Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is yfhM [C]

Identifier: 229586888

GI number: 229586888

Start: 794375

End: 800053

Strand: Direct

Name: yfhM [C]

Synonym: RAF_ORF0759

Alternate gene names: 229586888

Gene position: 794375-800053 (Clockwise)

Preceding gene: 229586882

Following gene: 229586894

Centisome position: 62.13

GC content: 32.54

Gene sequence:

>5679_bases
ATGCAAAATATTTTCCGCAAATTTGTATTTACTATTTTCGTATGTTTAATAAATTTACAACTAATTGCTGCAAGCTTTAA
CGAAAAAATACCTTTATATTTTAAATTAACTAACGAAAATCTGTTAGCAGGACAAAATGCGTTAAATATTGACCTTTGCG
ACTCTAGAATTAAAGAATGGTGTACAAAGCCACAAAGAGAGCTAGGGCTTAACGGAAAAAAAATCAATGATTACATATCT
ATTTCACCTGATATTAAAGGAGAATGGCGATTTGGCTGGTGGTATAACATAAATTTTACTCCAGAAAGCAATTTTGTAGC
TCATCAAACTTATAAGATTACTATCAAAGATTATATATTCCCTAATTTTGTCGGTTTAAAAAGTAATAATATAAGTTTCA
CGACTTTACCACTACTTCCTATTATTAAAGAAATGAATTATCTACAGGATAATATCGATATTTCCAAAAAATTCGTTCAA
ACTAAAATAGCTTTTAACTATCCTATCGATCCTAAAACTCTAGAGGAAAGAATAGAGTTTATAAAATCTTCAACTAAAGA
AAAATTACCGTTTTCTATCAAATTCAATACCAATAATACGGAAGCTACGATTATTACTAATATACCACCGCTTACAGATA
AAGAAGATACAATTTCCGTAATTATAAAAGACGGTGTTAAACCTCTACATGGCGGAGAAGTTTTCACATATAAAAATGTA
AAAGATCCAAATAATAAGACGCCAAATAACATAAGATATTCTTATAAAGAAAATGTATTAATTCCAAGTCTATCCTCATA
TTTCAAAATCACTAATAGTACTGCTACAATTGTTAAAGATGATAAACTAAAACCGGAACAGATAATTATAATTACCACAA
ATACACCGGTGTCGGGTGAGGAAATAAAAAAACATTTAGAGTTATTTTTATTACCGCAGGATAAGCCGGCTTTCTTAGGA
GTTGCAGGCAAAAAAAACTATAAATGGCAAAATCCGAAAGAAATAACCGATGATATTCTTAAATCGAGTGAAAAAATAAA
TTTTGAGCTTTTATCTTCCGTCCCAAGCATTACTACTATGCATAGTTTTAAAGTAGATACGTTTGCCTCAAGAGCTTTGC
TTGTTAAAGTAAATCAAGGTGTTAAAACATCGGATAATTTAACACTCGGCTCAGATTATTTTCAAATCGTACAAATACCG
GATAACCCTAAAGAAGTTAAGCTAATGTCCGACGGTTCTATTCTTTCATTAGCCGGCGAAAGAAAGCTTCCCGTATATTC
ACTTGGCATAGATAAATTATATTTAGAAATCGATAAGATTAATCAGCAAGAAGTTAATCATTTAATCAGCCAAACAAATA
GATATAATATTTTCCAAAACCCAACTTTTATAAATGAATATACCTTTAATGAGTATAATATTTCCGAGGTATTTCAAGAG
GAAGTAATAGTGAACTCTCAAAATTTAAATTTACCTCATTATACCGATTTAGATTTCAGTAAATATTTTAATTTAGAAGA
AGCAGGCAGTTATTCCAAGGGGTTATTTCTAGCAAAAGTTTATGCTAAAGACAATAATAACATTATATCTCAAGATAAAA
GATTAATTTTAGTTACCGATCTTGGTTGTATAGTAAAAACCGATAAAACCGGGACGCATCATATCTTTGTTTCTTATATC
AGTAACGGTAAACCGGCTGGAGGCGTAAAAGCAGATATTATAGGACTTAACGGTGAGGTGTTAGTAAGCAGCAAAACCGA
TAGTAAAGGACATGCCGTTTTATCAAATATAAATGATTTTTCAAAAGAAAAAACTCCAGTGGCTTATATATTAACTACTA
AGGATGATTTTTCATTTATGCCGTATAGTAGAATTGATAGACAAGTTAATTATTCTCGGTTTGATGTAGCAGGAGCCGTT
AGTTCTGATCAAGGGTTAAAAGCTTATTTATTTTCCGATCGTGGCATCTATAGACCAAGCGAGCAAGGTCACATAGGCAT
TATGCTCAAACAAACCGACTGGCAAGGGAAATTTGACGGCTTACCTTTAGAAATACAAGTAACTAACCCTAGAGGAAAAG
TAATAGATAAAAGTAAAATAGTTCTAGATGCAGAAGGATTCGGCGAATATTTATTCTCAACGCTTGATGATGCCTTAACC
GGCTTATACAATATAAGCTTATATTTAGTAGGAGATAAAGGCAGCAATAACTATCTTAATAGCGTGTCTGTCAGGGTTGG
TGATTTTCAGCCTGACCGCATGAAAATAAACATAAACTTCAATAACTCACAAGATGAGCTATGGACGAATCCAAAAGATC
TTAAAGCAACCGTTAATCTCATAAATCTTTACGGCACTCCTGCAGAAAATAGAAAAGTCAGCGGCTTTATTGATATTAGA
CCTAACGAGTTTTTCGTACCTAGATTTAAAGAATATAAATTTTATAGTAGCAAAGGAAATAAAGAGTTTTTTTACGAACG
TTTAGGAGATATTACTACCGACTCTAAAGGTACGGCAAACTTTGACCTTAACCTTGAGAAATATTATAACGCTACTTTTA
ATCTAACATTTTCAGCAGAAGGATTTGAGCCTGATTCAGGAAGAAGCGTAAACGCAAGCAAATCGCTTACAGTGTCACCT
CTGCCTTATATTATAGGATTTAGAAGCGATAGCGATCTAAAATATATTAAGACAAGAACAAGCGCGGCAATAGAATTCAT
AGCCATATCAAATAAAGCAGAAAAAGTAGCTGCACCTAATTTAACTCTTAACTTAAAAAAGATTAATTATGTAAATAACT
TAGTAGCAGATAGTAACGGTAATTATTCTTACAGTTCAGTACCTATTGAGACTAATATATCTTCTGACAAAATTAATATC
ACGGCAAACGAAAGTTATATTTATAAAGTACCTACTAAAGAAGCAGGCGATTACGTTATTTACTTAACCGATAAAGAAGA
TACAATCTTTGCCCAAGCTGAATTTTCGGTAATAGGTGAAGGAAATGTTACGGCTAATTTAACAGACAAAGCAAATTTAA
AAGTTAAACTTGATAAAGATGATTATACAGCCGGCGATACTATTCTTTTAAATATTATAACTCCTTATACAGGTTATGGG
TTAATTACTATCGAAACCGATAAAGTACATAATTTTGAATGGTTTAAAGCTGATGAAAATAATAGCATTCAAGAAATAAA
AATTCCTGACGGCTTTGAGGGTAAAGGATATGTAAATGTACAATTTATAAGAGACATAGAAGCTACGGAAATCTTTATAT
CACCGTTTAGCTATGCAGTAGTACCGTTTACTGCGGGCATTTATAAACATAAACAAGATATTGGATTAACACTTCCTGCA
AAAATCAAATCGGGAGAAAAGCTAGCAATTCGTTACCGTACTACAAATCCCGGTAAAATAATAATATTTGCTGTGGATGC
AGGGATATTATCATTTGCTGGTTATCAGACTCCCGATCCGCTTAATTACTTTATTAACGATAAAGCCTTGGAAGTCCGAA
CATCACAAATCATGGATTTAATATTACCTGAGCGTCCTTTATTAATGAAAGCTTATATGGCGGCTCCTGCCGGAGACGGT
TGTATAAATGTCGCTCGAAACCTTAATCCGTTTAAAAGAAAAAGCCAACCTCCCGTAGCATTTTGGTCAGGAATTTTAGA
AGCAGATCTTGATGAGAGAGAAGTCACATTTGATATACCAAGCTATTTTAACGGCACTTTAAGAGTTATAGGGGTAGCCT
CAAGCCTTGACTCTATAGGAACTTCCAAAGCTGATTTATTAGTCCAATCCGATCTTATTATCAATCCAAATTTACCTTTA
TTTGTAGCTCCAAATGATGAATTTACAGTACCGGTAACAATATTTAATAACCTAAAAGATTCAGGAAATGCTCAGGTTTT
TCTAAATATTGAAACAAGTGAAGGACTTAAAATATTAGATTATCCTAAAGAGATCCCGATAGACGAAAATAAGGAAGCTA
CTATTAATGTTAAATTAAAAGCGACTGATCAACTCGGTTCAGCAGATTTAAAGGTTGTGGCTTCTATAAATCACCTAAAG
CCGGATATAATATCTATGGCAGTAGTACATAGCTCCGAATTAACTAGTACTACGAGCGTGCGCCCTGCTAGTCCAAGCGT
TACAACAGTTAATACAGGCTTTATTACAGACAACAAGGCTAATTTAAAAATCTTACGGGATGTATATCCTGAATTTGCTA
AACTACAAATTTCCGCTTCTAAATCACCGCTAGCTATTATTTCTGGCTTTAAAGATTTCCTAGATAATTATCCTTATGGT
TGCACTGAACAATTAATAAGCCAAAATTTTGCCAATATTTTATTATATAATGAACAAGAACTAGTTCAGATTCTTAAAAC
TGATCGTAAAAAAATGGATGAATCATTATCAAAAATATTTCAAACTTTATCAGAACGTCAAAATTATGACGGTGGATTTA
GATATTGGAACAATTTTAATGACGATTCCGATCCATTTATTTCCGTTTATGCTATGCATTTCTTAAGCGAGGGAGCAACT
AGATATTTAGCCGTTCCAAGTGATACATTTAATCAAGGTATTTACTATTTAGAGAATATGGCTAACAGATCAATAAACTC
CTTAGATGAAGCAAGAGAAAAGGCATATGCGGTTTATATCCTGACGCAAAACAGCGTTATTACTACAAGCTATATTGCAA
ATATTTTAAAATATTTAGACGAGTACCATAAAAATACATGGCAAGATGATTTGACTAGCGTTTATTTAGCAGCTAGCTAT
AAAATGCTGCAAATGAATGAAGAAGCAGAGAAATTATTAGACAGATTTACTCTAAATAAACCTATATCAAAAACAGACTA
TCAGTATTACAATCCTCTAATAAAATATAGTCAGTATTTATACTTAATTTCTATGCATTTTCCAGAACGGTTAAAAGACT
TTGACCCAAAAATTGTACAGGATATCGCTCTTTTTGCTCAAGATAACTATAATAGCCTATCCGCAAGCTATGCTATTATG
GCAAGTCTTGCCTATGCCGATAAAATAAATCATGTAGATGAGACTACTATTAAAGTAACCTCTACAGATAAAGAAGTTAC
TTTAACAGGCAATAAAGTGATGATTGCTGAGCTGTCGGTAGAAAATAAGAATATCGACTTAACATCCTCAAGTAACGGCT
TTTTCTATCAGCTTTTAACTTCAGGCTATGATAAGCAATTAACAGAAAATAAAGAGATAGTTAAAGGCATAGAAATAACA
AAAAAATATCTCGATGAAAATAATAAAGAGGTTAGCAAAGTAAAATTAGGTGATAATATTACGGTGGAAATCACCATACG
TTCAGGTAGTAATAAAACCTTGAGCAATATGGTGCTACTTGATTTATTACCGGCAGGCTTCGAGCTTTTACCGGATAACA
ACCACATAAATATATTAGAACGCACGCAGGAAGTAATGATATGGAAACCGATATATATAAATAATCGTGATGATAGAGTT
ATGATTTTCGGTACTATTTCTGATCAAAAAATGACGCATCAGTATAAAATCAAAGCAGTTAATAAGGGCATATTCTCTAC
TCCTGCTATTTACAGTGAAGCTATGTACGACCCTCAAACTTACTATCGTGGTGTTATAGGCAATATTATTGTGGAGTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAAAACTTTTGCTGAATATTGAACAAAATATCCTTATTCATTACTTTACTTAATTTTATTTATATATAATTGAAGTTATC
ATAAATAATAAGCTATAGAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CATTACCCGCACGGTTTTTATGTCATTCCCGTGAAGCATTGTTGCGTGGACCGGTAAATGCTCTCTATGTCATTCCTGCA
AAAGCGGGAATCCAGTAAAA

Product: Large extracellular alpha-helical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 1892; Mature: 1892

Protein sequence:

>1892_residues
MQNIFRKFVFTIFVCLINLQLIAASFNEKIPLYFKLTNENLLAGQNALNIDLCDSRIKEWCTKPQRELGLNGKKINDYIS
ISPDIKGEWRFGWWYNINFTPESNFVAHQTYKITIKDYIFPNFVGLKSNNISFTTLPLLPIIKEMNYLQDNIDISKKFVQ
TKIAFNYPIDPKTLEERIEFIKSSTKEKLPFSIKFNTNNTEATIITNIPPLTDKEDTISVIIKDGVKPLHGGEVFTYKNV
KDPNNKTPNNIRYSYKENVLIPSLSSYFKITNSTATIVKDDKLKPEQIIIITTNTPVSGEEIKKHLELFLLPQDKPAFLG
VAGKKNYKWQNPKEITDDILKSSEKINFELLSSVPSITTMHSFKVDTFASRALLVKVNQGVKTSDNLTLGSDYFQIVQIP
DNPKEVKLMSDGSILSLAGERKLPVYSLGIDKLYLEIDKINQQEVNHLISQTNRYNIFQNPTFINEYTFNEYNISEVFQE
EVIVNSQNLNLPHYTDLDFSKYFNLEEAGSYSKGLFLAKVYAKDNNNIISQDKRLILVTDLGCIVKTDKTGTHHIFVSYI
SNGKPAGGVKADIIGLNGEVLVSSKTDSKGHAVLSNINDFSKEKTPVAYILTTKDDFSFMPYSRIDRQVNYSRFDVAGAV
SSDQGLKAYLFSDRGIYRPSEQGHIGIMLKQTDWQGKFDGLPLEIQVTNPRGKVIDKSKIVLDAEGFGEYLFSTLDDALT
GLYNISLYLVGDKGSNNYLNSVSVRVGDFQPDRMKININFNNSQDELWTNPKDLKATVNLINLYGTPAENRKVSGFIDIR
PNEFFVPRFKEYKFYSSKGNKEFFYERLGDITTDSKGTANFDLNLEKYYNATFNLTFSAEGFEPDSGRSVNASKSLTVSP
LPYIIGFRSDSDLKYIKTRTSAAIEFIAISNKAEKVAAPNLTLNLKKINYVNNLVADSNGNYSYSSVPIETNISSDKINI
TANESYIYKVPTKEAGDYVIYLTDKEDTIFAQAEFSVIGEGNVTANLTDKANLKVKLDKDDYTAGDTILLNIITPYTGYG
LITIETDKVHNFEWFKADENNSIQEIKIPDGFEGKGYVNVQFIRDIEATEIFISPFSYAVVPFTAGIYKHKQDIGLTLPA
KIKSGEKLAIRYRTTNPGKIIIFAVDAGILSFAGYQTPDPLNYFINDKALEVRTSQIMDLILPERPLLMKAYMAAPAGDG
CINVARNLNPFKRKSQPPVAFWSGILEADLDEREVTFDIPSYFNGTLRVIGVASSLDSIGTSKADLLVQSDLIINPNLPL
FVAPNDEFTVPVTIFNNLKDSGNAQVFLNIETSEGLKILDYPKEIPIDENKEATINVKLKATDQLGSADLKVVASINHLK
PDIISMAVVHSSELTSTTSVRPASPSVTTVNTGFITDNKANLKILRDVYPEFAKLQISASKSPLAIISGFKDFLDNYPYG
CTEQLISQNFANILLYNEQELVQILKTDRKKMDESLSKIFQTLSERQNYDGGFRYWNNFNDDSDPFISVYAMHFLSEGAT
RYLAVPSDTFNQGIYYLENMANRSINSLDEAREKAYAVYILTQNSVITTSYIANILKYLDEYHKNTWQDDLTSVYLAASY
KMLQMNEEAEKLLDRFTLNKPISKTDYQYYNPLIKYSQYLYLISMHFPERLKDFDPKIVQDIALFAQDNYNSLSASYAIM
ASLAYADKINHVDETTIKVTSTDKEVTLTGNKVMIAELSVENKNIDLTSSSNGFFYQLLTSGYDKQLTENKEIVKGIEIT
KKYLDENNKEVSKVKLGDNITVEITIRSGSNKTLSNMVLLDLLPAGFELLPDNNHINILERTQEVMIWKPIYINNRDDRV
MIFGTISDQKMTHQYKIKAVNKGIFSTPAIYSEAMYDPQTYYRGVIGNIIVE

Sequences:

>Translated_1892_residues
MQNIFRKFVFTIFVCLINLQLIAASFNEKIPLYFKLTNENLLAGQNALNIDLCDSRIKEWCTKPQRELGLNGKKINDYIS
ISPDIKGEWRFGWWYNINFTPESNFVAHQTYKITIKDYIFPNFVGLKSNNISFTTLPLLPIIKEMNYLQDNIDISKKFVQ
TKIAFNYPIDPKTLEERIEFIKSSTKEKLPFSIKFNTNNTEATIITNIPPLTDKEDTISVIIKDGVKPLHGGEVFTYKNV
KDPNNKTPNNIRYSYKENVLIPSLSSYFKITNSTATIVKDDKLKPEQIIIITTNTPVSGEEIKKHLELFLLPQDKPAFLG
VAGKKNYKWQNPKEITDDILKSSEKINFELLSSVPSITTMHSFKVDTFASRALLVKVNQGVKTSDNLTLGSDYFQIVQIP
DNPKEVKLMSDGSILSLAGERKLPVYSLGIDKLYLEIDKINQQEVNHLISQTNRYNIFQNPTFINEYTFNEYNISEVFQE
EVIVNSQNLNLPHYTDLDFSKYFNLEEAGSYSKGLFLAKVYAKDNNNIISQDKRLILVTDLGCIVKTDKTGTHHIFVSYI
SNGKPAGGVKADIIGLNGEVLVSSKTDSKGHAVLSNINDFSKEKTPVAYILTTKDDFSFMPYSRIDRQVNYSRFDVAGAV
SSDQGLKAYLFSDRGIYRPSEQGHIGIMLKQTDWQGKFDGLPLEIQVTNPRGKVIDKSKIVLDAEGFGEYLFSTLDDALT
GLYNISLYLVGDKGSNNYLNSVSVRVGDFQPDRMKININFNNSQDELWTNPKDLKATVNLINLYGTPAENRKVSGFIDIR
PNEFFVPRFKEYKFYSSKGNKEFFYERLGDITTDSKGTANFDLNLEKYYNATFNLTFSAEGFEPDSGRSVNASKSLTVSP
LPYIIGFRSDSDLKYIKTRTSAAIEFIAISNKAEKVAAPNLTLNLKKINYVNNLVADSNGNYSYSSVPIETNISSDKINI
TANESYIYKVPTKEAGDYVIYLTDKEDTIFAQAEFSVIGEGNVTANLTDKANLKVKLDKDDYTAGDTILLNIITPYTGYG
LITIETDKVHNFEWFKADENNSIQEIKIPDGFEGKGYVNVQFIRDIEATEIFISPFSYAVVPFTAGIYKHKQDIGLTLPA
KIKSGEKLAIRYRTTNPGKIIIFAVDAGILSFAGYQTPDPLNYFINDKALEVRTSQIMDLILPERPLLMKAYMAAPAGDG
CINVARNLNPFKRKSQPPVAFWSGILEADLDEREVTFDIPSYFNGTLRVIGVASSLDSIGTSKADLLVQSDLIINPNLPL
FVAPNDEFTVPVTIFNNLKDSGNAQVFLNIETSEGLKILDYPKEIPIDENKEATINVKLKATDQLGSADLKVVASINHLK
PDIISMAVVHSSELTSTTSVRPASPSVTTVNTGFITDNKANLKILRDVYPEFAKLQISASKSPLAIISGFKDFLDNYPYG
CTEQLISQNFANILLYNEQELVQILKTDRKKMDESLSKIFQTLSERQNYDGGFRYWNNFNDDSDPFISVYAMHFLSEGAT
RYLAVPSDTFNQGIYYLENMANRSINSLDEAREKAYAVYILTQNSVITTSYIANILKYLDEYHKNTWQDDLTSVYLAASY
KMLQMNEEAEKLLDRFTLNKPISKTDYQYYNPLIKYSQYLYLISMHFPERLKDFDPKIVQDIALFAQDNYNSLSASYAIM
ASLAYADKINHVDETTIKVTSTDKEVTLTGNKVMIAELSVENKNIDLTSSSNGFFYQLLTSGYDKQLTENKEIVKGIEIT
KKYLDENNKEVSKVKLGDNITVEITIRSGSNKTLSNMVLLDLLPAGFELLPDNNHINILERTQEVMIWKPIYINNRDDRV
MIFGTISDQKMTHQYKIKAVNKGIFSTPAIYSEAMYDPQTYYRGVIGNIIVE
>Mature_1892_residues
MQNIFRKFVFTIFVCLINLQLIAASFNEKIPLYFKLTNENLLAGQNALNIDLCDSRIKEWCTKPQRELGLNGKKINDYIS
ISPDIKGEWRFGWWYNINFTPESNFVAHQTYKITIKDYIFPNFVGLKSNNISFTTLPLLPIIKEMNYLQDNIDISKKFVQ
TKIAFNYPIDPKTLEERIEFIKSSTKEKLPFSIKFNTNNTEATIITNIPPLTDKEDTISVIIKDGVKPLHGGEVFTYKNV
KDPNNKTPNNIRYSYKENVLIPSLSSYFKITNSTATIVKDDKLKPEQIIIITTNTPVSGEEIKKHLELFLLPQDKPAFLG
VAGKKNYKWQNPKEITDDILKSSEKINFELLSSVPSITTMHSFKVDTFASRALLVKVNQGVKTSDNLTLGSDYFQIVQIP
DNPKEVKLMSDGSILSLAGERKLPVYSLGIDKLYLEIDKINQQEVNHLISQTNRYNIFQNPTFINEYTFNEYNISEVFQE
EVIVNSQNLNLPHYTDLDFSKYFNLEEAGSYSKGLFLAKVYAKDNNNIISQDKRLILVTDLGCIVKTDKTGTHHIFVSYI
SNGKPAGGVKADIIGLNGEVLVSSKTDSKGHAVLSNINDFSKEKTPVAYILTTKDDFSFMPYSRIDRQVNYSRFDVAGAV
SSDQGLKAYLFSDRGIYRPSEQGHIGIMLKQTDWQGKFDGLPLEIQVTNPRGKVIDKSKIVLDAEGFGEYLFSTLDDALT
GLYNISLYLVGDKGSNNYLNSVSVRVGDFQPDRMKININFNNSQDELWTNPKDLKATVNLINLYGTPAENRKVSGFIDIR
PNEFFVPRFKEYKFYSSKGNKEFFYERLGDITTDSKGTANFDLNLEKYYNATFNLTFSAEGFEPDSGRSVNASKSLTVSP
LPYIIGFRSDSDLKYIKTRTSAAIEFIAISNKAEKVAAPNLTLNLKKINYVNNLVADSNGNYSYSSVPIETNISSDKINI
TANESYIYKVPTKEAGDYVIYLTDKEDTIFAQAEFSVIGEGNVTANLTDKANLKVKLDKDDYTAGDTILLNIITPYTGYG
LITIETDKVHNFEWFKADENNSIQEIKIPDGFEGKGYVNVQFIRDIEATEIFISPFSYAVVPFTAGIYKHKQDIGLTLPA
KIKSGEKLAIRYRTTNPGKIIIFAVDAGILSFAGYQTPDPLNYFINDKALEVRTSQIMDLILPERPLLMKAYMAAPAGDG
CINVARNLNPFKRKSQPPVAFWSGILEADLDEREVTFDIPSYFNGTLRVIGVASSLDSIGTSKADLLVQSDLIINPNLPL
FVAPNDEFTVPVTIFNNLKDSGNAQVFLNIETSEGLKILDYPKEIPIDENKEATINVKLKATDQLGSADLKVVASINHLK
PDIISMAVVHSSELTSTTSVRPASPSVTTVNTGFITDNKANLKILRDVYPEFAKLQISASKSPLAIISGFKDFLDNYPYG
CTEQLISQNFANILLYNEQELVQILKTDRKKMDESLSKIFQTLSERQNYDGGFRYWNNFNDDSDPFISVYAMHFLSEGAT
RYLAVPSDTFNQGIYYLENMANRSINSLDEAREKAYAVYILTQNSVITTSYIANILKYLDEYHKNTWQDDLTSVYLAASY
KMLQMNEEAEKLLDRFTLNKPISKTDYQYYNPLIKYSQYLYLISMHFPERLKDFDPKIVQDIALFAQDNYNSLSASYAIM
ASLAYADKINHVDETTIKVTSTDKEVTLTGNKVMIAELSVENKNIDLTSSSNGFFYQLLTSGYDKQLTENKEIVKGIEIT
KKYLDENNKEVSKVKLGDNITVEITIRSGSNKTLSNMVLLDLLPAGFELLPDNNHINILERTQEVMIWKPIYINNRDDRV
MIFGTISDQKMTHQYKIKAVNKGIFSTPAIYSEAMYDPQTYYRGVIGNIIVE

Specific function: Unknown

COG id: COG2373

COG function: function code R; Large extracellular alpha-helical protein

Gene ontology:

Cell location: Attached to the membrane by a lipid anchor (Potential) [C]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the UPF0192 family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1788868, Length=1629, Percent_Identity=22.9588704726826, Blast_Score=242, Evalue=2e-64,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002890
- InterPro:   IPR011625
- InterPro:   IPR021868
- InterPro:   IPR001434
- InterPro:   IPR001599
- InterPro:   IPR008930 [H]

Pfam domain/function: PF00207 A2M; PF01835 A2M_N; PF07703 A2M_N_2; PF11974 MG1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 213785; Mature: 213785

Theoretical pI: Translated: 5.46; Mature: 5.46

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
1.3 %Met     (Translated Protein)
1.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
1.3 %Met     (Mature Protein)
1.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MQNIFRKFVFTIFVCLINLQLIAASFNEKIPLYFKLTNENLLAGQNALNIDLCDSRIKEW
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCEEEEEECCCCEECCCCCEEEEHHHHHHHHH
CTKPQRELGLNGKKINDYISISPDIKGEWRFGWWYNINFTPESNFVAHQTYKITIKDYIF
HCCCHHHHCCCCCEECCEEEECCCCCCCEEEEEEEEEEECCCCCEEEEEEEEEEEECCCC
PNFVGLKSNNISFTTLPLLPIIKEMNYLQDNIDISKKFVQTKIAFNYPIDPKTLEERIEF
CCEEEEECCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHH
IKSSTKEKLPFSIKFNTNNTEATIITNIPPLTDKEDTISVIIKDGVKPLHGGEVFTYKNV
HHCCCCCCCCEEEEECCCCCEEEEEECCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCEEEEECCC
KDPNNKTPNNIRYSYKENVLIPSLSSYFKITNSTATIVKDDKLKPEQIIIITTNTPVSGE
CCCCCCCCCCEEEEECCCEECCCCCHHEEEECCEEEEEECCCCCCCEEEEEECCCCCCHH
EIKKHLELFLLPQDKPAFLGVAGKKNYKWQNPKEITDDILKSSEKINFELLSSVPSITTM
HHHHCEEEEEECCCCCCEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCCCEEEE
HSFKVDTFASRALLVKVNQGVKTSDNLTLGSDYFQIVQIPDNPKEVKLMSDGSILSLAGE
EEEEEHHHCCCEEEEEECCCCCCCCCEEECCCEEEEEECCCCCCEEEEECCCCEEEECCC
RKLPVYSLGIDKLYLEIDKINQQEVNHLISQTNRYNIFQNPTFINEYTFNEYNISEVFQE
CCCCEEEECCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHCCCCEEEECCCEEEEEEECCCCCHHHHHHH
EVIVNSQNLNLPHYTDLDFSKYFNLEEAGSYSKGLFLAKVYAKDNNNIISQDKRLILVTD
HHEECCCCCCCCCCCCCCHHHHCCHHHCCCCCCCEEEEEEEECCCCCEECCCCCEEEEEE
LGCIVKTDKTGTHHIFVSYISNGKPAGGVKADIIGLNGEVLVSSKTDSKGHAVLSNINDF
CCEEEEECCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCEEEEEECCCEEEEEECCCCCCCCEECCCHHH
SKEKTPVAYILTTKDDFSFMPYSRIDRQVNYSRFDVAGAVSSDQGLKAYLFSDRGIYRPS
CCCCCCEEEEEEECCCCCCCCHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCCEEEEECCCCCCCCC
EQGHIGIMLKQTDWQGKFDGLPLEIQVTNPRGKVIDKSKIVLDAEGFGEYLFSTLDDALT
CCCEEEEEEEECCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCEEECCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHH
GLYNISLYLVGDKGSNNYLNSVSVRVGDFQPDRMKININFNNSQDELWTNPKDLKATVNL
CEEEEEEEEEECCCCCCCEEEEEEEECCCCCCEEEEEEEECCCCHHHCCCCHHHEEEEEE
INLYGTPAENRKVSGFIDIRPNEFFVPRFKEYKFYSSKGNKEFFYERLGDITTDSKGTAN
EEEECCCCCCCEEEEEEEECCCCEECCCHHEEEEECCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCEE
FDLNLEKYYNATFNLTFSAEGFEPDSGRSVNASKSLTVSPLPYIIGFRSDSDLKYIKTRT
EEEEEHHEECEEEEEEEEECCCCCCCCCEECCCCCEEECCCCEEEEECCCCCCEEEEECC
SAAIEFIAISNKAEKVAAPNLTLNLKKINYVNNLVADSNGNYSYSSVPIETNISSDKINI
CCEEEEEEECCCCHHEECCCEEEEEEEEEHHHHHEECCCCCEEEEEEEEEECCCCCEEEE
TANESYIYKVPTKEAGDYVIYLTDKEDTIFAQAEFSVIGEGNVTANLTDKANLKVKLDKD
EECCEEEEECCCCCCCCEEEEEECCCCEEEEEEEEEEEECCCEEEEECCCCEEEEEECCC
DYTAGDTILLNIITPYTGYGLITIETDKVHNFEWFKADENNSIQEIKIPDGFEGKGYVNV
CCCCCCEEEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCCEEEEECCCCCCEEEEECCCCCCCCEEEEE
QFIRDIEATEIFISPFSYAVVPFTAGIYKHKQDIGLTLPAKIKSGEKLAIRYRTTNPGKI
EEEECCCEEEEEECCCCEEEEEEHHHHHHHHHHCCEECCCCCCCCCEEEEEEEECCCCEE
IIFAVDAGILSFAGYQTPDPLNYFINDKALEVRTSQIMDLILPERPLLMKAYMAAPAGDG
EEEEECCCHHHHCCCCCCCCCEEEECCCEEEEEHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCCCC
CINVARNLNPFKRKSQPPVAFWSGILEADLDEREVTFDIPSYFNGTLRVIGVASSLDSIG
HHHHHHCCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCEEEEEEEEHHHHHCC
TSKADLLVQSDLIINPNLPLFVAPNDEFTVPVTIFNNLKDSGNAQVFLNIETSEGLKILD
CCCCEEEEECCEEECCCCCEEEECCCCEEEEEEEEECCCCCCCEEEEEEEECCCCEEEEE
YPKEIPIDENKEATINVKLKATDQLGSADLKVVASINHLKPDIISMAVVHSSELTSTTSV
CCCCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCC
RPASPSVTTVNTGFITDNKANLKILRDVYPEFAKLQISASKSPLAIISGFKDFLDNYPYG
CCCCCCEEEEEECEEECCCCCCHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCC
CTEQLISQNFANILLYNEQELVQILKTDRKKMDESLSKIFQTLSERQNYDGGFRYWNNFN
HHHHHHHCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCC
DDSDPFISVYAMHFLSEGATRYLAVPSDTFNQGIYYLENMANRSINSLDEAREKAYAVYI
CCCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCHHCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCEEEEEE
LTQNSVITTSYIANILKYLDEYHKNTWQDDLTSVYLAASYKMLQMNEEAEKLLDRFTLNK
EECCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHEEEEEECEEEEECCHHHHHHHHHHHCCC
PISKTDYQYYNPLIKYSQYLYLISMHFPERLKDFDPKIVQDIALFAQDNYNSLSASYAIM
CCCCCCHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHH
ASLAYADKINHVDETTIKVTSTDKEVTLTGNKVMIAELSVENKNIDLTSSSNGFFYQLLT
HHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCEEEEECCEEEEEEEEECCCCEEEEECCCCEEEEEEC
SGYDKQLTENKEIVKGIEITKKYLDENNKEVSKVKLGDNITVEITIRSGSNKTLSNMVLL
CCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCEEEEEEEECCCCCCHHHEEEE
DLLPAGFELLPDNNHINILERTQEVMIWKPIYINNRDDRVMIFGTISDQKMTHQYKIKAV
ECCCCCEEECCCCCCEEEEECCCEEEEEEEEEECCCCCEEEEEEECCCCCCCEEEEEEEE
NKGIFSTPAIYSEAMYDPQTYYRGVIGNIIVE
CCCCCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHEEEC
>Mature Secondary Structure
MQNIFRKFVFTIFVCLINLQLIAASFNEKIPLYFKLTNENLLAGQNALNIDLCDSRIKEW
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCEEEEEECCCCEECCCCCEEEEHHHHHHHHH
CTKPQRELGLNGKKINDYISISPDIKGEWRFGWWYNINFTPESNFVAHQTYKITIKDYIF
HCCCHHHHCCCCCEECCEEEECCCCCCCEEEEEEEEEEECCCCCEEEEEEEEEEEECCCC
PNFVGLKSNNISFTTLPLLPIIKEMNYLQDNIDISKKFVQTKIAFNYPIDPKTLEERIEF
CCEEEEECCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHH
IKSSTKEKLPFSIKFNTNNTEATIITNIPPLTDKEDTISVIIKDGVKPLHGGEVFTYKNV
HHCCCCCCCCEEEEECCCCCEEEEEECCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCEEEEECCC
KDPNNKTPNNIRYSYKENVLIPSLSSYFKITNSTATIVKDDKLKPEQIIIITTNTPVSGE
CCCCCCCCCCEEEEECCCEECCCCCHHEEEECCEEEEEECCCCCCCEEEEEECCCCCCHH
EIKKHLELFLLPQDKPAFLGVAGKKNYKWQNPKEITDDILKSSEKINFELLSSVPSITTM
HHHHCEEEEEECCCCCCEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCCCEEEE
HSFKVDTFASRALLVKVNQGVKTSDNLTLGSDYFQIVQIPDNPKEVKLMSDGSILSLAGE
EEEEEHHHCCCEEEEEECCCCCCCCCEEECCCEEEEEECCCCCCEEEEECCCCEEEECCC
RKLPVYSLGIDKLYLEIDKINQQEVNHLISQTNRYNIFQNPTFINEYTFNEYNISEVFQE
CCCCEEEECCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHCCCCEEEECCCEEEEEEECCCCCHHHHHHH
EVIVNSQNLNLPHYTDLDFSKYFNLEEAGSYSKGLFLAKVYAKDNNNIISQDKRLILVTD
HHEECCCCCCCCCCCCCCHHHHCCHHHCCCCCCCEEEEEEEECCCCCEECCCCCEEEEEE
LGCIVKTDKTGTHHIFVSYISNGKPAGGVKADIIGLNGEVLVSSKTDSKGHAVLSNINDF
CCEEEEECCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCEEEEEECCCEEEEEECCCCCCCCEECCCHHH
SKEKTPVAYILTTKDDFSFMPYSRIDRQVNYSRFDVAGAVSSDQGLKAYLFSDRGIYRPS
CCCCCCEEEEEEECCCCCCCCHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCCEEEEECCCCCCCCC
EQGHIGIMLKQTDWQGKFDGLPLEIQVTNPRGKVIDKSKIVLDAEGFGEYLFSTLDDALT
CCCEEEEEEEECCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCEEECCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHH
GLYNISLYLVGDKGSNNYLNSVSVRVGDFQPDRMKININFNNSQDELWTNPKDLKATVNL
CEEEEEEEEEECCCCCCCEEEEEEEECCCCCCEEEEEEEECCCCHHHCCCCHHHEEEEEE
INLYGTPAENRKVSGFIDIRPNEFFVPRFKEYKFYSSKGNKEFFYERLGDITTDSKGTAN
EEEECCCCCCCEEEEEEEECCCCEECCCHHEEEEECCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCEE
FDLNLEKYYNATFNLTFSAEGFEPDSGRSVNASKSLTVSPLPYIIGFRSDSDLKYIKTRT
EEEEEHHEECEEEEEEEEECCCCCCCCCEECCCCCEEECCCCEEEEECCCCCCEEEEECC
SAAIEFIAISNKAEKVAAPNLTLNLKKINYVNNLVADSNGNYSYSSVPIETNISSDKINI
CCEEEEEEECCCCHHEECCCEEEEEEEEEHHHHHEECCCCCEEEEEEEEEECCCCCEEEE
TANESYIYKVPTKEAGDYVIYLTDKEDTIFAQAEFSVIGEGNVTANLTDKANLKVKLDKD
EECCEEEEECCCCCCCCEEEEEECCCCEEEEEEEEEEEECCCEEEEECCCCEEEEEECCC
DYTAGDTILLNIITPYTGYGLITIETDKVHNFEWFKADENNSIQEIKIPDGFEGKGYVNV
CCCCCCEEEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCCEEEEECCCCCCEEEEECCCCCCCCEEEEE
QFIRDIEATEIFISPFSYAVVPFTAGIYKHKQDIGLTLPAKIKSGEKLAIRYRTTNPGKI
EEEECCCEEEEEECCCCEEEEEEHHHHHHHHHHCCEECCCCCCCCCEEEEEEEECCCCEE
IIFAVDAGILSFAGYQTPDPLNYFINDKALEVRTSQIMDLILPERPLLMKAYMAAPAGDG
EEEEECCCHHHHCCCCCCCCCEEEECCCEEEEEHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCCCC
CINVARNLNPFKRKSQPPVAFWSGILEADLDEREVTFDIPSYFNGTLRVIGVASSLDSIG
HHHHHHCCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCEEEEEEEEHHHHHCC
TSKADLLVQSDLIINPNLPLFVAPNDEFTVPVTIFNNLKDSGNAQVFLNIETSEGLKILD
CCCCEEEEECCEEECCCCCEEEECCCCEEEEEEEEECCCCCCCEEEEEEEECCCCEEEEE
YPKEIPIDENKEATINVKLKATDQLGSADLKVVASINHLKPDIISMAVVHSSELTSTTSV
CCCCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCC
RPASPSVTTVNTGFITDNKANLKILRDVYPEFAKLQISASKSPLAIISGFKDFLDNYPYG
CCCCCCEEEEEECEEECCCCCCHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCC
CTEQLISQNFANILLYNEQELVQILKTDRKKMDESLSKIFQTLSERQNYDGGFRYWNNFN
HHHHHHHCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCC
DDSDPFISVYAMHFLSEGATRYLAVPSDTFNQGIYYLENMANRSINSLDEAREKAYAVYI
CCCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCHHCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCEEEEEE
LTQNSVITTSYIANILKYLDEYHKNTWQDDLTSVYLAASYKMLQMNEEAEKLLDRFTLNK
EECCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHEEEEEECEEEEECCHHHHHHHHHHHCCC
PISKTDYQYYNPLIKYSQYLYLISMHFPERLKDFDPKIVQDIALFAQDNYNSLSASYAIM
CCCCCCHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHH
ASLAYADKINHVDETTIKVTSTDKEVTLTGNKVMIAELSVENKNIDLTSSSNGFFYQLLT
HHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCEEEEECCEEEEEEEEECCCCEEEEECCCCEEEEEEC
SGYDKQLTENKEIVKGIEITKKYLDENNKEVSKVKLGDNITVEITIRSGSNKTLSNMVLL
CCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCEEEEEEEECCCCCCHHHEEEE
DLLPAGFELLPDNNHINILERTQEVMIWKPIYINNRDDRVMIFGTISDQKMTHQYKIKAV
ECCCCCEEECCCCCCEEEEECCCEEEEEEEEEECCCCCEEEEEEECCCCCCCEEEEEEEE
NKGIFSTPAIYSEAMYDPQTYYRGVIGNIIVE
CCCCCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHEEEC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 11557893 [H]