Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 113476241

Identifier: 113476241

GI number: 113476241

Start: 4082424

End: 4084022

Strand: Reverse

Name: 113476241

Synonym: Tery_2634

Alternate gene names: NA

Gene position: 4084022-4082424 (Counterclockwise)

Preceding gene: 113476242

Following gene: 113476240

Centisome position: 52.7

GC content: 31.71

Gene sequence:

>1599_bases
ATGTTCCAACAAAAACCTTATTTTACTTGGTTAAAAATCTTTATTGCCATCATCCTAATCTTAGGAATATGTTTCAGATT
TATCAATATTGACCAGAAAGTTTACTGGTTCGATGAAACAATTACATCCTTAAGAATTGTTAGTTACACCAGGGGAGAAC
TTGAAGACCTACTCTCAAACGACGGAACTATTACCGTCGAAAAATTACAGAAATATCAAGAAATTAATCCTCAGAAAAAC
ACAATTAATATTATCAGCTCTCTAGCTAAAGATAATCCTGAACACTTACCAATTTATTTTGTACTTTTGAGGTGGTGGGT
AAAATTATTCGGTAATTCTGTCACCGTAATTAGAAGTTTTTCAGCCATAACAAGCTTACTCATTTTTCCCTGTACTTATT
GGCTATGTCGAGAATTATTTAGCAACTCATTAGTAGGATGGATAGCAATTTCTCTCACAGCAGCTTCCCCAATTTTAGTA
TTATATTCCCAGGAAGCACGAGCTTATACTCTTTTTTCCCTAGTTATTTTACTATCCAGTATTGCCTTACTTCAAGCAAT
AAGAATTAATACGAAACGTAGCTGGAAAATTTATATTGCAAGTCTCATTTTTGCTTTATATACTCATCTCTTTTCTGTAT
TAGTAGCCCTTGGTCATGGATTATATGTAATCCTGATTGAAAAATTTAAACTAACCCAAAAATTAAAAGCTTATTTACTA
GCCTCTTTCTGGGGATTTTTAGGATTTTTACCTTGGCTTATATTGATAATTAATCATTTTGAAGGCATTGGTTGGGTCTC
CAAAGATTTACCTTTATCCAGTTTGTTCAAAAGATGGTTTATCAATCTTGGTTTTACATTTTTTGATATTCAAATTGGTT
CCTCTGAGAGATTATTTGATGTGAAAAAACTAGTTTTTGATAATCATGCTTTGTTACAATTAAATACTATCTGGCCCTAT
ATCTTGGGATTGATTTTAGTATTAGTTATTTACTCTATTTATTTCCTCCTAAAAAATGCACCTCGACGGGTAACTATATT
TATCTTAACCTTAATGGCAGTTACCCCAATATGTTTAATAATTCCTGACTTAATATCTGGAGGGCAACGTTCTACTATTC
CTCGTTATTTAATTCCAGCTTACCTAGGAATTCAATTATCTGTAGCTTTTTTATTAGGAACAAAATTGACTAACTTTACT
AATAAAATCGAACATAAATTTTGGAAAATAGCAACTGTAGCTCTCATTTCTTTGGGTATTATATCTTGTGGTATTAGTTC
TCAAGCTGAGACTTGGTGGAATAAATATAGTAGTTATTATGATGGGGAAGTAGCTAGAATAATTAATCAAACAAACAAAC
CTCTTATTATTAGTAATTATTCCGTAAGATTAGCTACTCTCGGGTATATGTTGAGACCTGATGTGGAAGTTTTATTCATT
GAAGAACCGAAAGTTCCTACAGTTCCAAAAGGTTTCACTGATGTATTTGTATTTCGTCCTCCATGGAGTTTAATTTCTGG
ATTAGAAATACAAGAAAATTCTCGAATGGAGTTAGTTTATAATCCTGGGGAACTTTGGATTTTAAATCAAAGTAAGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTGATAAATAACCTCTTGCTTAAAACCACTTTTAACTTCCTTATCTGTGCATCCGTTGGAAAATTATTGTGGTGCATTCC
TACTCAAATTTAATTAAAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAAACATAAATAATTTAAGTATTCAGCTGAATGCTAGAAACTAACATAACTTTTTTGATGATTATTACCCCAAGAATGTG
TTAATTATTCTTCGGTTGTA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 532; Mature: 532

Protein sequence:

>532_residues
MFQQKPYFTWLKIFIAIILILGICFRFINIDQKVYWFDETITSLRIVSYTRGELEDLLSNDGTITVEKLQKYQEINPQKN
TINIISSLAKDNPEHLPIYFVLLRWWVKLFGNSVTVIRSFSAITSLLIFPCTYWLCRELFSNSLVGWIAISLTAASPILV
LYSQEARAYTLFSLVILLSSIALLQAIRINTKRSWKIYIASLIFALYTHLFSVLVALGHGLYVILIEKFKLTQKLKAYLL
ASFWGFLGFLPWLILIINHFEGIGWVSKDLPLSSLFKRWFINLGFTFFDIQIGSSERLFDVKKLVFDNHALLQLNTIWPY
ILGLILVLVIYSIYFLLKNAPRRVTIFILTLMAVTPICLIIPDLISGGQRSTIPRYLIPAYLGIQLSVAFLLGTKLTNFT
NKIEHKFWKIATVALISLGIISCGISSQAETWWNKYSSYYDGEVARIINQTNKPLIISNYSVRLATLGYMLRPDVEVLFI
EEPKVPTVPKGFTDVFVFRPPWSLISGLEIQENSRMELVYNPGELWILNQSK

Sequences:

>Translated_532_residues
MFQQKPYFTWLKIFIAIILILGICFRFINIDQKVYWFDETITSLRIVSYTRGELEDLLSNDGTITVEKLQKYQEINPQKN
TINIISSLAKDNPEHLPIYFVLLRWWVKLFGNSVTVIRSFSAITSLLIFPCTYWLCRELFSNSLVGWIAISLTAASPILV
LYSQEARAYTLFSLVILLSSIALLQAIRINTKRSWKIYIASLIFALYTHLFSVLVALGHGLYVILIEKFKLTQKLKAYLL
ASFWGFLGFLPWLILIINHFEGIGWVSKDLPLSSLFKRWFINLGFTFFDIQIGSSERLFDVKKLVFDNHALLQLNTIWPY
ILGLILVLVIYSIYFLLKNAPRRVTIFILTLMAVTPICLIIPDLISGGQRSTIPRYLIPAYLGIQLSVAFLLGTKLTNFT
NKIEHKFWKIATVALISLGIISCGISSQAETWWNKYSSYYDGEVARIINQTNKPLIISNYSVRLATLGYMLRPDVEVLFI
EEPKVPTVPKGFTDVFVFRPPWSLISGLEIQENSRMELVYNPGELWILNQSK
>Mature_532_residues
MFQQKPYFTWLKIFIAIILILGICFRFINIDQKVYWFDETITSLRIVSYTRGELEDLLSNDGTITVEKLQKYQEINPQKN
TINIISSLAKDNPEHLPIYFVLLRWWVKLFGNSVTVIRSFSAITSLLIFPCTYWLCRELFSNSLVGWIAISLTAASPILV
LYSQEARAYTLFSLVILLSSIALLQAIRINTKRSWKIYIASLIFALYTHLFSVLVALGHGLYVILIEKFKLTQKLKAYLL
ASFWGFLGFLPWLILIINHFEGIGWVSKDLPLSSLFKRWFINLGFTFFDIQIGSSERLFDVKKLVFDNHALLQLNTIWPY
ILGLILVLVIYSIYFLLKNAPRRVTIFILTLMAVTPICLIIPDLISGGQRSTIPRYLIPAYLGIQLSVAFLLGTKLTNFT
NKIEHKFWKIATVALISLGIISCGISSQAETWWNKYSSYYDGEVARIINQTNKPLIISNYSVRLATLGYMLRPDVEVLFI
EEPKVPTVPKGFTDVFVFRPPWSLISGLEIQENSRMELVYNPGELWILNQSK

Specific function: Unknown

COG id: COG5305

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 61186; Mature: 61186

Theoretical pI: Translated: 9.68; Mature: 9.68

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
0.8 %Met     (Translated Protein)
1.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
0.8 %Met     (Mature Protein)
1.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MFQQKPYFTWLKIFIAIILILGICFRFINIDQKVYWFDETITSLRIVSYTRGELEDLLSN
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHEEEHHHHHHHHHHHCC
DGTITVEKLQKYQEINPQKNTINIISSLAKDNPEHLPIYFVLLRWWVKLFGNSVTVIRSF
CCCEEHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
SAITSLLIFPCTYWLCRELFSNSLVGWIAISLTAASPILVLYSQEARAYTLFSLVILLSS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHEEEEECCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHH
IALLQAIRINTKRSWKIYIASLIFALYTHLFSVLVALGHGLYVILIEKFKLTQKLKAYLL
HHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHH
ASFWGFLGFLPWLILIINHFEGIGWVSKDLPLSSLFKRWFINLGFTFFDIQIGSSERLFD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCHHHH
VKKLVFDNHALLQLNTIWPYILGLILVLVIYSIYFLLKNAPRRVTIFILTLMAVTPICLI
HHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IPDLISGGQRSTIPRYLIPAYLGIQLSVAFLLGTKLTNFTNKIEHKFWKIATVALISLGI
HHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ISCGISSQAETWWNKYSSYYDGEVARIINQTNKPLIISNYSVRLATLGYMLRPDVEVLFI
HHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCCCEEEECCCEEHHHHHHHCCCCCEEEEE
EEPKVPTVPKGFTDVFVFRPPWSLISGLEIQENSRMELVYNPGELWILNQSK
ECCCCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHCCCEECCCCCEEEEECCCEEEEEECCC
>Mature Secondary Structure
MFQQKPYFTWLKIFIAIILILGICFRFINIDQKVYWFDETITSLRIVSYTRGELEDLLSN
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHEEEHHHHHHHHHHHCC
DGTITVEKLQKYQEINPQKNTINIISSLAKDNPEHLPIYFVLLRWWVKLFGNSVTVIRSF
CCCEEHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
SAITSLLIFPCTYWLCRELFSNSLVGWIAISLTAASPILVLYSQEARAYTLFSLVILLSS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHEEEEECCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHH
IALLQAIRINTKRSWKIYIASLIFALYTHLFSVLVALGHGLYVILIEKFKLTQKLKAYLL
HHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHH
ASFWGFLGFLPWLILIINHFEGIGWVSKDLPLSSLFKRWFINLGFTFFDIQIGSSERLFD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCHHHH
VKKLVFDNHALLQLNTIWPYILGLILVLVIYSIYFLLKNAPRRVTIFILTLMAVTPICLI
HHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IPDLISGGQRSTIPRYLIPAYLGIQLSVAFLLGTKLTNFTNKIEHKFWKIATVALISLGI
HHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ISCGISSQAETWWNKYSSYYDGEVARIINQTNKPLIISNYSVRLATLGYMLRPDVEVLFI
HHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCCCEEEECCCEEHHHHHHHCCCCCEEEEE
EEPKVPTVPKGFTDVFVFRPPWSLISGLEIQENSRMELVYNPGELWILNQSK
ECCCCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHCCCEECCCCCEEEEECCCEEEEEECCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA