Definition Trichodesmium erythraeum IMS101 chromosome, complete genome.
Accession NC_008312
Length 7,750,108

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The map label for this gene is feoB [H]

Identifier: 113476463

GI number: 113476463

Start: 4484081

End: 4485901

Strand: Reverse

Name: feoB [H]

Synonym: Tery_2878

Alternate gene names: 113476463

Gene position: 4485901-4484081 (Counterclockwise)

Preceding gene: 113476464

Following gene: 113476461

Centisome position: 57.88

GC content: 33.5

Gene sequence:

>1821_bases
ATGACTTGTCATAACAATAAAGTAACAATATCTCAACCTACTAATGCCACAAAAAAAGTGGCTTTAATAGGGATGCCAAA
CACTGGAAAATCTACATTTTTTAATCGGATTACTGGAGTTTCGGCCCATGTAGGAAATTGGCCGGGAATAACAGTTGATC
TTTTTCAAGCTGAGGTCAAAATAAATAAGGAAATTACACAATTTATAGACTTACCAGGAATTTATAATTTCAATGGTTTT
TCTGAAGATGAAAAAGTTGTTCAAAATTTTCTGGAAAATAATCCTGTTGACTTAGTAATAGTCGTTATTAATTCCTCACA
AATCGACCGTCAAATTATGCTACCATTACAGGTAAAATCTTTGGGTTTACCAGCAGTTTTGATGTTAAATATGTCAGATG
AAGCTAAACAATATGGGATTAAAATAGACAAAGAAGAATTATCCAAACGTTTGTCAATGCCAGTGTTTTTAATAAGTGCT
AAATATGGTAAAGGCTATATGAACGCCTACATGGCAATTTCTGAACAGTTAAAAGAGAGTAAAAATTCAGTTCAACTAGA
TACGAATAAAATCAAGGAAAATATTTCTGTTAGGGAAATAGATAGTATTTTAAATGGAACTGTGATTATGCCTTCTCAAA
TGGCACAAAATTTCACAGCTCAAGTTGATAAAATTCTGCTGCATCCTGTCTGGGGTTTACCTTTATTTTTCCTAGGAATG
TTCCTGGTTTTTTTGGCAATTTGGAATATCGGACTTCCTTCAGTAGACCTTCTTGAAATTGGGGTTGAATGGGTACAGTC
ATCAATTGTTGAACCTCTAGTTCAACCGTTTCCACAAGTACTTCAAGATTTTCTAATTAATGGGCTTTGGGCAGGGGTAA
CTACTGTTGCTTCTTTTGTACCTTTAATTATAGTATTTTTTATAATTATGGCGGTGTTAGAAGATAGTGGTTATCTATCA
CGTTCTGCTTATTTAATGGATGCCTTTATGGCAAGATTGGGTTTAGATGGACGTAGCTTTGTACTGCACATAATGGGGTT
TGGTTGTAATGTTCCGGCATTAATGGGAACTAGGGTGATGCGATCGCGTGCTTTACGACTATTAACCATGTTAATTATTC
CTTTTGGTTTATGTTCAGCACGATTACAAGTATTTGTATTTATTATTGCAGCAGTATTTCCTAATAGCAAGGGAGCGATA
GTTTTATTCTCTTTATATATTCTAAGTTTTCTGGTTGCTATTATTACTGCAGCATTATTTCAAGGAGTATATAAAAATGA
AGAACCTTTCGTTTTAGAGATGCCTCCTTATCGTTTTCCTACATGGAAACAAGTTTTACTAAGAAGTTGGGGAGAAGTTA
GAGAATTTTTAGTTAGAGCATCTGGCTTCATTACTGTTGGTTGTATTGGAGTTTGGATACTGACAAGTTTACCTTCAGGG
GCAACAGGATTAGATACAATTGGTGGTCAAATTGGTCAATTGATGAGTCCTATTATGGATCCTATTGGTATCAATTCTTA
TTTAACATTATCCCTATTTTTTGGCTTTATTGCTAAAGAAATTGTGATCGGTTCTTTAGCAGTTATTTATAGCATGAGCG
AACAGAATGTTAGTAGCAATATTGCTGAGACAGTTACTTTTATTCAAGGATATAGTTTCTGTATTTTTTGTTTACTTTAT
ACCCCATGTTTATCTACTTTAGCAACTTTAATTAAAGAAGCAAAATCATGGAAATTTTCCTTACTTTCTTTAGTATTTCC
ATTAGTTTTAGCTTGGTTATCTAGTTTCATTTTTTACCAAGGAGCTTTGGCTTTAAGTTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GACAAATCAATATTTTTATGATACCAAATGTTAAGAATCTTTTCAAAAAATTACAAATATTACATAATTTTTATATTATC
GGTTTTCTTGCTTAATAATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAATCTAAATATTAGATATTTCTAGAAAAAAGGGAATAGAAATTAAGGATAAATAATTAATAGTTTATGTAGGATTATTA
ATTTTATTTTGATGACTACA

Product: ferrous iron transport protein B

Products: Fe (II) [Cytoplasm] [C]

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 606; Mature: 605

Protein sequence:

>606_residues
MTCHNNKVTISQPTNATKKVALIGMPNTGKSTFFNRITGVSAHVGNWPGITVDLFQAEVKINKEITQFIDLPGIYNFNGF
SEDEKVVQNFLENNPVDLVIVVINSSQIDRQIMLPLQVKSLGLPAVLMLNMSDEAKQYGIKIDKEELSKRLSMPVFLISA
KYGKGYMNAYMAISEQLKESKNSVQLDTNKIKENISVREIDSILNGTVIMPSQMAQNFTAQVDKILLHPVWGLPLFFLGM
FLVFLAIWNIGLPSVDLLEIGVEWVQSSIVEPLVQPFPQVLQDFLINGLWAGVTTVASFVPLIIVFFIIMAVLEDSGYLS
RSAYLMDAFMARLGLDGRSFVLHIMGFGCNVPALMGTRVMRSRALRLLTMLIIPFGLCSARLQVFVFIIAAVFPNSKGAI
VLFSLYILSFLVAIITAALFQGVYKNEEPFVLEMPPYRFPTWKQVLLRSWGEVREFLVRASGFITVGCIGVWILTSLPSG
ATGLDTIGGQIGQLMSPIMDPIGINSYLTLSLFFGFIAKEIVIGSLAVIYSMSEQNVSSNIAETVTFIQGYSFCIFCLLY
TPCLSTLATLIKEAKSWKFSLLSLVFPLVLAWLSSFIFYQGALALS

Sequences:

>Translated_606_residues
MTCHNNKVTISQPTNATKKVALIGMPNTGKSTFFNRITGVSAHVGNWPGITVDLFQAEVKINKEITQFIDLPGIYNFNGF
SEDEKVVQNFLENNPVDLVIVVINSSQIDRQIMLPLQVKSLGLPAVLMLNMSDEAKQYGIKIDKEELSKRLSMPVFLISA
KYGKGYMNAYMAISEQLKESKNSVQLDTNKIKENISVREIDSILNGTVIMPSQMAQNFTAQVDKILLHPVWGLPLFFLGM
FLVFLAIWNIGLPSVDLLEIGVEWVQSSIVEPLVQPFPQVLQDFLINGLWAGVTTVASFVPLIIVFFIIMAVLEDSGYLS
RSAYLMDAFMARLGLDGRSFVLHIMGFGCNVPALMGTRVMRSRALRLLTMLIIPFGLCSARLQVFVFIIAAVFPNSKGAI
VLFSLYILSFLVAIITAALFQGVYKNEEPFVLEMPPYRFPTWKQVLLRSWGEVREFLVRASGFITVGCIGVWILTSLPSG
ATGLDTIGGQIGQLMSPIMDPIGINSYLTLSLFFGFIAKEIVIGSLAVIYSMSEQNVSSNIAETVTFIQGYSFCIFCLLY
TPCLSTLATLIKEAKSWKFSLLSLVFPLVLAWLSSFIFYQGALALS
>Mature_605_residues
TCHNNKVTISQPTNATKKVALIGMPNTGKSTFFNRITGVSAHVGNWPGITVDLFQAEVKINKEITQFIDLPGIYNFNGFS
EDEKVVQNFLENNPVDLVIVVINSSQIDRQIMLPLQVKSLGLPAVLMLNMSDEAKQYGIKIDKEELSKRLSMPVFLISAK
YGKGYMNAYMAISEQLKESKNSVQLDTNKIKENISVREIDSILNGTVIMPSQMAQNFTAQVDKILLHPVWGLPLFFLGMF
LVFLAIWNIGLPSVDLLEIGVEWVQSSIVEPLVQPFPQVLQDFLINGLWAGVTTVASFVPLIIVFFIIMAVLEDSGYLSR
SAYLMDAFMARLGLDGRSFVLHIMGFGCNVPALMGTRVMRSRALRLLTMLIIPFGLCSARLQVFVFIIAAVFPNSKGAIV
LFSLYILSFLVAIITAALFQGVYKNEEPFVLEMPPYRFPTWKQVLLRSWGEVREFLVRASGFITVGCIGVWILTSLPSGA
TGLDTIGGQIGQLMSPIMDPIGINSYLTLSLFFGFIAKEIVIGSLAVIYSMSEQNVSSNIAETVTFIQGYSFCIFCLLYT
PCLSTLATLIKEAKSWKFSLLSLVFPLVLAWLSSFIFYQGALALS

