| Definition | Streptococcus pneumoniae D39, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008533 |
| Length | 2,046,115 |
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The map label for this gene is 116516569
Identifier: 116516569
GI number: 116516569
Start: 1095236
End: 1098421
Strand: Reverse
Name: 116516569
Synonym: SPD_1071
Alternate gene names: NA
Gene position: 1098421-1095236 (Counterclockwise)
Preceding gene: 116515946
Following gene: 116515728
Centisome position: 53.68
GC content: 26.33
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases AATTTGTAAAAAAGAGAATAAAAGGTAGACGACGCCTCAGTAAAAATTGGCCCGGAAAAAAGCGAAGTTCGAAGCACTGA AGGGGGAGTAGAAAGCAAAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1061; Mature: 1061
Protein sequence:
>1061_residues MEDDLNYENLMDDVTEAIKKFNLVIFIGAGVSIAQGYPNWNNYIEHLIKYWQGQVLSVSGEKRLGREHHVVFDLISKSSI SNKRKVDLVNYELKKVFGEDFEKRRLDFEKGYFKNLLPYSIVNQTVESLASLNAIFITSNYDYEIENHIKRLKNAVVTIN DLNEFTKNKNGKLQFGDVLHIHGTPDCDVKYFVSSSADYSKTYLKNRENFENLVTWFKETKPTVLFVGAGLEEDEILSLL CKDSKNYALMKSENTGNQRVDEHYRGVVEGFFSSENHTQIIWYGDEFEKLPLFVKKLVADINEKLGTHDFYNQWNNLLNP SINQEEYNKNLDSISNDFKYLSSVLDKVIENDNNQLDQLMLNALLRSETLTVIKKNFVLAFWRFIVKNIEKLSDNEWDVI YKIIYEGSQNYFIDDVFFVYNYAIDNKISSFTNNNKLNELREIISKDGYIVNSNFNKDKTLLGYWLVSAFEQQNRDLYIK EDSEVEVNLNYECVNKLMSILNNPEFLSYNYYSIEHQLKEYDVVKFLYELVKSKKLFIEEEKFLESDSEDLISTILIQKL LVQLDNEINLDLEFIKRLIDKIDFSNIHFGEELNTFIKEHRSIIREKNIEIPKKPYRNWISSLEGGFVSQFSYLTQENLV EYDESRVLEILVNAEKEQRGSSFLEEKTINETENFFITVLKESNEISKKVSDLLKNHIDDLYPKYKRLYVKIISFPEIEE NLRKIVREKYLKRFNKESFDSNDRKFFEYHIKQQNTDIDIFEKLLSINVNELSTPKGDNKQLDILHFINSEMGSYFQCLI SLFINHSSYRDVIIQIINSVTDTDYREFAQGILLNEYNPNRINVTYNTFLGFAYYHSIITIEAADVFTDVVRDILNKKIE DNQILNKVYLVALERVDPTIESFSLSKNNYSQMINIIFTGDYEFRYSKEWLGALFKFDSSANYLVTIFYLLYNENLKKNR FALFIEELSDYLTTYNQKLSLRGMNYKLNHEELNNFDLLKKMFLKLMETDKIENDIFYLDGIKSILPLLSLDDRRNVLQH IQKQNNCPPPEIEELQRIIVN
Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 125268; Mature: 125268
Theoretical pI: Translated: 4.88; Mature: 4.88
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 0.9 %Met (Translated Protein) 1.4 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 0.9 %Met (Mature Protein) 1.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MEDDLNYENLMDDVTEAIKKFNLVIFIGAGVSIAQGYPNWNNYIEHLIKYWQGQVLSVSG CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEECC EKRLGREHHVVFDLISKSSISNKRKVDLVNYELKKVFGEDFEKRRLDFEKGYFKNLLPYS HHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCHHHHHHHHCCCHH IVNQTVESLASLNAIFITSNYDYEIENHIKRLKNAVVTINDLNEFTKNKNGKLQFGDVLH HHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHEEEEHHHHHHHCCCCCCEEECCEEE IHGTPDCDVKYFVSSSADYSKTYLKNRENFENLVTWFKETKPTVLFVGAGLEEDEILSLL ECCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHH CKDSKNYALMKSENTGNQRVDEHYRGVVEGFFSSENHTQIIWYGDEFEKLPLFVKKLVAD HCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHH INEKLGTHDFYNQWNNLLNPSINQEEYNKNLDSISNDFKYLSSVLDKVIENDNNQLDQLM HHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHH LNALLRSETLTVIKKNFVLAFWRFIVKNIEKLSDNEWDVIYKIIYEGSQNYFIDDVFFVY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHEEEECCCCCCHHHHHHHH NYAIDNKISSFTNNNKLNELREIISKDGYIVNSNFNKDKTLLGYWLVSAFEQQNRDLYIK HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEE EDSEVEVNLNYECVNKLMSILNNPEFLSYNYYSIEHQLKEYDVVKFLYELVKSKKLFIEE CCCEEEEECCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCH EKFLESDSEDLISTILIQKLLVQLDNEINLDLEFIKRLIDKIDFSNIHFGEELNTFIKEH HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHH RSIIREKNIEIPKKPYRNWISSLEGGFVSQFSYLTQENLVEYDESRVLEILVNAEKEQRG HHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH SSFLEEKTINETENFFITVLKESNEISKKVSDLLKNHIDDLYPKYKRLYVKIISFPEIEE HHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH NLRKIVREKYLKRFNKESFDSNDRKFFEYHIKQQNTDIDIFEKLLSINVNELSTPKGDNK HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCHHCCCCCCCCC QLDILHFINSEMGSYFQCLISLFINHSSYRDVIIQIINSVTDTDYREFAQGILLNEYNPN CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCEEECCCCC RINVTYNTFLGFAYYHSIITIEAADVFTDVVRDILNKKIEDNQILNKVYLVALERVDPTI EEEEEHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH ESFSLSKNNYSQMINIIFTGDYEFRYSKEWLGALFKFDSSANYLVTIFYLLYNENLKKNR HHHCCCCCCCCCEEEEEEECCCCEEECHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHH FALFIEELSDYLTTYNQKLSLRGMNYKLNHEELNNFDLLKKMFLKLMETDKIENDIFYLD HHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCEEECHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEC GIKSILPLLSLDDRRNVLQHIQKQNNCPPPEIEELQRIIVN CHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MEDDLNYENLMDDVTEAIKKFNLVIFIGAGVSIAQGYPNWNNYIEHLIKYWQGQVLSVSG CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEECC EKRLGREHHVVFDLISKSSISNKRKVDLVNYELKKVFGEDFEKRRLDFEKGYFKNLLPYS HHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCHHHHHHHHCCCHH IVNQTVESLASLNAIFITSNYDYEIENHIKRLKNAVVTINDLNEFTKNKNGKLQFGDVLH HHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHEEEEHHHHHHHCCCCCCEEECCEEE IHGTPDCDVKYFVSSSADYSKTYLKNRENFENLVTWFKETKPTVLFVGAGLEEDEILSLL ECCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHH CKDSKNYALMKSENTGNQRVDEHYRGVVEGFFSSENHTQIIWYGDEFEKLPLFVKKLVAD HCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHH INEKLGTHDFYNQWNNLLNPSINQEEYNKNLDSISNDFKYLSSVLDKVIENDNNQLDQLM HHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHH LNALLRSETLTVIKKNFVLAFWRFIVKNIEKLSDNEWDVIYKIIYEGSQNYFIDDVFFVY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHEEEECCCCCCHHHHHHHH NYAIDNKISSFTNNNKLNELREIISKDGYIVNSNFNKDKTLLGYWLVSAFEQQNRDLYIK HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEE EDSEVEVNLNYECVNKLMSILNNPEFLSYNYYSIEHQLKEYDVVKFLYELVKSKKLFIEE CCCEEEEECCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCH EKFLESDSEDLISTILIQKLLVQLDNEINLDLEFIKRLIDKIDFSNIHFGEELNTFIKEH HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHH RSIIREKNIEIPKKPYRNWISSLEGGFVSQFSYLTQENLVEYDESRVLEILVNAEKEQRG HHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH SSFLEEKTINETENFFITVLKESNEISKKVSDLLKNHIDDLYPKYKRLYVKIISFPEIEE HHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH NLRKIVREKYLKRFNKESFDSNDRKFFEYHIKQQNTDIDIFEKLLSINVNELSTPKGDNK HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCHHCCCCCCCCC QLDILHFINSEMGSYFQCLISLFINHSSYRDVIIQIINSVTDTDYREFAQGILLNEYNPN CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCEEECCCCC RINVTYNTFLGFAYYHSIITIEAADVFTDVVRDILNKKIEDNQILNKVYLVALERVDPTI EEEEEHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH ESFSLSKNNYSQMINIIFTGDYEFRYSKEWLGALFKFDSSANYLVTIFYLLYNENLKKNR HHHCCCCCCCCCEEEEEEECCCCEEECHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHH FALFIEELSDYLTTYNQKLSLRGMNYKLNHEELNNFDLLKKMFLKLMETDKIENDIFYLD HHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCEEECHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEC GIKSILPLLSLDDRRNVLQHIQKQNNCPPPEIEELQRIIVN CHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
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Specific activity: NA
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Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA