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The map label for this gene is flhA [H]

Identifier: 116515091

GI number: 116515091

Start: 179257

End: 181356

Strand: Direct

Name: flhA [H]

Synonym: BCc_151

Alternate gene names: 116515091

Gene position: 179257-181356 (Clockwise)

Preceding gene: 116515090

Following gene: 116515093

Centisome position: 43.05

GC content: 19.38

Gene sequence:

>2100_bases
TTGGAGAATAATTCATTGATAAAAAATATATCTCTTTTATTTAATTACTTTAAAAAAATTATTTATAAAAATTTGAATTC
TTTATTTTTTCCCTTTTTAATTTTAAGTATTCTCTGTTTACTTATACTTCCCTTACCAACTTTTGTTTTAGATTTATTTT
TTACATTTAATATTATTTTTTCTATTATTATTTTAATTGTTTCTATTTTTGTTGTTAAAATTCTTGATTTTTCTTCTTTT
CCTACAATTTTATTATTTTCAACTTTATTTCGTTTATCACTAAATATTTCTTCTACACGAATAATTTTATTAAATGGACA
TACAGGATCTTGTTCTGCGGGGCATGTTATAGAATCATTTGGTTTTTTTTTAATTCGTGGAAATTTTTTTATTGGTATTA
TTATATTTATAATGCTAGTAATTATAAATTTTTCGGTTATTTCAAATGGTTCTAGTAGAATTGCTGAAGTAGGAGCAAGA
TTTATTCTTGATGCTATGCCTGGTAAACAAATGGCCATAGATGCAGATTTAAATTCTGGATTAATTTCAGAAAAACAAGC
GAAAAAAAGAAGGTTAGAAATTCATAAAGAAGCTGAGTTTTATGGTTCTATGGATGGAGCTAGTAAATTTATTAGAGGAG
ATGCAATTGCTGGAATTATTATAATGATAGTAAATGTTATAGGAGGATTATTAATTGGTATAGTTCAATATAAAATGTCT
TTATTAAAAGCTATAAAGATATATAGTATATTAACTATTGGTGATGGTTTAGTTTCACAAATTCCTTCTTTAATTATATC
TATTGCTTCCGGAATAATTTTAACACGATCAAATTCTGATAAAATTAATATTGGTGAAAAAATAATTTATCAAGTTTTTA
ATAATTCTAAAGTTATTTTCTTTAGTAGTATTATTTTTTGTTTTTTTGGTTTAATTCCAGGTATGCCTAATTTTATTTTT
TTGTTTTTTTCTGTTTTATTTTTTATACTGTCATGGTATATAAATTATCGAAAAAATATAAATAAAAATTTTTCTAAAAT
ATTAAAATTTAAAAAAAGAAAAAAAATAGATATATCTTGGAATGATATTGAATTTGAAGATTTATTAAGAATAGAATTGA
GTTCTATATTTTTTAAACTATGTTATCAAAAAGAATATAATAATTTAATAAAAAAATTACAATTTTTAAGAAAAAATATT
GCTCAAGATTATGGTTTTTTATTACCTGAAATTAATATAATTCATAATTCTAAATTAGATAGAGGACAATATAAAATTTT
TATTAAAGGGGTAGAATTATTTAGTGGATTTATTTTTTTTGATAAATTATTAATAATTAATAAAGAAAGAGATTTAATTA
ATATTTCTGGTATAAAAATAACTGATTCTTTTTTTAGTTTTCCTGTTTTTTGGATTAATCCTGTAATTAAAGATACGCTT
TTAAATAAAAAAATTGTTTTTTTAGATTCTAATGTTTTAATTATAAAAAATTTTAATAAAATTATTAGAAATAATTTATA
TAATTTATTTGGATTTCAAGAAACACAGCAATTATTAGATCGTATATCACAGCATTATCCTAAATTAATTGATTATTTAA
TACCTAATTTAATGTCAATAATTACTTTTCAGAACATTTTACAAAATCTATTAAAAGATGATATATCAATAAAAGATATA
AGAACAATTGTAGAAACTTTAATAAAATATAGTAGTCAATTTAAAAATAATATTGAAGAATTAACGAATATAATTCGAAT
TGCATTAAAAGAATTTATTACACAAAAATTTTTTTTTAAAAATAAATATATTAATGTTATTGGATTGAGCACTAATTTTG
AAAACATATTATTAAAATTTGTTGGTAATAATAAAAATCAAATTGAACCAATTTTTTCAGAAAAATTAATTGAAAAAACT
AAATCTGCAATAATTTTACAAAAAAAAAATAATCTTCCTGTTGTTTTATTAGTTAATCCTAAAATAAGAGTTTTACTATC
AAATTTTTTTTTAAATTGTAATATTATACTTCCAGTTTTATCTTTTTCAGAGATTTCTGAAAATCGTGTAATTAAAATTA
CACAATTTATCGATAAGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AATTTTGGCATGGGCGTGGAAATTAAAATATTGGAAACAACATGGTGGAATTTATCCAACACAACCTACTATATTTTTTA
ATAATTCATAATTTATATTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GTTATTTATTTTTACATTTTTGATACTGTTTTTATTCCTAAAAAGTATAAACATTTTTTAATTATTTTAGAAGTTAAAAT
AGATAATTTAATTCTACTTA

Product: FlhA

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 699; Mature: 699

Protein sequence:

>699_residues
MENNSLIKNISLLFNYFKKIIYKNLNSLFFPFLILSILCLLILPLPTFVLDLFFTFNIIFSIIILIVSIFVVKILDFSSF
PTILLFSTLFRLSLNISSTRIILLNGHTGSCSAGHVIESFGFFLIRGNFFIGIIIFIMLVIINFSVISNGSSRIAEVGAR
FILDAMPGKQMAIDADLNSGLISEKQAKKRRLEIHKEAEFYGSMDGASKFIRGDAIAGIIIMIVNVIGGLLIGIVQYKMS
LLKAIKIYSILTIGDGLVSQIPSLIISIASGIILTRSNSDKINIGEKIIYQVFNNSKVIFFSSIIFCFFGLIPGMPNFIF
LFFSVLFFILSWYINYRKNINKNFSKILKFKKRKKIDISWNDIEFEDLLRIELSSIFFKLCYQKEYNNLIKKLQFLRKNI
AQDYGFLLPEINIIHNSKLDRGQYKIFIKGVELFSGFIFFDKLLIINKERDLINISGIKITDSFFSFPVFWINPVIKDTL
LNKKIVFLDSNVLIIKNFNKIIRNNLYNLFGFQETQQLLDRISQHYPKLIDYLIPNLMSIITFQNILQNLLKDDISIKDI
RTIVETLIKYSSQFKNNIEELTNIIRIALKEFITQKFFFKNKYINVIGLSTNFENILLKFVGNNKNQIEPIFSEKLIEKT
KSAIILQKKNNLPVVLLVNPKIRVLLSNFFLNCNIILPVLSFSEISENRVIKITQFIDK

Sequences:

>Translated_699_residues
MENNSLIKNISLLFNYFKKIIYKNLNSLFFPFLILSILCLLILPLPTFVLDLFFTFNIIFSIIILIVSIFVVKILDFSSF
PTILLFSTLFRLSLNISSTRIILLNGHTGSCSAGHVIESFGFFLIRGNFFIGIIIFIMLVIINFSVISNGSSRIAEVGAR
FILDAMPGKQMAIDADLNSGLISEKQAKKRRLEIHKEAEFYGSMDGASKFIRGDAIAGIIIMIVNVIGGLLIGIVQYKMS
LLKAIKIYSILTIGDGLVSQIPSLIISIASGIILTRSNSDKINIGEKIIYQVFNNSKVIFFSSIIFCFFGLIPGMPNFIF
LFFSVLFFILSWYINYRKNINKNFSKILKFKKRKKIDISWNDIEFEDLLRIELSSIFFKLCYQKEYNNLIKKLQFLRKNI
AQDYGFLLPEINIIHNSKLDRGQYKIFIKGVELFSGFIFFDKLLIINKERDLINISGIKITDSFFSFPVFWINPVIKDTL
LNKKIVFLDSNVLIIKNFNKIIRNNLYNLFGFQETQQLLDRISQHYPKLIDYLIPNLMSIITFQNILQNLLKDDISIKDI
RTIVETLIKYSSQFKNNIEELTNIIRIALKEFITQKFFFKNKYINVIGLSTNFENILLKFVGNNKNQIEPIFSEKLIEKT
KSAIILQKKNNLPVVLLVNPKIRVLLSNFFLNCNIILPVLSFSEISENRVIKITQFIDK
>Mature_699_residues
MENNSLIKNISLLFNYFKKIIYKNLNSLFFPFLILSILCLLILPLPTFVLDLFFTFNIIFSIIILIVSIFVVKILDFSSF
PTILLFSTLFRLSLNISSTRIILLNGHTGSCSAGHVIESFGFFLIRGNFFIGIIIFIMLVIINFSVISNGSSRIAEVGAR
FILDAMPGKQMAIDADLNSGLISEKQAKKRRLEIHKEAEFYGSMDGASKFIRGDAIAGIIIMIVNVIGGLLIGIVQYKMS
LLKAIKIYSILTIGDGLVSQIPSLIISIASGIILTRSNSDKINIGEKIIYQVFNNSKVIFFSSIIFCFFGLIPGMPNFIF
LFFSVLFFILSWYINYRKNINKNFSKILKFKKRKKIDISWNDIEFEDLLRIELSSIFFKLCYQKEYNNLIKKLQFLRKNI
AQDYGFLLPEINIIHNSKLDRGQYKIFIKGVELFSGFIFFDKLLIINKERDLINISGIKITDSFFSFPVFWINPVIKDTL
LNKKIVFLDSNVLIIKNFNKIIRNNLYNLFGFQETQQLLDRISQHYPKLIDYLIPNLMSIITFQNILQNLLKDDISIKDI
RTIVETLIKYSSQFKNNIEELTNIIRIALKEFITQKFFFKNKYINVIGLSTNFENILLKFVGNNKNQIEPIFSEKLIEKT
KSAIILQKKNNLPVVLLVNPKIRVLLSNFFLNCNIILPVLSFSEISENRVIKITQFIDK

Specific function: Required for formation of the rod structure of the flagellar apparatus. Together with fliI and fliH, may constitute the export apparatus of flagellin [H]

COG id: COG1298

COG function: function code NU; Flagellar biosynthesis pathway, component FlhA

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the FHIPEP (flagella/HR/invasion proteins export pore) family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1788187, Length=692, Percent_Identity=43.4971098265896, Blast_Score=623, Evalue=1e-179,

Paralogues:

None

Copy number: 10-20 (rich media) [C]

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR006301
- InterPro:   IPR001712 [H]

Pfam domain/function: PF00771 FHIPEP [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 80589; Mature: 80589

Theoretical pI: Translated: 10.27; Mature: 10.27

Prosite motif: PS00994 FHIPEP

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
1.3 %Met     (Translated Protein)
2.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
1.3 %Met     (Mature Protein)
2.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MENNSLIKNISLLFNYFKKIIYKNLNSLFFPFLILSILCLLILPLPTFVLDLFFTFNIIF
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SIIILIVSIFVVKILDFSSFPTILLFSTLFRLSLNISSTRIILLNGHTGSCSAGHVIESF
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHC
GFFLIRGNFFIGIIIFIMLVIINFSVISNGSSRIAEVGARFILDAMPGKQMAIDADLNSG
CEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCC
LISEKQAKKRRLEIHKEAEFYGSMDGASKFIRGDAIAGIIIMIVNVIGGLLIGIVQYKMS
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLKAIKIYSILTIGDGLVSQIPSLIISIASGIILTRSNSDKINIGEKIIYQVFNNSKVIF
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEH
FSSIIFCFFGLIPGMPNFIFLFFSVLFFILSWYINYRKNINKNFSKILKFKKRKKIDISW
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCEECCC
NDIEFEDLLRIELSSIFFKLCYQKEYNNLIKKLQFLRKNIAQDYGFLLPEINIIHNSKLD
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCC
RGQYKIFIKGVELFSGFIFFDKLLIINKERDLINISGIKITDSFFSFPVFWINPVIKDTL
CCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCEEEECCEEEEHHHHHCHHHHHHHHHHHHH
LNKKIVFLDSNVLIIKNFNKIIRNNLYNLFGFQETQQLLDRISQHYPKLIDYLIPNLMSI
CCCEEEEEECCEEEEECHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ITFQNILQNLLKDDISIKDIRTIVETLIKYSSQFKNNIEELTNIIRIALKEFITQKFFFK
HHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NKYINVIGLSTNFENILLKFVGNNKNQIEPIFSEKLIEKTKSAIILQKKNNLPVVLLVNP
CCCEEEEEECCCHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCEEEEECC
KIRVLLSNFFLNCNIILPVLSFSEISENRVIKITQFIDK
HHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHCCCCCEEEHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MENNSLIKNISLLFNYFKKIIYKNLNSLFFPFLILSILCLLILPLPTFVLDLFFTFNIIF
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SIIILIVSIFVVKILDFSSFPTILLFSTLFRLSLNISSTRIILLNGHTGSCSAGHVIESF
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHC
GFFLIRGNFFIGIIIFIMLVIINFSVISNGSSRIAEVGARFILDAMPGKQMAIDADLNSG
CEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCC
LISEKQAKKRRLEIHKEAEFYGSMDGASKFIRGDAIAGIIIMIVNVIGGLLIGIVQYKMS
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLKAIKIYSILTIGDGLVSQIPSLIISIASGIILTRSNSDKINIGEKIIYQVFNNSKVIF
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEH
FSSIIFCFFGLIPGMPNFIFLFFSVLFFILSWYINYRKNINKNFSKILKFKKRKKIDISW
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCEECCC
NDIEFEDLLRIELSSIFFKLCYQKEYNNLIKKLQFLRKNIAQDYGFLLPEINIIHNSKLD
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCC
RGQYKIFIKGVELFSGFIFFDKLLIINKERDLINISGIKITDSFFSFPVFWINPVIKDTL
CCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCEEEECCEEEEHHHHHCHHHHHHHHHHHHH
LNKKIVFLDSNVLIIKNFNKIIRNNLYNLFGFQETQQLLDRISQHYPKLIDYLIPNLMSI
CCCEEEEEECCEEEEECHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ITFQNILQNLLKDDISIKDIRTIVETLIKYSSQFKNNIEELTNIIRIALKEFITQKFFFK
HHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NKYINVIGLSTNFENILLKFVGNNKNQIEPIFSEKLIEKTKSAIILQKKNNLPVVLLVNP
CCCEEEEEECCCHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCEEEEECC
KIRVLLSNFFLNCNIILPVLSFSEISENRVIKITQFIDK
HHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHCCCCCEEEHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9097040; 9278503 [H]