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The map label for this gene is mepA [H]

Identifier: 116872391

GI number: 116872391

Start: 995113

End: 996474

Strand: Direct

Name: mepA [H]

Synonym: lwe0973

Alternate gene names: 116872391

Gene position: 995113-996474 (Clockwise)

Preceding gene: 116872390

Following gene: 116872392

Centisome position: 35.36

GC content: 34.88

Gene sequence:

>1362_bases
ATGAAACACGGAGATAATTATTATTTAACAAAAGCGAGTATTCCAAAAGCGATAGCACACTTATCCATTCCAATGATGCT
TGGTATGTCAGTAGGGGTCATTTATAATATCGTCAATGCCTTTTTTATTGGTTTATTACATGATACATCCATGTTAACAG
CTGTGACGCTTGGTTTACCAATGTTTACAGTGTTAATGGCAATTGGGAATATGTTTGGAGTTGGTGGTGGTACGTATATT
TCTCGTTTACTAGGGAAAGAAGAAGGAATAAAGGCGAAACAAGTATCGGCTTTTGTTTTATACGGAAGTTTGGTTTTAGG
TATTTTATGCGCCATTTTATTAGGATTTTTAATCAATCCAGTTACTCATTTTCTGGGTGCGGATACAACGAGTTTTTTAC
ACACGAAAAATTATACATTGGCGCTTCTAATTTGTAGTCCGTTTATTATTGCTAATTTTGCTTTAGAGCAAGTTGTTCGG
GCAGAGGGAGCTTCTCGGGTTTCAATGAATGGGATGCTGATTGGTACGCTAGTTAATTTAGTGTTTGATCCATTACTTAT
TTTATATTTTGATTTTAATGTCGTAGGAGCTGCCGTTTCAATTGGTTTAGCAAGTATCGTTTCACTTATCTATTATGCTT
GGTATTTAGAGAAAAAAAGTGATTATTTATCCATTCGTTTTAAATGGTTTAAAGCAACCAAAGAAATTGTCCAAAACGTT
TTTAAAATTGGTGTTTCTGAGCTACTTTTATCATTATTTTTAATTGTGACAACGCTCGTTTTAAATCATTATTCGATGAT
ATACGGGGATGGAGTGGTTGCAGGGTTTGGTGTAGCGCTACGGGTAGTGCAGTTACCTGAATTTATTTGTATGGGACTTT
ACATGGGAATTATTCCACTTTTGGCATATAATTACAGCTCGGGAAATATTGCACGGTTTGAGAAAGCAATCCGTTTTACA
GCATTCAGTATCGGTTTTATTGTGCTTGTGATTTCTAGTTTTGTATTTATTTTCCGTTTTCAAGTTATGCATTTATTTAG
TGACAATCAAAGTGTTATATCACTTGGTGTGCATATTATGATTGCGATGCTGATATCTTCTCTTTTTAGCGGATTTACAG
GGCTCTTTACAAGTACTTTTCAGGCGATTGGAAAAGCGGTTCCAGCTACAATTATGTCCGTCTCGCAAGGAATTATTTTT
ATTCCCGTCATTATAATAGGTCAACATTATTTTGGTTTAATGGGTGTGATTTGGTCCTTAACAGCGACAGAAATTCTTAC
GTGTATAATCGGTGTGATACTATTCACAATTTATAATATTAAAATCGCCAGTAGCGCGAAAACTAAAGATCTACTGGTTT
AA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAACCTTAATTGAACTACTTAGTAAAATTGATGACAACACAGAATAAAAAAATTTAGTTATATAGTTAGAATTCTAACTA
ATTTCAAGGGAGGAATTAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAGTTTGTGAGAAAAATTAGTTGACGAGTACTTCTTTATTATGGTATTATTCTCTAAGTAATCATATATCGTTCTTTGA
CAAATGTCAGAGGGGAGTAG

Product: MATE family efflux protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 453; Mature: 453

Protein sequence:

>453_residues
MKHGDNYYLTKASIPKAIAHLSIPMMLGMSVGVIYNIVNAFFIGLLHDTSMLTAVTLGLPMFTVLMAIGNMFGVGGGTYI
SRLLGKEEGIKAKQVSAFVLYGSLVLGILCAILLGFLINPVTHFLGADTTSFLHTKNYTLALLICSPFIIANFALEQVVR
AEGASRVSMNGMLIGTLVNLVFDPLLILYFDFNVVGAAVSIGLASIVSLIYYAWYLEKKSDYLSIRFKWFKATKEIVQNV
FKIGVSELLLSLFLIVTTLVLNHYSMIYGDGVVAGFGVALRVVQLPEFICMGLYMGIIPLLAYNYSSGNIARFEKAIRFT
AFSIGFIVLVISSFVFIFRFQVMHLFSDNQSVISLGVHIMIAMLISSLFSGFTGLFTSTFQAIGKAVPATIMSVSQGIIF
IPVIIIGQHYFGLMGVIWSLTATEILTCIIGVILFTIYNIKIASSAKTKDLLV

Sequences:

>Translated_453_residues
MKHGDNYYLTKASIPKAIAHLSIPMMLGMSVGVIYNIVNAFFIGLLHDTSMLTAVTLGLPMFTVLMAIGNMFGVGGGTYI
SRLLGKEEGIKAKQVSAFVLYGSLVLGILCAILLGFLINPVTHFLGADTTSFLHTKNYTLALLICSPFIIANFALEQVVR
AEGASRVSMNGMLIGTLVNLVFDPLLILYFDFNVVGAAVSIGLASIVSLIYYAWYLEKKSDYLSIRFKWFKATKEIVQNV
FKIGVSELLLSLFLIVTTLVLNHYSMIYGDGVVAGFGVALRVVQLPEFICMGLYMGIIPLLAYNYSSGNIARFEKAIRFT
AFSIGFIVLVISSFVFIFRFQVMHLFSDNQSVISLGVHIMIAMLISSLFSGFTGLFTSTFQAIGKAVPATIMSVSQGIIF
IPVIIIGQHYFGLMGVIWSLTATEILTCIIGVILFTIYNIKIASSAKTKDLLV
>Mature_453_residues
MKHGDNYYLTKASIPKAIAHLSIPMMLGMSVGVIYNIVNAFFIGLLHDTSMLTAVTLGLPMFTVLMAIGNMFGVGGGTYI
SRLLGKEEGIKAKQVSAFVLYGSLVLGILCAILLGFLINPVTHFLGADTTSFLHTKNYTLALLICSPFIIANFALEQVVR
AEGASRVSMNGMLIGTLVNLVFDPLLILYFDFNVVGAAVSIGLASIVSLIYYAWYLEKKSDYLSIRFKWFKATKEIVQNV
FKIGVSELLLSLFLIVTTLVLNHYSMIYGDGVVAGFGVALRVVQLPEFICMGLYMGIIPLLAYNYSSGNIARFEKAIRFT
AFSIGFIVLVISSFVFIFRFQVMHLFSDNQSVISLGVHIMIAMLISSLFSGFTGLFTSTFQAIGKAVPATIMSVSQGIIF
IPVIIIGQHYFGLMGVIWSLTATEILTCIIGVILFTIYNIKIASSAKTKDLLV

Specific function: Multidrug resistance efflux protein [H]

COG id: COG0534

COG function: function code V; Na+-driven multidrug efflux pump

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the multi antimicrobial extrusion (MATE) (TC 2.A.66.1) family. MepA subfamily [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002528
- InterPro:   IPR015522 [H]

Pfam domain/function: PF01554 MatE [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 49479; Mature: 49479

Theoretical pI: Translated: 9.26; Mature: 9.26

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
4.0 %Met     (Translated Protein)
4.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
4.0 %Met     (Mature Protein)
4.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKHGDNYYLTKASIPKAIAHLSIPMMLGMSVGVIYNIVNAFFIGLLHDTSMLTAVTLGLP
CCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MFTVLMAIGNMFGVGGGTYISRLLGKEEGIKAKQVSAFVLYGSLVLGILCAILLGFLINP
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VTHFLGADTTSFLHTKNYTLALLICSPFIIANFALEQVVRAEGASRVSMNGMLIGTLVNL
HHHHHCCCCHHHEEECCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCHHHHHHHHH
VFDPLLILYFDFNVVGAAVSIGLASIVSLIYYAWYLEKKSDYLSIRFKWFKATKEIVQNV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHH
FKIGVSELLLSLFLIVTTLVLNHYSMIYGDGVVAGFGVALRVVQLPEFICMGLYMGIIPL
HHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LAYNYSSGNIARFEKAIRFTAFSIGFIVLVISSFVFIFRFQVMHLFSDNQSVISLGVHIM
HHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
IAMLISSLFSGFTGLFTSTFQAIGKAVPATIMSVSQGIIFIPVIIIGQHYFGLMGVIWSL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TATEILTCIIGVILFTIYNIKIASSAKTKDLLV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MKHGDNYYLTKASIPKAIAHLSIPMMLGMSVGVIYNIVNAFFIGLLHDTSMLTAVTLGLP
CCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MFTVLMAIGNMFGVGGGTYISRLLGKEEGIKAKQVSAFVLYGSLVLGILCAILLGFLINP
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VTHFLGADTTSFLHTKNYTLALLICSPFIIANFALEQVVRAEGASRVSMNGMLIGTLVNL
HHHHHCCCCHHHEEECCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCHHHHHHHHH
VFDPLLILYFDFNVVGAAVSIGLASIVSLIYYAWYLEKKSDYLSIRFKWFKATKEIVQNV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHH
FKIGVSELLLSLFLIVTTLVLNHYSMIYGDGVVAGFGVALRVVQLPEFICMGLYMGIIPL
HHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LAYNYSSGNIARFEKAIRFTAFSIGFIVLVISSFVFIFRFQVMHLFSDNQSVISLGVHIM
HHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
IAMLISSLFSGFTGLFTSTFQAIGKAVPATIMSVSQGIIFIPVIIIGQHYFGLMGVIWSL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TATEILTCIIGVILFTIYNIKIASSAKTKDLLV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA