| Definition | Eubacterium eligens ATCC 27750 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_012778 |
| Length | 2,144,190 |
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The map label for this gene is 238917955
Identifier: 238917955
GI number: 238917955
Start: 2112985
End: 2115945
Strand: Reverse
Name: 238917955
Synonym: EUBELI_02044
Alternate gene names: NA
Gene position: 2115945-2112985 (Counterclockwise)
Preceding gene: 238917956
Following gene: 238917954
Centisome position: 98.68
GC content: 39.34
Gene sequence:
>2961_bases ATGACATATACAGTTTCAGGCGCGAATTTTAATAAAGATGTTGCGGCACAGGGAACATCTATTAATTATAAAGAAAATAA GGCGGTTAAAAGTGAAGGTGTGGCAGGCTCATTTGCAGGAGTGGTAATCTCTGGCAGTGTGACAGCTGCAACTGACAATA CATATGAGGGACTTCTTAAGGAGGCAGATGATGTAAAGAGCCAGATTATGGCGAGTGCTTCCAGTGCAAAGATAAGCCTT AAGGCATTGATGATGAAGTTATCAGGTGCTGATGCGGTAAAGCTAGATGAGGACGGCTTTAATCTTACAGATGCTACACC AGATGATATGGTTAATATTATTGAGAAAATTAAGATTGAACTTGCGATGCACTCTGATGATTATGTTAATTATGGAACAG CAGTTTCTAAGGATAAGATTGAGAGTGTGACTGGAAGTGCAGCAACAGCGGCAAGTGTCGAGAGCCGTATGCAGGGAGCA GATATAGCTGTCAATGATGAAAGTGTTGCTGAGGTTAAAAGCACACTTGAAAAGAGTAAAGAGTTAAAGCCATTATCAGA GAACACAAAGAATTACATGGTTGCTAATGGCATTGAGCCTTCAATTGCTGGAATATATCAGGCACAGGCGGCAACCTCAT CAAGTATCAGTGCAGATGGCGTTACAATAGGAAGGTGTGTAAATGCAATATCTGACGCTGATTTTGAAGCGTTAAGGCCG GGAATTGAGAAGATAATTGCTTCGTCAGGACTTGAGGTTAATGATAATACACTTGCGGATGCAAGAGCATTTATTGATGC ACAGATTCCTGTTACTAAAGAAAATCTTGAATATAAGGCACAGCTTGATGCGATAGATATTGAAAAGATTCAGGCTGACC CTGATGAAATGCTTAATAAGATACTTGATAACATGAAGCTTGGAGGCAAGGCAGAGAATACGCTCGTTACAGGTTCGCCA ATTGATGATATAAGGACAGCTCTTGATACTATTAACAGGGCAGAGTATTCAGATGTTGCAAATGTGGTATCAAAAGGAGA AACATTTACAATAGCAAGCCTTAAGCTGGAGATGGATGCAAGAAGCTTCAGAATTGAATACAGTGCAGCATCAGTAAGCA CAGGAAATAGTGAAGTTAGAAATCAGGCATCTGATGTACAGCAGGCAGCAGATAAGGCGTATGACACGCTTGTAACAGCA AGAGTTCTTATGAGTGCGAATGCGTCTGTATATCTAGTCAAGAATAACATTTCTATTCTTACAACTCCGATAGATGAGCT TAATTTAATGCTTATGGAATATGAACAGGCGGATGGAATGTATGAAGAAGCGCAGATTGCATATACAGATGTTCTTGAAG CAAGAAAGACATTGAATGAGATAGTAAGAAATCCTGCGCGTGTATTTGCCAGTATGTTTGACAAGATGAATGAAACTTAT GAGGCAGTCGGAACTCAGATAAGAGGCGATTTGGGTGATTCATTAAAGAAGGCAGTACAGGGAAGTGCGGATGATATTAT TAAGGAGCTTGGACTTGAGGGAACTGATGAGGACAAGGAAGCAATAAAGATACTGGCTGCTAATAACATGGATATGACAA AGGAAAATGTAGAGACAGTCAAATCTGTTAATGCAATGATTAATAATCTTATTAAGAATATGAAACCAGAGACAGTTCTT AATATGATAAAAGACGGAGTAAATCCAATGAATGCTTCAATTGAGGAAGTAAACGAATATCTTACAGAGGCTAATGATAA AGCATCTAAAGATAATGAGGAGAAGTTTTCAAAGTTTCTTTATAAGCTTGACCGTACCAATGGTATTACTAAAGAGCAGA GAAAGCAGTTTATAGGAATATACCAGATGATGAATATATTCACCAGAGATGCCGGAGTGGCAGCAGGTGCGCTGATTAAG CAGGGAGCTGAGGTCACTATGAATAATCTTATGACTGCATATAATTCAAGAAAGCATTATGACATGGACGCTGTTATTGA TGAGAATACAGGAATGGCAGAGGTAAGCGGAATTGCTAACTATTACAGTGCATTATTTATGGCAAATGGTGGATTAGTTA CCCCGAATACATTAAAGAATGTGGATAACTCATCCGGAATCGGAGAGCAGTCAGTTGAAATGTTTATTGAACAGTTAGAG GATAACTTCGATGCGGCAGCCGAGGAACAATATTATGAGGAATATCTTAAGGAACAGCAGGCAGCAGTGCAGGCAGGAGC TGATATATTGAGGCAGATAAGAAATGCAGATACAGAAATAAACAGTGGTAACATACAGGCTGTGAAAGCATTTTTAGAAT CCGGACAGTTCCCGGATATCAGAGGTGTTAAGACAACACGTGATTATGCAAGGGATTCGATTGAAAAAATCGGACATAAA GAAAAACTGTCACTTATGTATGAAGAAATGAAAGATGAGACAGAGGAAGAACTTCAGGAGGTTCTTTCCAAAGCAGGAGA CCTTGATACACAGATAGATGTCAATTACGAGGGATTTCTGGATTTAAGACTTAAAGACAGAACAATCGGATATATTAAGA ATCTGGCATTAAGGCATGATTACAGAATACCATATATAACAGACTCAGGAAGTACAGGCATGCTGAAGCTTACATTGGTT CAGGATGACGACAATAAAGGTCGTATATCTGTAAACATGCTAAGCAGCGTATTAGGAAAAGTTTCTGTTGAGGCTAAGGC TGACAGAGAAAGTCTTGGTATGTACATTGTCAGTGACACAGCAGTTTCAGATGAAGGAATCCAGCTTCTTGATGATATGG AAGAATCCTTAAAAGAAGTATTTGGCTTTACAAATGTGTCTGTAAACACTACAAAATCGTCAGATGTGCCATATGTGACT TATGAGGCAGCGGCGGATAGTGTGGCAACAGATAAGCTGTATGAAATTGCAGCACAGATTGTAAAACAGCTTGCAGGCTA A
Upstream 100 bases:
>100_bases CTATAATATATCTCTCAATTATCCCACCATATCTGCCGAAATATTTATTATATGACAATGAGTGATTGTTTCAGACAGTA AATAAGAAAGGCAGCAGAAT
Downstream 100 bases:
>100_bases AGATTTGCACAGAAAATCCGATATATAGAGCATGAACAGGTAAATTAGACAGACAGAAAGGTTAAGATATGAGAATAGGA ACTAATGTGGCAGCGATTGT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 986; Mature: 985
Protein sequence:
>986_residues MTYTVSGANFNKDVAAQGTSINYKENKAVKSEGVAGSFAGVVISGSVTAATDNTYEGLLKEADDVKSQIMASASSAKISL KALMMKLSGADAVKLDEDGFNLTDATPDDMVNIIEKIKIELAMHSDDYVNYGTAVSKDKIESVTGSAATAASVESRMQGA DIAVNDESVAEVKSTLEKSKELKPLSENTKNYMVANGIEPSIAGIYQAQAATSSSISADGVTIGRCVNAISDADFEALRP GIEKIIASSGLEVNDNTLADARAFIDAQIPVTKENLEYKAQLDAIDIEKIQADPDEMLNKILDNMKLGGKAENTLVTGSP IDDIRTALDTINRAEYSDVANVVSKGETFTIASLKLEMDARSFRIEYSAASVSTGNSEVRNQASDVQQAADKAYDTLVTA RVLMSANASVYLVKNNISILTTPIDELNLMLMEYEQADGMYEEAQIAYTDVLEARKTLNEIVRNPARVFASMFDKMNETY EAVGTQIRGDLGDSLKKAVQGSADDIIKELGLEGTDEDKEAIKILAANNMDMTKENVETVKSVNAMINNLIKNMKPETVL NMIKDGVNPMNASIEEVNEYLTEANDKASKDNEEKFSKFLYKLDRTNGITKEQRKQFIGIYQMMNIFTRDAGVAAGALIK QGAEVTMNNLMTAYNSRKHYDMDAVIDENTGMAEVSGIANYYSALFMANGGLVTPNTLKNVDNSSGIGEQSVEMFIEQLE DNFDAAAEEQYYEEYLKEQQAAVQAGADILRQIRNADTEINSGNIQAVKAFLESGQFPDIRGVKTTRDYARDSIEKIGHK EKLSLMYEEMKDETEEELQEVLSKAGDLDTQIDVNYEGFLDLRLKDRTIGYIKNLALRHDYRIPYITDSGSTGMLKLTLV QDDDNKGRISVNMLSSVLGKVSVEAKADRESLGMYIVSDTAVSDEGIQLLDDMEESLKEVFGFTNVSVNTTKSSDVPYVT YEAAADSVATDKLYEIAAQIVKQLAG
Sequences:
>Translated_986_residues MTYTVSGANFNKDVAAQGTSINYKENKAVKSEGVAGSFAGVVISGSVTAATDNTYEGLLKEADDVKSQIMASASSAKISL KALMMKLSGADAVKLDEDGFNLTDATPDDMVNIIEKIKIELAMHSDDYVNYGTAVSKDKIESVTGSAATAASVESRMQGA DIAVNDESVAEVKSTLEKSKELKPLSENTKNYMVANGIEPSIAGIYQAQAATSSSISADGVTIGRCVNAISDADFEALRP GIEKIIASSGLEVNDNTLADARAFIDAQIPVTKENLEYKAQLDAIDIEKIQADPDEMLNKILDNMKLGGKAENTLVTGSP IDDIRTALDTINRAEYSDVANVVSKGETFTIASLKLEMDARSFRIEYSAASVSTGNSEVRNQASDVQQAADKAYDTLVTA RVLMSANASVYLVKNNISILTTPIDELNLMLMEYEQADGMYEEAQIAYTDVLEARKTLNEIVRNPARVFASMFDKMNETY EAVGTQIRGDLGDSLKKAVQGSADDIIKELGLEGTDEDKEAIKILAANNMDMTKENVETVKSVNAMINNLIKNMKPETVL NMIKDGVNPMNASIEEVNEYLTEANDKASKDNEEKFSKFLYKLDRTNGITKEQRKQFIGIYQMMNIFTRDAGVAAGALIK QGAEVTMNNLMTAYNSRKHYDMDAVIDENTGMAEVSGIANYYSALFMANGGLVTPNTLKNVDNSSGIGEQSVEMFIEQLE DNFDAAAEEQYYEEYLKEQQAAVQAGADILRQIRNADTEINSGNIQAVKAFLESGQFPDIRGVKTTRDYARDSIEKIGHK EKLSLMYEEMKDETEEELQEVLSKAGDLDTQIDVNYEGFLDLRLKDRTIGYIKNLALRHDYRIPYITDSGSTGMLKLTLV QDDDNKGRISVNMLSSVLGKVSVEAKADRESLGMYIVSDTAVSDEGIQLLDDMEESLKEVFGFTNVSVNTTKSSDVPYVT YEAAADSVATDKLYEIAAQIVKQLAG >Mature_985_residues TYTVSGANFNKDVAAQGTSINYKENKAVKSEGVAGSFAGVVISGSVTAATDNTYEGLLKEADDVKSQIMASASSAKISLK ALMMKLSGADAVKLDEDGFNLTDATPDDMVNIIEKIKIELAMHSDDYVNYGTAVSKDKIESVTGSAATAASVESRMQGAD IAVNDESVAEVKSTLEKSKELKPLSENTKNYMVANGIEPSIAGIYQAQAATSSSISADGVTIGRCVNAISDADFEALRPG IEKIIASSGLEVNDNTLADARAFIDAQIPVTKENLEYKAQLDAIDIEKIQADPDEMLNKILDNMKLGGKAENTLVTGSPI DDIRTALDTINRAEYSDVANVVSKGETFTIASLKLEMDARSFRIEYSAASVSTGNSEVRNQASDVQQAADKAYDTLVTAR VLMSANASVYLVKNNISILTTPIDELNLMLMEYEQADGMYEEAQIAYTDVLEARKTLNEIVRNPARVFASMFDKMNETYE AVGTQIRGDLGDSLKKAVQGSADDIIKELGLEGTDEDKEAIKILAANNMDMTKENVETVKSVNAMINNLIKNMKPETVLN MIKDGVNPMNASIEEVNEYLTEANDKASKDNEEKFSKFLYKLDRTNGITKEQRKQFIGIYQMMNIFTRDAGVAAGALIKQ GAEVTMNNLMTAYNSRKHYDMDAVIDENTGMAEVSGIANYYSALFMANGGLVTPNTLKNVDNSSGIGEQSVEMFIEQLED NFDAAAEEQYYEEYLKEQQAAVQAGADILRQIRNADTEINSGNIQAVKAFLESGQFPDIRGVKTTRDYARDSIEKIGHKE KLSLMYEEMKDETEEELQEVLSKAGDLDTQIDVNYEGFLDLRLKDRTIGYIKNLALRHDYRIPYITDSGSTGMLKLTLVQ DDDNKGRISVNMLSSVLGKVSVEAKADRESLGMYIVSDTAVSDEGIQLLDDMEESLKEVFGFTNVSVNTTKSSDVPYVTY EAAADSVATDKLYEIAAQIVKQLAG
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 107551; Mature: 107419
Theoretical pI: Translated: 4.24; Mature: 4.24
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 3.8 %Met (Translated Protein) 3.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 3.7 %Met (Mature Protein) 3.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MTYTVSGANFNKDVAAQGTSINYKENKAVKSEGVAGSFAGVVISGSVTAATDNTYEGLLK CEEEECCCCCCCCHHCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCEEEECCEEECCCCHHHHHHH EADDVKSQIMASASSAKISLKALMMKLSGADAVKLDEDGFNLTDATPDDMVNIIEKIKIE HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHEEE LAMHSDDYVNYGTAVSKDKIESVTGSAATAASVESRMQGADIAVNDESVAEVKSTLEKSK EEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHH ELKPLSENTKNYMVANGIEPSIAGIYQAQAATSSSISADGVTIGRCVNAISDADFEALRP CCCCCCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHH GIEKIIASSGLEVNDNTLADARAFIDAQIPVTKENLEYKAQLDAIDIEKIQADPDEMLNK HHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEECCCEEHHHHCCCHHHHHHH ILDNMKLGGKAENTLVTGSPIDDIRTALDTINRAEYSDVANVVSKGETFTIASLKLEMDA HHHCCCCCCCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEEECC RSFRIEYSAASVSTGNSEVRNQASDVQQAADKAYDTLVTARVLMSANASVYLVKNNISIL CEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCEEE TTPIDELNLMLMEYEQADGMYEEAQIAYTDVLEARKTLNEIVRNPARVFASMFDKMNETY ECCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHH EAVGTQIRGDLGDSLKKAVQGSADDIIKELGLEGTDEDKEAIKILAANNMDMTKENVETV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHEEEEECCCCCCCHHHHHHH KSVNAMINNLIKNMKPETVLNMIKDGVNPMNASIEEVNEYLTEANDKASKDNEEKFSKFL HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHH YKLDRTNGITKEQRKQFIGIYQMMNIFTRDAGVAAGALIKQGAEVTMNNLMTAYNSRKHY HHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCC DMDAVIDENTGMAEVSGIANYYSALFMANGGLVTPNTLKNVDNSSGIGEQSVEMFIEQLE CCHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH DNFDAAAEEQYYEEYLKEQQAAVQAGADILRQIRNADTEINSGNIQAVKAFLESGQFPDI HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCC RGVKTTRDYARDSIEKIGHKEKLSLMYEEMKDETEEELQEVLSKAGDLDTQIDVNYEGFL CCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCEE DLRLKDRTIGYIKNLALRHDYRIPYITDSGSTGMLKLTLVQDDDNKGRISVNMLSSVLGK EEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCCEEEEEEEECCCCCCEEEHHHHHHHHHH