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The map label for this gene is 117919855

Identifier: 117919855

GI number: 117919855

Start: 1624743

End: 1626311

Strand: Direct

Name: 117919855

Synonym: Shewana3_1407

Alternate gene names: NA

Gene position: 1624743-1626311 (Clockwise)

Preceding gene: 117919854

Following gene: 117919858

Centisome position: 32.68

GC content: 47.04

Gene sequence:

>1569_bases
ATGACTGTAGTAAGTTACGCCGATTCGGCACTTTCTTTGCTGCCGCCTGTGGTCGCAATTGTGTTGGCGATTTTCACTCG
CCGCGTTCTCCTTTCCCTCGGTTTAGGTATTGTGATTGGGGTGTTATTACTCAATCAATTTTCACCTGTGGCCAGCGGTG
AGTTTTTATTTAACAGTGTAAAAGGACTTTTTTGGTCAGAAGATGGCGTAAATTCTTGGAATTTATACATTCTCGGCTTT
TTAATTGTATTAGGGATGATCACGGCATTAATTACCGTCAGTGGGAGTGCCAGGGCATTTGCCGATTGGGCGCGCCTGCA
TATTCGCAATAAACGCGATGCCAAATTACTGACCATGTTTTTAGGTTGTGTTGTCTTTATTGACGATTATTTCAATAGCT
TAGTCGTGGGCTCTGTCGCCAGACCCGTCACTGACCGTTATTATATTTCCCGCGCTAAGTTAGCCTATTTATTAGATTCA
ACGGCGGCGCCAGTTTGCGTTATTTCGCCGGTATCCAGTTGGGGCGCTTATATTATCGCGCTGATCGGCGGCATATTAAC
CGCCCACGGTTTTGCTGATTCTGGTCATTTGAGTGTGTTTATTCAAATGATCCCTATGAATTTCTACGCTATTTTCTCTT
TATTATTATTACTTTGTGTTGCATTTATGGGCTTGGATATTGGCCCTATGCGTGAGCATGAATTAAATGCACAGCGCGGT
AATTTATATGACGAGAATAAAGGATTACCGCCTGGGGCGAATGCCGATTTACCCGAAGCCGAAACGGGTAAAATCCTCGG
TTTATTCTTACCTATTACTGTGCTGGTATTTGCGACCCTGTATTTTATGGTCGACAGTGGTGCCCAGGTATTAACGAAAG
AAGGCATTGAATTTAATATTATTTCTGCTTTTGAAAAAACCGATGTGAGTTCATCACTGTTCTTTGGTGCACTGATTGGT
TTAGCGGTTGCGCTGGTGCTTAACCTAGTGCAAGGCGTCGAAAAGTCGATGGTCGTCAAAGGCGTGGTGCAGGGCGCTCG
CTCTATGCTGCCTGCGATTTATATCCTGTTATTTGCTTGGACCATCGCGGGCGTGATTGGCCAGCTTGAGACCGGTAAGT
TTATGGCAAGCCTCGCCACAGGAAACATTCCCTTTGCCTTCTTACCTGCGTTGATGTTTGTGTTAGCGGGTCTGACGGCG
TTTTCTACCGGCACCAGTTGGGGCACGTTCGGTATTATGTTGCCGATTGCCGCCGATATGGCGATGGGTAGCCACACTGC
CATGATGTTACCTATGCTGGCTTCTGTCTTGGCGGGCGCAGTATTTGGTGACCACTGCTCACCGATTTCGGATACCACGA
TTCTGTCGTCAACCGGCGCGAGCTGTCACCATATCGACCACGTTGTCACTCAGCTGCCTTACGCTGTGATTGTGGCACTG
ATCAGCATGGTGGGCTACGTAGTGCTTGGCTTTACTGAGTCGGTGAATGCGGGACTGCTGACCTGTGGCGTGCTGTTTGT
CTTAAGCATTGTGTGGTTACGATTCAAATCACAAAGCAACGCGAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTATGGAGCGCTACTGATAGGACAGGTGATCTTGGGTATCTATTGCCTTTTCCCACCAGTTCAGTCGCCCTCCATTCGTA
TTTTGACGAAGAAATAATCA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GCCTAATTTAAGCGAGCTGTTTATTCGCGTGTCTTCTCTGTGAATTTACCCAGCGCTAAAAACAAATCAGCCAGCAATTA
CGCTGGCTGATTTTTTATTG

Product: Na+/H+ antiporter NhaC

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 522; Mature: 521

Protein sequence:

>522_residues
MTVVSYADSALSLLPPVVAIVLAIFTRRVLLSLGLGIVIGVLLLNQFSPVASGEFLFNSVKGLFWSEDGVNSWNLYILGF
LIVLGMITALITVSGSARAFADWARLHIRNKRDAKLLTMFLGCVVFIDDYFNSLVVGSVARPVTDRYYISRAKLAYLLDS
TAAPVCVISPVSSWGAYIIALIGGILTAHGFADSGHLSVFIQMIPMNFYAIFSLLLLLCVAFMGLDIGPMREHELNAQRG
NLYDENKGLPPGANADLPEAETGKILGLFLPITVLVFATLYFMVDSGAQVLTKEGIEFNIISAFEKTDVSSSLFFGALIG
LAVALVLNLVQGVEKSMVVKGVVQGARSMLPAIYILLFAWTIAGVIGQLETGKFMASLATGNIPFAFLPALMFVLAGLTA
FSTGTSWGTFGIMLPIAADMAMGSHTAMMLPMLASVLAGAVFGDHCSPISDTTILSSTGASCHHIDHVVTQLPYAVIVAL
ISMVGYVVLGFTESVNAGLLTCGVLFVLSIVWLRFKSQSNAK

