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The map label for this gene is 126207933

Identifier: 126207933

GI number: 126207933

Start: 516537

End: 518054

Strand: Direct

Name: 126207933

Synonym: APL_0449

Alternate gene names: NA

Gene position: 516537-518054 (Clockwise)

Preceding gene: 126207927

Following gene: 126207934

Centisome position: 22.71

GC content: 42.03

Gene sequence:

>1518_bases
ATGAATTTAATTGATTATTCAAGTTCGTTGCTGTCGATTATACCGGCATCGCTTGCTTTACTATTGGCTATGGTTACTCG
ACGAGTATTGCTGTCTTTAAGTGTCGGTATCTTAGTCGGTGCCTTTATGCTTTCGGCAACATTTGCGGACGGTTTCGTTT
ATTTAAAAAATATTGCTATCGGTTTGGTTTATGCTGACGGTGAATATTCGTTCGGAAAAGTACAGATCTTAATTTTCTTA
CTTTTATTAGGCGTATTTACCTCTTTATTAACTTATTCGGGCAGTAATCAGGCTTTTGCCAATTGGGCGAAGAAACATAT
TAAAGGGCGCCGCGGTGCGAAATTATTAACCGCCTGTTTAGTTTTCGTGACGTTTATCGACGACTATTTCCATAGTCTGG
CGGTGGGGGCGATTGCTCGACCGGTAACGGATAAATTTAAAGTTTCGCGTGCAAAATTAGCTTATATTCTTGATTCAACC
GCCGCACCGATGTGCGTGCTTATGCCGGTTTCCAGCTGGGGAGCTTCAATTATCGCAACAATCGGCGGTTTATTGGCGAC
TTATAATATTACCGAATATACGGCGATCAGCGCATTCGCTTCAATGAGTTTGATGAACTACTATGCGTTATTTGCCTTAA
TTATGGTGTTTATCGTAGCTTATTTCTCATTTGATATCGGTTCGATGAGTCGTTTTGAAAGAAAAGCGTTGGCTTCGGAA
ACACATACGAATGAAGATACGGATGTCGAATCCAAAGGTCGAGTATATGCTTTAATCGTACCGATTCTTGTGTTGATTGT
AACCACCGTTACTTCGATGATTTATACCGGAGCGCAGGCATTGGAAGCCTTTAGCTTATTGGGTGCGTTTGAAAATACCA
ATGTCAATCTCTCTTTAGTTATCGGCGGATCGGCGGGGGTATTGGCAGTAATGCTTTGTACGCTCGGTTTAATTAAAGCG
GAAGATTATCCGAAAGCGATTTGGGTAGGTTGCAAATCTATGTTCGGTGCGATTTTAATTTTAACGCTTGCTTGGTTAAT
CAGTAGTGTCGTAAAAGATATGCATACCGGTGATTATTTATCTACGCTTGTTGCCGGCAATATTAATCCGGCCTTTTTAC
CTGCTATTTTATTTGTGCTTGCGACCGTTATGGCATTTGCAACCGGTACAAGCTGGGGGACATTTGGGATTATGCTACCG
ATTGCCGCAGCAATGGCGATTAATGTGGATGCAAGCCTTTTAATTCCGTGTATGTCTGCGGTTATGGCAGGGGCGGTATG
TGGCGATCACTGTTCTCCGATTTCTGATACGACGATCCTATCTTCAACCGGCGCACAATGTAACCATATCGATCACGTAA
CTTCACAGTTACCTTATGCGTTACTTGTTGCGGTTGCTTCCATTATCGGATATTTAGTGCTTGGCTTTACCGGATCCGCC
GTATCTGGATTTATTACCACGGCTGTTGTGATGATGGTATTGATTTTTATCTTTAGATCTAAAAAAATGACGGCTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTGCCTACCTCATCTTATGCGTTGCATAAATTCTCTCAGTAGATCCTCTTCTTTGTTTGGCTAGTATTTCATTACAAAG
TAACTTTTTTTAGAGGTTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GGTTTAATGCAATCCTTTTTGACAAGCGGTGAAATTTGTAAGAATTTTTGCAAATTTCACCGCTTGTTTTTTATTGTTGC
TTATTCGTAATGATTTCTGA

Product: putative integral membrane protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 505; Mature: 505

Protein sequence:

>505_residues
MNLIDYSSSLLSIIPASLALLLAMVTRRVLLSLSVGILVGAFMLSATFADGFVYLKNIAIGLVYADGEYSFGKVQILIFL
LLLGVFTSLLTYSGSNQAFANWAKKHIKGRRGAKLLTACLVFVTFIDDYFHSLAVGAIARPVTDKFKVSRAKLAYILDST
AAPMCVLMPVSSWGASIIATIGGLLATYNITEYTAISAFASMSLMNYYALFALIMVFIVAYFSFDIGSMSRFERKALASE
THTNEDTDVESKGRVYALIVPILVLIVTTVTSMIYTGAQALEAFSLLGAFENTNVNLSLVIGGSAGVLAVMLCTLGLIKA
EDYPKAIWVGCKSMFGAILILTLAWLISSVVKDMHTGDYLSTLVAGNINPAFLPAILFVLATVMAFATGTSWGTFGIMLP
IAAAMAINVDASLLIPCMSAVMAGAVCGDHCSPISDTTILSSTGAQCNHIDHVTSQLPYALLVAVASIIGYLVLGFTGSA
VSGFITTAVVMMVLIFIFRSKKMTA

Sequences:

>Translated_505_residues
MNLIDYSSSLLSIIPASLALLLAMVTRRVLLSLSVGILVGAFMLSATFADGFVYLKNIAIGLVYADGEYSFGKVQILIFL
LLLGVFTSLLTYSGSNQAFANWAKKHIKGRRGAKLLTACLVFVTFIDDYFHSLAVGAIARPVTDKFKVSRAKLAYILDST
AAPMCVLMPVSSWGASIIATIGGLLATYNITEYTAISAFASMSLMNYYALFALIMVFIVAYFSFDIGSMSRFERKALASE
THTNEDTDVESKGRVYALIVPILVLIVTTVTSMIYTGAQALEAFSLLGAFENTNVNLSLVIGGSAGVLAVMLCTLGLIKA
EDYPKAIWVGCKSMFGAILILTLAWLISSVVKDMHTGDYLSTLVAGNINPAFLPAILFVLATVMAFATGTSWGTFGIMLP
IAAAMAINVDASLLIPCMSAVMAGAVCGDHCSPISDTTILSSTGAQCNHIDHVTSQLPYALLVAVASIIGYLVLGFTGSA
VSGFITTAVVMMVLIFIFRSKKMTA
>Mature_505_residues
MNLIDYSSSLLSIIPASLALLLAMVTRRVLLSLSVGILVGAFMLSATFADGFVYLKNIAIGLVYADGEYSFGKVQILIFL
LLLGVFTSLLTYSGSNQAFANWAKKHIKGRRGAKLLTACLVFVTFIDDYFHSLAVGAIARPVTDKFKVSRAKLAYILDST
AAPMCVLMPVSSWGASIIATIGGLLATYNITEYTAISAFASMSLMNYYALFALIMVFIVAYFSFDIGSMSRFERKALASE
THTNEDTDVESKGRVYALIVPILVLIVTTVTSMIYTGAQALEAFSLLGAFENTNVNLSLVIGGSAGVLAVMLCTLGLIKA
EDYPKAIWVGCKSMFGAILILTLAWLISSVVKDMHTGDYLSTLVAGNINPAFLPAILFVLATVMAFATGTSWGTFGIMLP
IAAAMAINVDASLLIPCMSAVMAGAVCGDHCSPISDTTILSSTGAQCNHIDHVTSQLPYALLVAVASIIGYLVLGFTGSA
VSGFITTAVVMMVLIFIFRSKKMTA

Specific function: Unknown

COG id: COG1757

COG function: function code C; Na+/H+ antiporter

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR018461 [H]

Pfam domain/function: PF03553 Na_H_antiporter [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 53684; Mature: 53684

Theoretical pI: Translated: 7.74; Mature: 7.74

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.6 %Cys     (Translated Protein)
4.2 %Met     (Translated Protein)
5.7 %Cys+Met (Translated Protein)
1.6 %Cys     (Mature Protein)
4.2 %Met     (Mature Protein)
5.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNLIDYSSSLLSIIPASLALLLAMVTRRVLLSLSVGILVGAFMLSATFADGFVYLKNIAI
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE
GLVYADGEYSFGKVQILIFLLLLGVFTSLLTYSGSNQAFANWAKKHIKGRRGAKLLTACL
EEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH
VFVTFIDDYFHSLAVGAIARPVTDKFKVSRAKLAYILDSTAAPMCVLMPVSSWGASIIAT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECHHHHHHHHHH
IGGLLATYNITEYTAISAFASMSLMNYYALFALIMVFIVAYFSFDIGSMSRFERKALASE
HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
THTNEDTDVESKGRVYALIVPILVLIVTTVTSMIYTGAQALEAFSLLGAFENTNVNLSLV
CCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEE
IGGSAGVLAVMLCTLGLIKAEDYPKAIWVGCKSMFGAILILTLAWLISSVVKDMHTGDYL
ECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
STLVAGNINPAFLPAILFVLATVMAFATGTSWGTFGIMLPIAAAMAINVDASLLIPCMSA
HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
VMAGAVCGDHCSPISDTTILSSTGAQCNHIDHVTSQLPYALLVAVASIIGYLVLGFTGSA
HHHHHHHCCCCCCCCCCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
VSGFITTAVVMMVLIFIFRSKKMTA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MNLIDYSSSLLSIIPASLALLLAMVTRRVLLSLSVGILVGAFMLSATFADGFVYLKNIAI
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE
GLVYADGEYSFGKVQILIFLLLLGVFTSLLTYSGSNQAFANWAKKHIKGRRGAKLLTACL
EEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH
VFVTFIDDYFHSLAVGAIARPVTDKFKVSRAKLAYILDSTAAPMCVLMPVSSWGASIIAT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECHHHHHHHHHH
IGGLLATYNITEYTAISAFASMSLMNYYALFALIMVFIVAYFSFDIGSMSRFERKALASE
HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
THTNEDTDVESKGRVYALIVPILVLIVTTVTSMIYTGAQALEAFSLLGAFENTNVNLSLV
CCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEE
IGGSAGVLAVMLCTLGLIKAEDYPKAIWVGCKSMFGAILILTLAWLISSVVKDMHTGDYL
ECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
STLVAGNINPAFLPAILFVLATVMAFATGTSWGTFGIMLPIAAAMAINVDASLLIPCMSA
HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
VMAGAVCGDHCSPISDTTILSSTGAQCNHIDHVTSQLPYALLVAVASIIGYLVLGFTGSA
HHHHHHHCCCCCCCCCCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
VSGFITTAVVMMVLIFIFRSKKMTA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800 [H]