| Definition | Streptococcus pneumoniae D39, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008533 |
| Length | 2,046,115 |
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The map label for this gene is mtlR [H]
Identifier: 116516824
GI number: 116516824
Start: 363082
End: 365037
Strand: Direct
Name: mtlR [H]
Synonym: SPD_0361
Alternate gene names: 116516824
Gene position: 363082-365037 (Clockwise)
Preceding gene: 116515741
Following gene: 116515528
Centisome position: 17.74
GC content: 35.33
Gene sequence:
>1956_bases ATGCTATTAACCAAACGAGAAGAACAATTATTGAAGGCTTTCCTACATGTAGGGAAGCTTTCAATGCAAGATATGACTGA AATCTTACAGGTTTCATCTAGAACAATTTATCGAACTTTATCAGATTTGACAGATAGCATGGAGCAATATGGAATCGAAA TAACGAAGCATGGGAAATACTATATTTTGACTGGAGAGTTGGATGATTTGCCGACAGAACTTGAAGTGTTAGTTGAGTAT AGTCCCCAAGAAAGACAAGAGTTGATTACCTATCGCCTTCTGACTGAGAGCGGTTTTGTCACCAATGAAGCATTGCAAGA GTGCACGAAAGTCAGTAATGTAACTATTATTCAGGATATTTCAGATATTGATAAGCGTCTTTTAGACTTTGATCTGAAAA TTGAACGACAAAAAGGTTATCGGATTTCTGGTGATTCAGTTGGTAAGAGAAGATTTTTGGCTATTTTACTGACAAACTGT ATCTCAGTAGCAGATTTTTCAACCGGTAATTTTGGGAGCTTTGATATTTTAGAAGCAGATAGAACTAGGCTGGCCAGTCA GATTGTTAATAAGCAACTGTCAGGTTTTCCAGATATGGATGCTAGGATGAAGATGTTTTTTGCGATCTTGTTATCTCTTA TAGGTCAGGAGCAAAACATTGAAAATTCACCTAATACTAGTAAGCAGGCTTTGGAAATTTCTCAAAAAATTTTTCAAACT TACTCTAAGCAGACTGCACAATTTTATAGTATTCAGGAAATTATCTATTTTGCGAGCATCTTGGATGAATTAATCATTAA ACGTCAGGACAATCCGCTCTTTACGGAGAAATTTGATGGTGAATTTTTCTACAATATTTCAAATCTGATTGATACGGTTT CCATGTATACCAAGATTGACTTTTTTAAGGACAAGGTTTTATTCAATTTTCTTTTCCATCATATTCGGCTCAGTTTAGGC GTCCCTATCCTTTTTCAGGGTGAAAATTTGCCAGAATCTGTCCAGATTTTAGTTGAAAGGAATAAATTTCTTTATACAGT CATCAGTCTTTTAGTGAATGATATTTTTCCGAAATATCTTCATACAGAGTATGAGTATGGCATGATTGCCCTACATTTTA TCTCTAGCTTAGGCCGTAGTCCAGAGATTTATCCAGTCCGTGTTTTGCTTTTAACGGATGAACGTCGGGTCACTAGAGAT TTATTAGTCAGTAAAATTAAGAGTGTTGCTCCTTTTGTAGAGTTGATAGATATTCAGTCTCTAGTAGATTACCACAGTAT TGATCTCAGTCAGTATGATTATATTTTATCTACCAAGCCGCTGAGTAATCAGGAAATCGATGTAATTTCTAGTTTTCCAA CCGTCAAAGAATTGCTTGAATTACAGGAACGACTTCAGTATGTACAGGCACATCGTACAATTGTCGCGCGTGATGCTATC GCTCCAGAGAAAAGTTATGACTTGCAAGATTATTTAATATCTAGTAGTCAGCTTTTGAGTCAATTTGAGTTGGTTCAATT GGAGAATAATCAATCATTTGAGCACACGGTAGAACAAATCATCCAATATCAGAAGAATGTGAGTGACAGAGATTACCTAA CAAGAAAATTGTTATCTCACTTCCAGAATAGTCCTATGGCTATTCCTAATACTGGTCTGGTGCTTTTACATAGTCAGTCT AGCAAAGTAACAACAAATAGTTTTACTATGTTTGAACTCAAACTACCTATCTCCGCATTGTCAATGAAACGAGAGGAAGA AGAGGTCAAAAGGTGTCTGCTAATGCTAATGTCTAAAGAAGCTAGCGAGGAAGCTAGAGATTTAATGACAGCTATTAGTC AGTCGATTATTGAAAATCATCTTTATACAGAGATTTACAAGACGGGAAATCAATCCATTATTTATCAGATGCTAAATACT ATTTTTAACGAAAAAATTAAGAAATTGGAGAACTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases ATTCTCAATTTCTTATTGTGGATAGTTTAGTAACAACACCAGAATATGACAAAATGGCTGCTAGAATGTACAAATAGAAC TAGAGGTTTCTAAATTACGA
Downstream 100 bases:
>100_bases TATGAAACTTGAAAAACATTTGATTAAGCTTAATAAACAATTTTCTAACAAGGAGGAAGCTATTTGTTATTGTGGGCAAG TTCTTTATGAGGGTGGATAT
Product: transcriptional regulator
Products: NA
Alternate protein names: Putative phosphotransferase enzyme IIA component; Putative PTS system EIIA component [H]
Number of amino acids: Translated: 651; Mature: 651
Protein sequence:
>651_residues MLLTKREEQLLKAFLHVGKLSMQDMTEILQVSSRTIYRTLSDLTDSMEQYGIEITKHGKYYILTGELDDLPTELEVLVEY SPQERQELITYRLLTESGFVTNEALQECTKVSNVTIIQDISDIDKRLLDFDLKIERQKGYRISGDSVGKRRFLAILLTNC ISVADFSTGNFGSFDILEADRTRLASQIVNKQLSGFPDMDARMKMFFAILLSLIGQEQNIENSPNTSKQALEISQKIFQT YSKQTAQFYSIQEIIYFASILDELIIKRQDNPLFTEKFDGEFFYNISNLIDTVSMYTKIDFFKDKVLFNFLFHHIRLSLG VPILFQGENLPESVQILVERNKFLYTVISLLVNDIFPKYLHTEYEYGMIALHFISSLGRSPEIYPVRVLLLTDERRVTRD LLVSKIKSVAPFVELIDIQSLVDYHSIDLSQYDYILSTKPLSNQEIDVISSFPTVKELLELQERLQYVQAHRTIVARDAI APEKSYDLQDYLISSSQLLSQFELVQLENNQSFEHTVEQIIQYQKNVSDRDYLTRKLLSHFQNSPMAIPNTGLVLLHSQS SKVTTNSFTMFELKLPISALSMKREEEEVKRCLLMLMSKEASEEARDLMTAISQSIIENHLYTEIYKTGNQSIIYQMLNT IFNEKIKKLEN
Sequences:
>Translated_651_residues MLLTKREEQLLKAFLHVGKLSMQDMTEILQVSSRTIYRTLSDLTDSMEQYGIEITKHGKYYILTGELDDLPTELEVLVEY SPQERQELITYRLLTESGFVTNEALQECTKVSNVTIIQDISDIDKRLLDFDLKIERQKGYRISGDSVGKRRFLAILLTNC ISVADFSTGNFGSFDILEADRTRLASQIVNKQLSGFPDMDARMKMFFAILLSLIGQEQNIENSPNTSKQALEISQKIFQT YSKQTAQFYSIQEIIYFASILDELIIKRQDNPLFTEKFDGEFFYNISNLIDTVSMYTKIDFFKDKVLFNFLFHHIRLSLG VPILFQGENLPESVQILVERNKFLYTVISLLVNDIFPKYLHTEYEYGMIALHFISSLGRSPEIYPVRVLLLTDERRVTRD LLVSKIKSVAPFVELIDIQSLVDYHSIDLSQYDYILSTKPLSNQEIDVISSFPTVKELLELQERLQYVQAHRTIVARDAI APEKSYDLQDYLISSSQLLSQFELVQLENNQSFEHTVEQIIQYQKNVSDRDYLTRKLLSHFQNSPMAIPNTGLVLLHSQS SKVTTNSFTMFELKLPISALSMKREEEEVKRCLLMLMSKEASEEARDLMTAISQSIIENHLYTEIYKTGNQSIIYQMLNT IFNEKIKKLEN >Mature_651_residues MLLTKREEQLLKAFLHVGKLSMQDMTEILQVSSRTIYRTLSDLTDSMEQYGIEITKHGKYYILTGELDDLPTELEVLVEY SPQERQELITYRLLTESGFVTNEALQECTKVSNVTIIQDISDIDKRLLDFDLKIERQKGYRISGDSVGKRRFLAILLTNC ISVADFSTGNFGSFDILEADRTRLASQIVNKQLSGFPDMDARMKMFFAILLSLIGQEQNIENSPNTSKQALEISQKIFQT YSKQTAQFYSIQEIIYFASILDELIIKRQDNPLFTEKFDGEFFYNISNLIDTVSMYTKIDFFKDKVLFNFLFHHIRLSLG VPILFQGENLPESVQILVERNKFLYTVISLLVNDIFPKYLHTEYEYGMIALHFISSLGRSPEIYPVRVLLLTDERRVTRD LLVSKIKSVAPFVELIDIQSLVDYHSIDLSQYDYILSTKPLSNQEIDVISSFPTVKELLELQERLQYVQAHRTIVARDAI APEKSYDLQDYLISSSQLLSQFELVQLENNQSFEHTVEQIIQYQKNVSDRDYLTRKLLSHFQNSPMAIPNTGLVLLHSQS SKVTTNSFTMFELKLPISALSMKREEEEVKRCLLMLMSKEASEEARDLMTAISQSIIENHLYTEIYKTGNQSIIYQMLNT IFNEKIKKLEN
Specific function: Not necessary for mannitol utilization. May be involved in regulation of the mannitol phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system (PTS) [H]
COG id: COG3711
COG function: function code K; Transcriptional antiterminator
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 1 PTS EIIA type-2 domain [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR013196 - InterPro: IPR011608 - InterPro: IPR016152 - InterPro: IPR002178 - InterPro: IPR011991 [H]
Pfam domain/function: PF08279 HTH_11; PF00359 PTS_EIIA_2 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 75370; Mature: 75370
Theoretical pI: Translated: 4.95; Mature: 4.95
Prosite motif: PS51000 HTH_DEOR_2 ; PS51094 PTS_EIIA_TYPE_2
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 2.5 %Met (Translated Protein) 2.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 2.5 %Met (Mature Protein) 2.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLLTKREEQLLKAFLHVGKLSMQDMTEILQVSSRTIYRTLSDLTDSMEQYGIEITKHGKY CCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCE YILTGELDDLPTELEVLVEYSPQERQELITYRLLTESGFVTNEALQECTKVSNVTIIQDI EEEECCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEHHH SDIDKRLLDFDLKIERQKGYRISGDSVGKRRFLAILLTNCISVADFSTGNFGSFDILEAD HHHHHHHHCCCCEEECCCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEHHH RTRLASQIVNKQLSGFPDMDARMKMFFAILLSLIGQEQNIENSPNTSKQALEISQKIFQT HHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH YSKQTAQFYSIQEIIYFASILDELIIKRQDNPLFTEKFDGEFFYNISNLIDTVSMYTKID HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHH FFKDKVLFNFLFHHIRLSLGVPILFQGENLPESVQILVERNKFLYTVISLLVNDIFPKYL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HTEYEYGMIALHFISSLGRSPEIYPVRVLLLTDERRVTRDLLVSKIKSVAPFVELIDIQS CCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LVDYHSIDLSQYDYILSTKPLSNQEIDVISSFPTVKELLELQERLQYVQAHRTIVARDAI HHHHHHCCHHHCCCEEECCCCCCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC APEKSYDLQDYLISSSQLLSQFELVQLENNQSFEHTVEQIIQYQKNVSDRDYLTRKLLSH CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH FQNSPMAIPNTGLVLLHSQSSKVTTNSFTMFELKLPISALSMKREEEEVKRCLLMLMSKE HCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCEEECCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ASEEARDLMTAISQSIIENHLYTEIYKTGNQSIIYQMLNTIFNEKIKKLEN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MLLTKREEQLLKAFLHVGKLSMQDMTEILQVSSRTIYRTLSDLTDSMEQYGIEITKHGKY CCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCE YILTGELDDLPTELEVLVEYSPQERQELITYRLLTESGFVTNEALQECTKVSNVTIIQDI EEEECCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEHHH SDIDKRLLDFDLKIERQKGYRISGDSVGKRRFLAILLTNCISVADFSTGNFGSFDILEAD HHHHHHHHCCCCEEECCCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEHHH RTRLASQIVNKQLSGFPDMDARMKMFFAILLSLIGQEQNIENSPNTSKQALEISQKIFQT HHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH YSKQTAQFYSIQEIIYFASILDELIIKRQDNPLFTEKFDGEFFYNISNLIDTVSMYTKID HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHH FFKDKVLFNFLFHHIRLSLGVPILFQGENLPESVQILVERNKFLYTVISLLVNDIFPKYL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HTEYEYGMIALHFISSLGRSPEIYPVRVLLLTDERRVTRDLLVSKIKSVAPFVELIDIQS CCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LVDYHSIDLSQYDYILSTKPLSNQEIDVISSFPTVKELLELQERLQYVQAHRTIVARDAI HHHHHHCCHHHCCCEEECCCCCCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC APEKSYDLQDYLISSSQLLSQFELVQLENNQSFEHTVEQIIQYQKNVSDRDYLTRKLLSH CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH FQNSPMAIPNTGLVLLHSQSSKVTTNSFTMFELKLPISALSMKREEEEVKRCLLMLMSKE HCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCEEECCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ASEEARDLMTAISQSIIENHLYTEIYKTGNQSIIYQMLNTIFNEKIKKLEN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 10878121; 12397186; 1322373 [H]