCAACTAAAAATAATAAAACTATTATTTTAAAATCATTAAAGTTTAA TCACGATAAAAACAATATTGTTTTTGATTTAGTCAATAATTTAGAATTACAAACTCTTATTTTAAAAACTCCTTTTTTTA AAATTAAATCATTAACAATAATGAATGATAAGCAAACTTTGCCATTAAGTATTAGAGAAAAACAGCTTGATTTAACTAAT AAACATCTTTCTAAAATCATTAAATTTACATTTGATGATACTGATCCACAAAATATGCTTATGAAATTTCAATTAGATAG TGATTCGCCAATAGTGCAAAATACTAAAAAAGTTTTATTAACAATTAAAAAAATAAATACAGATCAGCAAGAAGATATAA AGACCTTTAGTTTTGATATTTTAGAAAACAAAATAACAACAGGTTCTTTTTATGATGTAAAAAATAAGTATTTTCTATTA AATCTAAATAAAACTTTGAATGCTAAATCGATAGGTCAAATTCTTGAAAATGATTCTAATTATATAATTACTAAATTAAC TGTGGTTAATAATGAAGCATCAATCAATGAAATACCAATTGAAATTGATGATTTACAAAATAAACAATTTACGTTAAAAT TTGCTGAATACCAATCAAATGTAATTAAATTTAATGCTAAGAATGATCCTGAATTACATCTTAATATCAAACATTTTAAA CAACTTAATCTTACAAAAATTAATAAAATTAAATTGACTTTAAAAGACGGTAAGCAAATTATTTTTAATCGTTTAAATAA TGAATTTAGTTTCCAACAAGCAGGATTTAAATTAAAAATTAACCAAAACACATTTCCAAATTATTTAAAACAACATCAAT ATGTAATTAAAAGTATTAGTTTAATAAACGATGATCAGTCTGTGATTGAGTTATTATCAAAACACAATCATGAAGCTATT TTTGAGATTCCTATTACAGCATCTCTTGATACTTGAGAATATGACAAAATCCATAATATATTAAAAATTAAAATGAAATT AGATAGTTTAAGTTTACATCAAAGCTTAAATCCATCAGATTATGCTTTAAATTTTTATAATCTTGATACTAATATTATTA ACCGAAAATTTACACTTAGTCCCCAAACTGTTTTATCTTCAAAAGTTAATAATTCAAATGTAATTGAATTAATTTATGAT TTAGATAATGATGAAAATATTTATGGAGGTTTAGAACCTGAGAGCACTTATCAAATTAGTTCGTTAATGATAAATGCTAA ACCAGTGATTATTAATACTTCTATAACAATGGTTCAAACTAACGCTTCAGCTTCTAAGGTAGAAAAAATTGTTGCTAGTT ATGATTCAGTAACCAAAAAAACAAAAATATCATTGCAGTTTTCTAATAATTGATGATATAACAAAAATGCGGATCATAAA CTGTTTGCCATTATTTCGTCTTTAAAGCCTAAAAATAATAAAAATGCTAATTGAACATTTTCATTATCTAGAACGTTTAG CAATCCTGAAGCAATTAATTCAAACAAGGACAAAGATTTTGTTTTAGATAAAGCAACTAAAACTTTAACATATGTAATAA ATTATGCAAATATTGACTATAAAGATCAAAATGATCATGAGTCATTTGATTGGTATTATGATGATTTAGTACTTAATAAA GTAACAATCATTTATAATGATTTAACAACAAATGATATTAGTCCTTTTTCTAAAGATGATCAAAATTTAACTATTAAACT ACCAAACAAAATTAATTCTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTAATTTAACTAAAAATAGCATTAATTTTTATTTAAATTTAACTTAATTACAACCGGTATAAAATATAAATATTTATTTG TTTAGTGGATTGAATAAACT
Downstream 100 bases:
>100_bases CGATAAAATTTTTTTAAAAAAACTTATTTTTTATAAATAAATAAATAAATGAATTCTATATTATTCATTTGCTTTGCCTT GTTTAAAAGATTAAAAAAGG
Product: MBA N-terminal paralog
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 913; Mature: 913
Protein sequence:
>913_residues MRLKNKNKYWNLLIASLISIPIISTISACSFSETRYKLKVLDYFLKTENDDYYIAYEFNKLTNEDMQKMPKVIFSTSIIN SSNQKIAFYVDIKPIIINNRIYIRLPQRPKPNEKIIINSSQEFVGVQVIQTNKMLTRSINFNFNKEDHLIKVVDQSARFT NIKKTEVEFEIKLLNLNLNDIKDKNIEIELTNKKTNKTFKLHFLKYQFNHLTQQNKKPVLTITANLNADANNQLDDGEYF ISKLVLDQKKLEINQSVYKPSGLQLDGSINNQRPTYLLIPSVFSKWTKINVLDTKVIKNDGIPQQLQLSYDHFINPYNFK DNMLSADIELISTKNNKTIILKSLKFNHDKNNIVFDLVNNLELQTLILKTPFFKIKSLTIMNDKQTLPLSIREKQLDLTN KHLSKIIKFTFDDTDPQNMLMKFQLDSDSPIVQNTKKVLLTIKKINTDQQEDIKTFSFDILENKITTGSFYDVKNKYFLL NLNKTLNAKSIGQILENDSNYIITKLTVVNNEASINEIPIEIDDLQNKQFTLKFAEYQSNVIKFNAKNDPELHLNIKHFK QLNLTKINKIKLTLKDGKQIIFNRLNNEFSFQQAGFKLKINQNTFPNYLKQHQYVIKSISLINDDQSVIELLSKHNHEAI FEIPITASLDTWEYDKIHNILKIKMKLDSLSLHQSLNPSDYALNFYNLDTNIINRKFTLSPQTVLSSKVNNSNVIELIYD LDNDENIYGGLEPESTYQISSLMINAKPVIINTSITMVQTNASASKVEKIVASYDSVTKKTKISLQFSNNWWYNKNADHK LFAIISSLKPKNNKNANWTFSLSRTFSNPEAINSNKDKDFVLDKATKTLTYVINYANIDYKDQNDHESFDWYYDDLVLNK VTIIYNDLTTNDISPFSKDDQNLTIKLPNKINS
Sequences:
>Translated_913_residues MRLKNKNKY*NLLIASLISIPIISTISACSFSETRYKLKVLDYFLKTENDDYYIAYEFNKLTNEDMQKMPKVIFSTSIIN SSNQKIAFYVDIKPIIINNRIYIRLPQRPKPNEKIIINSSQEFVGVQVIQTNKMLTRSINFNFNKEDHLIKVVDQSARFT NIKKTEVEFEIKLLNLNLNDIKDKNIEIELTNKKTNKTFKLHFLKYQFNHLTQQNKKPVLTITANLNADANNQLDDGEYF ISKLVLDQKKLEINQSVYKPSGLQLDGSINNQRPTYLLIPSVFSK*TKINVLDTKVIKNDGIPQQLQLSYDHFINPYNFK DNMLSADIELISTKNNKTIILKSLKFNHDKNNIVFDLVNNLELQTLILKTPFFKIKSLTIMNDKQTLPLSIREKQLDLTN KHLSKIIKFTFDDTDPQNMLMKFQLDSDSPIVQNTKKVLLTIKKINTDQQEDIKTFSFDILENKITTGSFYDVKNKYFLL NLNKTLNAKSIGQILENDSNYIITKLTVVNNEASINEIPIEIDDLQNKQFTLKFAEYQSNVIKFNAKNDPELHLNIKHFK QLNLTKINKIKLTLKDGKQIIFNRLNNEFSFQQAGFKLKINQNTFPNYLKQHQYVIKSISLINDDQSVIELLSKHNHEAI FEIPITASLDT*EYDKIHNILKIKMKLDSLSLHQSLNPSDYALNFYNLDTNIINRKFTLSPQTVLSSKVNNSNVIELIYD LDNDENIYGGLEPESTYQISSLMINAKPVIINTSITMVQTNASASKVEKIVASYDSVTKKTKISLQFSNN**YNKNADHK LFAIISSLKPKNNKNAN*TFSLSRTFSNPEAINSNKDKDFVLDKATKTLTYVINYANIDYKDQNDHESFDWYYDDLVLNK VTIIYNDLTTNDISPFSKDDQNLTIKLPNKINS >Mature_913_residues MRLKNKNKY*NLLIASLISIPIISTISACSFSETRYKLKVLDYFLKTENDDYYIAYEFNKLTNEDMQKMPKVIFSTSIIN SSNQKIAFYVDIKPIIINNRIYIRLPQRPKPNEKIIINSSQEFVGVQVIQTNKMLTRSINFNFNKEDHLIKVVDQSARFT NIKKTEVEFEIKLLNLNLNDIKDKNIEIELTNKKTNKTFKLHFLKYQFNHLTQQNKKPVLTITANLNADANNQLDDGEYF ISKLVLDQKKLEINQSVYKPSGLQLDGSINNQRPTYLLIPSVFSK*TKINVLDTKVIKNDGIPQQLQLSYDHFINPYNFK DNMLSADIELISTKNNKTIILKSLKFNHDKNNIVFDLVNNLELQTLILKTPFFKIKSLTIMNDKQTLPLSIREKQLDLTN KHLSKIIKFTFDDTDPQNMLMKFQLDSDSPIVQNTKKVLLTIKKINTDQQEDIKTFSFDILENKITTGSFYDVKNKYFLL NLNKTLNAKSIGQILENDSNYIITKLTVVNNEASINEIPIEIDDLQNKQFTLKFAEYQSNVIKFNAKNDPELHLNIKHFK QLNLTKINKIKLTLKDGKQIIFNRLNNEFSFQQAGFKLKINQNTFPNYLKQHQYVIKSISLINDDQSVIELLSKHNHEAI FEIPITASLDT*EYDKIHNILKIKMKLDSLSLHQSLNPSDYALNFYNLDTNIINRKFTLSPQTVLSSKVNNSNVIELIYD LDNDENIYGGLEPESTYQISSLMINAKPVIINTSITMVQTNASASKVEKIVASYDSVTKKTKISLQFSNN**YNKNADHK LFAIISSLKPKNNKNAN*TFSLSRTFSNPEAINSNKDKDFVLDKATKTLTYVINYANIDYKDQNDHESFDWYYDDLVLNK VTIIYNDLTTNDISPFSKDDQNLTIKLPNKINS
