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The map label for this gene is 119945638

Identifier: 119945638

GI number: 119945638

Start: 2371015

End: 2372322

Strand: Reverse

Name: 119945638

Synonym: Ping_1950

Alternate gene names: NA

Gene position: 2372322-2371015 (Counterclockwise)

Preceding gene: 119945641

Following gene: 119945635

Centisome position: 52.03

GC content: 36.47

Gene sequence:

>1308_bases
ATGAACCAATTGATAAAATCGAATCTATCACAATTTTTTATTTGGAGTAGGTTATTTGGCTTAAGTGGTATTGGTATATT
TATCTTTTTTATTCCAATTACGGTTGCTGGTAAGCAAAGTATTCCTTTAGACCAAATTGTAGGATGGCTGAAAGCAACGC
TTGGAACAGGAACTGCCTGGTATGCAATGATAATGATTCTCGCGGGTGCAATTTATCCAATTATTAGCAATGAATGGCGT
AGCAGTCTTACTAACAAAATTTTTCTTTTATTAAAATGGCTCGGGGTTGTCGCAGCTGCTCTGGCTATAACAAAATCTGG
CCCCACTTTTCTGCAAACCCCAGATATGCTACCTTTTTTATTCAATAAACTGGTTATCTCTGTCGGTTTAATTGTACCCA
TTGGTTCGGTATTTCTAGCATTTTTAATAAGCTACGGTTTGTTAGAAAGCATTGGTATTCTTTTACAAAAGATTATGCAA
CCAATTTGGCGCACACCCGGTCGTTCTGCAATTGATGCTGTTGCTTCTTTTGTTGGCAGTTATTCAATCGGTTTGCTTAT
TACCAACCGAGTATATCTTTCTGGTCATTACTCTGCACGAGAAGCGGCAATAATAGCAACAGGTTTTTCAACTGTTTCAG
CAACCTTTATGATTATTGTTGCAAAAACATTAAACTTGATGGAATTTTGGAATCTATATTTTTGGATAACACTATTAATT
ACATTTATTATCACAGCCATTACTGTACGTATTCCTCCGTTATCAACAATGAATAACGATGCAAAATTTAGAGAGCCTAA
TTGCAATTCAGGCAATAGACTGTCCAAAGCAATTGAAAGTGGCATGGAAGTAGCCGAAAAAGCACAACCCCTTGGCAAAA
GTATATTAGTTAACTTTAAAGATGGTTTACTGATGACAATCAGCATTTTACCTTCAATTATGTCAGTCGGTCTAATCGGT
TTATTATTGGCTAAATACACGCCGCTGTTTAATTGGATTGGTTACTTTTTTTATCCAATTCCATGGGCATTTGGTATAGA
TAATGCGATGGAACTCTCTAAAGCTAGCGCATCGGGGTTGGCTGAAATGTTCTTACCTGCATTATTAATGAAAGATGCGG
ATATTATTGCACGCTTTTCGGCAGGGGTTGTTGCGATATCGTCAATCCTCTTTTTCTCTGCGTCAATTCCATGTATTCTT
TCGACTAAAATCCCATTAAATGTGCCTAAGTTAGTTATTATTTGGTTTATTCGTACCGCTCTAAGTTTAGTGTTAGCCAT
TCCAACAGCATTATTCCTTTTTAACTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CGCACTTAAATGTATACACATTTTATTGTAATTGTATAACATATTGTTAACCATGCACCCTGCATTGTTAACAAAAATTT
TACATTATATGGAGAATATG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TATTATAAAGCTCATGCTCACTTCGATTGTGGGCTTTATATCTTCCTCAGGTGATGACAACTAACAACAGTTATTTTTTG
CGAAAAACACACCTTCAAAC

Product: nucleoside recognition domain-containing protein

Products: NA

Alternate protein names: ORF A [H]

Number of amino acids: Translated: 435; Mature: 435

Protein sequence:

>435_residues
MNQLIKSNLSQFFIWSRLFGLSGIGIFIFFIPITVAGKQSIPLDQIVGWLKATLGTGTAWYAMIMILAGAIYPIISNEWR
SSLTNKIFLLLKWLGVVAAALAITKSGPTFLQTPDMLPFLFNKLVISVGLIVPIGSVFLAFLISYGLLESIGILLQKIMQ
PIWRTPGRSAIDAVASFVGSYSIGLLITNRVYLSGHYSAREAAIIATGFSTVSATFMIIVAKTLNLMEFWNLYFWITLLI
TFIITAITVRIPPLSTMNNDAKFREPNCNSGNRLSKAIESGMEVAEKAQPLGKSILVNFKDGLLMTISILPSIMSVGLIG
LLLAKYTPLFNWIGYFFYPIPWAFGIDNAMELSKASASGLAEMFLPALLMKDADIIARFSAGVVAISSILFFSASIPCIL
STKIPLNVPKLVIIWFIRTALSLVLAIPTALFLFN

Sequences:

>Translated_435_residues
MNQLIKSNLSQFFIWSRLFGLSGIGIFIFFIPITVAGKQSIPLDQIVGWLKATLGTGTAWYAMIMILAGAIYPIISNEWR
SSLTNKIFLLLKWLGVVAAALAITKSGPTFLQTPDMLPFLFNKLVISVGLIVPIGSVFLAFLISYGLLESIGILLQKIMQ
PIWRTPGRSAIDAVASFVGSYSIGLLITNRVYLSGHYSAREAAIIATGFSTVSATFMIIVAKTLNLMEFWNLYFWITLLI
TFIITAITVRIPPLSTMNNDAKFREPNCNSGNRLSKAIESGMEVAEKAQPLGKSILVNFKDGLLMTISILPSIMSVGLIG
LLLAKYTPLFNWIGYFFYPIPWAFGIDNAMELSKASASGLAEMFLPALLMKDADIIARFSAGVVAISSILFFSASIPCIL
STKIPLNVPKLVIIWFIRTALSLVLAIPTALFLFN
>Mature_435_residues
MNQLIKSNLSQFFIWSRLFGLSGIGIFIFFIPITVAGKQSIPLDQIVGWLKATLGTGTAWYAMIMILAGAIYPIISNEWR
SSLTNKIFLLLKWLGVVAAALAITKSGPTFLQTPDMLPFLFNKLVISVGLIVPIGSVFLAFLISYGLLESIGILLQKIMQ
PIWRTPGRSAIDAVASFVGSYSIGLLITNRVYLSGHYSAREAAIIATGFSTVSATFMIIVAKTLNLMEFWNLYFWITLLI
TFIITAITVRIPPLSTMNNDAKFREPNCNSGNRLSKAIESGMEVAEKAQPLGKSILVNFKDGLLMTISILPSIMSVGLIG
LLLAKYTPLFNWIGYFFYPIPWAFGIDNAMELSKASASGLAEMFLPALLMKDADIIARFSAGVVAISSILFFSASIPCIL
STKIPLNVPKLVIIWFIRTALSLVLAIPTALFLFN

Specific function: Unknown

COG id: COG3314

COG function: function code S; Uncharacterized protein conserved in bacteria

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR011642 [H]

Pfam domain/function: PF07670 Gate [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 47650; Mature: 47650

Theoretical pI: Translated: 10.17; Mature: 10.17

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
3.2 %Met     (Translated Protein)
3.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
3.2 %Met     (Mature Protein)
3.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNQLIKSNLSQFFIWSRLFGLSGIGIFIFFIPITVAGKQSIPLDQIVGWLKATLGTGTAW
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHH
YAMIMILAGAIYPIISNEWRSSLTNKIFLLLKWLGVVAAALAITKSGPTFLQTPDMLPFL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHH
FNKLVISVGLIVPIGSVFLAFLISYGLLESIGILLQKIMQPIWRTPGRSAIDAVASFVGS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHC
YSIGLLITNRVYLSGHYSAREAAIIATGFSTVSATFMIIVAKTLNLMEFWNLYFWITLLI
CHHHEEEEEEEEEECCCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TFIITAITVRIPPLSTMNNDAKFREPNCNSGNRLSKAIESGMEVAEKAQPLGKSILVNFK
HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHEEEEEC
DGLLMTISILPSIMSVGLIGLLLAKYTPLFNWIGYFFYPIPWAFGIDNAMELSKASASGL
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
AEMFLPALLMKDADIIARFSAGVVAISSILFFSASIPCILSTKIPLNVPKLVIIWFIRTA
HHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHH
LSLVLAIPTALFLFN
HHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MNQLIKSNLSQFFIWSRLFGLSGIGIFIFFIPITVAGKQSIPLDQIVGWLKATLGTGTAW
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHH
YAMIMILAGAIYPIISNEWRSSLTNKIFLLLKWLGVVAAALAITKSGPTFLQTPDMLPFL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHH
FNKLVISVGLIVPIGSVFLAFLISYGLLESIGILLQKIMQPIWRTPGRSAIDAVASFVGS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHC
YSIGLLITNRVYLSGHYSAREAAIIATGFSTVSATFMIIVAKTLNLMEFWNLYFWITLLI
CHHHEEEEEEEEEECCCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TFIITAITVRIPPLSTMNNDAKFREPNCNSGNRLSKAIESGMEVAEKAQPLGKSILVNFK
HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHEEEEEC
DGLLMTISILPSIMSVGLIGLLLAKYTPLFNWIGYFFYPIPWAFGIDNAMELSKASASGL
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
AEMFLPALLMKDADIIARFSAGVVAISSILFFSASIPCILSTKIPLNVPKLVIIWFIRTA
HHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHH
LSLVLAIPTALFLFN
HHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA