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The map label for this gene is yjbQ [H]

Identifier: 108563547

GI number: 108563547

Start: 1182454

End: 1183605

Strand: Reverse

Name: yjbQ [H]

Synonym: HPAG1_1122

Alternate gene names: 108563547

Gene position: 1183605-1182454 (Counterclockwise)

Preceding gene: 108563549

Following gene: 108563544

Centisome position: 74.14

GC content: 38.19

Gene sequence:

>1152_bases
ATGCATGCAGAATTTTTCACTTTCGCGCTCATCATGCTTTTAATTGTGATGGCCCCTTATATGTCTAGAATCTCTCGTTT
GCCTATCACGGTTGTGGAGATTTTATTTGGGTCTGTTGGGGCGTATGTGGGTTTTATTGAGCCTACTAAGGGCTTTGAAA
TCATGTCCGAAATTGGCTTTTTGTTTTTAATGTTTTTATGCGGTTTGGAAGTGGAAATTTATTTGTTTAAAAAATTAGGG
GTTTCTCTTTTAAAACGCATTTTTGCTTATCTGTTGATTTTATACACGCTTTCATTCATCCTTACTTTTAGCCTTAATTT
AGAGCCTATTTTCATGGTGATTTTCCCTATTATTAGTTTGGGCATGATCATGACTTTAGTCAAAGATTATCGTAAAGAGA
TTTTGTGGCTTGATTTGGTTTTAAAAGTGGGCGTTATTGGGGAATTGTTAAGCATTTTTGGTTTGGTGGTCGTGGATGGG
GTGTATTCGCATGGTTTGGGCATGGATTTGATTAAAGATTTAGGCATTCTCATTGTTTTTTTAATCTTAATTATCGTGGC
GTTTCAAATCTTTAAGACTTTGTTTTGGTGGTTCCCGCATTTAAAGCTTTTTGTGATGCCTAAAAGCAGCCAGTTCAACC
AAGACGTGCGTTTTTCGCTCATGCTCTTTTTTTCACTGGTTGCGATCGTGGTGTGGCTCAAAATAGAAATGGTTTTGGGG
GCGTTTTTGGCGGGGTTAGTCGTTTCTACTTTCTTCCCTCACAAATCAGAGCTGATCCACAAGCTCAATGATGTGGGTTT
TGGGTTTTTTGTGCCTTTGTTTTTCATCCATGTAGGCTCTACTTTAGACTTAAAATTAGTGTTTTTAAACCCGCATTTGA
TCCTCCAGGGGATACTGATTGTCATAGCGATGTTGAGTTTGCACTTGATTACTTCAACCTTATTGTGGCGCAAATACTTT
AAAGAAGCTAAGCATTTATTTTCATTCGCTTTAGGGGCTTCTATGCCTTTAACTTTTTTAGTAACCACCGCAGCAGTGGG
TTTAAAAGCGCAAGCGATCTCGCAAAACACCTACTACGCATTGCTCATGGCGGCTATTTTTGAAGGGGTATTATTCACGA
TTGCGATTAAAATGCTCAACAAAAAAGCTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTAACTTATTACGAAATCAAAAAAGGGGTTTTTACCACTTATAAAGAGAAAAACCCTATCGCTTTGAAAACTTAACCAAT
AAATAAGGTAAAATTAAGAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATGAAAGCTTAAGCGTCTAAATATTTAGCGTCGCTAAAGCTGTTCGCTTGAACATTGTTGAATGCGTTTTCTAAGCTGTC
AAAGAAACGAGGGTGCAAGT

Product: Na+/H+ antiporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 383; Mature: 383

Protein sequence:

>383_residues
MHAEFFTFALIMLLIVMAPYMSRISRLPITVVEILFGSVGAYVGFIEPTKGFEIMSEIGFLFLMFLCGLEVEIYLFKKLG
VSLLKRIFAYLLILYTLSFILTFSLNLEPIFMVIFPIISLGMIMTLVKDYRKEILWLDLVLKVGVIGELLSIFGLVVVDG
VYSHGLGMDLIKDLGILIVFLILIIVAFQIFKTLFWWFPHLKLFVMPKSSQFNQDVRFSLMLFFSLVAIVVWLKIEMVLG
AFLAGLVVSTFFPHKSELIHKLNDVGFGFFVPLFFIHVGSTLDLKLVFLNPHLILQGILIVIAMLSLHLITSTLLWRKYF
KEAKHLFSFALGASMPLTFLVTTAAVGLKAQAISQNTYYALLMAAIFEGVLFTIAIKMLNKKA

Sequences:

>Translated_383_residues
MHAEFFTFALIMLLIVMAPYMSRISRLPITVVEILFGSVGAYVGFIEPTKGFEIMSEIGFLFLMFLCGLEVEIYLFKKLG
VSLLKRIFAYLLILYTLSFILTFSLNLEPIFMVIFPIISLGMIMTLVKDYRKEILWLDLVLKVGVIGELLSIFGLVVVDG
VYSHGLGMDLIKDLGILIVFLILIIVAFQIFKTLFWWFPHLKLFVMPKSSQFNQDVRFSLMLFFSLVAIVVWLKIEMVLG
AFLAGLVVSTFFPHKSELIHKLNDVGFGFFVPLFFIHVGSTLDLKLVFLNPHLILQGILIVIAMLSLHLITSTLLWRKYF
KEAKHLFSFALGASMPLTFLVTTAAVGLKAQAISQNTYYALLMAAIFEGVLFTIAIKMLNKKA
>Mature_383_residues
MHAEFFTFALIMLLIVMAPYMSRISRLPITVVEILFGSVGAYVGFIEPTKGFEIMSEIGFLFLMFLCGLEVEIYLFKKLG
VSLLKRIFAYLLILYTLSFILTFSLNLEPIFMVIFPIISLGMIMTLVKDYRKEILWLDLVLKVGVIGELLSIFGLVVVDG
VYSHGLGMDLIKDLGILIVFLILIIVAFQIFKTLFWWFPHLKLFVMPKSSQFNQDVRFSLMLFFSLVAIVVWLKIEMVLG
AFLAGLVVSTFFPHKSELIHKLNDVGFGFFVPLFFIHVGSTLDLKLVFLNPHLILQGILIVIAMLSLHLITSTLLWRKYF
KEAKHLFSFALGASMPLTFLVTTAAVGLKAQAISQNTYYALLMAAIFEGVLFTIAIKMLNKKA

Specific function: Probable Na(+)/H(+) antiporter [H]

COG id: COG0475

COG function: function code P; Kef-type K+ transport systems, membrane components

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 1 RCK N-terminal domain [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR006153
- InterPro:   IPR016040
- InterPro:   IPR006037
- InterPro:   IPR003148 [H]

Pfam domain/function: PF00999 Na_H_Exchanger; PF02080 TrkA_C; PF02254 TrkA_N [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 43362; Mature: 43362

Theoretical pI: Translated: 9.66; Mature: 9.66

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
4.4 %Met     (Translated Protein)
4.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
4.4 %Met     (Mature Protein)
4.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MHAEFFTFALIMLLIVMAPYMSRISRLPITVVEILFGSVGAYVGFIEPTKGFEIMSEIGF
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHH
LFLMFLCGLEVEIYLFKKLGVSLLKRIFAYLLILYTLSFILTFSLNLEPIFMVIFPIISL
HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH
GMIMTLVKDYRKEILWLDLVLKVGVIGELLSIFGLVVVDGVYSHGLGMDLIKDLGILIVF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHH
LILIIVAFQIFKTLFWWFPHLKLFVMPKSSQFNQDVRFSLMLFFSLVAIVVWLKIEMVLG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AFLAGLVVSTFFPHKSELIHKLNDVGFGFFVPLFFIHVGSTLDLKLVFLNPHLILQGILI
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHH
VIAMLSLHLITSTLLWRKYFKEAKHLFSFALGASMPLTFLVTTAAVGLKAQAISQNTYYA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
LLMAAIFEGVLFTIAIKMLNKKA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MHAEFFTFALIMLLIVMAPYMSRISRLPITVVEILFGSVGAYVGFIEPTKGFEIMSEIGF
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHH
LFLMFLCGLEVEIYLFKKLGVSLLKRIFAYLLILYTLSFILTFSLNLEPIFMVIFPIISL
HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH
GMIMTLVKDYRKEILWLDLVLKVGVIGELLSIFGLVVVDGVYSHGLGMDLIKDLGILIVF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHH
LILIIVAFQIFKTLFWWFPHLKLFVMPKSSQFNQDVRFSLMLFFSLVAIVVWLKIEMVLG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AFLAGLVVSTFFPHKSELIHKLNDVGFGFFVPLFFIHVGSTLDLKLVFLNPHLILQGILI
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHH
VIAMLSLHLITSTLLWRKYFKEAKHLFSFALGASMPLTFLVTTAAVGLKAQAISQNTYYA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
LLMAAIFEGVLFTIAIKMLNKKA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]