| Definition | Eubacterium eligens ATCC 27750 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_012778 |
| Length | 2,144,190 |
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The map label for this gene is 238916100
Identifier: 238916100
GI number: 238916100
Start: 158032
End: 159114
Strand: Direct
Name: 238916100
Synonym: EUBELI_00134
Alternate gene names: NA
Gene position: 158032-159114 (Clockwise)
Preceding gene: 238916099
Following gene: 238916101
Centisome position: 7.37
GC content: 27.05
Gene sequence:
>1083_bases ATGACAAATAATAGAATTATAAAGCTTGATATAGCGAGAACATTTGCAATAATATGTGTTGTTCTTTGCCATTGCAGCCA GATGGTATATACACAGCAAAGTGTGCTTATAAAAGACCTTGGCTTTATGTCACGAGTATTTTTTATGGCAACATTTACTA TAGGAAGGTTGGGAGTTCCGATATTTTTATATCTTTCAGGAGTTTTACTGTTGGAAAAATCAATAGAAAAAGATGAAGAT ATATTCCGTTTTTATAAAAATAATTTATTACCATTATTAATTGTTAATGAAGTATGGATTGTGATATACAATGTATATAA TATTTTTGTCCTAAAAGGAACTTTTTTAGTGACGAATTTTATAAAGGAATTACTGCTTTTAAAAAATTCAGACATGTTAA ATATGTGGTATATGCCAATGATAATTGGTGTATATATTGGAGTTCCATTTTTAGCTAAAATTGTTAAAAGTTTTTCTTTT AAATCATTTAAACCTATTATGATTGTTATGTTTATTTTCTTTTTTATTGTACCAGCATTGAATGTGTTTTCATCCATATT TGGTATTAACCAGACATTTGGTTCAGGGATGAATGTGGCATACATGGGGGGTACATACGGTTTATATCTTCTTGTGGGGT ATTACATATATAATAGGAAATGTGACAGATTGAAAAATTGGATGCTGGTAGTTTTATCTTTAATTAGTTTCTTTATTATT TTATATGTTGAAGTTTATTCTTTATATAATGCATATGGATCTATATATTATGTATGGTATGATTTTCCTTTTCTGTTAAT ATGTACGGGGGGTTTATTTGTTCTTTTTACAAGAATTAAAGATGAATATGTAAATAAAAACATAGCCAGATTATTTACAT ATATAAGCAGAATAAGTATGGGGATATATTTTGTACATAGCTTGATAATATTGGCAGAGATAAAATATATAGGGCAAATG ACTGGAAAATTATCATTAGATGTTTTTCTTCTTATGGCAATTACGATTATTACATCAGTGTTTATTGTGTGGATTTTTAG CAAGAATAGATGTTTGAGAAAATATATGTTTATGATAAAATAG
Upstream 100 bases:
>100_bases CCAGCATTATGTCTCAAACTAAAAATGTATTTCTTAACTATTATTATGATTAAAATAAGAGTGTACCAGAATACAAAATG AATAAAAGGGACTTTATGAT
Downstream 100 bases:
>100_bases AATAGGAGAAAAAATGGGAGAGAACATAAAATCGAAGAGAAATTCTAATATAGAATTATTAAGAATACTTGCAATGCTGA TGATTATTGTATATTTTTAC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 360; Mature: 359
Protein sequence:
>360_residues MTNNRIIKLDIARTFAIICVVLCHCSQMVYTQQSVLIKDLGFMSRVFFMATFTIGRLGVPIFLYLSGVLLLEKSIEKDED IFRFYKNNLLPLLIVNEVWIVIYNVYNIFVLKGTFLVTNFIKELLLLKNSDMLNMWYMPMIIGVYIGVPFLAKIVKSFSF KSFKPIMIVMFIFFFIVPALNVFSSIFGINQTFGSGMNVAYMGGTYGLYLLVGYYIYNRKCDRLKNWMLVVLSLISFFII LYVEVYSLYNAYGSIYYVWYDFPFLLICTGGLFVLFTRIKDEYVNKNIARLFTYISRISMGIYFVHSLIILAEIKYIGQM TGKLSLDVFLLMAITIITSVFIVWIFSKNRCLRKYMFMIK
Sequences:
>Translated_360_residues MTNNRIIKLDIARTFAIICVVLCHCSQMVYTQQSVLIKDLGFMSRVFFMATFTIGRLGVPIFLYLSGVLLLEKSIEKDED IFRFYKNNLLPLLIVNEVWIVIYNVYNIFVLKGTFLVTNFIKELLLLKNSDMLNMWYMPMIIGVYIGVPFLAKIVKSFSF KSFKPIMIVMFIFFFIVPALNVFSSIFGINQTFGSGMNVAYMGGTYGLYLLVGYYIYNRKCDRLKNWMLVVLSLISFFII LYVEVYSLYNAYGSIYYVWYDFPFLLICTGGLFVLFTRIKDEYVNKNIARLFTYISRISMGIYFVHSLIILAEIKYIGQM TGKLSLDVFLLMAITIITSVFIVWIFSKNRCLRKYMFMIK >Mature_359_residues TNNRIIKLDIARTFAIICVVLCHCSQMVYTQQSVLIKDLGFMSRVFFMATFTIGRLGVPIFLYLSGVLLLEKSIEKDEDI FRFYKNNLLPLLIVNEVWIVIYNVYNIFVLKGTFLVTNFIKELLLLKNSDMLNMWYMPMIIGVYIGVPFLAKIVKSFSFK SFKPIMIVMFIFFFIVPALNVFSSIFGINQTFGSGMNVAYMGGTYGLYLLVGYYIYNRKCDRLKNWMLVVLSLISFFIIL YVEVYSLYNAYGSIYYVWYDFPFLLICTGGLFVLFTRIKDEYVNKNIARLFTYISRISMGIYFVHSLIILAEIKYIGQMT GKLSLDVFLLMAITIITSVFIVWIFSKNRCLRKYMFMIK
Specific function: Unknown
COG id: COG3274
COG function: function code S; Uncharacterized protein conserved in bacteria
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 42052; Mature: 41920
Theoretical pI: Translated: 9.75; Mature: 9.75
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.7 %Cys (Translated Protein) 5.0 %Met (Translated Protein) 6.7 %Cys+Met (Translated Protein) 1.7 %Cys (Mature Protein) 4.7 %Met (Mature Protein) 6.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MTNNRIIKLDIARTFAIICVVLCHCSQMVYTQQSVLIKDLGFMSRVFFMATFTIGRLGVP CCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHH IFLYLSGVLLLEKSIEKDEDIFRFYKNNLLPLLIVNEVWIVIYNVYNIFVLKGTFLVTNF HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IKELLLLKNSDMLNMWYMPMIIGVYIGVPFLAKIVKSFSFKSFKPIMIVMFIFFFIVPAL HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH NVFSSIFGINQTFGSGMNVAYMGGTYGLYLLVGYYIYNRKCDRLKNWMLVVLSLISFFII HHHHHHHCCHHHHCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LYVEVYSLYNAYGSIYYVWYDFPFLLICTGGLFVLFTRIKDEYVNKNIARLFTYISRISM HHHHHHHHHHHHCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHH GIYFVHSLIILAEIKYIGQMTGKLSLDVFLLMAITIITSVFIVWIFSKNRCLRKYMFMIK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure TNNRIIKLDIARTFAIICVVLCHCSQMVYTQQSVLIKDLGFMSRVFFMATFTIGRLGVP CCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHH IFLYLSGVLLLEKSIEKDEDIFRFYKNNLLPLLIVNEVWIVIYNVYNIFVLKGTFLVTNF HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IKELLLLKNSDMLNMWYMPMIIGVYIGVPFLAKIVKSFSFKSFKPIMIVMFIFFFIVPAL HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH NVFSSIFGINQTFGSGMNVAYMGGTYGLYLLVGYYIYNRKCDRLKNWMLVVLSLISFFII HHHHHHHCCHHHHCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LYVEVYSLYNAYGSIYYVWYDFPFLLICTGGLFVLFTRIKDEYVNKNIARLFTYISRISM HHHHHHHHHHHHCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHH GIYFVHSLIILAEIKYIGQMTGKLSLDVFLLMAITIITSVFIVWIFSKNRCLRKYMFMIK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA