| Definition | Kosmotoga olearia TBF 19.5.1, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_012785 |
| Length | 2,302,126 |
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The map label for this gene is malG [H]
Identifier: 239617767
GI number: 239617767
Start: 1479527
End: 1482298
Strand: Reverse
Name: malG [H]
Synonym: Kole_1392
Alternate gene names: 239617767
Gene position: 1482298-1479527 (Counterclockwise)
Preceding gene: 239617768
Following gene: 239617766
Centisome position: 64.39
GC content: 42.1
Gene sequence:
>2772_bases ATGGCCGTAGAAAAGAAAAATTACTGGTTGAGACATATAATTCTGGTGATTATTGTTGCAATCGTGCTGTTCCCCATGGT ATGGCTGATAAGCACCTCCATTCGAAGAGACCAGGCCGCGTTTTCTCCAAAACTATTTTCATCCCGTATCACTTTGCAAC ATTACAGAAACCTGCTCTTTCCTGAAAGAAGCATTCCCAGACTCATCCTGGATGTCCAGGAAGCAACATATCTCCTTGGA AGATTTCGTGATAAATCCGAGGAAAAAATTATAAGTACCGTCGAAAGATATATGAACAAATTCGATAAATTGATGGCTGA ATCAGAAGGATTGGTCTCCACAATAGATGATAGCTTCTCCTCTCTGAGCGAAGAACTCAATAACTCCGGCCTGTCAGAAG CTATTTCCACAATAAACGCAATAAGAAAAGATGATCTCGAATTGGTAGAGCAAAGATTACTCGAGTTGAAGCTCGACAAG AATTCCGAACTTTATCTCTACGCCCTGGGAAACATCCTAAACAAAACGAAACCATCGATCAAAGACAAATACCTGTTCTA TGTGAGCAATTCCGGCGAATACGGTAAGGAAGTTCTAACACTCGCTGAAGAACTAAAGAAAACCTACGGCGAAATTCTCA ACAAAAGAGACGAACTTTTAACCCTTCTCGAGACAGAAAACTTTGATGAAAAGCCTCTTGTCATCGAAAGTTTGAAAAGA ACAGAAAAATATCTGAGTGAAAAGGGTGTTGAATATTCGAGCTGGAGAAAAACAGAATGGTTCAAGGTTATCAACAAATA TCTGCGAACCCTGGAAAAAGAAATACCTGAAGAAAGAGCAAACATAATAAACGCAACAAGAAAAGCCATGTACAACAGCT TCAAAGCTGCGAATTCTCTGTGGGATGACTTTGCTGAAGCCCACAATGCTCTGGTAAATGGACTCCTTGACTTAAAAGAA AAGGCACTCGGGCCAAGATTTGTCGAGTATGAAGAAACCACTCAAAGACTCGATGAAATTGCTGCAAAAAAAAGTGCAAT AGAAAAAACACTGGAAAAAGACGAATTGGCAATAAAAGAAATCGAAGATGCATTAGAAACCGTTACACCCATAATCGTCC CTGAAGCGGAAAGATTAAAAATACTCAGAACCACCATTGAAAAGTCACTTAAAGAAACCGCACCGGAATCCCCCAGTTCA ACTCTCTCCGACTTTTTCGAGAAACTCCGGGAGCTTTACTCCCGGGTCGAAACAGTGAAAGATAGTATAGAAAAATTAAA CCTTAAAGATTCTACTCTTTACGCTGGTGTAGCTGACCTGTACACAGAATTGAACTGGTTCTTAAGCAACGAAACCAAAA TCTCCGCATTTTCGGACGATCCGGATGTCAAGAGAGCTATCGATATATTCGAAGTGAGCAGAGCAAATATTGAGCGTGCT CTTCCAGATCTCATATTTACACTGAATGAAGCCAAAGAAATAAACGAAAAAGTAATGGCAATGAAGAATAATTTGATAAC TCTCTCCAAAGAAAGCGGCGTATTGCAGCAGAAGATCTCAGAACTTCAGGAAGGCTACTTGACTGCACTTCAAAAACTTG AAAACTGCAAACAAGGAATAGAGCTTGGTTTTGTCAAAAAACTAGCAAACAAACCTATAAACAGCATAGATGACGCAGCC ACATACTTTGAGAATGCTGCCGATATCATCGAAACCTATTTTGACAAGAAAAAGAACCTGAGATACCGTGCTTATACCTG GTATGAAGATTTCCAGCGGGCTTATCAGGAAGCTCTTGAAGGGTCCAGGGTACTATCTTCCGCCATAACAACACTTTCGA AGATGAAAGAAAATCTTGAAAGCAAGATTTACGATTATATCCACCTACGCTTCCTTGGTACCCAGATAACCCTGGAAACC TTCACAAACATGGTCGATTCCTACAATAAAAGCTTCCAGATATTCAACGCCAGATACCAGAGGGCTTCTCGCCTTGTTTC GGATCTTCTGGATTATCCGGCAAACTATGCAGCACAGTACAGCCACAAGCTGAAAGCTCTTGACAAAGCTCTCTTCAGGG TCAATCAGATATGGGCGCAAAAAGAGACTACCTACTTCTATTTCGTTCGCTGGATAGGGAATTCTGTTCTTGTAGCACTC ATGGTATCCTTGATAAGTGTCACGGTTGCGGCCCTCGCCGCCTATCCTTTCAGCAGGATGCGGTTCCCGGGTAGATCCCA GGGGCTTCTGTTTTTGCTCTTGATACAGATGTTCCCATCAATAATGTTCATGGTCGCCGTCTATGCCCTGTTGCAATTCA TGGGCAATTATGTATCATGGCTTGGCCTGGATAGCCTTGGTGGTTTGATATTCGTATATTCTGGAGGGATCGCTTTCAAC ACGTGGTTGATCAAAGGTTACTTCGATACCATTCCAGACTCTCTTGAGGAGTCAGCTATGATTGATGGCGCAACAAGACT CCAGACCTTCTGGAAGATAGTAATTCCTTTGGCACGACCCATACTCGCTGTTATAGCCATATTGACGTTCATGGGAATAT TCAACGAGTTCATAATGGCCAGAATTCTCCTGCAGGATATAAACAAATGGACGTACGCTGTCGGATTGCAACAATTCTCT GGACGTTTTGAAACAAGCTGGGGTCCATTCACTGCCGCTGCTCTCATAGGTGCAATTCCGATGGTAACCTTTTTCCTTAT CCTTCAGGACTACATCGTTGGTGGCCTAACAAAAGGTGCCGTGAAAGGTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases GTTTCGCCAGCGCTATCTCTATCCTGATATTCATCATAGTAGGTAGTTTCAGCTGGTTGAATTTCAAACTTTCAGGCGCA TTCGAAGAGGTGAGCAGATA
Downstream 100 bases:
>100_bases GCAAGCAATATGGAGCATGGGAAATCCATGCTCCTTTTTCTTGAGGTGATGAGCTTGTTAGAGAAAAAACTGGTACTGCC AGATTACAGCAACAAAAAAA
Product: binding-protein-dependent transport systems inner membrane component
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 923; Mature: 922
Protein sequence:
>923_residues MAVEKKNYWLRHIILVIIVAIVLFPMVWLISTSIRRDQAAFSPKLFSSRITLQHYRNLLFPERSIPRLILDVQEATYLLG RFRDKSEEKIISTVERYMNKFDKLMAESEGLVSTIDDSFSSLSEELNNSGLSEAISTINAIRKDDLELVEQRLLELKLDK NSELYLYALGNILNKTKPSIKDKYLFYVSNSGEYGKEVLTLAEELKKTYGEILNKRDELLTLLETENFDEKPLVIESLKR TEKYLSEKGVEYSSWRKTEWFKVINKYLRTLEKEIPEERANIINATRKAMYNSFKAANSLWDDFAEAHNALVNGLLDLKE KALGPRFVEYEETTQRLDEIAAKKSAIEKTLEKDELAIKEIEDALETVTPIIVPEAERLKILRTTIEKSLKETAPESPSS TLSDFFEKLRELYSRVETVKDSIEKLNLKDSTLYAGVADLYTELNWFLSNETKISAFSDDPDVKRAIDIFEVSRANIERA LPDLIFTLNEAKEINEKVMAMKNNLITLSKESGVLQQKISELQEGYLTALQKLENCKQGIELGFVKKLANKPINSIDDAA TYFENAADIIETYFDKKKNLRYRAYTWYEDFQRAYQEALEGSRVLSSAITTLSKMKENLESKIYDYIHLRFLGTQITLET FTNMVDSYNKSFQIFNARYQRASRLVSDLLDYPANYAAQYSHKLKALDKALFRVNQIWAQKETTYFYFVRWIGNSVLVAL MVSLISVTVAALAAYPFSRMRFPGRSQGLLFLLLIQMFPSIMFMVAVYALLQFMGNYVSWLGLDSLGGLIFVYSGGIAFN TWLIKGYFDTIPDSLEESAMIDGATRLQTFWKIVIPLARPILAVIAILTFMGIFNEFIMARILLQDINKWTYAVGLQQFS GRFETSWGPFTAAALIGAIPMVTFFLILQDYIVGGLTKGAVKG
Sequences:
>Translated_923_residues MAVEKKNYWLRHIILVIIVAIVLFPMVWLISTSIRRDQAAFSPKLFSSRITLQHYRNLLFPERSIPRLILDVQEATYLLG RFRDKSEEKIISTVERYMNKFDKLMAESEGLVSTIDDSFSSLSEELNNSGLSEAISTINAIRKDDLELVEQRLLELKLDK NSELYLYALGNILNKTKPSIKDKYLFYVSNSGEYGKEVLTLAEELKKTYGEILNKRDELLTLLETENFDEKPLVIESLKR TEKYLSEKGVEYSSWRKTEWFKVINKYLRTLEKEIPEERANIINATRKAMYNSFKAANSLWDDFAEAHNALVNGLLDLKE KALGPRFVEYEETTQRLDEIAAKKSAIEKTLEKDELAIKEIEDALETVTPIIVPEAERLKILRTTIEKSLKETAPESPSS TLSDFFEKLRELYSRVETVKDSIEKLNLKDSTLYAGVADLYTELNWFLSNETKISAFSDDPDVKRAIDIFEVSRANIERA LPDLIFTLNEAKEINEKVMAMKNNLITLSKESGVLQQKISELQEGYLTALQKLENCKQGIELGFVKKLANKPINSIDDAA TYFENAADIIETYFDKKKNLRYRAYTWYEDFQRAYQEALEGSRVLSSAITTLSKMKENLESKIYDYIHLRFLGTQITLET FTNMVDSYNKSFQIFNARYQRASRLVSDLLDYPANYAAQYSHKLKALDKALFRVNQIWAQKETTYFYFVRWIGNSVLVAL MVSLISVTVAALAAYPFSRMRFPGRSQGLLFLLLIQMFPSIMFMVAVYALLQFMGNYVSWLGLDSLGGLIFVYSGGIAFN TWLIKGYFDTIPDSLEESAMIDGATRLQTFWKIVIPLARPILAVIAILTFMGIFNEFIMARILLQDINKWTYAVGLQQFS GRFETSWGPFTAAALIGAIPMVTFFLILQDYIVGGLTKGAVKG >Mature_922_residues AVEKKNYWLRHIILVIIVAIVLFPMVWLISTSIRRDQAAFSPKLFSSRITLQHYRNLLFPERSIPRLILDVQEATYLLGR FRDKSEEKIISTVERYMNKFDKLMAESEGLVSTIDDSFSSLSEELNNSGLSEAISTINAIRKDDLELVEQRLLELKLDKN SELYLYALGNILNKTKPSIKDKYLFYVSNSGEYGKEVLTLAEELKKTYGEILNKRDELLTLLETENFDEKPLVIESLKRT EKYLSEKGVEYSSWRKTEWFKVINKYLRTLEKEIPEERANIINATRKAMYNSFKAANSLWDDFAEAHNALVNGLLDLKEK ALGPRFVEYEETTQRLDEIAAKKSAIEKTLEKDELAIKEIEDALETVTPIIVPEAERLKILRTTIEKSLKETAPESPSST LSDFFEKLRELYSRVETVKDSIEKLNLKDSTLYAGVADLYTELNWFLSNETKISAFSDDPDVKRAIDIFEVSRANIERAL PDLIFTLNEAKEINEKVMAMKNNLITLSKESGVLQQKISELQEGYLTALQKLENCKQGIELGFVKKLANKPINSIDDAAT YFENAADIIETYFDKKKNLRYRAYTWYEDFQRAYQEALEGSRVLSSAITTLSKMKENLESKIYDYIHLRFLGTQITLETF TNMVDSYNKSFQIFNARYQRASRLVSDLLDYPANYAAQYSHKLKALDKALFRVNQIWAQKETTYFYFVRWIGNSVLVALM VSLISVTVAALAAYPFSRMRFPGRSQGLLFLLLIQMFPSIMFMVAVYALLQFMGNYVSWLGLDSLGGLIFVYSGGIAFNT WLIKGYFDTIPDSLEESAMIDGATRLQTFWKIVIPLARPILAVIAILTFMGIFNEFIMARILLQDINKWTYAVGLQQFSG RFETSWGPFTAAALIGAIPMVTFFLILQDYIVGGLTKGAVKG
Specific function: Part of a binding-protein-dependent transport system. Probably responsible for the translocation of the substrate across the membrane [H]
COG id: COG3833
COG function: function code G; ABC-type maltose transport systems, permease component
Gene ontology:
Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 1 ABC transmembrane type-1 domain [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1790464, Length=232, Percent_Identity=44.8275862068966, Blast_Score=210, Evalue=3e-55, Organism=Escherichia coli, GI1787571, Length=192, Percent_Identity=33.8541666666667, Blast_Score=107, Evalue=3e-24, Organism=Escherichia coli, GI1789860, Length=258, Percent_Identity=30.6201550387597, Blast_Score=97, Evalue=5e-21,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR000515 [H]
Pfam domain/function: PF00528 BPD_transp_1 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 105819; Mature: 105688
Theoretical pI: Translated: 5.57; Mature: 5.57
Prosite motif: PS50928 ABC_TM1
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 2.1 %Met (Translated Protein) 2.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 2.0 %Met (Mature Protein) 2.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MAVEKKNYWLRHIILVIIVAIVLFPMVWLISTSIRRDQAAFSPKLFSSRITLQHYRNLLF CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCC PERSIPRLILDVQEATYLLGRFRDKSEEKIISTVERYMNKFDKLMAESEGLVSTIDDSFS CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH SLSEELNNSGLSEAISTINAIRKDDLELVEQRLLELKLDKNSELYLYALGNILNKTKPSI HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHCCCCCC KDKYLFYVSNSGEYGKEVLTLAEELKKTYGEILNKRDELLTLLETENFDEKPLVIESLKR CCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHH TEKYLSEKGVEYSSWRKTEWFKVINKYLRTLEKEIPEERANIINATRKAMYNSFKAANSL HHHHHHHCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WDDFAEAHNALVNGLLDLKEKALGPRFVEYEETTQRLDEIAAKKSAIEKTLEKDELAIKE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IEDALETVTPIIVPEAERLKILRTTIEKSLKETAPESPSSTLSDFFEKLRELYSRVETVK HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DSIEKLNLKDSTLYAGVADLYTELNWFLSNETKISAFSDDPDVKRAIDIFEVSRANIERA HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LPDLIFTLNEAKEINEKVMAMKNNLITLSKESGVLQQKISELQEGYLTALQKLENCKQGI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ELGFVKKLANKPINSIDDAATYFENAADIIETYFDKKKNLRYRAYTWYEDFQRAYQEALE HHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHH GSRVLSSAITTLSKMKENLESKIYDYIHLRFLGTQITLETFTNMVDSYNKSFQIFNARYQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH RASRLVSDLLDYPANYAAQYSHKLKALDKALFRVNQIWAQKETTYFYFVRWIGNSVLVAL HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH MVSLISVTVAALAAYPFSRMRFPGRSQGLLFLLLIQMFPSIMFMVAVYALLQFMGNYVSW HHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LGLDSLGGLIFVYSGGIAFNTWLIKGYFDTIPDSLEESAMIDGATRLQTFWKIVIPLARP HCHHHHCCEEEEEECCEEEEHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHH ILAVIAILTFMGIFNEFIMARILLQDINKWTYAVGLQQFSGRFETSWGPFTAAALIGAIP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH MVTFFLILQDYIVGGLTKGAVKG HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure AVEKKNYWLRHIILVIIVAIVLFPMVWLISTSIRRDQAAFSPKLFSSRITLQHYRNLLF CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCC PERSIPRLILDVQEATYLLGRFRDKSEEKIISTVERYMNKFDKLMAESEGLVSTIDDSFS CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH SLSEELNNSGLSEAISTINAIRKDDLELVEQRLLELKLDKNSELYLYALGNILNKTKPSI HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHCCCCCC KDKYLFYVSNSGEYGKEVLTLAEELKKTYGEILNKRDELLTLLETENFDEKPLVIESLKR CCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHH TEKYLSEKGVEYSSWRKTEWFKVINKYLRTLEKEIPEERANIINATRKAMYNSFKAANSL HHHHHHHCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WDDFAEAHNALVNGLLDLKEKALGPRFVEYEETTQRLDEIAAKKSAIEKTLEKDELAIKE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IEDALETVTPIIVPEAERLKILRTTIEKSLKETAPESPSSTLSDFFEKLRELYSRVETVK HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DSIEKLNLKDSTLYAGVADLYTELNWFLSNETKISAFSDDPDVKRAIDIFEVSRANIERA HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LPDLIFTLNEAKEINEKVMAMKNNLITLSKESGVLQQKISELQEGYLTALQKLENCKQGI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ELGFVKKLANKPINSIDDAATYFENAADIIETYFDKKKNLRYRAYTWYEDFQRAYQEALE HHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHH GSRVLSSAITTLSKMKENLESKIYDYIHLRFLGTQITLETFTNMVDSYNKSFQIFNARYQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH RASRLVSDLLDYPANYAAQYSHKLKALDKALFRVNQIWAQKETTYFYFVRWIGNSVLVAL HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH MVSLISVTVAALAAYPFSRMRFPGRSQGLLFLLLIQMFPSIMFMVAVYALLQFMGNYVSW HHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LGLDSLGGLIFVYSGGIAFNTWLIKGYFDTIPDSLEESAMIDGATRLQTFWKIVIPLARP HCHHHHCCEEEEEECCEEEEHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHH ILAVIAILTFMGIFNEFIMARILLQDINKWTYAVGLQQFSGRFETSWGPFTAAALIGAIP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH MVTFFLILQDYIVGGLTKGAVKG HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 11586360; 12142430 [H]