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 104786; Mature: 104786
Theoretical pI: Translated: 9.63; Mature: 9.63
Prosite motif: PS00013 PROKAR_LIPOPROTEIN
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 1.2 %Met (Translated Protein) 1.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 1.2 %Met (Mature Protein) 1.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MRLKNKNKYNLLIASLISIPIISTISACSFSETRYKLKVLDYFLKTENDDYYIAYEFNKL CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHEEEEEEEHHHHCCCCCEEEEEEECCC TNEDMQKMPKVIFSTSIINSSNQKIAFYVDIKPIIINNRIYIRLPQRPKPNEKIIINSSQ CCHHHHHHHHHHEEHEEECCCCCEEEEEEEEEEEEECCEEEEECCCCCCCCCEEEEECCC EFVGVQVIQTNKMLTRSINFNFNKEDHLIKVVDQSARFTNIKKTEVEFEIKLLNLNLNDI CEEEEEEEECCCEEEEEECCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCEEEEEEEEEEEEECCCCCC KDKNIEIELTNKKTNKTFKLHFLKYQFNHLTQQNKKPVLTITANLNADANNQLDDGEYFI CCCCEEEEEECCCCCCEEEEEEEEEEHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHH SKLVLDQKKLEINQSVYKPSGLQLDGSINNQRPTYLLIPSVFSKTKINVLDTKVIKNDGI HHHHHCHHHHHHCHHHCCCCCEEECCCCCCCCCCEEEECCCCCCCEEEEEEEEEECCCCC PQQLQLSYDHFINPYNFKDNMLSADIELISTKNNKTIILKSLKFNHDKNNIVFDLVNNLE CHHEEECHHHCCCCCCCCCCEEECCEEEEEECCCCEEEEEEEECCCCCCCEEEEEECCCE LQTLILKTPFFKIKSLTIMNDKQTLPLSIREKQLDLTNKHLSKIIKFTFDDTDPQNMLMK EEEEEEECCCEEEEEEEEECCCCCCCEEEECHHCCHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCEEEE FQLDSDSPIVQNTKKVLLTIKKINTDQQEDIKTFSFDILENKITTGSFYDVKNKYFLLNL EEECCCCCHHHCCEEEEEEEEECCCCCHHHHHEEEEEEHHCCCCCCCEEECCCEEEEEEC NKTLNAKSIGQILENDSNYIITKLTVVNNEASINEIPIEIDDLQNKQFTLKFAEYQSNVI CCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEECCCCCCCCCCEEEECCCCCEEEEEEEECCCCEE KFNAKNDPELHLNIKHFKQLNLTKINKIKLTLKDGKQIIFNRLNNEFSFQQAGFKLKINQ EEECCCCCEEEEEHHHHCCCCCEEEEEEEEEEECCHHHHHHHCCCCCCHHHCCEEEEECC NTFPNYLKQHQYVIKSISLINDDQSVIELLSKHNHEAIFEIPITASLDTEYDKIHNILKI CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEECCCCHHHHCCEEEE KMKLDSLSLHQSLNPSDYALNFYNLDTNIINRKFTLSPQTVLSSKVNNSNVIELIYDLDN EEEECCCHHHCCCCCCCEEEEEEECCHHHCCEEEECCHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCC DENIYGGLEPESTYQISSLMINAKPVIINTSITMVQTNASASKVEKIVASYDSVTKKTKI CCCEECCCCCCCCEEEEEEEEECCEEEEECEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEE SLQFSNNYNKNADHKLFAIISSLKPKNNKNANTFSLSRTFSNPEAINSNKDKDFVLDKAT EEEECCCCCCCCCCCCEEEHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEECCC KTLTYVINYANIDYKDQNDHESFDWYYDDLVLNKVTIIYNDLTTNDISPFSKDDQNLTIK CEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEEE LPNKINS CCCCCCC >Mature Secondary Structure MRLKNKNKYNLLIASLISIPIISTISACSFSETRYKLKVLDYFLKTENDDYYIAYEFNKL CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHEEEEEEEHHHHCCCCCEEEEEEECCC TNEDMQKMPKVIFSTSIINSSNQKIAFYVDIKPIIINNRIYIRLPQRPKPNEKIIINSSQ CCHHHHHHHHHHEEHEEECCCCCEEEEEEEEEEEEECCEEEEECCCCCCCCCEEEEECCC EFVGVQVIQTNKMLTRSINFNFNKEDHLIKVVDQSARFTNIKKTEVEFEIKLLNLNLNDI CEEEEEEEECCCEEEEEECCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCEEEEEEEEEEEEECCCCCC KDKNIEIELTNKKTNKTFKLHFLKYQFNHLTQQNKKPVLTITANLNADANNQLDDGEYFI CCCCEEEEEECCCCCCEEEEEEEEEEHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHH SKLVLDQKKLEINQSVYKPSGLQLDGSINNQRPTYLLIPSVFSKTKINVLDTKVIKNDGI HHHHHCHHHHHHCHHHCCCCCEEECCCCCCCCCCEEEECCCCCCCEEEEEEEEEECCCCC PQQLQLSYDHFINPYNFKDNMLSADIELISTKNNKTIILKSLKFNHDKNNIVFDLVNNLE CHHEEECHHHCCCCCCCCCCEEECCEEEEEECCCCEEEEEEEECCCCCCCEEEEEECCCE LQTLILKTPFFKIKSLTIMNDKQTLPLSIREKQLDLTNKHLSKIIKFTFDDTDPQNMLMK EEEEEEECCCEEEEEEEEECCCCCCCEEEECHHCCHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCEEEE FQLDSDSPIVQNTKKVLLTIKKINTDQQEDIKTFSFDILENKITTGSFYDVKNKYFLLNL EEECCCCCHHHCCEEEEEEEEECCCCCHHHHHEEEEEEHHCCCCCCCEEECCCEEEEEEC NKTLNAKSIGQILENDSNYIITKLTVVNNEASINEIPIEIDDLQNKQFTLKFAEYQSNVI CCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEECCCCCCCCCCEEEECCCCCEEEEEEEECCCCEE KFNAKNDPELHLNIKHFKQLNLTKINKIKLTLKDGKQIIFNRLNNEFSFQQAGFKLKINQ EEECCCCCEEEEEHHHHCCCCCEEEEEEEEEEECCHHHHHHHCCCCCCHHHCCEEEEECC NTFPNYLKQHQYVIKSISLINDDQSVIELLSKHNHEAIFEIPITASLDTEYDKIHNILKI CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEECCCCHHHHCCEEEE KMKLDSLSLHQSLNPSDYALNFYNLDTNIINRKFTLSPQTVLSSKVNNSNVIELIYDLDN EEEECCCHHHCCCCCCCEEEEEEECCHHHCCEEEECCHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCC DENIYGGLEPESTYQISSLMINAKPVIINTSITMVQTNASASKVEKIVASYDSVTKKTKI CCCEECCCCCCCCEEEEEEEEECCEEEEECEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEE SLQFSNNYNKNADHKLFAIISSLKPKNNKNANTFSLSRTFSNPEAINSNKDKDFVLDKAT EEEECCCCCCCCCCCCEEEHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEECCC KTLTYVINYANIDYKDQNDHESFDWYYDDLVLNKVTIIYNDLTTNDISPFSKDDQNLTIK CEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEEE LPNKINS CCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA