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The map label for this gene is 116516835

Identifier: 116516835

GI number: 116516835

Start: 324398

End: 325807

Strand: Direct

Name: 116516835

Synonym: SPD_0325

Alternate gene names: NA

Gene position: 324398-325807 (Clockwise)

Preceding gene: 116516743

Following gene: 116516033

Centisome position: 15.85

GC content: 26.38

Gene sequence:

>1410_bases
TTGAGTAGAAGATATAATTACTTACTAAAAAATATTGGATTACTAACTTTAAGCAACTTTGGTTCTAAAATTTTAGTCTT
TTTAATGGTTCCGTTATATACAAGCGTACTATCTACATCTGATTATGGAACATATGATTTATTTAATACGACAATCTCAT
TGCTAATTCCAATTATTTCAATTAATATTTCTGAAGGGGTTCTTCGATTTGCATTAGATGAAAAAAATGACAGTAGTATA
GTATATTCAATTGGCTGGAATATTATAATAAAAGGTTTCTTAGTTGTAGTATTAGGAATTATTTTCAATAATATCTTTAA
TATATTCCCATTACTTAAAGAAAATTCCATAACTTTTTTATTACTTTATTTATCAACTATTGTTTATCAATTTCTTTCTT
CATTTATTAGAGGTATAGATAAAGTTTCTATATTATCAATTGCTGCTATTCTCAATACAATTTCTATATTGGGGTTTAAC
ATTCTATTTCTTATAATTATACCTCTAGGTTTGGTTGGATATTTTTGGTCTAATATATTGGGTTTGGTGCTACCTAGTTT
ATACTTGATATATAAGATATCTCAATATAACATTAAGTACACTAGCCTTCAGAATAAAAAGTTACAGCAAAGACTTGTTA
GTTACAGTATTCCCTTAATCTTAAATTCATTAGGTTGGTGGATTAATAATGCAATAGATAGATACGTAGTTATTGCATTT
TGTGGTGTAGCGGTGAATGGCATCTATTCAGTTGGTTATAAAATCCCATCAATTTTAAATATTTTTGCAAATATATTTAA
CCAAGCGTGGATATTATCATCTGTAAAGTCTTATCGTGATGAAGATAGTGAATATTTCTTTTCTCAAGTTTATAATAAGT
ATAACATGATTATGGTATTAATTTCCGGGCTACTAATTTCTTGTAGTAAAATACTTGCTAAGTTTCTATATATGAATGAA
TTTTATGATGCTTGGAAGTTTGTTCCGTTTTTACTAATTGCAAATGTTTTTGGAGCTATTTCAGGATTTGCTGGTGGAAT
TTTTTCCGCGGTTAAAGATTCAAAAATATATAGTCAGTCAACCTTAGTAGGAGCGATAGTGAATATTATTTTCACATTTG
TTTTTGTATATTATTATGGAGCTATAGGTGCTGCTATTGCCACTATGATATCTTACTTTGTTGTTTGGATAATACGTGTT
CATACAATGAGAAAATATATAAAGTTAAAAATTTTTATTAGAAGAGATGTATTTTCCTATGTATTGCTTATTTTTCAGTC
AATAGTCTTATGGTTGGAAAATAGTTATATTCTTTATCCTATACAAGTTGTGTTATTCTTATTATTAGTTATGTTATTTT
ATAAAGAAATAAAGAGTATTATTGGTGAATTAAAAAAGTTTCTAACATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCTTGGAAATTGCTTTGAGAGGACAAGAGAAGGCTACATTACGTTTTTCAGATAAAAATAATGCCATGCAGATCATGCAA
CTATATAAGGAACTAGAAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GAACCAATAAGTACGAGTATTGAAAGGAGAAAAATGTGAAAATAGCAGTAGCAGGTACGGGATATGTTGGTCTATCCATT
GCAGTTTTATTGTCTCAACA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Polysaccharide Biosynthesis Protein; Exopolysacharide Protein Wzx; Polysaccharide Transporter; Flippase Wzx; Repeat Unit Transporter; Capsule Biosynthesis Repeating Unit Flippase Wzx; O-Antigen Translocase; Flippase

Number of amino acids: Translated: 469; Mature: 468

Protein sequence:

>469_residues
MSRRYNYLLKNIGLLTLSNFGSKILVFLMVPLYTSVLSTSDYGTYDLFNTTISLLIPIISINISEGVLRFALDEKNDSSI
VYSIGWNIIIKGFLVVVLGIIFNNIFNIFPLLKENSITFLLLYLSTIVYQFLSSFIRGIDKVSILSIAAILNTISILGFN
ILFLIIIPLGLVGYFWSNILGLVLPSLYLIYKISQYNIKYTSLQNKKLQQRLVSYSIPLILNSLGWWINNAIDRYVVIAF
CGVAVNGIYSVGYKIPSILNIFANIFNQAWILSSVKSYRDEDSEYFFSQVYNKYNMIMVLISGLLISCSKILAKFLYMNE
FYDAWKFVPFLLIANVFGAISGFAGGIFSAVKDSKIYSQSTLVGAIVNIIFTFVFVYYYGAIGAAIATMISYFVVWIIRV
HTMRKYIKLKIFIRRDVFSYVLLIFQSIVLWLENSYILYPIQVVLFLLLVMLFYKEIKSIIGELKKFLT

Sequences:

>Translated_469_residues
MSRRYNYLLKNIGLLTLSNFGSKILVFLMVPLYTSVLSTSDYGTYDLFNTTISLLIPIISINISEGVLRFALDEKNDSSI
VYSIGWNIIIKGFLVVVLGIIFNNIFNIFPLLKENSITFLLLYLSTIVYQFLSSFIRGIDKVSILSIAAILNTISILGFN
ILFLIIIPLGLVGYFWSNILGLVLPSLYLIYKISQYNIKYTSLQNKKLQQRLVSYSIPLILNSLGWWINNAIDRYVVIAF
CGVAVNGIYSVGYKIPSILNIFANIFNQAWILSSVKSYRDEDSEYFFSQVYNKYNMIMVLISGLLISCSKILAKFLYMNE
FYDAWKFVPFLLIANVFGAISGFAGGIFSAVKDSKIYSQSTLVGAIVNIIFTFVFVYYYGAIGAAIATMISYFVVWIIRV
HTMRKYIKLKIFIRRDVFSYVLLIFQSIVLWLENSYILYPIQVVLFLLLVMLFYKEIKSIIGELKKFLT
>Mature_468_residues
SRRYNYLLKNIGLLTLSNFGSKILVFLMVPLYTSVLSTSDYGTYDLFNTTISLLIPIISINISEGVLRFALDEKNDSSIV
YSIGWNIIIKGFLVVVLGIIFNNIFNIFPLLKENSITFLLLYLSTIVYQFLSSFIRGIDKVSILSIAAILNTISILGFNI
LFLIIIPLGLVGYFWSNILGLVLPSLYLIYKISQYNIKYTSLQNKKLQQRLVSYSIPLILNSLGWWINNAIDRYVVIAFC
GVAVNGIYSVGYKIPSILNIFANIFNQAWILSSVKSYRDEDSEYFFSQVYNKYNMIMVLISGLLISCSKILAKFLYMNEF
YDAWKFVPFLLIANVFGAISGFAGGIFSAVKDSKIYSQSTLVGAIVNIIFTFVFVYYYGAIGAAIATMISYFVVWIIRVH
TMRKYIKLKIFIRRDVFSYVLLIFQSIVLWLENSYILYPIQVVLFLLLVMLFYKEIKSIIGELKKFLT

Specific function: Unknown

COG id: COG2244

COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 53643; Mature: 53512

Theoretical pI: Translated: 9.79; Mature: 9.79

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
1.7 %Met     (Translated Protein)
2.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
1.5 %Met     (Mature Protein)
1.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSRRYNYLLKNIGLLTLSNFGSKILVFLMVPLYTSVLSTSDYGTYDLFNTTISLLIPIIS
CCCHHHHHHHHCCHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
INISEGVLRFALDEKNDSSIVYSIGWNIIIKGFLVVVLGIIFNNIFNIFPLLKENSITFL
CCHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH
LLYLSTIVYQFLSSFIRGIDKVSILSIAAILNTISILGFNILFLIIIPLGLVGYFWSNIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GLVLPSLYLIYKISQYNIKYTSLQNKKLQQRLVSYSIPLILNSLGWWINNAIDRYVVIAF
HHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
CGVAVNGIYSVGYKIPSILNIFANIFNQAWILSSVKSYRDEDSEYFFSQVYNKYNMIMVL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ISGLLISCSKILAKFLYMNEFYDAWKFVPFLLIANVFGAISGFAGGIFSAVKDSKIYSQS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TLVGAIVNIIFTFVFVYYYGAIGAAIATMISYFVVWIIRVHTMRKYIKLKIFIRRDVFSY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VLLIFQSIVLWLENSYILYPIQVVLFLLLVMLFYKEIKSIIGELKKFLT
HHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
SRRYNYLLKNIGLLTLSNFGSKILVFLMVPLYTSVLSTSDYGTYDLFNTTISLLIPIIS
CCHHHHHHHHCCHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
INISEGVLRFALDEKNDSSIVYSIGWNIIIKGFLVVVLGIIFNNIFNIFPLLKENSITFL
CCHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH
LLYLSTIVYQFLSSFIRGIDKVSILSIAAILNTISILGFNILFLIIIPLGLVGYFWSNIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GLVLPSLYLIYKISQYNIKYTSLQNKKLQQRLVSYSIPLILNSLGWWINNAIDRYVVIAF
HHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
CGVAVNGIYSVGYKIPSILNIFANIFNQAWILSSVKSYRDEDSEYFFSQVYNKYNMIMVL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ISGLLISCSKILAKFLYMNEFYDAWKFVPFLLIANVFGAISGFAGGIFSAVKDSKIYSQS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TLVGAIVNIIFTFVFVYYYGAIGAAIATMISYFVVWIIRVHTMRKYIKLKIFIRRDVFSY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VLLIFQSIVLWLENSYILYPIQVVLFLLLVMLFYKEIKSIIGELKKFLT
HHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA