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The map label for this gene is yrrI [H]

Identifier: 113477436

GI number: 113477436

Start: 6189732

End: 6190838

Strand: Reverse

Name: yrrI [H]

Synonym: Tery_4001

Alternate gene names: 113477436

Gene position: 6190838-6189732 (Counterclockwise)

Preceding gene: 113477437

Following gene: 113477435

Centisome position: 79.88

GC content: 33.24

Gene sequence:

>1107_bases
ATGAAACCTGAACAAAGGATTTCTATTTCTATCTCTAACCTACTGTTAATTATTAGTAGTTTTTTACTATTAATTATTTT
ATGGCAAGTGCGAAGTCTGATAGTACTGTTGATGATTGCAGTAATTTTAGCAGCATCAATTTCACCATTAGTAAATTTAA
CAGAAAGAATTAGATTGCCTCGTTGGTTAGGGGTAGTTATTGTCTATTTAACTCTAATTTCTGGATTGATCAGTGTAGTC
TTAATTATTGGCCCACAAGTTTTTGAGCAAATTGAAAGGCTTTTACGACAATTGCCATTATTTTCTAAGAGTATCAGCGA
TAATTTTGAAAATTTTGTTAGTTCTTTAACTCAAAATCCCCCTGATTGGATTAATCAACTTTTTGATACTAAATCTGTCA
CAAGTTGGGTAATTAGTTCTAGTCAACAACTTTTATTACGTTCCTATAGTTTAACTAAAGGTGTATTGGGAAGCATAGTT
AGTTTAATATTGGCTTTATTTATTTCAGGCTATATGGTATCTGATAGTCAAACTTTAATTACCAGTATAGTCAAACTTTT
TCCTCAACCTTGGGATAAACGTCTGGAAGATCAAGTTATTCCTGTAACTAAAAGAATGGGAGGTTACATTAGAGGTAGAA
TTATTGTTTCTGCTATTTTAGGTCTAGCAACAACTACTGGTTTAGGATTTTTAGGATTGCAAGATTTTTCCCTAGGCTTA
GGAGCAATAGCTGCTGTGACAAACCTGATTCCTTTTATCGGCCCAATTCTTGGTGCAGTTCCAGCCTTAATTGTTGCTAT
TGCTAAAGGGGGATGGTTGTTTTTATGGGTAATAATTTTGTACTATATTATCCAAAATATAGAGACTTATATACTCGATC
CTTTACTGGTAGGTTCTTCTGTTGGAGTACATCCTTTATATCAATTATTATCGGTTCTAGTAGGAGTTCAGTTATTAGGA
ATTATTGGTGCTTTGATTATTCCACCTTGGTTTGCTGGCGCTGCTGCTCTAGTAGAAAATTTATATTTGAAACCCAAGTT
AGAAGCCGAAAATATCCAATCTATTATTACCAGTAATGGCGAGCATAATTTACCCCCTGTAATATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AATATAACTAGTTAGTTTAAAATTCATTTTGGGAAAAACTGCAAAGAACAAAAAATGTTAGCTTTTAGCCTTGAGTTGAT
AACCTATTTAAGTAGCTTCT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GCATTCAGTTATCAGCTACCTTCCTGGGGCCGTAACTTTCTTATTCAGATATTATTAACTATTAACTAATTCCTAAATTC
AGGAATACTAGATAAAATCT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 368; Mature: 368

Protein sequence:

>368_residues
MKPEQRISISISNLLLIISSFLLLIILWQVRSLIVLLMIAVILAASISPLVNLTERIRLPRWLGVVIVYLTLISGLISVV
LIIGPQVFEQIERLLRQLPLFSKSISDNFENFVSSLTQNPPDWINQLFDTKSVTSWVISSSQQLLLRSYSLTKGVLGSIV
SLILALFISGYMVSDSQTLITSIVKLFPQPWDKRLEDQVIPVTKRMGGYIRGRIIVSAILGLATTTGLGFLGLQDFSLGL
GAIAAVTNLIPFIGPILGAVPALIVAIAKGGWLFLWVIILYYIIQNIETYILDPLLVGSSVGVHPLYQLLSVLVGVQLLG
IIGALIIPPWFAGAAALVENLYLKPKLEAENIQSIITSNGEHNLPPVI

Sequences:

>Translated_368_residues
MKPEQRISISISNLLLIISSFLLLIILWQVRSLIVLLMIAVILAASISPLVNLTERIRLPRWLGVVIVYLTLISGLISVV
LIIGPQVFEQIERLLRQLPLFSKSISDNFENFVSSLTQNPPDWINQLFDTKSVTSWVISSSQQLLLRSYSLTKGVLGSIV
SLILALFISGYMVSDSQTLITSIVKLFPQPWDKRLEDQVIPVTKRMGGYIRGRIIVSAILGLATTTGLGFLGLQDFSLGL
GAIAAVTNLIPFIGPILGAVPALIVAIAKGGWLFLWVIILYYIIQNIETYILDPLLVGSSVGVHPLYQLLSVLVGVQLLG
IIGALIIPPWFAGAAALVENLYLKPKLEAENIQSIITSNGEHNLPPVI
>Mature_368_residues
MKPEQRISISISNLLLIISSFLLLIILWQVRSLIVLLMIAVILAASISPLVNLTERIRLPRWLGVVIVYLTLISGLISVV
LIIGPQVFEQIERLLRQLPLFSKSISDNFENFVSSLTQNPPDWINQLFDTKSVTSWVISSSQQLLLRSYSLTKGVLGSIV
SLILALFISGYMVSDSQTLITSIVKLFPQPWDKRLEDQVIPVTKRMGGYIRGRIIVSAILGLATTTGLGFLGLQDFSLGL
GAIAAVTNLIPFIGPILGAVPALIVAIAKGGWLFLWVIILYYIIQNIETYILDPLLVGSSVGVHPLYQLLSVLVGVQLLG
IIGALIIPPWFAGAAALVENLYLKPKLEAENIQSIITSNGEHNLPPVI

Specific function: Unknown

COG id: COG0628

COG function: function code R; Predicted permease

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the UPF0118 (perM) family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1788838, Length=304, Percent_Identity=25.6578947368421, Blast_Score=75, Evalue=5e-15,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002549 [H]

Pfam domain/function: PF01594 UPF0118 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 40260; Mature: 40260

Theoretical pI: Translated: 9.46; Mature: 9.46

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
1.1 %Met     (Translated Protein)
1.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
1.1 %Met     (Mature Protein)
1.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKPEQRISISISNLLLIISSFLLLIILWQVRSLIVLLMIAVILAASISPLVNLTERIRLP
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH
RWLGVVIVYLTLISGLISVVLIIGPQVFEQIERLLRQLPLFSKSISDNFENFVSSLTQNP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDWINQLFDTKSVTSWVISSSQQLLLRSYSLTKGVLGSIVSLILALFISGYMVSDSQTLI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCHHHHH
TSIVKLFPQPWDKRLEDQVIPVTKRMGGYIRGRIIVSAILGLATTTGLGFLGLQDFSLGL
HHHHHHCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
GAIAAVTNLIPFIGPILGAVPALIVAIAKGGWLFLWVIILYYIIQNIETYILDPLLVGSS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
VGVHPLYQLLSVLVGVQLLGIIGALIIPPWFAGAAALVENLYLKPKLEAENIQSIITSNG
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCC
EHNLPPVI
CCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MKPEQRISISISNLLLIISSFLLLIILWQVRSLIVLLMIAVILAASISPLVNLTERIRLP
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH
RWLGVVIVYLTLISGLISVVLIIGPQVFEQIERLLRQLPLFSKSISDNFENFVSSLTQNP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDWINQLFDTKSVTSWVISSSQQLLLRSYSLTKGVLGSIVSLILALFISGYMVSDSQTLI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCHHHHH
TSIVKLFPQPWDKRLEDQVIPVTKRMGGYIRGRIIVSAILGLATTTGLGFLGLQDFSLGL
HHHHHHCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
GAIAAVTNLIPFIGPILGAVPALIVAIAKGGWLFLWVIILYYIIQNIETYILDPLLVGSS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
VGVHPLYQLLSVLVGVQLLGIIGALIIPPWFAGAAALVENLYLKPKLEAENIQSIITSNG
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCC
EHNLPPVI
CCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]