| Definition | Eubacterium eligens ATCC 27750 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_012778 |
| Length | 2,144,190 |
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The map label for this gene is yfhO [H]
Identifier: 238916871
GI number: 238916871
Start: 954380
End: 957196
Strand: Direct
Name: yfhO [H]
Synonym: EUBELI_00940
Alternate gene names: 238916871
Gene position: 954380-957196 (Clockwise)
Preceding gene: 238916870
Following gene: 238916872
Centisome position: 44.51
GC content: 36.71
Gene sequence:
>2817_bases ATGGCAGAGATGAAATCGAAGTTACAAGATTTTTATAAAAGACTTGATTCCAGAAAATCAACATATTTTCTGGCTTATTC AGTTATTTTTGCAATCCTTGCTATAGGTGTGTTTTCTTTTTATTTTTTCACTGGAAAGACATTCATATGGGAGGTTGATG GCTGGGAACAGCATTATAAGTCACTCATATATTATTCACAGTATTTAAGGGATTTCTTTAAAAATATATTTATCAATCGT CAGTTTGTAATACCACAGTGGGATTTTGCAATAGGTGAGGGAAGTGATGTTATAGGAACATTTCACTATTATGTTATAGG CGACCCATTTACATTCTTCTGTTTCCTGTTTCCTGCAAAGTACATGTATATATTCTATGAAGCAATGATTCTTTTAAGAA TATATCTGTCAGGTATAGCATTTTCACTGCTGTGTTTTTATATAGGACATAAGAAAAGATATGTCCTTCCAGGAGCAGTA GCTTATGCATTCTGCTACTGGGCAATATATAATGCAGTAAGACATCCGTTTTTTCTTAACCCGCTTCTGTATTATCCTCT GCTTGTATTAGGCGTTGAGAAGATAATCAGAGAGAAGAAAATGTGGCTCTTTACAATAACAGTAGCTGTTGCTGCAATGA GTAATTTTTATTTCTTCTACATGCTTGTGTTCACAACAATTATATATGTTATTGTAAGATTCATATTCTGTTATGGAAAG AATGTAAAAATGTGGGGCAAAGGAATATTAAGACTTGCAGTTTCATCGGTTACAGGACTGTGTATGGCGGCAATAGTGTT TCTCCCTGTGCTTCACGTTTTCTTAAGTGACAGCAGATTTAATACACCTAATAAAATGGGACTGGTATATCCTTTTTCAT ACTATGCAAAGCTTCCGGGACTTTTTATCGTTGAGGGTGATAACTTCTGGACATGCATGGGATTTGCAGTGCCGGTGTTA CTTGCAGTGCTTTTAATGTTTAAGAGCAGACGTAAGTACACAATGCTTAAGACTTATTTTATTATAAGTGCTGTGATGAT ATGTATACCGTTCTTCGGACAGGCAATGAACGGATTTTCATATATGTGTAACAGGTGGATATATTCATTTGCATTATTAT GTGCATATATACTTGTGTGCATGATGCCGCGTCTTATAAAACTGGAAAGAAAAGAAATCCGCTTTATTGGAATTGCACTT ACAATATATTTTGTGGTATGTATGTGCGTAAAGTATTCAAGAAATGGCAAGCTTATAAGTGCAGTTGCAATCGGAGCAAT ATTGCTAATTGGACTTAGCATAAAGAATGTTAATGAATATAACAGATGCATGATGGTGACAGTAGCGGTTATGGTGGCGG CATTAGCTAATGGCATATGGAAAAATGCTTCATTTGGGGAAAATTATGCGGCACAGTGCATAAGCGTTAAAATGGCACAG GAAGATGTGTTTGGAAGCGAGAAGGAGCTTATAAGTAAAGATGCTGAAGATACAGATTTTATCAGATATTCAGGCTCGGG ACTTTCATACAATATGAATTGCATTACTGGAATATCGTCCTCTAATCTGTACTGGACACTTACTAATCCGTATGTATCGA AGTTCAGATATGATTGTGCAATCAGACTTGATACGCTGCTTCCGCACAAATACACAGGTTATGATGACAGGTCGTCTCTT ATAGCTTTATCATCTGCCTCAAAGTATCTGGTGAGTAAGACCGGCGGACTTGTTCCATATGGATTTACTTATGAATCAGA AAATGATGATTATGTAATGTATAATAACGACAATGCACTTCCATTAGGCTTTACCTATGACAAAGCTGTTAATAAGAGGG AATGGGAAGGCTTAAGTGCAGTAGATAAGCAGAAGGCTATGCTTCAGGCTGTTGTTATTGGCAGAAGTGGGAAAGATACC AGGGAGGCGCTTCCTAACAGGGTATCTGTTAAAGATTTAAGTTATGACAGCCAGATTAAAGATTATACAATGGATTATGA TGCTAAAGAGGTACAGTGTACTGACAATACATTTGCAGTAACTAAGGCAGGTGCCAGGGTAACATTTAACTTTACAGGCA GTGGTGCAGGCGAGACTTACTTTAATATTAATGGTCTTGACTATGAAGGAGCGGCACAGTTCCAGCTGTATTTTGGAAAG AGGAAGTTTGATCCATTAGACTTATACTCTAAGGCAGACTGGAAAGAGCTTTCACATAATGAAAAGAAGAAGATATTTAA GAATTTCATATACTGGACACAGTCTACAAGCAGTGTTAAGCTTGGGATTACGACTGATACAGGAGTAACCAAGTCAATGA ATTACTTTACATCTGATTACAGCTATTATAGTAACCAGCATGATTTCAGTGTGAATATGGGTTATTCGGAAGAAAATGTG ACATCAGTTACAGTGACTTTCCAGAAGATTGGTGTGTATTCTTATGATGATATACAGATTGTATGCCAGCCGATGGACAG TTACACTGACGAGATTAATGCACTTAAAGAAAATGTATTAACAGATGTAGAGCTTGGAAATAATAAGGTTACAGGACAGA TAACACTTGACCGTAATAAATATCTGTGTCTTACAATCCCTTATTCAAAGGGATGGAAGGTATATGTAGACGGAGAAAGA CAAAAGCTATATAATGCTAATGGCCAGTATATGGCTGTATATCTTACGAGTGGAACGCATAATGTAACACTTAAGTATTC TACGCCGCTTCTTAAAGAGGGAGCGCTTATGTCACTTGCAGGTGTGGCCATCTTTGCCATGCAGCTTGTAATTAATAATA GAAAGAAGAGGAAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases ATCTTCATTGATAATTTAATCACAATAAGTTATAATAAGAAACTGCCGTAGGCTTATGCTTATGGCAGTTTCCTAGTTTA AGAAAAGAGAAGATACACCT
Downstream 100 bases:
>100_bases TAATGTACAGAGAAGTTGCGAAGCTTATTATATATGGTAATCATGAGGACACTATTCTTATGAAAATGTCCGATATTTTC AAAAAATTTGACAGGGATGA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 938; Mature: 937
Protein sequence:
>938_residues MAEMKSKLQDFYKRLDSRKSTYFLAYSVIFAILAIGVFSFYFFTGKTFIWEVDGWEQHYKSLIYYSQYLRDFFKNIFINR QFVIPQWDFAIGEGSDVIGTFHYYVIGDPFTFFCFLFPAKYMYIFYEAMILLRIYLSGIAFSLLCFYIGHKKRYVLPGAV AYAFCYWAIYNAVRHPFFLNPLLYYPLLVLGVEKIIREKKMWLFTITVAVAAMSNFYFFYMLVFTTIIYVIVRFIFCYGK NVKMWGKGILRLAVSSVTGLCMAAIVFLPVLHVFLSDSRFNTPNKMGLVYPFSYYAKLPGLFIVEGDNFWTCMGFAVPVL LAVLLMFKSRRKYTMLKTYFIISAVMICIPFFGQAMNGFSYMCNRWIYSFALLCAYILVCMMPRLIKLERKEIRFIGIAL TIYFVVCMCVKYSRNGKLISAVAIGAILLIGLSIKNVNEYNRCMMVTVAVMVAALANGIWKNASFGENYAAQCISVKMAQ EDVFGSEKELISKDAEDTDFIRYSGSGLSYNMNCITGISSSNLYWTLTNPYVSKFRYDCAIRLDTLLPHKYTGYDDRSSL IALSSASKYLVSKTGGLVPYGFTYESENDDYVMYNNDNALPLGFTYDKAVNKREWEGLSAVDKQKAMLQAVVIGRSGKDT REALPNRVSVKDLSYDSQIKDYTMDYDAKEVQCTDNTFAVTKAGARVTFNFTGSGAGETYFNINGLDYEGAAQFQLYFGK RKFDPLDLYSKADWKELSHNEKKKIFKNFIYWTQSTSSVKLGITTDTGVTKSMNYFTSDYSYYSNQHDFSVNMGYSEENV TSVTVTFQKIGVYSYDDIQIVCQPMDSYTDEINALKENVLTDVELGNNKVTGQITLDRNKYLCLTIPYSKGWKVYVDGER QKLYNANGQYMAVYLTSGTHNVTLKYSTPLLKEGALMSLAGVAIFAMQLVINNRKKRK
Sequences:
>Translated_938_residues MAEMKSKLQDFYKRLDSRKSTYFLAYSVIFAILAIGVFSFYFFTGKTFIWEVDGWEQHYKSLIYYSQYLRDFFKNIFINR QFVIPQWDFAIGEGSDVIGTFHYYVIGDPFTFFCFLFPAKYMYIFYEAMILLRIYLSGIAFSLLCFYIGHKKRYVLPGAV AYAFCYWAIYNAVRHPFFLNPLLYYPLLVLGVEKIIREKKMWLFTITVAVAAMSNFYFFYMLVFTTIIYVIVRFIFCYGK NVKMWGKGILRLAVSSVTGLCMAAIVFLPVLHVFLSDSRFNTPNKMGLVYPFSYYAKLPGLFIVEGDNFWTCMGFAVPVL LAVLLMFKSRRKYTMLKTYFIISAVMICIPFFGQAMNGFSYMCNRWIYSFALLCAYILVCMMPRLIKLERKEIRFIGIAL TIYFVVCMCVKYSRNGKLISAVAIGAILLIGLSIKNVNEYNRCMMVTVAVMVAALANGIWKNASFGENYAAQCISVKMAQ EDVFGSEKELISKDAEDTDFIRYSGSGLSYNMNCITGISSSNLYWTLTNPYVSKFRYDCAIRLDTLLPHKYTGYDDRSSL IALSSASKYLVSKTGGLVPYGFTYESENDDYVMYNNDNALPLGFTYDKAVNKREWEGLSAVDKQKAMLQAVVIGRSGKDT REALPNRVSVKDLSYDSQIKDYTMDYDAKEVQCTDNTFAVTKAGARVTFNFTGSGAGETYFNINGLDYEGAAQFQLYFGK RKFDPLDLYSKADWKELSHNEKKKIFKNFIYWTQSTSSVKLGITTDTGVTKSMNYFTSDYSYYSNQHDFSVNMGYSEENV TSVTVTFQKIGVYSYDDIQIVCQPMDSYTDEINALKENVLTDVELGNNKVTGQITLDRNKYLCLTIPYSKGWKVYVDGER QKLYNANGQYMAVYLTSGTHNVTLKYSTPLLKEGALMSLAGVAIFAMQLVINNRKKRK >Mature_937_residues AEMKSKLQDFYKRLDSRKSTYFLAYSVIFAILAIGVFSFYFFTGKTFIWEVDGWEQHYKSLIYYSQYLRDFFKNIFINRQ FVIPQWDFAIGEGSDVIGTFHYYVIGDPFTFFCFLFPAKYMYIFYEAMILLRIYLSGIAFSLLCFYIGHKKRYVLPGAVA YAFCYWAIYNAVRHPFFLNPLLYYPLLVLGVEKIIREKKMWLFTITVAVAAMSNFYFFYMLVFTTIIYVIVRFIFCYGKN VKMWGKGILRLAVSSVTGLCMAAIVFLPVLHVFLSDSRFNTPNKMGLVYPFSYYAKLPGLFIVEGDNFWTCMGFAVPVLL AVLLMFKSRRKYTMLKTYFIISAVMICIPFFGQAMNGFSYMCNRWIYSFALLCAYILVCMMPRLIKLERKEIRFIGIALT IYFVVCMCVKYSRNGKLISAVAIGAILLIGLSIKNVNEYNRCMMVTVAVMVAALANGIWKNASFGENYAAQCISVKMAQE DVFGSEKELISKDAEDTDFIRYSGSGLSYNMNCITGISSSNLYWTLTNPYVSKFRYDCAIRLDTLLPHKYTGYDDRSSLI ALSSASKYLVSKTGGLVPYGFTYESENDDYVMYNNDNALPLGFTYDKAVNKREWEGLSAVDKQKAMLQAVVIGRSGKDTR EALPNRVSVKDLSYDSQIKDYTMDYDAKEVQCTDNTFAVTKAGARVTFNFTGSGAGETYFNINGLDYEGAAQFQLYFGKR KFDPLDLYSKADWKELSHNEKKKIFKNFIYWTQSTSSVKLGITTDTGVTKSMNYFTSDYSYYSNQHDFSVNMGYSEENVT SVTVTFQKIGVYSYDDIQIVCQPMDSYTDEINALKENVLTDVELGNNKVTGQITLDRNKYLCLTIPYSKGWKVYVDGERQ KLYNANGQYMAVYLTSGTHNVTLKYSTPLLKEGALMSLAGVAIFAMQLVINNRKKRK
Specific function: Unknown
COG id: COG4485
COG function: function code S; Predicted membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR018580 [H]
Pfam domain/function: PF09586 YfhO [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 107519; Mature: 107388
Theoretical pI: Translated: 9.02; Mature: 9.02
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
2.0 %Cys (Translated Protein) 3.5 %Met (Translated Protein) 5.5 %Cys+Met (Translated Protein) 2.0 %Cys (Mature Protein) 3.4 %Met (Mature Protein) 5.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MAEMKSKLQDFYKRLDSRKSTYFLAYSVIFAILAIGVFSFYFFTGKTFIWEVDGWEQHYK CCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCHHHHHH SLIYYSQYLRDFFKNIFINRQFVIPQWDFAIGEGSDVIGTFHYYVIGDPFTFFCFLFPAK HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHH YMYIFYEAMILLRIYLSGIAFSLLCFYIGHKKRYVLPGAVAYAFCYWAIYNAVRHPFFLN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC PLLYYPLLVLGVEKIIREKKMWLFTITVAVAAMSNFYFFYMLVFTTIIYVIVRFIFCYGK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC NVKMWGKGILRLAVSSVTGLCMAAIVFLPVLHVFLSDSRFNTPNKMGLVYPFSYYAKLPG CEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEECHHHHHHCCC LFIVEGDNFWTCMGFAVPVLLAVLLMFKSRRKYTMLKTYFIISAVMICIPFFGQAMNGFS EEEEECCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YMCNRWIYSFALLCAYILVCMMPRLIKLERKEIRFIGIALTIYFVVCMCVKYSRNGKLIS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEH AVAIGAILLIGLSIKNVNEYNRCMMVTVAVMVAALANGIWKNASFGENYAAQCISVKMAQ HHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHEEHH EDVFGSEKELISKDAEDTDFIRYSGSGLSYNMNCITGISSSNLYWTLTNPYVSKFRYDCA HHHCCCHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCEEECEEEECCCCCCEEEEECCHHHHHHEEEEE IRLDTLLPHKYTGYDDRSSLIALSSASKYLVSKTGGLVPYGFTYESENDDYVMYNNDNAL EEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCHHHHHCCCCCCEECEEECCCCCCEEEECCCCEE PLGFTYDKAVNKREWEGLSAVDKQKAMLQAVVIGRSGKDTREALPNRVSVKDLSYDSQIK EECEEHHHHCCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHEECCCCCCHHHHCCCCCEEEECCCCCCCC DYTMDYDAKEVQCTDNTFAVTKAGARVTFNFTGSGAGETYFNINGLDYEGAAQFQLYFGK CCCCCCCCCEEEECCCEEEEEECCCEEEEEEECCCCCCEEEEECCCCCCCCEEEEEEECC RKFDPLDLYSKADWKELSHNEKKKIFKNFIYWTQSTSSVKLGITTDTGVTKSMNYFTSDY CCCCCHHCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHEEECCCCEEEEEEECCCCCCCCCHHHCCCC SYYSNQHDFSVNMGYSEENVTSVTVTFQKIGVYSYDDIQIVCQPMDSYTDEINALKENVL HHCCCCCCEEEECCCCCCCCEEEEEEEEECCCEECCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHC TDVELGNNKVTGQITLDRNKYLCLTIPYSKGWKVYVDGERQKLYNANGQYMAVYLTSGTH CEEECCCCEEEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCEEEECCCHHHHCCCCCCEEEEEEECCCE NVTLKYSTPLLKEGALMSLAGVAIFAMQLVINNRKKRK EEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC >Mature Secondary Structure AEMKSKLQDFYKRLDSRKSTYFLAYSVIFAILAIGVFSFYFFTGKTFIWEVDGWEQHYK CHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCHHHHHH SLIYYSQYLRDFFKNIFINRQFVIPQWDFAIGEGSDVIGTFHYYVIGDPFTFFCFLFPAK HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHH YMYIFYEAMILLRIYLSGIAFSLLCFYIGHKKRYVLPGAVAYAFCYWAIYNAVRHPFFLN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC PLLYYPLLVLGVEKIIREKKMWLFTITVAVAAMSNFYFFYMLVFTTIIYVIVRFIFCYGK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC NVKMWGKGILRLAVSSVTGLCMAAIVFLPVLHVFLSDSRFNTPNKMGLVYPFSYYAKLPG CEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEECHHHHHHCCC LFIVEGDNFWTCMGFAVPVLLAVLLMFKSRRKYTMLKTYFIISAVMICIPFFGQAMNGFS EEEEECCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YMCNRWIYSFALLCAYILVCMMPRLIKLERKEIRFIGIALTIYFVVCMCVKYSRNGKLIS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEH AVAIGAILLIGLSIKNVNEYNRCMMVTVAVMVAALANGIWKNASFGENYAAQCISVKMAQ HHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHEEHH EDVFGSEKELISKDAEDTDFIRYSGSGLSYNMNCITGISSSNLYWTLTNPYVSKFRYDCA HHHCCCHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCEEECEEEECCCCCCEEEEECCHHHHHHEEEEE IRLDTLLPHKYTGYDDRSSLIALSSASKYLVSKTGGLVPYGFTYESENDDYVMYNNDNAL EEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCHHHHHCCCCCCEECEEECCCCCCEEEECCCCEE PLGFTYDKAVNKREWEGLSAVDKQKAMLQAVVIGRSGKDTREALPNRVSVKDLSYDSQIK EECEEHHHHCCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHEECCCCCCHHHHCCCCCEEEECCCCCCCC DYTMDYDAKEVQCTDNTFAVTKAGARVTFNFTGSGAGETYFNINGLDYEGAAQFQLYFGK CCCCCCCCCEEEECCCEEEEEECCCEEEEEEECCCCCCEEEEECCCCCCCCEEEEEEECC RKFDPLDLYSKADWKELSHNEKKKIFKNFIYWTQSTSSVKLGITTDTGVTKSMNYFTSDY CCCCCHHCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHEEECCCCEEEEEEECCCCCCCCCHHHCCCC SYYSNQHDFSVNMGYSEENVTSVTVTFQKIGVYSYDDIQIVCQPMDSYTDEINALKENVL HHCCCCCCEEEECCCCCCCCEEEEEEEEECCCEECCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHC TDVELGNNKVTGQITLDRNKYLCLTIPYSKGWKVYVDGERQKLYNANGQYMAVYLTSGTH CEEECCCCEEEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCEEEECCCHHHHCCCCCCEEEEEEECCCE NVTLKYSTPLLKEGALMSLAGVAIFAMQLVINNRKKRK EEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8946165; 9384377 [H]