| Definition | Rickettsia africae ESF-5 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_012633 |
| Length | 1,278,540 |
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The map label for this gene is 229586747
Identifier: 229586747
GI number: 229586747
Start: 630778
End: 633660
Strand: Direct
Name: 229586747
Synonym: RAF_ORF0599
Alternate gene names: NA
Gene position: 630778-633660 (Clockwise)
Preceding gene: 229586746
Following gene: 229586757
Centisome position: 49.34
GC content: 27.33
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases ATCAAATTGATTGAATTACCATATTATGTAATATAAATTAAAATATTTAAGTAGTGCTTAATTTATTTCTTTGAATCAAT TTTAAGATAATTTAATGTTT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 960; Mature: 959
Protein sequence:
>960_residues MAVINNKNYQKVVEKVLSSSKANKVLNSAMQDLLSSKSISLRKSISLRTILLGARFALTNPVNTYNLFRFANSSKIYLDP EFQKALLKKSPIWEFLKKHSDDLPKIGQILANAGFREFQDKSALDAKGLEILKECFKNEQVLKKLQEIAVEVKQELPDWN KVTSRTLDMLVTDKNFQKFFNEKSEDITQYIRTGATEILPSDYIKTFDDILQQPEKKNLLKIFNEHPDFKQELAKNINNP NTLKRFNKLSPEKQIIIENFLEEAKEQAKPFLKEHFETYKIDLKILDIIPTLLNKMPETKEIFDTLNAPNQGVMISLEKS LEMVAGDDKLKSFFANNKTILPNIVLGIIENTPSVQSVTKEYNFDKQMLSIVGEVMSKPEVAHEIIADLNKGDYMSLTGN IISALNDPSFKLKDILVEQSKGGLFDNLITGVLEQDAKNSQTIKQQLINYGLEANDVTKLTSIMPILLDQSESLKKVFRD FIQGDYTGMAKELIALTKDNPEIKKYLNNNREIFASILDKTLVEIPGINNLDKKELYNVLPSMLNHPNELVKVIEEVEKS NYREAASAIYTLAQKTNYLEGQLPNIIKAGFSYATEKLKDVFSPSQDFKGKTIDAITLRNNLHKIQNGKFSLEGAILVGD LSNIDFSGVSLKNADLTKVTSLKDCNFKNINLAEAKLPDNLMLLTDTYNLDKAIPPLVPQLIKEQQAKLIDKAIDKLFLQ IQAEGKRNVFSKKNFVQQVKRLYEENQTIKDYIIEKLNSLPMNMVTNLATPRTNQYKHITNHVNSPLQILNPLYENIANK QNIKSNLLANILSEKISQKLFDKGDNRGEDFYMINQMLKAIVSESSKENPDNINNFLEPKNLEKLASNIASTLYSKSKYT GVGTITGGIYLPKEIFNEQLKDNFKNEFENITKLNILKEATNIVSNLDSKVHVVGNHDKSHIYASLPTKSKQIHRSLHKS
Sequences:
>Translated_960_residues MAVINNKNYQKVVEKVLSSSKANKVLNSAMQDLLSSKSISLRKSISLRTILLGARFALTNPVNTYNLFRFANSSKIYLDP EFQKALLKKSPIWEFLKKHSDDLPKIGQILANAGFREFQDKSALDAKGLEILKECFKNEQVLKKLQEIAVEVKQELPDWN KVTSRTLDMLVTDKNFQKFFNEKSEDITQYIRTGATEILPSDYIKTFDDILQQPEKKNLLKIFNEHPDFKQELAKNINNP NTLKRFNKLSPEKQIIIENFLEEAKEQAKPFLKEHFETYKIDLKILDIIPTLLNKMPETKEIFDTLNAPNQGVMISLEKS LEMVAGDDKLKSFFANNKTILPNIVLGIIENTPSVQSVTKEYNFDKQMLSIVGEVMSKPEVAHEIIADLNKGDYMSLTGN IISALNDPSFKLKDILVEQSKGGLFDNLITGVLEQDAKNSQTIKQQLINYGLEANDVTKLTSIMPILLDQSESLKKVFRD FIQGDYTGMAKELIALTKDNPEIKKYLNNNREIFASILDKTLVEIPGINNLDKKELYNVLPSMLNHPNELVKVIEEVEKS NYREAASAIYTLAQKTNYLEGQLPNIIKAGFSYATEKLKDVFSPSQDFKGKTIDAITLRNNLHKIQNGKFSLEGAILVGD LSNIDFSGVSLKNADLTKVTSLKDCNFKNINLAEAKLPDNLMLLTDTYNLDKAIPPLVPQLIKEQQAKLIDKAIDKLFLQ IQAEGKRNVFSKKNFVQQVKRLYEENQTIKDYIIEKLNSLPMNMVTNLATPRTNQYKHITNHVNSPLQILNPLYENIANK QNIKSNLLANILSEKISQKLFDKGDNRGEDFYMINQMLKAIVSESSKENPDNINNFLEPKNLEKLASNIASTLYSKSKYT GVGTITGGIYLPKEIFNEQLKDNFKNEFENITKLNILKEATNIVSNLDSKVHVVGNHDKSHIYASLPTKSKQIHRSLHKS >Mature_959_residues AVINNKNYQKVVEKVLSSSKANKVLNSAMQDLLSSKSISLRKSISLRTILLGARFALTNPVNTYNLFRFANSSKIYLDPE FQKALLKKSPIWEFLKKHSDDLPKIGQILANAGFREFQDKSALDAKGLEILKECFKNEQVLKKLQEIAVEVKQELPDWNK VTSRTLDMLVTDKNFQKFFNEKSEDITQYIRTGATEILPSDYIKTFDDILQQPEKKNLLKIFNEHPDFKQELAKNINNPN TLKRFNKLSPEKQIIIENFLEEAKEQAKPFLKEHFETYKIDLKILDIIPTLLNKMPETKEIFDTLNAPNQGVMISLEKSL EMVAGDDKLKSFFANNKTILPNIVLGIIENTPSVQSVTKEYNFDKQMLSIVGEVMSKPEVAHEIIADLNKGDYMSLTGNI ISALNDPSFKLKDILVEQSKGGLFDNLITGVLEQDAKNSQTIKQQLINYGLEANDVTKLTSIMPILLDQSESLKKVFRDF IQGDYTGMAKELIALTKDNPEIKKYLNNNREIFASILDKTLVEIPGINNLDKKELYNVLPSMLNHPNELVKVIEEVEKSN YREAASAIYTLAQKTNYLEGQLPNIIKAGFSYATEKLKDVFSPSQDFKGKTIDAITLRNNLHKIQNGKFSLEGAILVGDL SNIDFSGVSLKNADLTKVTSLKDCNFKNINLAEAKLPDNLMLLTDTYNLDKAIPPLVPQLIKEQQAKLIDKAIDKLFLQI QAEGKRNVFSKKNFVQQVKRLYEENQTIKDYIIEKLNSLPMNMVTNLATPRTNQYKHITNHVNSPLQILNPLYENIANKQ NIKSNLLANILSEKISQKLFDKGDNRGEDFYMINQMLKAIVSESSKENPDNINNFLEPKNLEKLASNIASTLYSKSKYTG VGTITGGIYLPKEIFNEQLKDNFKNEFENITKLNILKEATNIVSNLDSKVHVVGNHDKSHIYASLPTKSKQIHRSLHKS
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 109000; Mature: 108869
Theoretical pI: Translated: 9.26; Mature: 9.26
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 1.8 %Met (Translated Protein) 2.0 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 1.7 %Met (Mature Protein) 1.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MAVINNKNYQKVVEKVLSSSKANKVLNSAMQDLLSSKSISLRKSISLRTILLGARFALTN CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC PVNTYNLFRFANSSKIYLDPEFQKALLKKSPIWEFLKKHSDDLPKIGQILANAGFREFQD CCCHHHHHEECCCCEEEECHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHC KSALDAKGLEILKECFKNEQVLKKLQEIAVEVKQELPDWNKVTSRTLDMLVTDKNFQKFF CCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH NEKSEDITQYIRTGATEILPSDYIKTFDDILQQPEKKNLLKIFNEHPDFKQELAKNINNP CCCHHHHHHHHHCCCHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCC NTLKRFNKLSPEKQIIIENFLEEAKEQAKPFLKEHFETYKIDLKILDIIPTLLNKMPETK HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH EIFDTLNAPNQGVMISLEKSLEMVAGDDKLKSFFANNKTILPNIVLGIIENTPSVQSVTK HHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH EYNFDKQMLSIVGEVMSKPEVAHEIIADLNKGDYMSLTGNIISALNDPSFKLKDILVEQS HHCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHC KGGLFDNLITGVLEQDAKNSQTIKQQLINYGLEANDVTKLTSIMPILLDQSESLKKVFRD CCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH FIQGDYTGMAKELIALTKDNPEIKKYLNNNREIFASILDKTLVEIPGINNLDKKELYNVL HHCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHH PSMLNHPNELVKVIEEVEKSNYREAASAIYTLAQKTNYLEGQLPNIIKAGFSYATEKLKD HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH VFSPSQDFKGKTIDAITLRNNLHKIQNGKFSLEGAILVGDLSNIDFSGVSLKNADLTKVT HHCCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHCCCCEEECCEEEEECCCCCCCCCCEECCCCHHHHC SLKDCNFKNINLAEAKLPDNLMLLTDTYNLDKAIPPLVPQLIKEQQAKLIDKAIDKLFLQ CCCCCCCCCCCCHHCCCCCCEEEEEECCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IQAEGKRNVFSKKNFVQQVKRLYEENQTIKDYIIEKLNSLPMNMVTNLATPRTNQYKHIT HHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCCCHHHHH NHVNSPLQILNPLYENIANKQNIKSNLLANILSEKISQKLFDKGDNRGEDFYMINQMLKA HHCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHH IVSESSKENPDNINNFLEPKNLEKLASNIASTLYSKSKYTGVGTITGGIYLPKEIFNEQL HHHCCCCCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCEECCHHHHHHHH KDNFKNEFENITKLNILKEATNIVSNLDSKVHVVGNHDKSHIYASLPTKSKQIHRSLHKS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure AVINNKNYQKVVEKVLSSSKANKVLNSAMQDLLSSKSISLRKSISLRTILLGARFALTN CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC PVNTYNLFRFANSSKIYLDPEFQKALLKKSPIWEFLKKHSDDLPKIGQILANAGFREFQD CCCHHHHHEECCCCEEEECHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHC KSALDAKGLEILKECFKNEQVLKKLQEIAVEVKQELPDWNKVTSRTLDMLVTDKNFQKFF CCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH NEKSEDITQYIRTGATEILPSDYIKTFDDILQQPEKKNLLKIFNEHPDFKQELAKNINNP CCCHHHHHHHHHCCCHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCC NTLKRFNKLSPEKQIIIENFLEEAKEQAKPFLKEHFETYKIDLKILDIIPTLLNKMPETK HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH EIFDTLNAPNQGVMISLEKSLEMVAGDDKLKSFFANNKTILPNIVLGIIENTPSVQSVTK HHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH EYNFDKQMLSIVGEVMSKPEVAHEIIADLNKGDYMSLTGNIISALNDPSFKLKDILVEQS HHCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHC KGGLFDNLITGVLEQDAKNSQTIKQQLINYGLEANDVTKLTSIMPILLDQSESLKKVFRD CCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH FIQGDYTGMAKELIALTKDNPEIKKYLNNNREIFASILDKTLVEIPGINNLDKKELYNVL HHCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHH PSMLNHPNELVKVIEEVEKSNYREAASAIYTLAQKTNYLEGQLPNIIKAGFSYATEKLKD HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH VFSPSQDFKGKTIDAITLRNNLHKIQNGKFSLEGAILVGDLSNIDFSGVSLKNADLTKVT HHCCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHCCCCEEECCEEEEECCCCCCCCCCEECCCCHHHHC SLKDCNFKNINLAEAKLPDNLMLLTDTYNLDKAIPPLVPQLIKEQQAKLIDKAIDKLFLQ CCCCCCCCCCCCHHCCCCCCEEEEEECCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IQAEGKRNVFSKKNFVQQVKRLYEENQTIKDYIIEKLNSLPMNMVTNLATPRTNQYKHIT HHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCCCHHHHH NHVNSPLQILNPLYENIANKQNIKSNLLANILSEKISQKLFDKGDNRGEDFYMINQMLKA HHCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHH IVSESSKENPDNINNFLEPKNLEKLASNIASTLYSKSKYTGVGTITGGIYLPKEIFNEQL HHHCCCCCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCEECCHHHHHHHH KDNFKNEFENITKLNILKEATNIVSNLDSKVHVVGNHDKSHIYASLPTKSKQIHRSLHKS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
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Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9823893 [H]