VSVEAKADRESLGMYIVSDTAVSDEGIQLLDDMEESLKEVFGFTNVSVNTTKSSDVPYVT CCCCCCCCHHHCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCCCEEE YEAAADSVATDKLYEIAAQIVKQLAG EHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure TYTVSGANFNKDVAAQGTSINYKENKAVKSEGVAGSFAGVVISGSVTAATDNTYEGLLK EEEECCCCCCCCHHCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCEEEECCEEECCCCHHHHHHH EADDVKSQIMASASSAKISLKALMMKLSGADAVKLDEDGFNLTDATPDDMVNIIEKIKIE HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHEEE LAMHSDDYVNYGTAVSKDKIESVTGSAATAASVESRMQGADIAVNDESVAEVKSTLEKSK EEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHH ELKPLSENTKNYMVANGIEPSIAGIYQAQAATSSSISADGVTIGRCVNAISDADFEALRP CCCCCCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHH GIEKIIASSGLEVNDNTLADARAFIDAQIPVTKENLEYKAQLDAIDIEKIQADPDEMLNK HHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEECCCEEHHHHCCCHHHHHHH ILDNMKLGGKAENTLVTGSPIDDIRTALDTINRAEYSDVANVVSKGETFTIASLKLEMDA HHHCCCCCCCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEEECC RSFRIEYSAASVSTGNSEVRNQASDVQQAADKAYDTLVTARVLMSANASVYLVKNNISIL CEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCEEE TTPIDELNLMLMEYEQADGMYEEAQIAYTDVLEARKTLNEIVRNPARVFASMFDKMNETY ECCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHH EAVGTQIRGDLGDSLKKAVQGSADDIIKELGLEGTDEDKEAIKILAANNMDMTKENVETV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHEEEEECCCCCCCHHHHHHH KSVNAMINNLIKNMKPETVLNMIKDGVNPMNASIEEVNEYLTEANDKASKDNEEKFSKFL HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHH YKLDRTNGITKEQRKQFIGIYQMMNIFTRDAGVAAGALIKQGAEVTMNNLMTAYNSRKHY HHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCC DMDAVIDENTGMAEVSGIANYYSALFMANGGLVTPNTLKNVDNSSGIGEQSVEMFIEQLE CCHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH DNFDAAAEEQYYEEYLKEQQAAVQAGADILRQIRNADTEINSGNIQAVKAFLESGQFPDI HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCC RGVKTTRDYARDSIEKIGHKEKLSLMYEEMKDETEEELQEVLSKAGDLDTQIDVNYEGFL CCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCEE DLRLKDRTIGYIKNLALRHDYRIPYITDSGSTGMLKLTLVQDDDNKGRISVNMLSSVLGK EEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCCEEEEEEEECCCCCCEEEHHHHHHHHHH VSVEAKADRESLGMYIVSDTAVSDEGIQLLDDMEESLKEVFGFTNVSVNTTKSSDVPYVT CCCCCCCCHHHCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCCCEEE YEAAADSVATDKLYEIAAQIVKQLAG EHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA