Definition Pediococcus pentosaceus ATCC 25745, complete genome.
Accession NC_008525
Length 1,832,387

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 116493430

Identifier: 116493430

GI number: 116493430

Start: 1677920

End: 1679773

Strand: Reverse

Name: 116493430

Synonym: PEPE_1702

Alternate gene names: NA

Gene position: 1679773-1677920 (Counterclockwise)

Preceding gene: 116493431

Following gene: 116493429

Centisome position: 91.67

GC content: 37.86

Gene sequence:

>1854_bases
ATGTCAATATCGGGATTAATCGTCTTTATCATGGCCCAAATTGGATATACTGGGATGGTTCGCATGGCAGGTGTGAATAA
ATACATGTCCTGGATTACATCGATGGTAATTCAAACGTTGCTATTGTATGTTTTGGCGATGCTAAATTGGTTAAAATTTG
GACTAAAAGCAGTCGTTATTTTAGGCTGCATTTTTGTAGTAGTTCGAATTGGAACAATTATTTTCCGAGTGGGAAAGCTG
CCCTTTGAGGGTATCCATTATTTTGACGTTTGGATGATTGCTATCGGAATTATTATGGGACGCATCCTATTTGCCAGCCC
GTTGATCCACTATGATAATTATTCACATTGGGCATTAATCGTAAAATACCTCCTATTTCAAGGTCATCTGCCAGTTGCGG
CAGATACCATTATTTCATTTACTTCTTATCCACCAGCAACGGCTTTATTCATTACCCAGTTTGTATCATGGGTAGGCTTT
AGCGATGGTGCCATGTTACTAGGACAGTTTTTATTGATTTGGGCCAGTATCTACGGGATATTTGCGGTTTTACGCGATCG
GACCCGTTCAACCAACTCATTTGTAATCTGTTTTACTGTTTCAATTATTAATATTTTTAATATTTCAATTCGAATGAATA
ATTTATTAGTTGATTTTGTCCTTCCGGTAGTCGCCGCCGCAGGATTTGCGGGAGTTTATGCTTACCGTCGCTCGCCTTGG
TTGCAGTGTGCTACAGCGTCTTTATTTAGTGCGGAACTTTTACTGATTAAGAATTCTGGAACGATGTATGTAGTGATGCT
AGGCTGTTATTTGTTGTATTCTTTAGTTACCAATGGACAAGGTCAACGCTGGAAACGTCTGGGTAAAGGCATCAGCAAAA
CCGTTGTGACAATGGGACTAGGCTATTTACCATTCTTCTGGTGGAATCAGCATGTGCATGCAACTTTCAGCGCTGTGTCA
AAACATCAAATTAGTACAGATGCGTACAAGAGTCAGTTAGCCCATGAAAGTTCAGCCGTAATTGCTAAAATTGGAAGTAA
ATTTTTACATCAGATTTTGAGTTTTAACTCGCTATCGACGCGTGGAGTATTACTTATTAACGTCGGTCTACTCGGAGCTT
GGATTATTATTCGCTGGTTTTTACGTAAAAAGAATAACCTGCTAAAAAGTTTAATAGCTAGTGATATCAGTTTTATCGCC
TATTACATCAGTGTATTTGCGATGTATATTGTTTCAATGCCCTATGCAGAAGCAATCCTGTTAGATGGATCTGAACGCTA
TCTTTCAAGTATGGTGATTCTAAACCTGCTATTAGCGACCATGGTGCTGGTTGTAGCGATGGACCGAGCTAGTTTTGAAG
AAGATGTTAGTAAACGAGGGATCCGATCTTTCAGGAATGTTATTACCAAAAATGTTTATCAGTTGTCATCATTGGTTTTA
ATGTTGTTTGCCTCCATTTTGATGTTCTCTGAAATTAACGGAGTTAAGTATAATAACACCTTAGGTAAAGAACAATTACC
GGTACAATTAAAACAAATAGCTCAGCAGAGTACCCAGTACAACCATCAGAAAATTTTATTAGTTGACCCACATTTTAATG
ATGTAAATAATTATTACGCGGGTTATGTGGGACGCTATTATTTCTTTTCCGATCAAGTTGTTGGACAGGAAAACTTCATG
ATGTCTCAAGCGGAGTTCAAAAACACCATTAAACAGTATGATTATGTGGTGTTACCTGAATGGCATCGAACATTTACGAC
CATGCTGGAAAAAACGTACCATCAGGATTATAAAACGGGGTTATTTAAAGTCACCAAAGATGGTTTACAAAAAGTAAATA
AAATTAATGTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTTCATTTAAATGTTATTCTAAGAATGAAAGAATTAGAAAGAAATGCTACTCAATTTATGAGACAACGGTAATTAGTTTA
AGAAATTGTAGGTGTATTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GAGTAAGCTGAAAATGACAAGTGAATTGTGATTTTCAGCTTTTTTAGTACTTTAAGTATAATAAGAGGAATAGAAGTAGA
TTAATAATAGAATTAAGCGT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 617; Mature: 616

Protein sequence:

>617_residues
MSISGLIVFIMAQIGYTGMVRMAGVNKYMSWITSMVIQTLLLYVLAMLNWLKFGLKAVVILGCIFVVVRIGTIIFRVGKL
PFEGIHYFDVWMIAIGIIMGRILFASPLIHYDNYSHWALIVKYLLFQGHLPVAADTIISFTSYPPATALFITQFVSWVGF
SDGAMLLGQFLLIWASIYGIFAVLRDRTRSTNSFVICFTVSIINIFNISIRMNNLLVDFVLPVVAAAGFAGVYAYRRSPW
LQCATASLFSAELLLIKNSGTMYVVMLGCYLLYSLVTNGQGQRWKRLGKGISKTVVTMGLGYLPFFWWNQHVHATFSAVS
KHQISTDAYKSQLAHESSAVIAKIGSKFLHQILSFNSLSTRGVLLINVGLLGAWIIIRWFLRKKNNLLKSLIASDISFIA
YYISVFAMYIVSMPYAEAILLDGSERYLSSMVILNLLLATMVLVVAMDRASFEEDVSKRGIRSFRNVITKNVYQLSSLVL
MLFASILMFSEINGVKYNNTLGKEQLPVQLKQIAQQSTQYNHQKILLVDPHFNDVNNYYAGYVGRYYFFSDQVVGQENFM
MSQAEFKNTIKQYDYVVLPEWHRTFTTMLEKTYHQDYKTGLFKVTKDGLQKVNKINV

Sequences:

>Translated_617_residues
MSISGLIVFIMAQIGYTGMVRMAGVNKYMSWITSMVIQTLLLYVLAMLNWLKFGLKAVVILGCIFVVVRIGTIIFRVGKL
PFEGIHYFDVWMIAIGIIMGRILFASPLIHYDNYSHWALIVKYLLFQGHLPVAADTIISFTSYPPATALFITQFVSWVGF
SDGAMLLGQFLLIWASIYGIFAVLRDRTRSTNSFVICFTVSIINIFNISIRMNNLLVDFVLPVVAAAGFAGVYAYRRSPW
LQCATASLFSAELLLIKNSGTMYVVMLGCYLLYSLVTNGQGQRWKRLGKGISKTVVTMGLGYLPFFWWNQHVHATFSAVS
KHQISTDAYKSQLAHESSAVIAKIGSKFLHQILSFNSLSTRGVLLINVGLLGAWIIIRWFLRKKNNLLKSLIASDISFIA
YYISVFAMYIVSMPYAEAILLDGSERYLSSMVILNLLLATMVLVVAMDRASFEEDVSKRGIRSFRNVITKNVYQLSSLVL
MLFASILMFSEINGVKYNNTLGKEQLPVQLKQIAQQSTQYNHQKILLVDPHFNDVNNYYAGYVGRYYFFSDQVVGQENFM
MSQAEFKNTIKQYDYVVLPEWHRTFTTMLEKTYHQDYKTGLFKVTKDGLQKVNKINV
>Mature_616_residues
SISGLIVFIMAQIGYTGMVRMAGVNKYMSWITSMVIQTLLLYVLAMLNWLKFGLKAVVILGCIFVVVRIGTIIFRVGKLP
FEGIHYFDVWMIAIGIIMGRILFASPLIHYDNYSHWALIVKYLLFQGHLPVAADTIISFTSYPPATALFITQFVSWVGFS
DGAMLLGQFLLIWASIYGIFAVLRDRTRSTNSFVICFTVSIINIFNISIRMNNLLVDFVLPVVAAAGFAGVYAYRRSPWL
QCATASLFSAELLLIKNSGTMYVVMLGCYLLYSLVTNGQGQRWKRLGKGISKTVVTMGLGYLPFFWWNQHVHATFSAVSK
HQISTDAYKSQLAHESSAVIAKIGSKFLHQILSFNSLSTRGVLLINVGLLGAWIIIRWFLRKKNNLLKSLIASDISFIAY
YISVFAMYIVSMPYAEAILLDGSERYLSSMVILNLLLATMVLVVAMDRASFEEDVSKRGIRSFRNVITKNVYQLSSLVLM
LFASILMFSEINGVKYNNTLGKEQLPVQLKQIAQQSTQYNHQKILLVDPHFNDVNNYYAGYVGRYYFFSDQVVGQENFMM
SQAEFKNTIKQYDYVVLPEWHRTFTTMLEKTYHQDYKTGLFKVTKDGLQKVNKINV

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 69993; Mature: 69861

Theoretical pI: Translated: 9.94; Mature: 9.94

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
3.9 %Met     (Translated Protein)
4.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
3.7 %Met     (Mature Protein)
4.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSISGLIVFIMAQIGYTGMVRMAGVNKYMSWITSMVIQTLLLYVLAMLNWLKFGLKAVVI
CCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LGCIFVVVRIGTIIFRVGKLPFEGIHYFDVWMIAIGIIMGRILFASPLIHYDNYSHWALI
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCCCHHHHH
VKYLLFQGHLPVAADTIISFTSYPPATALFITQFVSWVGFSDGAMLLGQFLLIWASIYGI
HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FAVLRDRTRSTNSFVICFTVSIINIFNISIRMNNLLVDFVLPVVAAAGFAGVYAYRRSPW
HHHHHHCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH
LQCATASLFSAELLLIKNSGTMYVVMLGCYLLYSLVTNGQGQRWKRLGKGISKTVVTMGL
HHHHHHHHHHEEEEEEECCCCEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
GYLPFFWWNQHVHATFSAVSKHQISTDAYKSQLAHESSAVIAKIGSKFLHQILSFNSLST
HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
RGVLLINVGLLGAWIIIRWFLRKKNNLLKSLIASDISFIAYYISVFAMYIVSMPYAEAIL
CCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEE
LDGSERYLSSMVILNLLLATMVLVVAMDRASFEEDVSKRGIRSFRNVITKNVYQLSSLVL
ECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MLFASILMFSEINGVKYNNTLGKEQLPVQLKQIAQQSTQYNHQKILLVDPHFNDVNNYYA
HHHHHHHHHHHCCCCEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCHHHHH
GYVGRYYFFSDQVVGQENFMMSQAEFKNTIKQYDYVVLPEWHRTFTTMLEKTYHQDYKTG
HHHHEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LFKVTKDGLQKVNKINV
HHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
SISGLIVFIMAQIGYTGMVRMAGVNKYMSWITSMVIQTLLLYVLAMLNWLKFGLKAVVI
CCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LGCIFVVVRIGTIIFRVGKLPFEGIHYFDVWMIAIGIIMGRILFASPLIHYDNYSHWALI
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCCCHHHHH
VKYLLFQGHLPVAADTIISFTSYPPATALFITQFVSWVGFSDGAMLLGQFLLIWASIYGI
HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FAVLRDRTRSTNSFVICFTVSIINIFNISIRMNNLLVDFVLPVVAAAGFAGVYAYRRSPW
HHHHHHCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH
LQCATASLFSAELLLIKNSGTMYVVMLGCYLLYSLVTNGQGQRWKRLGKGISKTVVTMGL
HHHHHHHHHHEEEEEEECCCCEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
GYLPFFWWNQHVHATFSAVSKHQISTDAYKSQLAHESSAVIAKIGSKFLHQILSFNSLST
HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
RGVLLINVGLLGAWIIIRWFLRKKNNLLKSLIASDISFIAYYISVFAMYIVSMPYAEAIL
CCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEE
LDGSERYLSSMVILNLLLATMVLVVAMDRASFEEDVSKRGIRSFRNVITKNVYQLSSLVL
ECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MLFASILMFSEINGVKYNNTLGKEQLPVQLKQIAQQSTQYNHQKILLVDPHFNDVNNYYA
HHHHHHHHHHHCCCCEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCHHHHH
GYVGRYYFFSDQVVGQENFMMSQAEFKNTIKQYDYVVLPEWHRTFTTMLEKTYHQDYKTG
HHHHEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LFKVTKDGLQKVNKINV
HHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA