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The map label for this gene is ybjZ [C]

Identifier: 11496870

GI number: 11496870

Start: 19995

End: 21230

Strand: Direct

Name: ybjZ [C]

Synonym: BBJ27

Alternate gene names: 11496870

Gene position: 19995-21230 (Clockwise)

Preceding gene: 11496838

Following gene: 11496850

Centisome position: 51.5

GC content: 29.85

Gene sequence:

>1236_bases
GTGAGTGTGTTTAAATTGGCTTTTTACAATATCTTTAGAGATTTAAGGCGTACAATCATATTATCTTTACTTCTAGCAAG
TTCTGTGGTATTTTTATTGGTTTTTGTTGGATATATGAACTTTAGTAGAGAGGGGATGGAAAAGAGCTTTGTTAGTTCAA
GTGGCCATATTCAAATTGCGAAAGAAAATTATTTTAATCCTAAATTTAGCAACCTTAAGAATGGGCTTTTACTTGAAGAA
AAGGATATTAATTTGATACGGAATGAAATAGATAGTTATGATGAATTACAATCTACCAATTTAATAGTTAATTTTGATGG
ACTTCTAGGCAATTCTTCGACAAGTAACCCAGTTTTTGCATTTGCCTATGAAGATCCAGATATAATTACAAGCAGCCTAT
CTTTATTAGAGGGTGAGCCCATTTTCCACGATTCTAATGCAGGTGAGTTTTTGCTTGGTAGTAATTTGGCCTCTTCGTTT
GGTATAGAAAAAATAACAGAAACCAATTCTGATCTTACATTAATGACAAATTTGCTCGGGAGAGGTTTGAATTTCCAAAA
TATTAAAGTTGCTGGAATTATAAAATTTCCATTTTCAACAGCAGATAATATTTTTGCAATTACTACTATTAAGACTTTAA
AAGACTTGTTTGCATTTGAGGGTGGAGCACATGTGATCCAAGTATTTTTAAAGGATAGTTCTACCTTAGAGACTTTTAAA
AAGAAATTAGATAATTTTAAAAAAAATAAGGGGATTTCATTTGATTATAATGACTGGTTTGAGATTAATCCTTACTTTAA
ATCTGTTTTAGGGATGACTAGAACAACATTTATGTTTATATTGGTCTTAATATCTCTTCTTATATTTATTGCATTTTTCC
AGATAATGACCGCATTAAGCATTGAGCGCACTAGAGAGCTTGGTACATTAAGAGCAATTGGTTTAACCAAATTGGAACTT
TTTTACTCTCTATTTTTAGAAATTGTTATTATTTCTGTTGTCAATATTGTTGTAGGAGTAATATTGGCTTATTTTGCTAA
ACTTTTTATTCAGTTTCAAAAAATTAGCTTTACTCCTCCAGGCTATTCAGAAACATACTACATCAACATATTTTATTATG
CTAGTGATATAATATATGTTTCAATTTTCATGTTAATTCTTGCTATTTTTTCTTCTATTTTGCCATTTAGCAAAGCAAGT
AAGAAATCGGTAGTAGAGGTAATGAATGATGCTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAGAATGCAATTGGGATTTTTGTTTCTCATGATTATAATTTAAAAAATTTGGCTAATAAACTTTATAGAATAGAAGATGG
AGTGCTGTCTTTAGTGGGGG

Downstream 100 bases:

>100_bases
GATTTTTGTAATTGTTTTCAATTTTTGTGTTTTAAATTTGTTAAATGCTGGAGATGGGAAAAGTTTAATAAAAGAATTTG
AAAATCTATATTATCCCCAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 411; Mature: 410

Protein sequence:

>411_residues
MSVFKLAFYNIFRDLRRTIILSLLLASSVVFLLVFVGYMNFSREGMEKSFVSSSGHIQIAKENYFNPKFSNLKNGLLLEE
KDINLIRNEIDSYDELQSTNLIVNFDGLLGNSSTSNPVFAFAYEDPDIITSSLSLLEGEPIFHDSNAGEFLLGSNLASSF
GIEKITETNSDLTLMTNLLGRGLNFQNIKVAGIIKFPFSTADNIFAITTIKTLKDLFAFEGGAHVIQVFLKDSSTLETFK
KKLDNFKKNKGISFDYNDWFEINPYFKSVLGMTRTTFMFILVLISLLIFIAFFQIMTALSIERTRELGTLRAIGLTKLEL
FYSLFLEIVIISVVNIVVGVILAYFAKLFIQFQKISFTPPGYSETYYINIFYYASDIIYVSIFMLILAIFSSILPFSKAS
KKSVVEVMNDA

Sequences:

>Translated_411_residues
MSVFKLAFYNIFRDLRRTIILSLLLASSVVFLLVFVGYMNFSREGMEKSFVSSSGHIQIAKENYFNPKFSNLKNGLLLEE
KDINLIRNEIDSYDELQSTNLIVNFDGLLGNSSTSNPVFAFAYEDPDIITSSLSLLEGEPIFHDSNAGEFLLGSNLASSF
GIEKITETNSDLTLMTNLLGRGLNFQNIKVAGIIKFPFSTADNIFAITTIKTLKDLFAFEGGAHVIQVFLKDSSTLETFK
KKLDNFKKNKGISFDYNDWFEINPYFKSVLGMTRTTFMFILVLISLLIFIAFFQIMTALSIERTRELGTLRAIGLTKLEL
FYSLFLEIVIISVVNIVVGVILAYFAKLFIQFQKISFTPPGYSETYYINIFYYASDIIYVSIFMLILAIFSSILPFSKAS
KKSVVEVMNDA
>Mature_410_residues
SVFKLAFYNIFRDLRRTIILSLLLASSVVFLLVFVGYMNFSREGMEKSFVSSSGHIQIAKENYFNPKFSNLKNGLLLEEK
DINLIRNEIDSYDELQSTNLIVNFDGLLGNSSTSNPVFAFAYEDPDIITSSLSLLEGEPIFHDSNAGEFLLGSNLASSFG
IEKITETNSDLTLMTNLLGRGLNFQNIKVAGIIKFPFSTADNIFAITTIKTLKDLFAFEGGAHVIQVFLKDSSTLETFKK
KLDNFKKNKGISFDYNDWFEINPYFKSVLGMTRTTFMFILVLISLLIFIAFFQIMTALSIERTRELGTLRAIGLTKLELF
YSLFLEIVIISVVNIVVGVILAYFAKLFIQFQKISFTPPGYSETYYINIFYYASDIIYVSIFMLILAIFSSILPFSKASK
KSVVEVMNDA

Specific function: Unknown

COG id: COG4591

COG function: function code M; ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component

Gene ontology:

Cell location: Integral Membrane Protein. Inner Membrane [C]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 46457; Mature: 46325

Theoretical pI: Translated: 5.50; Mature: 5.50

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
2.2 %Met     (Translated Protein)
2.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
2.0 %Met     (Mature Protein)
2.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSVFKLAFYNIFRDLRRTIILSLLLASSVVFLLVFVGYMNFSREGMEKSFVSSSGHIQIA
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEE
KENYFNPKFSNLKNGLLLEEKDINLIRNEIDSYDELQSTNLIVNFDGLLGNSSTSNPVFA
CCCCCCCCHHHCCCCCEEECCHHHHHHHHHCCHHHHHHCCEEEEECCCCCCCCCCCCEEE
FAYEDPDIITSSLSLLEGEPIFHDSNAGEFLLGSNLASSFGIEKITETNSDLTLMTNLLG
EEECCCHHHHHHHHHHCCCCCEECCCCCCEEECCCHHHHCCCHHHHCCCCCHHHHHHHHH
RGLNFQNIKVAGIIKFPFSTADNIFAITTIKTLKDLFAFEGGAHVIQVFLKDSSTLETFK
CCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHH
KKLDNFKKNKGISFDYNDWFEINPYFKSVLGMTRTTFMFILVLISLLIFIAFFQIMTALS
HHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IERTRELGTLRAIGLTKLELFYSLFLEIVIISVVNIVVGVILAYFAKLFIQFQKISFTPP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCC
GYSETYYINIFYYASDIIYVSIFMLILAIFSSILPFSKASKKSVVEVMNDA
CCCCEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
SVFKLAFYNIFRDLRRTIILSLLLASSVVFLLVFVGYMNFSREGMEKSFVSSSGHIQIA
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEE
KENYFNPKFSNLKNGLLLEEKDINLIRNEIDSYDELQSTNLIVNFDGLLGNSSTSNPVFA
CCCCCCCCHHHCCCCCEEECCHHHHHHHHHCCHHHHHHCCEEEEECCCCCCCCCCCCEEE
FAYEDPDIITSSLSLLEGEPIFHDSNAGEFLLGSNLASSFGIEKITETNSDLTLMTNLLG
EEECCCHHHHHHHHHHCCCCCEECCCCCCEEECCCHHHHCCCHHHHCCCCCHHHHHHHHH
RGLNFQNIKVAGIIKFPFSTADNIFAITTIKTLKDLFAFEGGAHVIQVFLKDSSTLETFK
CCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHH
KKLDNFKKNKGISFDYNDWFEINPYFKSVLGMTRTTFMFILVLISLLIFIAFFQIMTALS
HHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IERTRELGTLRAIGLTKLELFYSLFLEIVIISVVNIVVGVILAYFAKLFIQFQKISFTPP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCC
GYSETYYINIFYYASDIIYVSIFMLILAIFSSILPFSKASKKSVVEVMNDA
CCCCEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA