Definition Yersinia pestis Nepal516, complete genome.
Accession NC_008149
Length 4,534,590

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The map label for this gene is 108811205

Identifier: 108811205

GI number: 108811205

Start: 1198677

End: 1200884

Strand: Reverse

Name: 108811205

Synonym: YPN_1040

Alternate gene names: NA

Gene position: 1200884-1198677 (Counterclockwise)

Preceding gene: 108811206

Following gene: 108811204

Centisome position: 26.48

GC content: 49.23

Gene sequence:

>2208_bases
ATGGCTGAACCGAAACCCGCGTCTTGGATGCCTTCACATGCGGCAGCGCAACTCTGCCGCCAGTTGCAGTCACTCTTGCC
AATGCATCTTCTTGCACCTGCGGCCTTTGAACAGATATTACGTTATTGCGGTGTCCGGCCCGGACGTCAGGCTTGGCGTT
TGTTTCTCAGTAGAACGCTGCTACTGGCCGGATCCCTCGCGGCCATCTGTGGCGTCATCTTTTTCTTTGCGTGGAACTGG
GCAGCAATGCCCGCAATGGCAAAGTTCGGTATCATCGAATTGCTGATCGTGGCCTTGGCCATTCTCATCTGGTGGCGCTG
GTATGATGCCGTCAGTCGCACGGCATTATTGGCCGCAGGGTTCCTCTTTGGTGCGCTGTTTGCCGTCTTCGGGCAGATTT
ACCAAACCGGGGCCGATAGCTGGGAGTTATTCCGCGCTTGGGCACTAATTCTTCTCCCTTTAGCGTTGCTCAGCAGGCAG
GGGGGATTATGGTTTTTAACCTGGCTGGTGACCAATATTGGCCTGAATCTCTTTTTCTTCAGTTACTCATCGCCGTTTAC
GGTCTCTTTCTCACTGTTCGACAACATTTTTTATCTCAACACCTTGTTCACGTATGGTTATTTGCTTTTTCAGGGATTAT
GTCTTTTGGCCTGGGAAGTGACACAAAGATTCAGCAAAACCCAATCCCCCGATAAAACGGTAAATCGCTGGTTTCCGAGG
CTCATGGCAGCCTATTTTTTACTGTCACTGACAACCCCAATAATCAGTGAACTCACTTACTTTCACTTCCAACAGCCTGG
CTACGTTTTACTACTTTGCTGGGTAGCGGTTATGGCCGGTGGCTACTGGTGGTATCGCTATCGCCAACCCGATTTATGCA
TGCTGACACTGGGTGTTTGCAGCTTATTAGCGGTGGGAACTGCCGCTATCCTTACCTCGGCGGGTTGGGGTTGGTATAGA
AATGTTGGCTCCCTGTTCCTGATTGGGATATTAATCGCCCTATTGCTTGGCGCAGGGGGCAAATTGTTACTCCACTGGCG
CCGAAAGATGTATCCAAATCAAGCCGTGGAGTTATCCCGATCAGCCTACGACGAACTGTTAGTTAATCTCGAACAGCATT
CGTTGCTCAACGCAGACCAAAAAGCGGTGTTGCTTGCTGAACAAGGCAAGTTAACTCTGCCTTGGTATATTCGTACCGCT
TTTGCGTTCGGCGGGTGGATCGCGGCATTAATCCTGTTAGCTCTGTTGATATTGCTGGGATTTGTCAGTGGGATGTTTGA
CAATCTCAATGCTGGAACAATTATTGTTGTTTCACTGATAGGCGGAGCCTTTGCCGCGTTCTTGCTCACCCGACCGGGTA
TGGGGATACAGCAGATTGGTTTGGTATGGGCAATAGCGTCCTCGATCGGGTTATATAGCGGAATAATATTAATCCAGGAT
TCAAGCAGCAGATTGATGCTGATGCAAAGTCTGTGGTTCATTCCTGTTTTGGCGGTTCTGATTGTGGTATTCCACAATGA
TATGTATCGCTTTCTGGCGACGGGCACGTTGGTATTCATGAGTATTGTGACGACAAGCTACGCTCTGATATGGCACTTGG
CACCCGATAACCAACAGCTCTTTTTCTTCATTCCAATCCTGATAGTCACCGTCATTGTCATGTTGATTCTTTGGCTGATC
TGCAATGAAATTAAATTGCTGGCGACCGTCAATGCACCACTGATTCATCCGTTAATGTATGGCGGGATCGGGGGCATACT
GGTGGTTTGCCTGCACAGCATTCAGATGGGGAATATCCATGAATTCTACTGGATGTCAGATCGGGGGCTTTATTTGGAAC
AGAGTTTGAGCTACGGGATCCCTGCCGCTTTCTTGCTGTTTACGCTAATTCAATGGGTTTTGCATCGCAGTAAGCTCAAG
CCACTCTGGTTGATAGCGGCGGTCGTAACCTCCCTTGCAGCCTATTTTGCACCGGGAATGGGTTTTGGTTTGGCACTGTT
ATTGATTGCCCGTTATCAGGGGAATCAGTGGTTACTGGGGGTTGCAGCCAGTTTTCTCGCGGTTTACACCAGTGGCTGGT
ATTACTTCCTCGGCTTCAGCTTGTTGTATAAATCATTGTTATTAATTGGGGGGGGTGTCTTGCTGCTGGTTTTGGCCGGC
GTATTGAATCGAGTACTCTCTGCTGGGGAGGTCAATCAACATGCTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AGAAACCAGAGATGACTCGCCATCTTGCCGCCGTCAGAGCCTATCGGCAACAAGACGGCATTTGATATCCCTTTCGCTTT
CAGAAACAAGGATGTAAACC

Downstream 100 bases:

>100_bases
GAGAAAATGGCTCAGCATCGCGGTTATTATCGTTGCCCTGATCATGGTGAATATCTCTATTTATCAGAAACAACATTTGT
TGGCTAAAGGTGACATCATT

Product: membrane protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 735; Mature: 734

Protein sequence:

>735_residues
MAEPKPASWMPSHAAAQLCRQLQSLLPMHLLAPAAFEQILRYCGVRPGRQAWRLFLSRTLLLAGSLAAICGVIFFFAWNW
AAMPAMAKFGIIELLIVALAILIWWRWYDAVSRTALLAAGFLFGALFAVFGQIYQTGADSWELFRAWALILLPLALLSRQ
GGLWFLTWLVTNIGLNLFFFSYSSPFTVSFSLFDNIFYLNTLFTYGYLLFQGLCLLAWEVTQRFSKTQSPDKTVNRWFPR
LMAAYFLLSLTTPIISELTYFHFQQPGYVLLLCWVAVMAGGYWWYRYRQPDLCMLTLGVCSLLAVGTAAILTSAGWGWYR
NVGSLFLIGILIALLLGAGGKLLLHWRRKMYPNQAVELSRSAYDELLVNLEQHSLLNADQKAVLLAEQGKLTLPWYIRTA
FAFGGWIAALILLALLILLGFVSGMFDNLNAGTIIVVSLIGGAFAAFLLTRPGMGIQQIGLVWAIASSIGLYSGIILIQD
SSSRLMLMQSLWFIPVLAVLIVVFHNDMYRFLATGTLVFMSIVTTSYALIWHLAPDNQQLFFFIPILIVTVIVMLILWLI
CNEIKLLATVNAPLIHPLMYGGIGGILVVCLHSIQMGNIHEFYWMSDRGLYLEQSLSYGIPAAFLLFTLIQWVLHRSKLK
PLWLIAAVVTSLAAYFAPGMGFGLALLLIARYQGNQWLLGVAASFLAVYTSGWYYFLGFSLLYKSLLLIGGGVLLLVLAG
VLNRVLSAGEVNQHA

Sequences:

>Translated_735_residues
MAEPKPASWMPSHAAAQLCRQLQSLLPMHLLAPAAFEQILRYCGVRPGRQAWRLFLSRTLLLAGSLAAICGVIFFFAWNW
AAMPAMAKFGIIELLIVALAILIWWRWYDAVSRTALLAAGFLFGALFAVFGQIYQTGADSWELFRAWALILLPLALLSRQ
GGLWFLTWLVTNIGLNLFFFSYSSPFTVSFSLFDNIFYLNTLFTYGYLLFQGLCLLAWEVTQRFSKTQSPDKTVNRWFPR
LMAAYFLLSLTTPIISELTYFHFQQPGYVLLLCWVAVMAGGYWWYRYRQPDLCMLTLGVCSLLAVGTAAILTSAGWGWYR
NVGSLFLIGILIALLLGAGGKLLLHWRRKMYPNQAVELSRSAYDELLVNLEQHSLLNADQKAVLLAEQGKLTLPWYIRTA
FAFGGWIAALILLALLILLGFVSGMFDNLNAGTIIVVSLIGGAFAAFLLTRPGMGIQQIGLVWAIASSIGLYSGIILIQD
SSSRLMLMQSLWFIPVLAVLIVVFHNDMYRFLATGTLVFMSIVTTSYALIWHLAPDNQQLFFFIPILIVTVIVMLILWLI
CNEIKLLATVNAPLIHPLMYGGIGGILVVCLHSIQMGNIHEFYWMSDRGLYLEQSLSYGIPAAFLLFTLIQWVLHRSKLK
PLWLIAAVVTSLAAYFAPGMGFGLALLLIARYQGNQWLLGVAASFLAVYTSGWYYFLGFSLLYKSLLLIGGGVLLLVLAG
VLNRVLSAGEVNQHA
>Mature_734_residues
AEPKPASWMPSHAAAQLCRQLQSLLPMHLLAPAAFEQILRYCGVRPGRQAWRLFLSRTLLLAGSLAAICGVIFFFAWNWA
AMPAMAKFGIIELLIVALAILIWWRWYDAVSRTALLAAGFLFGALFAVFGQIYQTGADSWELFRAWALILLPLALLSRQG
GLWFLTWLVTNIGLNLFFFSYSSPFTVSFSLFDNIFYLNTLFTYGYLLFQGLCLLAWEVTQRFSKTQSPDKTVNRWFPRL
MAAYFLLSLTTPIISELTYFHFQQPGYVLLLCWVAVMAGGYWWYRYRQPDLCMLTLGVCSLLAVGTAAILTSAGWGWYRN
VGSLFLIGILIALLLGAGGKLLLHWRRKMYPNQAVELSRSAYDELLVNLEQHSLLNADQKAVLLAEQGKLTLPWYIRTAF
AFGGWIAALILLALLILLGFVSGMFDNLNAGTIIVVSLIGGAFAAFLLTRPGMGIQQIGLVWAIASSIGLYSGIILIQDS
SSRLMLMQSLWFIPVLAVLIVVFHNDMYRFLATGTLVFMSIVTTSYALIWHLAPDNQQLFFFIPILIVTVIVMLILWLIC
NEIKLLATVNAPLIHPLMYGGIGGILVVCLHSIQMGNIHEFYWMSDRGLYLEQSLSYGIPAAFLLFTLIQWVLHRSKLKP
LWLIAAVVTSLAAYFAPGMGFGLALLLIARYQGNQWLLGVAASFLAVYTSGWYYFLGFSLLYKSLLLIGGGVLLLVLAGV
LNRVLSAGEVNQHA

Specific function: Unknown

COG id: COG4984

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 82027; Mature: 81896

Theoretical pI: Translated: 9.29; Mature: 9.29

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
2.7 %Met     (Translated Protein)
3.9 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
2.6 %Met     (Mature Protein)
3.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
AEPKPASWMPSHAAAQLCRQLQSLLPMHLLAPAAFEQILRYCGVRPGRQAWRLFLSRTL
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH
LLAGSLAAICGVIFFFAWNWAAMPAMAKFGIIELLIVALAILIWWRWYDAVSRTALLAAG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FLFGALFAVFGQIYQTGADSWELFRAWALILLPLALLSRQGGLWFLTWLVTNIGLNLFFF
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCHHEEEE
SYSSPFTVSFSLFDNIFYLNTLFTYGYLLFQGLCLLAWEVTQRFSKTQSPDKTVNRWFPR
ECCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH
LMAAYFLLSLTTPIISELTYFHFQQPGYVLLLCWVAVMAGGYWWYRYRQPDLCMLTLGVC
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCHHHHHHHHH
SLLAVGTAAILTSAGWGWYRNVGSLFLIGILIALLLGAGGKLLLHWRRKMYPNQAVELSR
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
SAYDELLVNLEQHSLLNADQKAVLLAEQGKLTLPWYIRTAFAFGGWIAALILLALLILLG
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FVSGMFDNLNAGTIIVVSLIGGAFAAFLLTRPGMGIQQIGLVWAIASSIGLYSGIILIQD
HHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEC
SSSRLMLMQSLWFIPVLAVLIVVFHNDMYRFLATGTLVFMSIVTTSYALIWHLAPDNQQL
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCH
FFFIPILIVTVIVMLILWLICNEIKLLATVNAPLIHPLMYGGIGGILVVCLHSIQMGNIH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHEEECCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCE
EFYWMSDRGLYLEQSLSYGIPAAFLLFTLIQWVLHRSKLKPLWLIAAVVTSLAAYFAPGM
EEEEECCCCCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
GFGLALLLIARYQGNQWLLGVAASFLAVYTSGWYYFLGFSLLYKSLLLIGGGVLLLVLAG
HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH
VLNRVLSAGEVNQHA
HHHHHHHCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA