Definition Eubacterium eligens ATCC 27750 chromosome, complete genome.
Accession NC_012778
Length 2,144,190

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The map label for this gene is yfhO [H]

Identifier: 238916871

GI number: 238916871

Start: 954380

End: 957196

Strand: Direct

Name: yfhO [H]

Synonym: EUBELI_00940

Alternate gene names: 238916871

Gene position: 954380-957196 (Clockwise)

Preceding gene: 238916870

Following gene: 238916872

Centisome position: 44.51

GC content: 36.71

Gene sequence:

>2817_bases
ATGGCAGAGATGAAATCGAAGTTACAAGATTTTTATAAAAGACTTGATTCCAGAAAATCAACATATTTTCTGGCTTATTC
AGTTATTTTTGCAATCCTTGCTATAGGTGTGTTTTCTTTTTATTTTTTCACTGGAAAGACATTCATATGGGAGGTTGATG
GCTGGGAACAGCATTATAAGTCACTCATATATTATTCACAGTATTTAAGGGATTTCTTTAAAAATATATTTATCAATCGT
CAGTTTGTAATACCACAGTGGGATTTTGCAATAGGTGAGGGAAGTGATGTTATAGGAACATTTCACTATTATGTTATAGG
CGACCCATTTACATTCTTCTGTTTCCTGTTTCCTGCAAAGTACATGTATATATTCTATGAAGCAATGATTCTTTTAAGAA
TATATCTGTCAGGTATAGCATTTTCACTGCTGTGTTTTTATATAGGACATAAGAAAAGATATGTCCTTCCAGGAGCAGTA
GCTTATGCATTCTGCTACTGGGCAATATATAATGCAGTAAGACATCCGTTTTTTCTTAACCCGCTTCTGTATTATCCTCT
GCTTGTATTAGGCGTTGAGAAGATAATCAGAGAGAAGAAAATGTGGCTCTTTACAATAACAGTAGCTGTTGCTGCAATGA
GTAATTTTTATTTCTTCTACATGCTTGTGTTCACAACAATTATATATGTTATTGTAAGATTCATATTCTGTTATGGAAAG
AATGTAAAAATGTGGGGCAAAGGAATATTAAGACTTGCAGTTTCATCGGTTACAGGACTGTGTATGGCGGCAATAGTGTT
TCTCCCTGTGCTTCACGTTTTCTTAAGTGACAGCAGATTTAATACACCTAATAAAATGGGACTGGTATATCCTTTTTCAT
ACTATGCAAAGCTTCCGGGACTTTTTATCGTTGAGGGTGATAACTTCTGGACATGCATGGGATTTGCAGTGCCGGTGTTA
CTTGCAGTGCTTTTAATGTTTAAGAGCAGACGTAAGTACACAATGCTTAAGACTTATTTTATTATAAGTGCTGTGATGAT
ATGTATACCGTTCTTCGGACAGGCAATGAACGGATTTTCATATATGTGTAACAGGTGGATATATTCATTTGCATTATTAT
GTGCATATATACTTGTGTGCATGATGCCGCGTCTTATAAAACTGGAAAGAAAAGAAATCCGCTTTATTGGAATTGCACTT
ACAATATATTTTGTGGTATGTATGTGCGTAAAGTATTCAAGAAATGGCAAGCTTATAAGTGCAGTTGCAATCGGAGCAAT
ATTGCTAATTGGACTTAGCATAAAGAATGTTAATGAATATAACAGATGCATGATGGTGACAGTAGCGGTTATGGTGGCGG
CATTAGCTAATGGCATATGGAAAAATGCTTCATTTGGGGAAAATTATGCGGCACAGTGCATAAGCGTTAAAATGGCACAG
GAAGATGTGTTTGGAAGCGAGAAGGAGCTTATAAGTAAAGATGCTGAAGATACAGATTTTATCAGATATTCAGGCTCGGG
ACTTTCATACAATATGAATTGCATTACTGGAATATCGTCCTCTAATCTGTACTGGACACTTACTAATCCGTATGTATCGA
AGTTCAGATATGATTGTGCAATCAGACTTGATACGCTGCTTCCGCACAAATACACAGGTTATGATGACAGGTCGTCTCTT
ATAGCTTTATCATCTGCCTCAAAGTATCTGGTGAGTAAGACCGGCGGACTTGTTCCATATGGATTTACTTATGAATCAGA
AAATGATGATTATGTAATGTATAATAACGACAATGCACTTCCATTAGGCTTTACCTATGACAAAGCTGTTAATAAGAGGG
AATGGGAAGGCTTAAGTGCAGTAGATAAGCAGAAGGCTATGCTTCAGGCTGTTGTTATTGGCAGAAGTGGGAAAGATACC
AGGGAGGCGCTTCCTAACAGGGTATCTGTTAAAGATTTAAGTTATGACAGCCAGATTAAAGATTATACAATGGATTATGA
TGCTAAAGAGGTACAGTGTACTGACAATACATTTGCAGTAACTAAGGCAGGTGCCAGGGTAACATTTAACTTTACAGGCA
GTGGTGCAGGCGAGACTTACTTTAATATTAATGGTCTTGACTATGAAGGAGCGGCACAGTTCCAGCTGTATTTTGGAAAG
AGGAAGTTTGATCCATTAGACTTATACTCTAAGGCAGACTGGAAAGAGCTTTCACATAATGAAAAGAAGAAGATATTTAA
GAATTTCATATACTGGACACAGTCTACAAGCAGTGTTAAGCTTGGGATTACGACTGATACAGGAGTAACCAAGTCAATGA
ATTACTTTACATCTGATTACAGCTATTATAGTAACCAGCATGATTTCAGTGTGAATATGGGTTATTCGGAAGAAAATGTG
ACATCAGTTACAGTGACTTTCCAGAAGATTGGTGTGTATTCTTATGATGATATACAGATTGTATGCCAGCCGATGGACAG
TTACACTGACGAGATTAATGCACTTAAAGAAAATGTATTAACAGATGTAGAGCTTGGAAATAATAAGGTTACAGGACAGA
TAACACTTGACCGTAATAAATATCTGTGTCTTACAATCCCTTATTCAAAGGGATGGAAGGTATATGTAGACGGAGAAAGA
CAAAAGCTATATAATGCTAATGGCCAGTATATGGCTGTATATCTTACGAGTGGAACGCATAATGTAACACTTAAGTATTC
TACGCCGCTTCTTAAAGAGGGAGCGCTTATGTCACTTGCAGGTGTGGCCATCTTTGCCATGCAGCTTGTAATTAATAATA
GAAAGAAGAGGAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATCTTCATTGATAATTTAATCACAATAAGTTATAATAAGAAACTGCCGTAGGCTTATGCTTATGGCAGTTTCCTAGTTTA
AGAAAAGAGAAGATACACCT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAATGTACAGAGAAGTTGCGAAGCTTATTATATATGGTAATCATGAGGACACTATTCTTATGAAAATGTCCGATATTTTC
AAAAAATTTGACAGGGATGA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 938; Mature: 937

Protein sequence:

>938_residues
MAEMKSKLQDFYKRLDSRKSTYFLAYSVIFAILAIGVFSFYFFTGKTFIWEVDGWEQHYKSLIYYSQYLRDFFKNIFINR
QFVIPQWDFAIGEGSDVIGTFHYYVIGDPFTFFCFLFPAKYMYIFYEAMILLRIYLSGIAFSLLCFYIGHKKRYVLPGAV
AYAFCYWAIYNAVRHPFFLNPLLYYPLLVLGVEKIIREKKMWLFTITVAVAAMSNFYFFYMLVFTTIIYVIVRFIFCYGK
NVKMWGKGILRLAVSSVTGLCMAAIVFLPVLHVFLSDSRFNTPNKMGLVYPFSYYAKLPGLFIVEGDNFWTCMGFAVPVL
LAVLLMFKSRRKYTMLKTYFIISAVMICIPFFGQAMNGFSYMCNRWIYSFALLCAYILVCMMPRLIKLERKEIRFIGIAL
TIYFVVCMCVKYSRNGKLISAVAIGAILLIGLSIKNVNEYNRCMMVTVAVMVAALANGIWKNASFGENYAAQCISVKMAQ
EDVFGSEKELISKDAEDTDFIRYSGSGLSYNMNCITGISSSNLYWTLTNPYVSKFRYDCAIRLDTLLPHKYTGYDDRSSL
IALSSASKYLVSKTGGLVPYGFTYESENDDYVMYNNDNALPLGFTYDKAVNKREWEGLSAVDKQKAMLQAVVIGRSGKDT
REALPNRVSVKDLSYDSQIKDYTMDYDAKEVQCTDNTFAVTKAGARVTFNFTGSGAGETYFNINGLDYEGAAQFQLYFGK
RKFDPLDLYSKADWKELSHNEKKKIFKNFIYWTQSTSSVKLGITTDTGVTKSMNYFTSDYSYYSNQHDFSVNMGYSEENV
TSVTVTFQKIGVYSYDDIQIVCQPMDSYTDEINALKENVLTDVELGNNKVTGQITLDRNKYLCLTIPYSKGWKVYVDGER
QKLYNANGQYMAVYLTSGTHNVTLKYSTPLLKEGALMSLAGVAIFAMQLVINNRKKRK

Sequences:

>Translated_938_residues
MAEMKSKLQDFYKRLDSRKSTYFLAYSVIFAILAIGVFSFYFFTGKTFIWEVDGWEQHYKSLIYYSQYLRDFFKNIFINR
QFVIPQWDFAIGEGSDVIGTFHYYVIGDPFTFFCFLFPAKYMYIFYEAMILLRIYLSGIAFSLLCFYIGHKKRYVLPGAV
AYAFCYWAIYNAVRHPFFLNPLLYYPLLVLGVEKIIREKKMWLFTITVAVAAMSNFYFFYMLVFTTIIYVIVRFIFCYGK
NVKMWGKGILRLAVSSVTGLCMAAIVFLPVLHVFLSDSRFNTPNKMGLVYPFSYYAKLPGLFIVEGDNFWTCMGFAVPVL
LAVLLMFKSRRKYTMLKTYFIISAVMICIPFFGQAMNGFSYMCNRWIYSFALLCAYILVCMMPRLIKLERKEIRFIGIAL
TIYFVVCMCVKYSRNGKLISAVAIGAILLIGLSIKNVNEYNRCMMVTVAVMVAALANGIWKNASFGENYAAQCISVKMAQ
EDVFGSEKELISKDAEDTDFIRYSGSGLSYNMNCITGISSSNLYWTLTNPYVSKFRYDCAIRLDTLLPHKYTGYDDRSSL
IALSSASKYLVSKTGGLVPYGFTYESENDDYVMYNNDNALPLGFTYDKAVNKREWEGLSAVDKQKAMLQAVVIGRSGKDT
REALPNRVSVKDLSYDSQIKDYTMDYDAKEVQCTDNTFAVTKAGARVTFNFTGSGAGETYFNINGLDYEGAAQFQLYFGK
RKFDPLDLYSKADWKELSHNEKKKIFKNFIYWTQSTSSVKLGITTDTGVTKSMNYFTSDYSYYSNQHDFSVNMGYSEENV
TSVTVTFQKIGVYSYDDIQIVCQPMDSYTDEINALKENVLTDVELGNNKVTGQITLDRNKYLCLTIPYSKGWKVYVDGER
QKLYNANGQYMAVYLTSGTHNVTLKYSTPLLKEGALMSLAGVAIFAMQLVINNRKKRK
>Mature_937_residues
AEMKSKLQDFYKRLDSRKSTYFLAYSVIFAILAIGVFSFYFFTGKTFIWEVDGWEQHYKSLIYYSQYLRDFFKNIFINRQ
FVIPQWDFAIGEGSDVIGTFHYYVIGDPFTFFCFLFPAKYMYIFYEAMILLRIYLSGIAFSLLCFYIGHKKRYVLPGAVA
YAFCYWAIYNAVRHPFFLNPLLYYPLLVLGVEKIIREKKMWLFTITVAVAAMSNFYFFYMLVFTTIIYVIVRFIFCYGKN
VKMWGKGILRLAVSSVTGLCMAAIVFLPVLHVFLSDSRFNTPNKMGLVYPFSYYAKLPGLFIVEGDNFWTCMGFAVPVLL
AVLLMFKSRRKYTMLKTYFIISAVMICIPFFGQAMNGFSYMCNRWIYSFALLCAYILVCMMPRLIKLERKEIRFIGIALT
IYFVVCMCVKYSRNGKLISAVAIGAILLIGLSIKNVNEYNRCMMVTVAVMVAALANGIWKNASFGENYAAQCISVKMAQE
DVFGSEKELISKDAEDTDFIRYSGSGLSYNMNCITGISSSNLYWTLTNPYVSKFRYDCAIRLDTLLPHKYTGYDDRSSLI
ALSSASKYLVSKTGGLVPYGFTYESENDDYVMYNNDNALPLGFTYDKAVNKREWEGLSAVDKQKAMLQAVVIGRSGKDTR
EALPNRVSVKDLSYDSQIKDYTMDYDAKEVQCTDNTFAVTKAGARVTFNFTGSGAGETYFNINGLDYEGAAQFQLYFGKR
KFDPLDLYSKADWKELSHNEKKKIFKNFIYWTQSTSSVKLGITTDTGVTKSMNYFTSDYSYYSNQHDFSVNMGYSEENVT
SVTVTFQKIGVYSYDDIQIVCQPMDSYTDEINALKENVLTDVELGNNKVTGQITLDRNKYLCLTIPYSKGWKVYVDGERQ
KLYNANGQYMAVYLTSGTHNVTLKYSTPLLKEGALMSLAGVAIFAMQLVINNRKKRK

Specific function: Unknown

COG id: COG4485

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR018580 [H]

Pfam domain/function: PF09586 YfhO [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 107519; Mature: 107388

Theoretical pI: Translated: 9.02; Mature: 9.02

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.0 %Cys     (Translated Protein)
3.5 %Met     (Translated Protein)
5.5 %Cys+Met (Translated Protein)
2.0 %Cys     (Mature Protein)
3.4 %Met     (Mature Protein)
5.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MAEMKSKLQDFYKRLDSRKSTYFLAYSVIFAILAIGVFSFYFFTGKTFIWEVDGWEQHYK
CCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCHHHHHH
SLIYYSQYLRDFFKNIFINRQFVIPQWDFAIGEGSDVIGTFHYYVIGDPFTFFCFLFPAK
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHH
YMYIFYEAMILLRIYLSGIAFSLLCFYIGHKKRYVLPGAVAYAFCYWAIYNAVRHPFFLN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
PLLYYPLLVLGVEKIIREKKMWLFTITVAVAAMSNFYFFYMLVFTTIIYVIVRFIFCYGK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
NVKMWGKGILRLAVSSVTGLCMAAIVFLPVLHVFLSDSRFNTPNKMGLVYPFSYYAKLPG
CEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEECHHHHHHCCC
LFIVEGDNFWTCMGFAVPVLLAVLLMFKSRRKYTMLKTYFIISAVMICIPFFGQAMNGFS
EEEEECCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YMCNRWIYSFALLCAYILVCMMPRLIKLERKEIRFIGIALTIYFVVCMCVKYSRNGKLIS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEH
AVAIGAILLIGLSIKNVNEYNRCMMVTVAVMVAALANGIWKNASFGENYAAQCISVKMAQ
HHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHEEHH
EDVFGSEKELISKDAEDTDFIRYSGSGLSYNMNCITGISSSNLYWTLTNPYVSKFRYDCA
HHHCCCHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCEEECEEEECCCCCCEEEEECCHHHHHHEEEEE
IRLDTLLPHKYTGYDDRSSLIALSSASKYLVSKTGGLVPYGFTYESENDDYVMYNNDNAL
EEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCHHHHHCCCCCCEECEEECCCCCCEEEECCCCEE
PLGFTYDKAVNKREWEGLSAVDKQKAMLQAVVIGRSGKDTREALPNRVSVKDLSYDSQIK
EECEEHHHHCCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHEECCCCCCHHHHCCCCCEEEECCCCCCCC
DYTMDYDAKEVQCTDNTFAVTKAGARVTFNFTGSGAGETYFNINGLDYEGAAQFQLYFGK
CCCCCCCCCEEEECCCEEEEEECCCEEEEEEECCCCCCEEEEECCCCCCCCEEEEEEECC
RKFDPLDLYSKADWKELSHNEKKKIFKNFIYWTQSTSSVKLGITTDTGVTKSMNYFTSDY
CCCCCHHCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHEEECCCCEEEEEEECCCCCCCCCHHHCCCC
SYYSNQHDFSVNMGYSEENVTSVTVTFQKIGVYSYDDIQIVCQPMDSYTDEINALKENVL
HHCCCCCCEEEECCCCCCCCEEEEEEEEECCCEECCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHC
TDVELGNNKVTGQITLDRNKYLCLTIPYSKGWKVYVDGERQKLYNANGQYMAVYLTSGTH
CEEECCCCEEEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCEEEECCCHHHHCCCCCCEEEEEEECCCE
NVTLKYSTPLLKEGALMSLAGVAIFAMQLVINNRKKRK
EEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
AEMKSKLQDFYKRLDSRKSTYFLAYSVIFAILAIGVFSFYFFTGKTFIWEVDGWEQHYK
CHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCHHHHHH
SLIYYSQYLRDFFKNIFINRQFVIPQWDFAIGEGSDVIGTFHYYVIGDPFTFFCFLFPAK
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NVKMWGKGILRLAVSSVTGLCMAAIVFLPVLHVFLSDSRFNTPNKMGLVYPFSYYAKLPG
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EECEEHHHHCCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHEECCCCCCHHHHCCCCCEEEECCCCCCCC
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CCCCCHHCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHEEECCCCEEEEEEECCCCCCCCCHHHCCCC
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HHCCCCCCEEEECCCCCCCCEEEEEEEEECCCEECCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHC
TDVELGNNKVTGQITLDRNKYLCLTIPYSKGWKVYVDGERQKLYNANGQYMAVYLTSGTH
CEEECCCCEEEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCEEEECCCHHHHCCCCCCEEEEEEECCCE
NVTLKYSTPLLKEGALMSLAGVAIFAMQLVINNRKKRK
EEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8946165; 9384377 [H]