Sequences:

>Translated_522_residues
MTVVSYADSALSLLPPVVAIVLAIFTRRVLLSLGLGIVIGVLLLNQFSPVASGEFLFNSVKGLFWSEDGVNSWNLYILGF
LIVLGMITALITVSGSARAFADWARLHIRNKRDAKLLTMFLGCVVFIDDYFNSLVVGSVARPVTDRYYISRAKLAYLLDS
TAAPVCVISPVSSWGAYIIALIGGILTAHGFADSGHLSVFIQMIPMNFYAIFSLLLLLCVAFMGLDIGPMREHELNAQRG
NLYDENKGLPPGANADLPEAETGKILGLFLPITVLVFATLYFMVDSGAQVLTKEGIEFNIISAFEKTDVSSSLFFGALIG
LAVALVLNLVQGVEKSMVVKGVVQGARSMLPAIYILLFAWTIAGVIGQLETGKFMASLATGNIPFAFLPALMFVLAGLTA
FSTGTSWGTFGIMLPIAADMAMGSHTAMMLPMLASVLAGAVFGDHCSPISDTTILSSTGASCHHIDHVVTQLPYAVIVAL
ISMVGYVVLGFTESVNAGLLTCGVLFVLSIVWLRFKSQSNAK
>Mature_521_residues
TVVSYADSALSLLPPVVAIVLAIFTRRVLLSLGLGIVIGVLLLNQFSPVASGEFLFNSVKGLFWSEDGVNSWNLYILGFL
IVLGMITALITVSGSARAFADWARLHIRNKRDAKLLTMFLGCVVFIDDYFNSLVVGSVARPVTDRYYISRAKLAYLLDST
AAPVCVISPVSSWGAYIIALIGGILTAHGFADSGHLSVFIQMIPMNFYAIFSLLLLLCVAFMGLDIGPMREHELNAQRGN
LYDENKGLPPGANADLPEAETGKILGLFLPITVLVFATLYFMVDSGAQVLTKEGIEFNIISAFEKTDVSSSLFFGALIGL
AVALVLNLVQGVEKSMVVKGVVQGARSMLPAIYILLFAWTIAGVIGQLETGKFMASLATGNIPFAFLPALMFVLAGLTAF
STGTSWGTFGIMLPIAADMAMGSHTAMMLPMLASVLAGAVFGDHCSPISDTTILSSTGASCHHIDHVVTQLPYAVIVALI
SMVGYVVLGFTESVNAGLLTCGVLFVLSIVWLRFKSQSNAK

Specific function: Unknown

COG id: COG1757

COG function: function code C; Na+/H+ antiporter

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR018461 [H]

Pfam domain/function: PF03553 Na_H_antiporter [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 55683; Mature: 55551

Theoretical pI: Translated: 6.42; Mature: 6.42

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.1 %Cys     (Translated Protein)
3.6 %Met     (Translated Protein)
4.8 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
3.5 %Met     (Mature Protein)
4.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTVVSYADSALSLLPPVVAIVLAIFTRRVLLSLGLGIVIGVLLLNQFSPVASGEFLFNSV
CCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHH
KGLFWSEDGVNSWNLYILGFLIVLGMITALITVSGSARAFADWARLHIRNKRDAKLLTMF
HHCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
LGCVVFIDDYFNSLVVGSVARPVTDRYYISRAKLAYLLDSTAAPVCVISPVSSWGAYIIA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCHHHHHHHHHH
LIGGILTAHGFADSGHLSVFIQMIPMNFYAIFSLLLLLCVAFMGLDIGPMREHELNAQRG
HHHHHHHHCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHCCCCCC
NLYDENKGLPPGANADLPEAETGKILGLFLPITVLVFATLYFMVDSGAQVLTKEGIEFNI
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCEEEE
ISAFEKTDVSSSLFFGALIGLAVALVLNLVQGVEKSMVVKGVVQGARSMLPAIYILLFAW
EHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TIAGVIGQLETGKFMASLATGNIPFAFLPALMFVLAGLTAFSTGTSWGTFGIMLPIAADM
HHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
AMGSHTAMMLPMLASVLAGAVFGDHCSPISDTTILSSTGASCHHIDHVVTQLPYAVIVAL
HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
ISMVGYVVLGFTESVNAGLLTCGVLFVLSIVWLRFKSQSNAK
HHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
TVVSYADSALSLLPPVVAIVLAIFTRRVLLSLGLGIVIGVLLLNQFSPVASGEFLFNSV
CEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHH
KGLFWSEDGVNSWNLYILGFLIVLGMITALITVSGSARAFADWARLHIRNKRDAKLLTMF
HHCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
LGCVVFIDDYFNSLVVGSVARPVTDRYYISRAKLAYLLDSTAAPVCVISPVSSWGAYIIA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCHHHHHHHHHH
LIGGILTAHGFADSGHLSVFIQMIPMNFYAIFSLLLLLCVAFMGLDIGPMREHELNAQRG
HHHHHHHHCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHCCCCCC
NLYDENKGLPPGANADLPEAETGKILGLFLPITVLVFATLYFMVDSGAQVLTKEGIEFNI
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCEEEE
ISAFEKTDVSSSLFFGALIGLAVALVLNLVQGVEKSMVVKGVVQGARSMLPAIYILLFAW
EHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TIAGVIGQLETGKFMASLATGNIPFAFLPALMFVLAGLTAFSTGTSWGTFGIMLPIAADM
HHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
AMGSHTAMMLPMLASVLAGAVFGDHCSPISDTTILSSTGASCHHIDHVVTQLPYAVIVAL
HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
ISMVGYVVLGFTESVNAGLLTCGVLFVLSIVWLRFKSQSNAK
HHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800 [H]