Definition Rickettsia africae ESF-5 chromosome, complete genome.
Accession NC_012633
Length 1,278,540

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 229586747

Identifier: 229586747

GI number: 229586747

Start: 630778

End: 633660

Strand: Direct

Name: 229586747

Synonym: RAF_ORF0599

Alternate gene names: NA

Gene position: 630778-633660 (Clockwise)

Preceding gene: 229586746

Following gene: 229586757

Centisome position: 49.34

GC content: 27.33

Gene sequence:

>2883_bases
ATGGCTGTTATAAATAATAAAAACTATCAAAAAGTTGTAGAAAAAGTTTTATCTTCTTCTAAAGCTAATAAAGTACTAAA
TAGTGCAATGCAGGACTTATTATCTTCAAAGAGTATAAGCTTAAGAAAGAGTATAAGCTTAAGAACGATATTACTCGGAG
CAAGATTTGCTTTAACTAATCCTGTAAATACTTATAATCTTTTTAGGTTTGCTAACTCTTCTAAGATATATCTTGATCCG
GAATTTCAAAAAGCACTTCTTAAAAAATCTCCAATATGGGAATTTTTAAAAAAACATTCGGATGATTTGCCTAAAATAGG
TCAAATCTTAGCAAATGCGGGCTTTAGAGAATTTCAAGATAAGAGTGCTTTAGATGCAAAGGGACTCGAAATACTAAAAG
AATGTTTTAAAAATGAACAAGTACTTAAAAAACTTCAAGAAATTGCAGTTGAAGTAAAGCAAGAGCTACCGGACTGGAAT
AAAGTGACTTCTAGGACTTTAGATATGCTGGTTACCGATAAAAACTTCCAAAAATTCTTTAACGAAAAGAGTGAAGATAT
TACGCAATACATACGTACAGGAGCAACTGAAATACTTCCAAGCGATTATATAAAAACTTTTGATGATATATTACAACAAC
CCGAAAAGAAAAATTTATTAAAAATATTTAATGAACATCCTGATTTTAAGCAAGAACTGGCTAAAAATATAAACAATCCT
AATACTCTAAAAAGATTTAATAAGTTATCTCCTGAAAAACAAATAATTATTGAAAATTTCTTAGAAGAAGCAAAAGAACA
AGCTAAACCTTTCTTAAAAGAACATTTTGAAACCTACAAAATTGATCTTAAAATTTTAGATATTATTCCTACTTTATTAA
ATAAAATGCCTGAGACAAAAGAGATTTTTGATACTCTTAATGCTCCAAATCAAGGTGTAATGATATCTCTTGAGAAATCC
TTAGAAATGGTAGCTGGTGATGATAAATTAAAAAGTTTTTTTGCTAATAATAAAACAATCTTACCAAATATTGTTTTAGG
TATTATTGAAAATACTCCTAGCGTACAAAGCGTAACAAAAGAATATAATTTTGATAAACAAATGCTTAGTATTGTAGGCG
AAGTTATGTCAAAACCGGAAGTTGCTCATGAGATTATTGCAGACTTAAATAAAGGCGATTATATGAGTTTAACCGGTAAT
ATAATCTCCGCCCTTAATGATCCTTCATTTAAATTAAAAGATATATTAGTAGAGCAAAGTAAAGGAGGTCTATTTGATAA
TTTAATTACAGGAGTTTTAGAACAAGATGCAAAAAATAGCCAAACTATAAAACAACAACTTATAAATTATGGTCTGGAAG
CGAATGATGTTACAAAGCTAACGAGCATAATGCCTATATTACTTGATCAATCTGAATCATTAAAAAAGGTTTTTCGAGAT
TTTATTCAAGGTGATTATACGGGAATGGCAAAAGAGTTAATAGCTTTAACTAAAGACAATCCTGAAATTAAAAAATATTT
AAACAATAATAGAGAAATATTTGCAAGTATTTTAGATAAAACTTTAGTAGAAATACCAGGTATAAATAACCTTGATAAGA
AAGAATTATATAATGTACTTCCATCAATGTTAAACCATCCTAATGAATTAGTTAAAGTTATAGAAGAGGTTGAAAAAAGT
AATTATCGTGAGGCTGCTAGTGCTATATATACTCTAGCTCAAAAAACAAATTATTTGGAAGGGCAATTGCCGAATATTAT
AAAAGCAGGTTTTAGCTATGCTACTGAAAAACTAAAAGACGTATTTAGTCCATCACAAGATTTTAAAGGTAAAACTATAG
ATGCAATTACTCTTAGAAATAATTTACATAAAATACAAAATGGAAAATTCAGCTTAGAGGGAGCTATATTAGTAGGCGAT
TTATCTAATATCGACTTCTCAGGCGTATCATTAAAAAATGCAGATTTAACTAAAGTCACTTCTTTAAAAGATTGTAATTT
TAAAAATATTAATTTAGCAGAGGCTAAATTACCTGATAATTTAATGCTACTTACTGATACTTACAATCTTGATAAGGCTA
TCCCTCCTTTAGTACCTCAACTAATTAAAGAACAACAAGCAAAATTAATTGATAAGGCAATTGATAAATTATTTTTACAA
ATACAAGCTGAAGGAAAAAGAAATGTATTTAGTAAAAAAAATTTTGTTCAACAAGTAAAAAGATTATATGAAGAAAATCA
AACGATTAAAGACTATATTATAGAAAAACTAAATTCACTACCTATGAATATGGTTACTAACCTAGCTACTCCTAGAACAA
ATCAATATAAACATATTACAAATCATGTAAATTCTCCATTACAAATATTGAACCCTTTATATGAAAATATTGCAAATAAA
CAAAATATTAAGAGTAATTTATTGGCAAATATTTTAAGCGAGAAAATATCACAAAAACTTTTTGATAAAGGTGATAATAG
AGGTGAAGATTTTTACATGATAAATCAGATGCTAAAAGCTATCGTTTCTGAATCTTCTAAAGAAAATCCTGATAATATAA
ATAATTTTTTAGAGCCAAAAAATCTAGAAAAGCTAGCAAGTAATATTGCCTCTACTTTATATTCTAAATCTAAATATACT
GGGGTAGGCACTATTACCGGTGGAATTTATTTACCAAAAGAAATTTTCAATGAACAGTTAAAAGATAACTTTAAAAATGA
GTTCGAAAATATTACTAAATTAAATATTTTAAAAGAAGCAACAAATATAGTTTCAAATTTAGATAGTAAAGTGCATGTAG
TAGGTAATCACGATAAATCACATATTTACGCATCATTACCTACAAAAAGTAAACAAATACACAGATCACTCCATAAATCT
TAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATACATATTAACAATAACAAAAAATTAAAAATACCTGATCTTTATTTTTAAAAATTTTTTAAAATAGATTTAGAATATTT
AAACATTAGCGAGTGATTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATCAAATTGATTGAATTACCATATTATGTAATATAAATTAAAATATTTAAGTAGTGCTTAATTTATTTCTTTGAATCAAT
TTTAAGATAATTTAATGTTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 960; Mature: 959

Protein sequence:

>960_residues
MAVINNKNYQKVVEKVLSSSKANKVLNSAMQDLLSSKSISLRKSISLRTILLGARFALTNPVNTYNLFRFANSSKIYLDP
EFQKALLKKSPIWEFLKKHSDDLPKIGQILANAGFREFQDKSALDAKGLEILKECFKNEQVLKKLQEIAVEVKQELPDWN
KVTSRTLDMLVTDKNFQKFFNEKSEDITQYIRTGATEILPSDYIKTFDDILQQPEKKNLLKIFNEHPDFKQELAKNINNP
NTLKRFNKLSPEKQIIIENFLEEAKEQAKPFLKEHFETYKIDLKILDIIPTLLNKMPETKEIFDTLNAPNQGVMISLEKS
LEMVAGDDKLKSFFANNKTILPNIVLGIIENTPSVQSVTKEYNFDKQMLSIVGEVMSKPEVAHEIIADLNKGDYMSLTGN
IISALNDPSFKLKDILVEQSKGGLFDNLITGVLEQDAKNSQTIKQQLINYGLEANDVTKLTSIMPILLDQSESLKKVFRD
FIQGDYTGMAKELIALTKDNPEIKKYLNNNREIFASILDKTLVEIPGINNLDKKELYNVLPSMLNHPNELVKVIEEVEKS
NYREAASAIYTLAQKTNYLEGQLPNIIKAGFSYATEKLKDVFSPSQDFKGKTIDAITLRNNLHKIQNGKFSLEGAILVGD
LSNIDFSGVSLKNADLTKVTSLKDCNFKNINLAEAKLPDNLMLLTDTYNLDKAIPPLVPQLIKEQQAKLIDKAIDKLFLQ
IQAEGKRNVFSKKNFVQQVKRLYEENQTIKDYIIEKLNSLPMNMVTNLATPRTNQYKHITNHVNSPLQILNPLYENIANK
QNIKSNLLANILSEKISQKLFDKGDNRGEDFYMINQMLKAIVSESSKENPDNINNFLEPKNLEKLASNIASTLYSKSKYT
GVGTITGGIYLPKEIFNEQLKDNFKNEFENITKLNILKEATNIVSNLDSKVHVVGNHDKSHIYASLPTKSKQIHRSLHKS

Sequences:

>Translated_960_residues
MAVINNKNYQKVVEKVLSSSKANKVLNSAMQDLLSSKSISLRKSISLRTILLGARFALTNPVNTYNLFRFANSSKIYLDP
EFQKALLKKSPIWEFLKKHSDDLPKIGQILANAGFREFQDKSALDAKGLEILKECFKNEQVLKKLQEIAVEVKQELPDWN
KVTSRTLDMLVTDKNFQKFFNEKSEDITQYIRTGATEILPSDYIKTFDDILQQPEKKNLLKIFNEHPDFKQELAKNINNP
NTLKRFNKLSPEKQIIIENFLEEAKEQAKPFLKEHFETYKIDLKILDIIPTLLNKMPETKEIFDTLNAPNQGVMISLEKS
LEMVAGDDKLKSFFANNKTILPNIVLGIIENTPSVQSVTKEYNFDKQMLSIVGEVMSKPEVAHEIIADLNKGDYMSLTGN
IISALNDPSFKLKDILVEQSKGGLFDNLITGVLEQDAKNSQTIKQQLINYGLEANDVTKLTSIMPILLDQSESLKKVFRD
FIQGDYTGMAKELIALTKDNPEIKKYLNNNREIFASILDKTLVEIPGINNLDKKELYNVLPSMLNHPNELVKVIEEVEKS
NYREAASAIYTLAQKTNYLEGQLPNIIKAGFSYATEKLKDVFSPSQDFKGKTIDAITLRNNLHKIQNGKFSLEGAILVGD
LSNIDFSGVSLKNADLTKVTSLKDCNFKNINLAEAKLPDNLMLLTDTYNLDKAIPPLVPQLIKEQQAKLIDKAIDKLFLQ
IQAEGKRNVFSKKNFVQQVKRLYEENQTIKDYIIEKLNSLPMNMVTNLATPRTNQYKHITNHVNSPLQILNPLYENIANK
QNIKSNLLANILSEKISQKLFDKGDNRGEDFYMINQMLKAIVSESSKENPDNINNFLEPKNLEKLASNIASTLYSKSKYT
GVGTITGGIYLPKEIFNEQLKDNFKNEFENITKLNILKEATNIVSNLDSKVHVVGNHDKSHIYASLPTKSKQIHRSLHKS
>Mature_959_residues
AVINNKNYQKVVEKVLSSSKANKVLNSAMQDLLSSKSISLRKSISLRTILLGARFALTNPVNTYNLFRFANSSKIYLDPE
FQKALLKKSPIWEFLKKHSDDLPKIGQILANAGFREFQDKSALDAKGLEILKECFKNEQVLKKLQEIAVEVKQELPDWNK
VTSRTLDMLVTDKNFQKFFNEKSEDITQYIRTGATEILPSDYIKTFDDILQQPEKKNLLKIFNEHPDFKQELAKNINNPN
TLKRFNKLSPEKQIIIENFLEEAKEQAKPFLKEHFETYKIDLKILDIIPTLLNKMPETKEIFDTLNAPNQGVMISLEKSL
EMVAGDDKLKSFFANNKTILPNIVLGIIENTPSVQSVTKEYNFDKQMLSIVGEVMSKPEVAHEIIADLNKGDYMSLTGNI
ISALNDPSFKLKDILVEQSKGGLFDNLITGVLEQDAKNSQTIKQQLINYGLEANDVTKLTSIMPILLDQSESLKKVFRDF
IQGDYTGMAKELIALTKDNPEIKKYLNNNREIFASILDKTLVEIPGINNLDKKELYNVLPSMLNHPNELVKVIEEVEKSN
YREAASAIYTLAQKTNYLEGQLPNIIKAGFSYATEKLKDVFSPSQDFKGKTIDAITLRNNLHKIQNGKFSLEGAILVGDL
SNIDFSGVSLKNADLTKVTSLKDCNFKNINLAEAKLPDNLMLLTDTYNLDKAIPPLVPQLIKEQQAKLIDKAIDKLFLQI
QAEGKRNVFSKKNFVQQVKRLYEENQTIKDYIIEKLNSLPMNMVTNLATPRTNQYKHITNHVNSPLQILNPLYENIANKQ
NIKSNLLANILSEKISQKLFDKGDNRGEDFYMINQMLKAIVSESSKENPDNINNFLEPKNLEKLASNIASTLYSKSKYTG
VGTITGGIYLPKEIFNEQLKDNFKNEFENITKLNILKEATNIVSNLDSKVHVVGNHDKSHIYASLPTKSKQIHRSLHKS

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 109000; Mature: 108869

Theoretical pI: Translated: 9.26; Mature: 9.26

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
1.8 %Met     (Translated Protein)
2.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
1.7 %Met     (Mature Protein)
1.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MAVINNKNYQKVVEKVLSSSKANKVLNSAMQDLLSSKSISLRKSISLRTILLGARFALTN
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PVNTYNLFRFANSSKIYLDPEFQKALLKKSPIWEFLKKHSDDLPKIGQILANAGFREFQD
CCCHHHHHEECCCCEEEECHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHC
KSALDAKGLEILKECFKNEQVLKKLQEIAVEVKQELPDWNKVTSRTLDMLVTDKNFQKFF
CCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
NEKSEDITQYIRTGATEILPSDYIKTFDDILQQPEKKNLLKIFNEHPDFKQELAKNINNP
CCCHHHHHHHHHCCCHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCC
NTLKRFNKLSPEKQIIIENFLEEAKEQAKPFLKEHFETYKIDLKILDIIPTLLNKMPETK
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH
EIFDTLNAPNQGVMISLEKSLEMVAGDDKLKSFFANNKTILPNIVLGIIENTPSVQSVTK
HHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
EYNFDKQMLSIVGEVMSKPEVAHEIIADLNKGDYMSLTGNIISALNDPSFKLKDILVEQS
HHCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHC
KGGLFDNLITGVLEQDAKNSQTIKQQLINYGLEANDVTKLTSIMPILLDQSESLKKVFRD
CCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH
FIQGDYTGMAKELIALTKDNPEIKKYLNNNREIFASILDKTLVEIPGINNLDKKELYNVL
HHCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHH
PSMLNHPNELVKVIEEVEKSNYREAASAIYTLAQKTNYLEGQLPNIIKAGFSYATEKLKD
HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
VFSPSQDFKGKTIDAITLRNNLHKIQNGKFSLEGAILVGDLSNIDFSGVSLKNADLTKVT
HHCCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHCCCCEEECCEEEEECCCCCCCCCCEECCCCHHHHC
SLKDCNFKNINLAEAKLPDNLMLLTDTYNLDKAIPPLVPQLIKEQQAKLIDKAIDKLFLQ
CCCCCCCCCCCCHHCCCCCCEEEEEECCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IQAEGKRNVFSKKNFVQQVKRLYEENQTIKDYIIEKLNSLPMNMVTNLATPRTNQYKHIT
HHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCCCHHHHH
NHVNSPLQILNPLYENIANKQNIKSNLLANILSEKISQKLFDKGDNRGEDFYMINQMLKA
HHCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHH
IVSESSKENPDNINNFLEPKNLEKLASNIASTLYSKSKYTGVGTITGGIYLPKEIFNEQL
HHHCCCCCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCEECCHHHHHHHH
KDNFKNEFENITKLNILKEATNIVSNLDSKVHVVGNHDKSHIYASLPTKSKQIHRSLHKS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
AVINNKNYQKVVEKVLSSSKANKVLNSAMQDLLSSKSISLRKSISLRTILLGARFALTN
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PVNTYNLFRFANSSKIYLDPEFQKALLKKSPIWEFLKKHSDDLPKIGQILANAGFREFQD
CCCHHHHHEECCCCEEEECHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHC
KSALDAKGLEILKECFKNEQVLKKLQEIAVEVKQELPDWNKVTSRTLDMLVTDKNFQKFF
CCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
NEKSEDITQYIRTGATEILPSDYIKTFDDILQQPEKKNLLKIFNEHPDFKQELAKNINNP
CCCHHHHHHHHHCCCHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCC
NTLKRFNKLSPEKQIIIENFLEEAKEQAKPFLKEHFETYKIDLKILDIIPTLLNKMPETK
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH
EIFDTLNAPNQGVMISLEKSLEMVAGDDKLKSFFANNKTILPNIVLGIIENTPSVQSVTK
HHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
EYNFDKQMLSIVGEVMSKPEVAHEIIADLNKGDYMSLTGNIISALNDPSFKLKDILVEQS
HHCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHC
KGGLFDNLITGVLEQDAKNSQTIKQQLINYGLEANDVTKLTSIMPILLDQSESLKKVFRD
CCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH
FIQGDYTGMAKELIALTKDNPEIKKYLNNNREIFASILDKTLVEIPGINNLDKKELYNVL
HHCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHH
PSMLNHPNELVKVIEEVEKSNYREAASAIYTLAQKTNYLEGQLPNIIKAGFSYATEKLKD
HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
VFSPSQDFKGKTIDAITLRNNLHKIQNGKFSLEGAILVGDLSNIDFSGVSLKNADLTKVT
HHCCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHCCCCEEECCEEEEECCCCCCCCCCEECCCCHHHHC
SLKDCNFKNINLAEAKLPDNLMLLTDTYNLDKAIPPLVPQLIKEQQAKLIDKAIDKLFLQ
CCCCCCCCCCCCHHCCCCCCEEEEEECCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IQAEGKRNVFSKKNFVQQVKRLYEENQTIKDYIIEKLNSLPMNMVTNLATPRTNQYKHIT
HHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCCCHHHHH
NHVNSPLQILNPLYENIANKQNIKSNLLANILSEKISQKLFDKGDNRGEDFYMINQMLKA
HHCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHH
IVSESSKENPDNINNFLEPKNLEKLASNIASTLYSKSKYTGVGTITGGIYLPKEIFNEQL
HHHCCCCCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCEECCHHHHHHHH
KDNFKNEFENITKLNILKEATNIVSNLDSKVHVVGNHDKSHIYASLPTKSKQIHRSLHKS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9823893 [H]