| Definition | Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 700970, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_002162 |
| Length | 751,719 |
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The map label for this gene is fatD-2
Identifier: 13357961
GI number: 13357961
Start: 459716
End: 460735
Strand: Reverse
Name: fatD-2
Synonym: UU400
Alternate gene names: NA
Gene position: 460735-459716 (Counterclockwise)
Preceding gene: 13357962
Following gene: 13357960
Centisome position: 61.29
GC content: 26.96
Gene sequence:
>1020_bases ATGTTTAAGAATAAATCATTAAAATTTAAAAATAAATTAGATTGAAAAACACATTTTAGAAGACTTATAACATCTTTATT AATTATTTTAAGTATTTGTGTGCTAATTTGTTATTGTCTTTTTGATGGTAAAGAGTTAATGAATTTTAAAAATGTAGGTG AAGAAATAAATGAGGGAAGTGCCCCTTATATTCGTAAATTTATTGCTACTCCAATTGCAATCTTTTTATCTGCATTAACA TTATCATTTAGTGGGTACAGTATGCAAGTAGTTTCACGAAACCCACTAGCTTCACCAACTACATTAGGATATTTACCTGC TGCAATTTTAGGTTTAGCAATTAGTAAACTTGCTATTAATCAAATTTTATATCTTCCTTTCATTATTGGTATTGTTTTTG CTTCATGTCTAATTGTAATTAATTTTTTCTTGGTAAAAGGAAATGCTTTAGAAGCAAGTTTTAAACCAATTTTAGTAGGA TTTGCAATTGGAGGTATCATTACTGGTATTAATGTATTATTAGAAGACCTTGTAAAAGATATAAACATTAAAATTACAGG TTTCGTTGAACCTCCAATTAATTTTCAATGACAACAATTATGTATAGGTGGTCCATTAATTATTATTTCTAGTTTAGCAA ATTTATTTATGGCGCCATATTATACAATCATTGCTAAAGATTATTTATTAGCAAAATCTTTAGGAATTAAAGTTAATTTG ATTTTTTGGCTAACAGCTTTTTTTGCAGTTGTCGCAACTGTTTCAAGCATCATTTTAATTGGTGTTTTAACACTATTAGG AATGATAGCGCCTCATGTGGCACGAATATTAAATCCAAAAGGCAATAGTTTTAAACAATTATTATTATCATTTGTAATTT CATTATTACTATTAACATCTTCACGTTGATTAATTAATGTCTATAATCAATTTGATATTAATTTATTCTCAGCTATCGCT GCCTTACCAGTCTTTGCATATATTTTTGTTTCAAAACAATACCGTCGGAATGTGGAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TATGATCGTACAACAAACACATTACAATCTGTTGAAGGAACAAAAGTTGTAAGTTGAACAGATCCAGCAAAAGAAAATAA ACAAAAATAATTAAGTTTTT
Downstream 100 bases:
>100_bases CTATGAAAATGAAATTTAATTTTTTTAAAGATAAACAAAATATATTAGGACAAAATCACATCTTAGAATTAAATAAAAAA AGTTTTATTCCATATCATTT
Product: ferrichrome ABC transporter (permease)
Products: NA
Alternate protein names: Citrate-Dependent Iron Transport Membrane-Bound Protein
Number of amino acids: Translated: 339; Mature: 339
Protein sequence:
>339_residues MFKNKSLKFKNKLDWKTHFRRLITSLLIILSICVLICYCLFDGKELMNFKNVGEEINEGSAPYIRKFIATPIAIFLSALT LSFSGYSMQVVSRNPLASPTTLGYLPAAILGLAISKLAINQILYLPFIIGIVFASCLIVINFFLVKGNALEASFKPILVG FAIGGIITGINVLLEDLVKDINIKITGFVEPPINFQWQQLCIGGPLIIISSLANLFMAPYYTIIAKDYLLAKSLGIKVNL IFWLTAFFAVVATVSSIILIGVLTLLGMIAPHVARILNPKGNSFKQLLLSFVISLLLLTSSRWLINVYNQFDINLFSAIA ALPVFAYIFVSKQYRRNVE
Sequences:
>Translated_339_residues MFKNKSLKFKNKLD*KTHFRRLITSLLIILSICVLICYCLFDGKELMNFKNVGEEINEGSAPYIRKFIATPIAIFLSALT LSFSGYSMQVVSRNPLASPTTLGYLPAAILGLAISKLAINQILYLPFIIGIVFASCLIVINFFLVKGNALEASFKPILVG FAIGGIITGINVLLEDLVKDINIKITGFVEPPINFQ*QQLCIGGPLIIISSLANLFMAPYYTIIAKDYLLAKSLGIKVNL IFWLTAFFAVVATVSSIILIGVLTLLGMIAPHVARILNPKGNSFKQLLLSFVISLLLLTSSR*LINVYNQFDINLFSAIA ALPVFAYIFVSKQYRRNVE >Mature_339_residues MFKNKSLKFKNKLD*KTHFRRLITSLLIILSICVLICYCLFDGKELMNFKNVGEEINEGSAPYIRKFIATPIAIFLSALT LSFSGYSMQVVSRNPLASPTTLGYLPAAILGLAISKLAINQILYLPFIIGIVFASCLIVINFFLVKGNALEASFKPILVG FAIGGIITGINVLLEDLVKDINIKITGFVEPPINFQ*QQLCIGGPLIIISSLANLFMAPYYTIIAKDYLLAKSLGIKVNL IFWLTAFFAVVATVSSIILIGVLTLLGMIAPHVARILNPKGNSFKQLLLSFVISLLLLTSSR*LINVYNQFDINLFSAIA ALPVFAYIFVSKQYRRNVE
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 37002; Mature: 37002
Theoretical pI: Translated: 10.05; Mature: 10.05
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.5 %Cys (Translated Protein) 1.5 %Met (Translated Protein) 2.9 %Cys+Met (Translated Protein) 1.5 %Cys (Mature Protein) 1.5 %Met (Mature Protein) 2.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MFKNKSLKFKNKLDKTHFRRLITSLLIILSICVLICYCLFDGKELMNFKNVGEEINEGSA CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCC PYIRKFIATPIAIFLSALTLSFSGYSMQVVSRNPLASPTTLGYLPAAILGLAISKLAINQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ILYLPFIIGIVFASCLIVINFFLVKGNALEASFKPILVGFAIGGIITGINVLLEDLVKDI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC NIKITGFVEPPINFQQQLCIGGPLIIISSLANLFMAPYYTIIAKDYLLAKSLGIKVNLIF CEEEEEEECCCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH WLTAFFAVVATVSSIILIGVLTLLGMIAPHVARILNPKGNSFKQLLLSFVISLLLLTSSR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LINVYNQFDINLFSAIAALPVFAYIFVSKQYRRNVE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC >Mature Secondary Structure MFKNKSLKFKNKLDKTHFRRLITSLLIILSICVLICYCLFDGKELMNFKNVGEEINEGSA CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCC PYIRKFIATPIAIFLSALTLSFSGYSMQVVSRNPLASPTTLGYLPAAILGLAISKLAINQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ILYLPFIIGIVFASCLIVINFFLVKGNALEASFKPILVGFAIGGIITGINVLLEDLVKDI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC NIKITGFVEPPINFQQQLCIGGPLIIISSLANLFMAPYYTIIAKDYLLAKSLGIKVNLIF CEEEEEEECCCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH WLTAFFAVVATVSSIILIGVLTLLGMIAPHVARILNPKGNSFKQLLLSFVISLLLLTSSR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LINVYNQFDINLFSAIAALPVFAYIFVSKQYRRNVE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 10.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA