Definition Trichodesmium erythraeum IMS101 chromosome, complete genome.
Accession NC_008312
Length 7,750,108

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The map label for this gene is 113474164

Identifier: 113474164

GI number: 113474164

Start: 413407

End: 415158

Strand: Direct

Name: 113474164

Synonym: Tery_0269

Alternate gene names: NA

Gene position: 413407-415158 (Clockwise)

Preceding gene: 113474154

Following gene: 113474165

Centisome position: 5.33

GC content: 34.87

Gene sequence:

>1752_bases
ATGGAACGGAAAATGGATACTCAACCTTCAAATCAAGGAGCTTCAACTCCTCATACAGCAGAAGAAGTCCTGAAATTAGT
GATTCAAGACTTGGACAATTTTCGTCAAGATTTGACACATCAGTTAGGGCAAGATGTAAGTAGATTAAGAGCTGAGAAAG
AACAGCTCAATGAGGATGTTAATAAATTAAGAAAGCAATATGAACAGTTGCAAGTTCAACAACTGGAATCTCTTTCTCAA
CGACAAATAGCCCAGCAACAATTATGGCTGAAACAACTGGCCCAAGTACTGGCAAATAATTTACAAAAACAGTTAGGCCA
TAAAATTAAAGAGTTAAAGGAGAGTGTTGACCCAGGATTACAACAAGGTGTTTCTTCAGGAGGAGGGTTACCAATGACTA
ATTCTCCAGATAACTATTATGAATCTGCTAATGAGTTGGGCTCTTCTTTGTCTGCTACTTTGAGCAGAACATTTGATACT
CTAAAAAAGGAGTTGGATAGTTACGAAAGTGACCTTTGTGTGCAACTAAATAATATGCGTGGTATGGAACAGCAGAGTGA
GGTGATTTTAGAAACCTTGCTCAGTCGTCTTCAGGGACAACTAGAAGGTAATAATGTAGTTTTATCACGAAATTTTCAAA
CTTTTCAGTCTGATCCCAGGAATTCATTAAATAATGCTTCTAGTGAAATATCAACTCCTATTGAGTCCCCAGAAATAGCA
CAAATAAGCAAACCTGAATCTACTGCAAAATCTCAAAAGTCTCCTTCTCAAGTTCAGATAGGTTTAATTTTGGCTTTGCT
CTCAGCAGCAGTTCTATCTTTATTTAATGTTTGTGTAAAGATAGTTTTCAATACACCACCACAACCATATCAAGTTTTCG
GTGGTTTATTTTCAGTATCAGGATTAATTAATCCTGATGTTTGGAATTCTTTGTTAATTTTATTACTACGGCAAGGGGTA
GTAATGTTATTGATGCCTTTGGTTGCGACATTTCTTTATCCTGCTGTTTGGAGTGATATTGAGCATTTAATCAAATCCAA
AAATTTTTCGTTATGGTGGAAAGTTATTGGTAGTGCTTTCTTTTTGTTTTTATCTCAGGTATTAATATATATTTCTATTG
GTAATATACCTACTGGTATTGCCATGACAATTTTCTTTATTTATCCAATTATTACTGTTTTATTATCTTGGGGATTATTT
GGTGATTCCCCTTCTGTTTTAAGAATTTGTGCGATGGTTATTATTGGTTTGGGAGGAATTTTAGTTATTCCTGGTGGAGT
TGGTAATTATCAACCAGGAGTTATGGCTGGAGTTGCTGCTAGTATTACTTTTTCTGGATATATTTTACTAACACAAATGT
CAGCAGGAAAGCTTCATCCTATTCCTTTTAGTTTAATTAATTTTGCTGGAATTTTTGTATTTTCGGCTTTGGGAATGATG
ATGCCTAAACCTGTAGAATGGTCTGCTAATTTTGATCCTAGTCTGTGGTCTAATTTAATTGTTATTAGTATTATTTTAGG
GGTTTTAACCATTTCTAGCTATGTATTAAATAGTTTTGCTATTAAATTTGCTGGAGCGGCAAGAGCATCTATTATGGGTA
CTTTGGGTCCACCTTTAACTGCTTTAATTGCCCTTTTTACTATTGGAGAAGCATTAGGAGTAAAAGAGATTTTTGGGATA
ATACTGGTAATTATTGGTGTGGCAGCGATGAGTTTTGAAAGAATGTTTGGAGTGAAACGAAAGCCTAGTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAGTTCTGTTATAGTTTGGCACTCAGTTCAATATTGATATTCTGTTGCTGAGACTTCTAGGATGGAGCAATAAAAGTATT
GTGAGCTATTGTTAGCAAAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TATTGAGTGCTTACTATGTCTTTATACATTCATAATTGAGGCTATAAAGTTTGAATTTTCCTTTTTTTATATTCTTAAGA
GGGGATGCTTGAGACTTTAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 583; Mature: 583

Protein sequence:

>583_residues
MERKMDTQPSNQGASTPHTAEEVLKLVIQDLDNFRQDLTHQLGQDVSRLRAEKEQLNEDVNKLRKQYEQLQVQQLESLSQ
RQIAQQQLWLKQLAQVLANNLQKQLGHKIKELKESVDPGLQQGVSSGGGLPMTNSPDNYYESANELGSSLSATLSRTFDT
LKKELDSYESDLCVQLNNMRGMEQQSEVILETLLSRLQGQLEGNNVVLSRNFQTFQSDPRNSLNNASSEISTPIESPEIA
QISKPESTAKSQKSPSQVQIGLILALLSAAVLSLFNVCVKIVFNTPPQPYQVFGGLFSVSGLINPDVWNSLLILLLRQGV
VMLLMPLVATFLYPAVWSDIEHLIKSKNFSLWWKVIGSAFFLFLSQVLIYISIGNIPTGIAMTIFFIYPIITVLLSWGLF
GDSPSVLRICAMVIIGLGGILVIPGGVGNYQPGVMAGVAASITFSGYILLTQMSAGKLHPIPFSLINFAGIFVFSALGMM
MPKPVEWSANFDPSLWSNLIVISIILGVLTISSYVLNSFAIKFAGAARASIMGTLGPPLTALIALFTIGEALGVKEIFGI
ILVIIGVAAMSFERMFGVKRKPS

Sequences:

>Translated_583_residues
MERKMDTQPSNQGASTPHTAEEVLKLVIQDLDNFRQDLTHQLGQDVSRLRAEKEQLNEDVNKLRKQYEQLQVQQLESLSQ
RQIAQQQLWLKQLAQVLANNLQKQLGHKIKELKESVDPGLQQGVSSGGGLPMTNSPDNYYESANELGSSLSATLSRTFDT
LKKELDSYESDLCVQLNNMRGMEQQSEVILETLLSRLQGQLEGNNVVLSRNFQTFQSDPRNSLNNASSEISTPIESPEIA
QISKPESTAKSQKSPSQVQIGLILALLSAAVLSLFNVCVKIVFNTPPQPYQVFGGLFSVSGLINPDVWNSLLILLLRQGV
VMLLMPLVATFLYPAVWSDIEHLIKSKNFSLWWKVIGSAFFLFLSQVLIYISIGNIPTGIAMTIFFIYPIITVLLSWGLF
GDSPSVLRICAMVIIGLGGILVIPGGVGNYQPGVMAGVAASITFSGYILLTQMSAGKLHPIPFSLINFAGIFVFSALGMM
MPKPVEWSANFDPSLWSNLIVISIILGVLTISSYVLNSFAIKFAGAARASIMGTLGPPLTALIALFTIGEALGVKEIFGI
ILVIIGVAAMSFERMFGVKRKPS
>Mature_583_residues
MERKMDTQPSNQGASTPHTAEEVLKLVIQDLDNFRQDLTHQLGQDVSRLRAEKEQLNEDVNKLRKQYEQLQVQQLESLSQ
RQIAQQQLWLKQLAQVLANNLQKQLGHKIKELKESVDPGLQQGVSSGGGLPMTNSPDNYYESANELGSSLSATLSRTFDT
LKKELDSYESDLCVQLNNMRGMEQQSEVILETLLSRLQGQLEGNNVVLSRNFQTFQSDPRNSLNNASSEISTPIESPEIA
QISKPESTAKSQKSPSQVQIGLILALLSAAVLSLFNVCVKIVFNTPPQPYQVFGGLFSVSGLINPDVWNSLLILLLRQGV
VMLLMPLVATFLYPAVWSDIEHLIKSKNFSLWWKVIGSAFFLFLSQVLIYISIGNIPTGIAMTIFFIYPIITVLLSWGLF
GDSPSVLRICAMVIIGLGGILVIPGGVGNYQPGVMAGVAASITFSGYILLTQMSAGKLHPIPFSLINFAGIFVFSALGMM
MPKPVEWSANFDPSLWSNLIVISIILGVLTISSYVLNSFAIKFAGAARASIMGTLGPPLTALIALFTIGEALGVKEIFGI
ILVIIGVAAMSFERMFGVKRKPS

Specific function: Unknown

COG id: COG0697

COG function: function code GER; Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 2 DUF6 domains [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR000620 [H]

Pfam domain/function: PF00892 DUF6 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 63827; Mature: 63827

Theoretical pI: Translated: 6.69; Mature: 6.69

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
2.9 %Met     (Translated Protein)
3.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
2.9 %Met     (Mature Protein)
3.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8905231 [H]