Specific function: GTP-driven Fe(2+) uptake system [H]

COG id: COG0370

COG function: function code P; Fe2+ transport system protein B

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 1 G (guanine nucleotide-binding) domain [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1789813, Length=612, Percent_Identity=30.0653594771242, Blast_Score=249, Evalue=5e-67,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003373
- InterPro:   IPR011640
- InterPro:   IPR011642
- InterPro:   IPR006073
- InterPro:   IPR002917
- InterPro:   IPR005225 [H]

Pfam domain/function: PF07664 FeoB_C; PF07670 Gate; PF01926 MMR_HSR1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 67145; Mature: 67014

Theoretical pI: Translated: 7.33; Mature: 7.33

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
3.6 %Met     (Translated Protein)
4.8 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
3.5 %Met     (Mature Protein)
4.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTCHNNKVTISQPTNATKKVALIGMPNTGKSTFFNRITGVSAHVGNWPGITVDLFQAEVK
CCCCCCCEEEECCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEHHHHH
INKEITQFIDLPGIYNFNGFSEDEKVVQNFLENNPVDLVIVVINSSQIDRQIMLPLQVKS
HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCCCCEECCEEHHH
LGLPAVLMLNMSDEAKQYGIKIDKEELSKRLSMPVFLISAKYGKGYMNAYMAISEQLKES
CCCCEEEEECCCHHHHHCCCEECHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHC
KNSVQLDTNKIKENISVREIDSILNGTVIMPSQMAQNFTAQVDKILLHPVWGLPLFFLGM
CCCEEEEHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
FLVFLAIWNIGLPSVDLLEIGVEWVQSSIVEPLVQPFPQVLQDFLINGLWAGVTTVASFV
HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
PLIIVFFIIMAVLEDSGYLSRSAYLMDAFMARLGLDGRSFVLHIMGFGCNVPALMGTRVM
HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHH
RSRALRLLTMLIIPFGLCSARLQVFVFIIAAVFPNSKGAIVLFSLYILSFLVAIITAALF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QGVYKNEEPFVLEMPPYRFPTWKQVLLRSWGEVREFLVRASGFITVGCIGVWILTSLPSG
HHHHCCCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCC
ATGLDTIGGQIGQLMSPIMDPIGINSYLTLSLFFGFIAKEIVIGSLAVIYSMSEQNVSSN
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
IAETVTFIQGYSFCIFCLLYTPCLSTLATLIKEAKSWKFSLLSLVFPLVLAWLSSFIFYQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GALALS
CHHCCC
>Mature Secondary Structure 
TCHNNKVTISQPTNATKKVALIGMPNTGKSTFFNRITGVSAHVGNWPGITVDLFQAEVK
CCCCCCEEEECCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEHHHHH
INKEITQFIDLPGIYNFNGFSEDEKVVQNFLENNPVDLVIVVINSSQIDRQIMLPLQVKS
HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCCCCEECCEEHHH
LGLPAVLMLNMSDEAKQYGIKIDKEELSKRLSMPVFLISAKYGKGYMNAYMAISEQLKES
CCCCEEEEECCCHHHHHCCCEECHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHC
KNSVQLDTNKIKENISVREIDSILNGTVIMPSQMAQNFTAQVDKILLHPVWGLPLFFLGM
CCCEEEEHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
FLVFLAIWNIGLPSVDLLEIGVEWVQSSIVEPLVQPFPQVLQDFLINGLWAGVTTVASFV
HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
PLIIVFFIIMAVLEDSGYLSRSAYLMDAFMARLGLDGRSFVLHIMGFGCNVPALMGTRVM
HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHH
RSRALRLLTMLIIPFGLCSARLQVFVFIIAAVFPNSKGAIVLFSLYILSFLVAIITAALF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QGVYKNEEPFVLEMPPYRFPTWKQVLLRSWGEVREFLVRASGFITVGCIGVWILTSLPSG
HHHHCCCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCC
ATGLDTIGGQIGQLMSPIMDPIGINSYLTLSLFFGFIAKEIVIGSLAVIYSMSEQNVSSN
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
IAETVTFIQGYSFCIFCLLYTPCLSTLATLIKEAKSWKFSLLSLVFPLVLAWLSSFIFYQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GALALS
CHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: Fe (II) [Periplasm] [C]

Specific reaction: Fe (II) [Periplasm] = Fe (II) [Cytoplasm] [C]

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8905231 [H]